Фармацевтическая биотехнология. Клеточная инженерия

Содержание

Слайд 2

СОВЕРШЕНСТВОВАНИЕ ИМЕЮЩИХСЯ И ПОЛУЧЕНИЕ НОВЫХ БИООБЪЕКТОВ (БО)

СОВЕРШЕНСТВОВАНИЕ ИМЕЮЩИХСЯ И ПОЛУЧЕНИЕ НОВЫХ БИООБЪЕКТОВ (БО)

Слайд 3

СУПЕРПРОДУЦЕНТ ― биообъект отличающийся от исходного «дичка» рядом показателей: высокий выход

СУПЕРПРОДУЦЕНТ ― биообъект отличающийся от исходного «дичка» рядом показателей:

высокий выход целевого продукта;
способность

расти на относительно дешевых питательных средах;
благоприятные реологические свойства биомассы, обеспечивающие относительно несложное выделение продукта;
устойчивость к вирусам, в т.ч. фагам;
благоприятные экологические показатели процесса (низкое спорообразование, отсутствие неприятного запаха и т.д.).
Слайд 4

Современные методы совершенствования биообъектов мутагенез и селекция; клеточная инженерия; генетическая инженерия

Современные методы совершенствования биообъектов

мутагенез и селекция;
клеточная инженерия;
генетическая инженерия

Слайд 5

Слайд 6

Совершенствование биообъектов методами мутагенеза и селекции Мутация — изменение структуры ДНК,

Совершенствование биообъектов методами мутагенеза и селекции

Мутация — изменение структуры ДНК, приводящее

(в итоге) к изменению фенотипа биообъекта.

Меняется биосинтетическая способность биообъекта: изменяется либо набор его ферментов, либо активность некоторых из них.

Слайд 7

Слайд 8

Классификация мутаций Спонтанный мутагенез является источником изменчивости организмов в процессе эволюции.

Классификация мутаций

Спонтанный мутагенез является источником изменчивости организмов в процессе эволюции.
Пример

эффективности индуцированного мутагенеза в БТ - создание современных суперпродуцентов пенициллина.
Слайд 9

Совершенствование БО путем преднамеренного искусственного мутагенеза и последующей селекции I стадия.

Совершенствование БО путем преднамеренного искусственного мутагенеза и последующей селекции

I стадия. Осуществляется

обработка биообъекта мутагенами (собственно мутагенез);
II стадия. Отбор и оценка полезных мутаций (селекция)
Слайд 10

По выраженности признака, возникающего в результате мутации, клетки БО в популяции

По выраженности признака, возникающего в результате мутации, клетки БО в популяции

составляют
вариационный ряд

Большинство клеток имеют среднюю выраженность признака. Отклонения от среднего значения встречаются в популяции тем реже, чем больше величина отклонения от среднего значения

Индуцированные мутации - разброс мутантов по выраженности признаков больше.
Спонтанные мутации встречаются редко, разброс по степени выраженности признаков невелик.

Слайд 11

Классификация мутаций В зависимости от размеров мутируемых сегментов генома: Геномные -

Классификация мутаций

В зависимости от размеров мутируемых сегментов генома:
Геномные
- аллополиплоидизация
-

аутополиплоидизация
Хромосомные (делеции, дупликации, инверсии, транслокации участков хромосом)
- анеуплоидия (измен. числа отдельных хромосом)
- хромосомные аберрации (крупные измен. структуры отдельных хромосом )
Генные (изменение первичной структуры ДНК):
делеции, дупликации, инверсии, транслокации участков генов
точковые мутации (изменение 1 нуклеотида)
- транзиции
- трансверсии
Слайд 12

Геномные мутации Изменение числа хромосом. Полиплоидия - увеличение числа хромосом, кратное

Геномные мутации

Изменение числа хромосом.
Полиплоидия - увеличение числа хромосом, кратное гаплоидному набору.

Появляется в рез. нарушения хода митоза и мейоза. Полиплоиды часто встречаются среди растений. ↑ жизнеспособность и позволяет сохраняться в борьбе за существование.
Типы полиплоидов:
Автополиплоидия – формы, возникающие в рез. умножения числа хромосом собственного генома, кратное 2n. Возникают при:
выпадении цитокинеза, завершающего процесс митоза;
при отсутствии редукционного деления во время мейоза,
при разрушении веретена деления при делении клеток.
Сопровождается увеличением размеров организма, но понижением его фертильности.
2. Аллополиплоидия – формы, возникающие в результате умножения числа хромосом двух разных геномов. Возникают при гибридизации целых неродственных геномов
Слайд 13

Хромосомные мутации

Хромосомные мутации

Слайд 14

Хромосомные мутации

Хромосомные мутации

Слайд 15

Генные мутации

Генные мутации

Слайд 16

Генные мутации – замена азотистых оснований в нуклеотидах В этом случае

Генные мутации – замена азотистых оснований в нуклеотидах

В этом случае одна

комплементарная нуклеотидная пара молекулы ДНК заменяется в ряду циклов репликации на другую (≈ 20 % всех генных мутаций). Например, в результате дезаминирования (при воздействии мутагена) цитозина образуется урацил:
В ДНК образ. нуклеотидная пара Г-У вместо Г-Ц. Если ошибка не будет репарирована ферм. ДНК-гликолазой, при очередной репликации цепи ДНК разойдутся, против Г будет установлен Ц, а на др. цепи против У встанет А. В результате одна из дочерних молекул ДНК будет содержать аномальную пару У-А. При ее последующей репликации в одной из молекул напротив А встанет Т. В гене произойдет замена пары Г-Ц на А-Т
Слайд 17

Генные мутации – инверсия в пределах гена Происх. вследствие поворота участка

Генные мутации – инверсия в пределах гена

Происх. вследствие поворота участка ДНК

на 180⁰, например, при образовании петли в ДНК. В петле репликация идет в обратном направлении. Далее этот участок сшивается с остальной нитью ДНК, но оказывается перевернутым наоборот.
Если инверсия происходит в структурном гене, то при синтезе пептида часть его аминокислот будет иметь обратную последовательность, что вызовет изменение свойств белка.
Слайд 18

Генные мутации – сдвиг рамки считывания Происходит изменение количества нуклеотидных пар

Генные мутации – сдвиг рамки считывания

Происходит изменение количества нуклеотидных пар в

составе гена. Это может быть как выпадение, так и вставка одной или нескольких нуклеотидных пар в ДНК. Если происходит делеция или вставка числа нуклеотидов не кратного трем, то рамка считывания сдвигается и трансляция генетического кода обессмысливается.
Если кол-во вставленных или выпавших нуклеотидов кратно трем, то сдвига рамки считывания не происходит, но при трансляции таких генов в пептидную цепь будут включены лишние или утрачены значащие аминокислоты
Генных мутаций по типу сдвига рамки считывания больше всего. Наиболее часто возникают в повторяющихся нуклеотидных последовательностях.
Вставка или выпадение нуклеотидных пар может произойти вследствие воздействия определенных химических веществ, которые деформируют двойную спираль ДНК.
Рентгеновское облучение может приводить к выпадению, т. е. делеции, участка с большим количеством пар нуклеотидов.
Слайд 19

ГЕНЕТИЧЕСКИЙ КОД (ПО мРНК) НИРЕНБЕРГ М. И С.ОЧОА В 1966 г.

ГЕНЕТИЧЕСКИЙ КОД (ПО мРНК) НИРЕНБЕРГ М. И С.ОЧОА В 1966 г.

Словарь

для перевода генетической информации с языка нуклеотидов на язык аминокислот - биологический код
Триплеты нуклеотидов (кодоны) mRNA кодируют каждый одну аминокислоту
Слайд 20

Интеркаляция

Интеркаляция

Слайд 21

Как можно объяснить отсутствие генетических последствий в результате некоторых мутаций?

Как можно объяснить отсутствие генетических последствий в результате некоторых мутаций?

Слайд 22

ЗАДАЧА 1 Как изменится структура белка, если в участке гена 3´

ЗАДАЧА 1

Как изменится структура белка, если в участке гена 3´ -

АЦАТТТАААГТЦ - 5´ – смысловая нить
в результате точковой мутации девятый слева нуклеотид был заменен на гуанин?
Слайд 23

ОТВЕТ 1 3׳- АЦА ТТТ ААА ГТЦ -3׳ – иРНК: 5'-

ОТВЕТ 1

3׳- АЦА ТТТ ААА ГТЦ -3׳
– иРНК: 5'-

УГУ ААА УУУ ЦАГ-3‘
Пептид: цис-лиз-фен-глн
участок ДНК после замены нуклеотида
3׳- АЦА ТТТ ААГ ГТЦ -3
иРНК: 5'- УГУ ААА УУЦ ЦАГ-3‘
пептид: цис-лиз-фен-глн

Синонимическая
замена

Слайд 24

ЗАДАЧА 2 Как изменится структура белка, если из участка гена 3´-

ЗАДАЧА 2

Как изменится структура белка, если из участка гена 3´- АЦАТТТАААГТЦ

- 5´ (смысловая нить)
в результате точковой мутации были делетированы второй и десятый слева нуклеотиды?
Слайд 25

ОТВЕТ 2 3׳- АЦА ТТТ ААА ГТЦ -5׳ – иРНК: 5'-

ОТВЕТ 2

3׳- АЦА ТТТ ААА ГТЦ -5׳
– иРНК: 5'-

УГУ ААА УУУ ЦАГ-3‘
Пептид: цис-лиз-фен-глн
участок ДНК после делеции нуклеотидов
3'-ААТ ТТА ААТ Ц-5'
иРНК: 5'- УУА ААУ УУА Г -3'
пептид: лей – асн – лей

Миссенс-мутация

Слайд 26

ЗАДАЧА 3 Как изменится структура белка, если в участке гена 3´

ЗАДАЧА 3

Как изменится структура белка, если в участке гена 3´ -

АЦАТТТАААГТЦ - 5´ смысловая нить
в результате точковой мутации третий слева нуклеотид был заменен на тимин?
Слайд 27

ОТВЕТ 3 3׳- АЦА ТТТ ААА ГТЦ -3׳ – иРНК: 5'-

ОТВЕТ 3

3׳- АЦА ТТТ ААА ГТЦ -3׳
– иРНК: 5'-

УГУ ААА УУУ ЦАГ-3‘
Пептид: цис-лиз-фен-глн
участок ДНК после замены нуклеотида
3׳- АЦТ ТТТ ААА ГТЦ -3
иРНК: 5'- УГА ААА УУУ ЦАГ-3‘
пептид: стоп -лиз-фен-глн

Нонсенс мутация

Слайд 28

Классификация точечных мутаций

Классификация точечных мутаций

Слайд 29

Точковые мутации

Точковые мутации

Слайд 30

Не всякая мутация сопровождается генетическими последствиями: Синонимические замены Реверсии (обратные мутации)

Не всякая мутация сопровождается генетическими последствиями:
Синонимические замены
Реверсии (обратные мутации)
Супрессорные мутации
В

процессе совершенствования биообъекта путем индуцированного мутагенеза их стараются избегать или ликвидировать при возникновении
Слайд 31

Классификация мутаций Супрессорные и обратные мутации приводят к появлению ревертантов. Не

Классификация мутаций

Супрессорные и обратные мутации приводят к появлению ревертантов.
Не выгодны для биотехнологии

Реверсивная

мутация, обратная мутация (reverse mutation, back mutation) — мутация, восстанавливающая дикий тип гена, поврежденного другой мутацией.
Супре́ссорная мута́ция — мутация, восстанавливающая дикий фенотип (изменённый предшествующей мутацией) без восстановления исходного генотипа.
Возврат к исходному фенотипу происх. Вследствие мутации в другой части того же самого гена или даже другого гена. Механизмы супрессии разнообразны.
Этим супрессорные мутации отличаются от обратных мутаций, которые точно восстанавливают исходный генотип.
Слайд 32

Репарация

Репарация

Слайд 33

Слайд 34

Совершенствование биообъектов методами преднамеренного мутагенеза и селекции Для справки: интеркаляция -

Совершенствование биообъектов методами преднамеренного мутагенеза и селекции

Для справки: интеркаляция - встраивание

плоских ароматических колец между стопками пар азотистых оснований ДНК (обратимое включение м-лы или группы между другими молекулами или группами)

Повреждения ДНК не должны приводить к гибели БО

I стадия – обработка БО мутагенами

Биологические – вирусы; транспозоны (переносят уч-ки ДНК в хромосомах)

Слайд 35

МУТАГЕНЫ

МУТАГЕНЫ

Слайд 36

Слайд 37

Слайд 38

Слайд 39

Nitrogen mustard - азотная горчица — термин, принятый в США для

Nitrogen mustard - азотная горчица — термин, принятый в США для обозначения

ряда веществ, близких по строению к горчичному газу — иприту
Слайд 40

транзиции

транзиции

Слайд 41

Пара оснований А = Т стабилизируется двумя водородными связями; Пара C

Пара оснований А = Т стабилизируется двумя водородными связями;
Пара C ≡

G – тремя, является более прочной.
Нуклеотиды способны образовывать пары как угодно. Но в структуре ДНК они соединяются только так, и никак иначе. Причина заключается в том, что угол между «хвостиками», которые идут к сахарам, совпадает только в этих парах, и, кроме того, совпадают их размеры. Никакая другая пара не образует такой пространственной конфигурации.
А поскольку они совпадают, то их через сахаро-фосфатный остов можно связать друг с другом
Слайд 42

гуанин тимин цитозин аденин

гуанин

тимин

цитозин

аденин

Слайд 43

Слайд 44

Слайд 45

Азотистая кислота как мутаген Азотистая кислота индуцирует транзиции в обоих направлениях,

Азотистая кислота как мутаген

Азотистая кислота индуцирует транзиции в обоих направлениях, поэтому

вызываемые ею мутации способны ревертировать при повторной обработке этим же мутагеном.
Помимо замен оснований, азотистая кислота индуцирует делеции, что обусловлено ее способностью к поперечному сшиванию цепей ДНК.
У эукариот вызывает сшивки ДНК с гистонами.
Слайд 46

Слайд 47

Слайд 48

Слайд 49

Слайд 50

Вместо цитозина Вместо аденина

Вместо цитозина

Вместо аденина

Слайд 51

Слайд 52

Слайд 53

Слайд 54

Слайд 55

Слайд 56

Слайд 57

Слайд 58

Репарация (восстановление) —способность клеток исправлять повреждения и разрывы в ДНК.

Репарация (восстановление) —способность клеток исправлять повреждения и разрывы в ДНК.

Слайд 59

Слайд 60

Слайд 61

Какие мутации, увеличивают образование целевого продукта: дупликации (удвоение) или амплификации (умножение)

Какие мутации, увеличивают образование целевого продукта:

дупликации (удвоение) или амплификации (умножение)

структурных генов, включенных в систему синтеза целевого продукта
нарушающие системы ретроингибирования;
измененяющие (интенсифицирующие) системы транспорта предшественников целевого продукта в клетку;
повышающие резистентность продуцента к образуемому им же веществу. Необходимо для получения суперпрдуцентов антибиотиков
Слайд 62

2 стадия. Оценка и отбор полезных мутаций в процессе естественной эволюции (селекция)

2 стадия. Оценка и отбор полезных мутаций в процессе естественной эволюции

(селекция)
Слайд 63

Метод «отпечатков» (реплик) Ледербергов Дж. и Э.

Метод «отпечатков» (реплик) Ледербергов Дж. и Э.

Слайд 64

Проблемы суперпродуцентов Высокопродуктивные штаммы продуцентов крайне нестабильны и менее жизнеспособны в

Проблемы суперпродуцентов

Высокопродуктивные штаммы продуцентов крайне нестабильны и менее жизнеспособны в сравнении

с дикими по причине многочисленных искусственных изменений в геноме.
Мутантные штаммы могут ревертировать.
Для предотвращения реверсии клетки суперпродуцентов иммобилизируют – связывают с нерастворимыми носителями и используют в технологическом процессе, не прибегая в течение длительного времени (от нескольких недель до нескольких месяцев) к пересевам
Слайд 65

СОВЕРШЕНСТВОВАНИЕ БИООБЪЕКТОВ МЕТОДАМИ КЛЕТОЧНОЙ ИНЖЕНЕРИИ

СОВЕРШЕНСТВОВАНИЕ БИООБЪЕКТОВ МЕТОДАМИ КЛЕТОЧНОЙ ИНЖЕНЕРИИ

Слайд 66

Совершенствование биообъектов методами клеточной инженерии Клеточная инженерия — «насильственный» обмен участками

Совершенствование биообъектов методами клеточной инженерии

Клеточная инженерия — «насильственный» обмен участками хромосом

или целыми хромосомами (у эукариот) между клетками с отличающимися геномами. Осуществляется в клетке (in vivo)

Конструирование клетоконового типа. Включает объе-динение двух целых клеток, принадлежащих различным видам (и даже относящихся к разным царствам:орас-тениям и животным), с образованием новыхоклеток,  несущих генетический материал исходных клеток. Предполагаетореконструкцию жизнеспособной клетки из от-дельных фрагментов разных клеток.

Слайд 67

Лигр —гибрид льва и тигра Волкособ Томофель Возможно получение межвидовых и

Лигр —гибрид льва и тигра

Волкособ

Томофель

Возможно получение межвидовых и межродовых
гибридных культур
микроорганизмов,


а также гибридных клеток
между отдаленными в эволюционном отношении многоклеточными организмами.
Слайд 68

Гибридные антибиотики Макролидный агликон эритромицина связан с углеводной частью антрациклина; Антрациклиновый

Гибридные антибиотики

Макролидный агликон эритромицина связан с углеводной частью антрациклина;
Антрациклиновый агликон связан

с сахарами эритромицина.
Продуценты их получены с помощью клеточной инженерии
Слайд 69

Схема формирования гибридных клеток (на примере прокариотов)

Схема формирования гибридных клеток
(на примере прокариотов)

Слайд 70

Клеточную стенку можно разрушить механически или с помощью ферментов. Ферментативный способ

Клеточную стенку можно разрушить механически или с помощью ферментов. Ферментативный способ

менее травматичен. Для разрушения клеточных оболочек используют специальные ферменты, лизирующие структурный материал оболочек:
у прокариотов гидролазы пептидогликана - лизоцим куриного яйца – расщепляет полисахаридные цепи пептидогликана;
у плесневых и дрожжевых грибков - хитиназа, глюканаза, маннопротеиназа;
у растительных клеток пектиназы и целлюлазы или сложные смеси ферментов;

1 стадия

Слайд 71

Схема строения пептидогликана бактерий (муреина) Структура пептидогликана: остов из N–ацетилмурамовой кислоты

Схема строения пептидогликана бактерий
(муреина)

 Структура пептидогликана: 
остов из N–ацетилмурамовой кислоты (MypNAц) и

N–ацетилглюкозамина (ГлюNAц); боковые пептиды, состоящие из L–аланина (L–Ала), D–глутамата (D–Глу), L–лизина (L–Лиз) и D–аланина (D–Ала); пептидные (Гли5) поперечные мостики.

Клеточные стенки бактерий состоят из пептидогликана (муреина)

Слайд 72

Слайд 73

Клеточная стенка грамотрицательных бактерий покрыта слоем липидов. Для реорганизации структуры используют

Клеточная стенка грамотрицательных бактерий покрыта слоем липидов. Для реорганизации структуры используют

лизоцим в сочетании с ЭДТА, растворяющей липополисахариды наружной мембраны клеточной стенки
Слайд 74

Слайд 75

Слайд 76

Клеточные стенки высших растений Отличаются у разных видов. Основные компоненты: целлюлоза,

Клеточные стенки высших растений

Отличаются у разных видов.
Основные компоненты: целлюлоза, пектиновые

вещества

Для реорганизации применяют ферменты:
целлюлазу, пектиназу

Слайд 77

В результате реорганизации клеточной стенки образуются протопласты. Протопласт ( др.-греч. πρῶτος

В результате реорганизации клеточной стенки образуются протопласты.
Протопласт ( др.-греч. πρῶτος — «первый» + πλαστός — образованный,

вылепленный и др.) – содержимое клетки, оставшееся после разрушения внешней клеточной стенки, но с сохранившейся клеточной плазматической мембраной (клетка, лишенная клеточной стенки).
Протопласт включает:
цитоплазму
ядро
все органеллы
клеточную плазматическую мембрану
То есть протоплазму и мембрану.
«Голая» клетка потенциально способна образовывать новую оболочку, способна делиться.
Отсутствие клеточной стенки облегчает реконструирование генома при слиянии клеток
Слайд 78

Для предотвращения лизиса образующихся протопластов клеточную стенку удаляют ферментативной обработкой в

Для предотвращения лизиса образующихся протопластов клеточную стенку удаляют ферментативной обработкой в

гипертонической среде (20 % раствор сахарозы, маннита, 10 % раствор натрия хлорида и т.д.)
После разрушения клеточных стенок суспензию протопластов отделяют от остатков клеток и тканей фильтрованием, ферменты отделяют центрифугированием с последующим промыванием в культуральной среде. Очищенные протопласты ресуспендируют в ПС.

Протопласты клеток листа петунии, полученные обработкой клеток целлюлазами и пектиназами

Слайд 79

Слайд 80

Образование диплоидов, ломка и рекомбинация хромосом Гетерокарионы содержат два ядра (у

Образование диплоидов, ломка и рекомбинация хромосом

Гетерокарионы содержат два ядра (у прокариот

- две кольцевых молекулы ДНК) разных клеток в одной цитоплазме. В них происходит «ломка» (причины до конца неясны) и воссоединение хромосомных нитей, при котором в одну хромосому может включиться фрагмент другой – происходит природная рекомбинация хромосом.
Свою целостность протопласты сохраняют в гипертонической среде

3 стадия

Схема получения гибридных клонов “человек-мышь”

Слайд 81

Словарь РЕКОМБИНАЦИЯ – процесс реорганизации генома, обмен участками ДНК

Словарь
РЕКОМБИНАЦИЯ –
процесс реорганизации генома, обмен участками ДНК

Слайд 82

Рекомбинация может быть: Гомологичная – основана на спаривании комплементарных цепей ДНК.

Рекомбинация может быть:

Гомологичная
– основана на спаривании комплементарных цепей ДНК. Требуется

общая (по все длине молекулы) гомология между рекомбинирующими участками
Сайт-специфическая
– происходит между последовательностями ДНК в пределах очень коротких участков гомологии, обычно 15 – 30 п.н.
Незаконная
– рекомбинация происходит без гомологии между молекулами ДНК (причины разнообразны, например посредством транспозонов и ретротранспозонов)
Слайд 83

После промывания протопласты помещают в питательную среду. При этом у определенной

После промывания протопласты помещают в питательную среду.
При этом у определенной

части протопластов наблюдается регенерация клеточной стенки, в результате образуются клетки, способные к размножению.
После митоза из двухъядерного гетерокариона образуются две одноядерные клетки, каждая из которых представляет собой синкарион – гибридную клетку, содержащую хромосомы обеих исходных клеток (образуются в результате объединения двух геномов) и гибридные хромосомы
Культуры таких клеток обладают новыми свойствами

4 стадия

Образование клеток с рекомбинантными хромосомами