Биотехнология растений. Трансгенные растения (часть 1)

Содержание

Слайд 2

Трансгенные растения-1 Молекулярные механизмы взаимодействия растения – агробактерии Векторы на основе

Трансгенные растения-1

Молекулярные механизмы взаимодействия растения – агробактерии
Векторы на основе агробактерии
Селективные

и репортерные гены
Методы трансформации
Замолкание (сайленсинг) генов у трансгенных растений
Слайд 3

Нобелевская премия , основоположник 1и2-ой Зеленой революции. Норман Эрнст Борлаг Норман

Нобелевская премия , основоположник 1и2-ой Зеленой революции.

Норман Эрнст Борлаг
Норман Борлаг получил

новые сорта
пшеницы с повышенной урожайностью.
Начало «Зеленой Революции» в сельском
хозяйстве.
1963
Слайд 4

X Методы традиционной селекции растений 1. Близкородственное скрещивание (имбридинг) родительская форма

X

Методы традиционной селекции растений

1. Близкородственное скрещивание (имбридинг)

родительская форма 1

потомство

отбор

2. Отдаленное скрещивание

(аутбридинг)

родительская форма 1

X

родительская форма 1

потомство (гетерозисные гибриды)

отбор

родительская форма 2

3. Мутагенез

родительская форма

потомство (мутанты)

отбор

мутагенез

Слайд 5

Slide courtesy of Wayne Parrott, University of Georgia теосинте кукуруза

Slide courtesy of Wayne Parrott, University of Georgia

теосинте

кукуруза

Слайд 6

Slide courtesy of Wayne Parrott, University of Georgia

Slide courtesy of Wayne Parrott, University of Georgia

Слайд 7

Слайд 8

Генетически модифицированный организм (ГМО) - организм, генетический материал которого (ДНК) изменен

Генетически модифицированный организм (ГМО) -

организм, генетический материал которого (ДНК) изменен не

в ходе естественной гибридизации (вертикального переноса генов от родителей потомству), а с помощью горизонтального переноса генов от одного организма - другому. Процесс горизонтального переноса называется генетической трансформацией, а ГМО – трансгенным организмом.
Слайд 9

1975г. - группы из компании Монсанто, из Гентского государственного университета (Бельгия),

1975г. - группы из компании Монсанто, из Гентского государственного университета (Бельгия),

из Института растениеводства им. Макса Планка в Кельне (Германия) и группа из Вашингтонского университета создали первые трансгенные растения - санбин.
1990г. - первое коммерческое применение ГМО в США.
1992г. - в Китае начали промышленно выращивать трансгенный табак, устойчивый к насекомым.
1994г. - в США зарегистрировали первое трансгенное растение, предназначенное для употребления в пищу, - томаты “Флавр-Савр” с замедленным созреванием.
1999г. - получены трансгенные растения более чем 120 видов.

История развития получения трансгенных растений

Слайд 10

Значительное ускорение создания сорта (1-3 года против 10 и более лет).

Значительное ускорение создания сорта (1-3 года против 10 и более лет).
Избавление

от значительного количества «генетического балласта».
Создание растений с заданными признаками. Традиционная селекция отбирает растения, которые нас устраивают, биотехнология создает растения, которые нам нужны.
Большая возможность контроля целевого гена за счет управления его экспрессией в нужных органах, тканях и в нужное время.

В чём преимущества методов генной инженерии по сравнению с традиционной селекцией?

Слайд 11

Уолтер Гилберт Создание ГМ растений с полезными свойствами – устойчивостью к

Уолтер Гилберт
Создание ГМ растений с полезными свойствами –
устойчивостью к гербицидам, вредителям

и вирусам.
1980-е годы
Слайд 12

Основные культуры трансгенных растений

Основные культуры трансгенных растений

Слайд 13

Основные направления биотехнологии: производство продуктов питания с заданными характеристиками; производство веществ

Основные направления биотехнологии:

производство продуктов питания с заданными характеристиками;
производство веществ вторичного метаболизма

и фармбелков;
получение растений с декоративными признаками;
использование трансгенных растений в фундаментальных исследованиях.
Слайд 14

Векторные системы для переноса генов в растения Вирусы растений Транспозоны Агробактерии

Векторные системы для переноса генов в растения

Вирусы растений
Транспозоны
Агробактерии

Слайд 15

Схема агробактериальной трансформации

Схема агробактериальной трансформации

Слайд 16

Геном агробактерий A. rhizogenes A. tumefaciens A. vitis 3Мб 3Мб 3Мб

Геном агробактерий

A. rhizogenes

A. tumefaciens

A. vitis

3Мб

3Мб

3Мб

2Мб хромосома II

2Мб хромосома II

2,65Мб

3Мб

450кб

450кб

200кб

200кб

Хромосома I

Хромосома I

Хромосома

I

pAt

pRi

pTi

pTi

pAt

200кб

2

Слайд 17

Октопин Нопалин Агропин Структура Ti-плазмиды и основные опины

Октопин

Нопалин

Агропин

Структура Ti-плазмиды и основные опины

Слайд 18

Онкогены A. tumefaciens 5 1. tms-гены (iaaM, iaaH) Триптофан Индолацетамид Ауксин

Онкогены A. tumefaciens

5

1. tms-гены (iaaM, iaaH)

Триптофан

Индолацетамид

Ауксин

iaaM

iaaH

Гены бактериального происхождения, гомологи
аналогичных генов

у других ауксин-синтезирующих
фитопатогенов

Pseudomonas savastanoi

iaaH

6b

iaaM

ipt

5

Слайд 19

Онкогены A. tumefaciens 6 2. tmr-ген (ipt) HMBDP Зеатинрибозид – 5-МФ

Онкогены A. tumefaciens

6

2. tmr-ген (ipt)

HMBDP

Зеатинрибозид – 5-МФ

Транс-зеатин

ipt

iaaH

6b

iaaM

ipt

5

Слайд 20

Онкогены A. tumefaciens 7 3. tml-локус(6a, 6b) 6a – опиновая пермеаза

Онкогены A. tumefaciens

7

3. tml-локус(6a, 6b)

6a – опиновая пермеаза

4. ген 5.


Индол-3-лактат

5

6b – онкоген с неизученным механизмом действия, взаимодействует с
некоторыми хозяйскими ТФ.

Триптофан

Слайд 21

Слайд 22

Онкогены A. rhizogenes. 8 RolA - есть на всех Ri-плазмидах. Снижает

Онкогены A. rhizogenes.

8

RolA - есть на всех Ri-плазмидах. Снижает концентрацию ауксина,

повышает чувствительность к нему. Экспессируется и в самих бактериях.

RolB – рассматривается как основной онкоген A.
rhizogenes. Повышает чувствительность клеток
к ауксину
RolС –b-гликозидаза. Гидролизует неактивные
цитокинин-гликозиды или влияет на клеточный цикл
через регуляцию метаболизма сахаров.
RolD – орнитин-циклодеаминаза

Набор онкогенов A.rhizogenes не совпадает с набором онкогенов A.tumefaciens и не всегда содержит гены синтеза гормонов.

Пролин

Орнитин

RolD

Слайд 23

Онкогены A. rhizogenes. 9 ORF13 – связывает белок ретинобластомы (Rb). Стимулирует

Онкогены A. rhizogenes.

9

ORF13 – связывает белок ретинобластомы (Rb). Стимулирует
пролиферацию клеток,

вызывает эктопическую экспрессию KNOX-генов.
В конечном итоге способствует дедифференцировке трансформированных
клеток и образованию новой меристемы

aux1, aux2 – гены синтеза ауксина, гомологи iaaM и iaaH. Только у агропиновых штаммов.

Слайд 24

Пути биосинтеза основных гормонов в агробактерии

Пути биосинтеза основных гормонов в агробактерии

Слайд 25

Сигнальные молекулы

Сигнальные молекулы

Слайд 26

Опиновая концепция 12 Т-ДНК Опины

Опиновая концепция

12

Т-ДНК

Опины

Слайд 27

Интеграция Т-ДНК в геном растения

Интеграция Т-ДНК в геном растения

Слайд 28

Требование к векторным системам Идеальная векторная система на основе Ti-плазмиды должна

Требование к векторным системам

Идеальная векторная система на основе Ti-плазмиды должна содержать:

сигналы,

необходимые для переноса и стабильной интеграции в ДНК растений;
узнаваемый растительными полимеразами промотор;
селективный маркер для селекции трансформированных клеток;
репортерные гены для отбора трансгенных растений;
полилинкер (уникальные сайты рестрикции), в который будет клонирован чужеродный фрагмент ДНК;
не содержать онкогены.
Слайд 29

pBR322 Ti-плазмида + T-ДНК T-ДНК pBR322 Ген растения Встраивание гена растения

pBR322

Ti-плазмида

+

T-ДНК

T-ДНК

pBR322

Ген растения

Встраивание гена растения в несущественный участок Т-ДНК

pBR322

Agrobacteria

Гомологичная рекомбинация с Ti-плазмидой

Ti-плазмида

со встроенным геном

ДНК растения

Интеграция Т-ДНК с новым геном в геном растения

Схема конструирования вектора на основе Ti-плазмиды

Слайд 30

Бинарный вектор Коинтегративный вектор

Бинарный вектор

Коинтегративный вектор

Слайд 31

Слайд 32

Репортерные гены Ген GFP Ген GUS Ген LUX

Репортерные гены

Ген GFP

Ген GUS

Ген LUX

Слайд 33

Биолюминисценция у Aequoria victoria aequorin Зеленый флюоресцентный белок

Биолюминисценция у Aequoria victoria

aequorin

Зеленый флюоресцентный белок

Слайд 34

Репортерные гены

Репортерные гены

Слайд 35

Методы прямого переноса электропорация биобаллистика трансфекция Методы непрямого переноса вирусная трансформация (трансдукция) агробактериальная трансформация Методы трансформации

Методы прямого переноса
электропорация
биобаллистика
трансфекция
Методы непрямого переноса
вирусная трансформация (трансдукция)
агробактериальная трансформация

Методы трансформации

Слайд 36

Схема баллистической трансформации

Схема баллистической трансформации

Слайд 37

Трансформация картофеля Agrobacterium Образование микроклубней (1 мес.) Иннокуляция клубневых дисков A.

Трансформация картофеля Agrobacterium

Образование микроклубней (1 мес.)

Иннокуляция клубневых дисков A. tumefaciens (15

с)

Регенерация побегов

Укоренение на среде, содержащей Km устойчивых к норфлуразону регенерантов

Селекция на среде, содержащей 100 мг/л Km

Ко-культивация с A. tumefaciens (3 д)

Ночная культура A. tumefaciens

Слайд 38

Трансформация гороха Agrobacterium Спелый горох 96% этанол, 20 минут Удаление корней

Трансформация гороха Agrobacterium

Спелый горох

96% этанол, 20 минут

Удаление корней и разделение горошины

на 2-4 части

Среда B5: + 0,5 мг/л 2-4D 4,5 мг/л BAP

Среда MS: + 5 мг/л BAP 2 мг/л NAA, с Agrobacterium

Среда MS: + 5 мг/л BAP 2 мг/л NAA, 500 мг/л Cf, 5 мг/л Basta

Среда MS: + 5 мг/л BAP 2 мг/л NAA, 500 мг/л Cf, 5 мг/л Азацетидин

Фильтровальная бумага

Вакуум

Агробактериальная суспензия

48 ч

20 д

ПЦР, GUS окрашивание

Слайд 39

Слайд 40

Eugene Nester и Frank White обнаружили в геноме нетрансформированного Nicotiana glauca

Eugene Nester и Frank White обнаружили в геноме
нетрансформированного Nicotiana glauca

последовательности,
гомологичные участку плазмиды Agrobacterium rhizogenes.

Nicotiana glauca

Слайд 41

N. otophora N.tomentosiformis rolC, ORF13, ORF14 rolC, rolB, ORF13, ORF14 N.bigelovii

N. otophora

N.tomentosiformis

rolC, ORF13, ORF14

rolC, rolB, ORF13, ORF14

N.bigelovii

rolB

rolC

N.acunminata

N.benavidensii

N.gossei

N. suaveolens

N. arentsii

N. tabacum

N. glauca

Примеры

ГПГ от агробактерий к растениям.
Слайд 42

(Suzuki et.al., 2001, 2002) Актов трансформации в эволюции рода Nicotiana было

(Suzuki et.al., 2001, 2002)

Актов трансформации в эволюции рода Nicotiana было несколько

и проходили они независимо.
Существуют две группы Т-ДНК содержащих видов
Данные на основании сравнения приграничных последовательностей, а также гомологов микимопин синтазы.

Схема дивергенции части рода Nicotiana (черные и белые стрелки показывают предполагаемое инфицирование плазмидой микимопинового типа и неизвестного типа опинов, соответственно. Виды, содержащие Т-ДНК Ri плазмиды микимопинового типа, заключены в прямоугольник, виды, содержащие Т-ДНК Ri плазмиды неизвестного типа опинов, подчеркнуты)

Слайд 43

Expression of the oncogenes (Intrieri M.C., Buiatti M., 2001)

Expression of the oncogenes

(Intrieri M.C., Buiatti M., 2001)

Слайд 44

Скрининг видов на наличие Т-ДНК содержащих последовательностей Закрепление Т-ДНК в геноме

Скрининг видов на наличие Т-ДНК содержащих последовательностей

Закрепление Т-ДНК в геноме

растений – это уникальная черта рода Nicotiana?
Встречается ли у других родов?
Какова эволюционная роль вставки?

Разработка подхода на основе Real-time PCR:
использование вырожденных праймеров и TaqMan-зондов

Слайд 45

п/кл. Ranunculidae сем. Berberidaceae (1) сем. Ranunculaceae (1) п/кл. Hammamelididae сем.

п/кл. Ranunculidae
сем. Berberidaceae (1)
сем. Ranunculaceae (1)

п/кл. Hammamelididae
сем. Betulaceae (4)
сем. Fagaceae (3)
сем.

Ulmaceae (1)
сем. Buxaceae (1)
сем. Moraceae (1)

п/кл. Caryophyllidae
сем. Amaranthaceae (1)
сем. Portulacaceae (1)

п/кл. Dilleniidae
сем. Salicaceae (4)
сем. Tiliaceae (2)
сем. Brassicaceae (5)
сем. Euphorbiaceae (2)
сем. Malvaceae (1)

п/кл. Rosidae
сем. Grossulariaceae (3)
сем. Rosaceae (23)
сем. Fabaceae (3)
сем. Aceraceae (4)
сем. Hyppocastanoceae (1)
сем. Vitaceae (1)
сем. Celasteraceae (1)
сем. Linaceae (1)
сем. Pedaliaceae (1)
сем. Bignoniaceae (1)
сем. Orobanchaceae (1)

п/кл. Asteridae
сем. Asteraceae (13)
сем. Oleaceae (3)

п/кл. Lamiidae
сем. Convolvulaceae (1)
сем. Cuscutaceae (1)

п/кл. Magnoliidae

Схема родства исследованных видов.

90 видов двудольных растений
(29 семейств)

Слайд 46

В 2006 году сотрудниками лаборатории ГКИР был обнаружен новый пример горизонтального

В 2006 году сотрудниками лаборатории ГКИР был обнаружен новый пример горизонтального

переноса от агробактерий к высшим растениям.
В геноме Linaria vulgaris L. выявлены последовательности, гомологичные Agrobacterium rhizogenes.

Linaria vulgaris L.

Проведен целевой поиск подобных мотивов у других представителей рода Linaria

Слайд 47

Выявлены последовательности, гомологичные rolB, rolC, ORF13, ORF14 и mis (ген микимопин-синтазы)

Выявлены последовательности, гомологичные rolB, rolC, ORF13, ORF14 и mis (ген микимопин-синтазы)
Определена

их нуклеотидная последовательность
Детально изучена структура вставки
Определено количество вставок
Охарактеризован район интеграции.

Linaria vulgaris L..

Слайд 48

Анализ района инсерции у разных линарий. У разных видов совпадает район

Анализ района инсерции у разных линарий.

У разных видов совпадает район интеграции.

Закрепление произошло до разделения видов, т.е. общий предок подвергся агротрансформации.
«Видообразующий» характер вставки?!