12 ДУПЛЕТНЫЙ КОД

Август 24, 2022

Главная
Биология
12 ДУПЛЕТНЫЙ КОД

Содержание

2. Генетический код – это Способ записи информации о первичной структуре белков через последовательность нуклеотидов ДНК и
3. Каким должен быть дуплетный код Число возможных дуплетов = 16 Им можно закодировать не более 15
4. Наш метод создания кода: Выбрали белки лизоцим (129 а.к.) и миоглобин (154 а.к.); Разделили а.к. на
5. Проблема глицина: считать глицин полярной или неполярной а.к.? Мы считали неполярной, потому что: Gly – п:
7. Знаком начала гена мы выбрали СТАРТ-кодон АУ кодирует Мет, а в начале гена фМет. (в триплетном
8. Идеальный дуплетный код
9. Свойства дуплетного кода: Отсутствие межкодонных знаков препинания Наличие межгенных знаков препинания Однозначность Неперекрываемость Дуплетность Нет вырожденности
10. Сравним эти два кода – построенный нами дуплетный и стандартный триплетный Один из самых важных параметров
11. Помехоустойчивость X Y 1 2 Консервативная замена – не меняет класс аминокислоты Радикальная замена – меняет
12. Гидрофобные (неполярные) Классификация аминокислот по полярности радикала Гидрофильные Полярные Заряженные (ионы) + ─
13. Подсчёт коэффициента помехоустойчивости (q). Число радикальных замен = 40, А консервативных - 44, Учитывая, что глицин
14. Недостатки дуплетного кода: Таким кодом невозможно закодировать больше, чем 15 аминокислот. Возможный путь преодоления: Посттрансляционная модификация
15. Molecular Cell Biology Harvey Lodish et al. Примеры пострансляционной модификации аминокислот
16. Недостатки дуплетного кода: Коэффициент помехоустойчивости (q) меньше, чем у триплетного кода (qтр~1,28, а qдп~1,1) Нет вырожденности
18. Скачать презентацию

Слайд 2

Генетический код – это
Способ записи информации о первичной структуре белков

через последовательность нуклеотидов ДНК и РНК
= «Словарь» перевода с языка нуклеиновых кислот на язык белков.

Слайд 3

Каким должен быть дуплетный код
Число возможных дуплетов = 16
Им можно

закодировать не более 15 а.к.
один из дуплетов – на СТОП-кодон

Слайд 4

Наш метод создания кода:
Выбрали белки лизоцим (129 а.к.) и миоглобин (154

а.к.);
Разделили а.к. на две группы:
а) обязательно кодируемые
б) с похожими радикалами
Посмотрели, какие а.к. наиболее часто встречаются в данных белках;
Подобрали дуплеты и а.к. так, чтобы коэффициент q был как можно больше.

Слайд 5

Проблема глицина:
считать глицин полярной или неполярной а.к.?
Мы считали неполярной, потому что:
Gly

– п: qтр=1,16

Gly – н/п: qтр=1,28

Слайд 6

Слайд 7

Знаком начала гена мы выбрали
СТАРТ-кодон АУ
кодирует Мет, а в начале

гена фМет.
(в триплетном АУГ)
Знак окончания гена –
СТОП-кодон УА
(в триплетном УАА, УАГ, УГА)

Слайд 8

Идеальный дуплетный код

Слайд 9

Свойства дуплетного кода:
Отсутствие межкодонных знаков препинания
Наличие межгенных знаков препинания
Однозначность
Неперекрываемость
Дуплетность
Нет вырожденности (избыточности)
Экономичность

(на белок той же длины нужно меньше ДНК)

Слайд 10

Сравним эти два кода – построенный нами дуплетный и стандартный триплетный
Один

из самых важных параметров - помехоустойчивость

Слайд 11

Помехоустойчивость
X Y
1 2
Консервативная замена – не меняет класс аминокислоты
Радикальная

замена – меняет класс аминокислоты

Слайд 12

Гидрофобные (неполярные)
Классификация аминокислот по полярности радикала
Гидрофильные
Полярные
Заряженные (ионы)
+
─

Слайд 13

Подсчёт коэффициента помехоустойчивости (q).
Число радикальных замен = 40,
А консервативных -

44,
Учитывая, что глицин – неполярная аминокислота и не включая кодон УА
q = 44/40 = 1,1.

Слайд 14

Недостатки дуплетного кода:
Таким кодом невозможно закодировать больше, чем 15 аминокислот.
Возможный путь

преодоления:
Посттрансляционная модификация

Слайд 15

Molecular Cell Biology Harvey Lodish et al.
Примеры пострансляционной модификации аминокислот

Слайд 16

Недостатки дуплетного кода:
Коэффициент помехоустойчивости (q) меньше, чем у триплетного кода (qтр~1,28,

а qдп~1,1)
Нет вырожденности (избыточности).