Ферменты (энзимы)

Содержание

Слайд 2

Понятие о ферментах Fermentum — «закваска» Enzume — «в дрожжах» 3

Понятие о ферментах
Fermentum — «закваска»
Enzume — «в дрожжах»

3

Слайд 3

Слайд 4

Ферменты Однокомпонентные (только аминокислоты) Двухкомпонентые Апофермент (ак) Кофактор Простетическая Кофермент группа (Ме**) (Vit В)

Ферменты

Однокомпонентные

(только аминокислоты)

Двухкомпонентые


Апофермент (ак)
Кофактор
Простетическая Кофермент
группа (Ме**) (Vit В)

Слайд 5

Слайд 6

Слайд 7

Активный центр фермента

Активный центр фермента

Слайд 8

Слайд 9

Механизм действия ферментов Применение ферментов снижает Еактивации (энергетический барьер), осуществив превращение

Механизм действия ферментов

Применение ферментов снижает Еактивации (энергетический барьер), осуществив превращение

исходного вещества в конечное через промежуточное состояние или состояние активного комплекса, что энергетически более выгодно.

6

Слайд 10

Модель «ключ-замок» В 1890 г. Эмиль Фишер предположил, что специфичность ферментов

Модель «ключ-замок»

В 1890 г. Эмиль Фишер предположил, что специфичность ферментов определяется

точным соответствием формы фермента и субстрата

7

Слайд 11

Слайд 12

4

4

Слайд 13

Абсолютная специфичность

Абсолютная специфичность

Слайд 14

Абсолютная специфичность

Абсолютная специфичность

Слайд 15

Относительная специфичность

Относительная специфичность

Слайд 16

Стереоспецифичность

Стереоспецифичность

Слайд 17

Схема ферментативной реакции Между субстратом (S) и ферментом (Е) возникает связь

Схема ферментативной реакции

Между субстратом (S) и ферментом (Е) возникает связь (ионная,

ковалентная или др.), (Е подходит к S по типу «ключ-замок» или «рука-перчатка»).
ES претерпевает изменение, делающее его более доступным для соответствующей ХР.
Происходит сама ХР.
Образующиеся продукты освобождаются из фермент-продуктного комплекса.

8

Слайд 18

t°C (opt = 30-50°С); topt непостоянен, зависит от продолжительности реакции Факторы,

t°C (opt = 30-50°С);
topt непостоянен, зависит от продолжительности реакции

Факторы, влияющие

на активность ферментов

2. рН – max kat активность лежит в узких пределах рН (~7). В резко кислой и щелочной средах работают лишь некоторые ферменты.

9

Слайд 19

Факторы, влияющие на активность ферментов 3. Наличие активаторов и ингибиторов 10

Факторы, влияющие на активность ферментов

3. Наличие активаторов и ингибиторов

10

Слайд 20

4. рН – max kat активность лежит в узких пределах рН

4. рН – max kat активность лежит в узких пределах

рН (~7). В резко кислой и щелочной средах работают лишь некоторые ферменты.

Факторы, влияющие на активность ферментов

Отклонение от рНopt вызывает ионизацию функциональных групп → заряда фермента → конформации активного центра→ сродства Е к S→ Vхр

Для большинства людей сдвиги величины рН крови за пределы 6,8-7,8 (при норме 7,35-7,45) несовместимы с жизнью из-за дисбаланса скорости ферментативных реакций.

Слайд 21

Оптимальное значение рН Пепсин Трипсин Сахараза Мальтаза Амилаза Липаза Фосфатаза Аргиназа

Оптимальное значение рН

Пепсин
Трипсин
Сахараза
Мальтаза
Амилаза
Липаза
Фосфатаза
Аргиназа
Карбоксилаза

1,5-2,5
8,0-9,0
6,2
6,1
≈ 7,0
7,0-8,5
6,0-9,0
9,8
4,8

Слайд 22

При оптимальных условиях активность ферментов зависит от количества субстрата (S); количества

При оптимальных условиях активность ферментов зависит от
количества субстрата (S);
количества продукта (Р);
количества

фермента (Е);

Факторы, влияющие на активность ферментов

концентрации кофактора;
наличия активаторов и ингибиторов

Слайд 23

Константа Михаэлиса-Ментен

Константа Михаэлиса-Ментен

Слайд 24

Зависимость скорости ферментативной реакции от концентрации субстрата

Зависимость скорости ферментативной реакции от концентрации субстрата

Слайд 25

[S] >> Km; V = Vmax [S] [S] = Km; V = ½ Vmax

[S] >> Km; V = Vmax
[S] << Km; V = Vmax

[S] /Km
[S] = Km; V = ½ Vmax
Слайд 26

График зависимости скорости ферментативной реакции от концентрации субстрата

График зависимости скорости ферментативной реакции от концентрации субстрата

Слайд 27

Регуляция скорости ферментативных реакций 1. Количеством ферментов 2. Доступностью фермента и

Регуляция скорости ферментативных реакций

1. Количеством ферментов
2. Доступностью фермента и субстрата
3. Регуляцией

активности самого фермента:
аллостерическая
химическая модификация
частичный протеолиз
Слайд 28

Аллостерическая регуляция

Аллостерическая регуляция

Слайд 29

Слайд 30

Ингибиторы обратимые необратимые конкуретные неконкурентные 11 специфические Игибитор и субстрат конкурируют

Ингибиторы

обратимые

необратимые

конкуретные

неконкурентные

11

специфические
Игибитор и субстрат конкурируют между собой стремясь

вытеснить один другого из ЕS комплекса

Активность фермента восстанавливается при
удалении ингибитора
из среды

присоединяются к Е не в активном центре, а в другом месте, вызывая изменение конформации фермента и его активного центра.

ковалентно связываются или разрушают функционально значимую молекулы активного центра.

Слайд 31

субстрат конкурентный ингибитор Конкурентное ингибирование

субстрат

конкурентный ингибитор

Конкурентное ингибирование

Слайд 32

Конкурентное ингибирование

Конкурентное ингибирование

Слайд 33

Обратимые конкурентные ингибиторы – структурные аналоги S. Игибитор и субстрат конкурируют

Обратимые конкурентные ингибиторы – структурные аналоги S. Игибитор и субстрат конкурируют

между собой стремясь вытеснить один другого из ЕS комплекса

Использование ингибиторов ферментов
в качестве лекарственных средств
При панкреатите происходит преждевременная активация трипсина, что приводит к протеолизу белков ткани поджелудочной железы (самопереваривание). Одна из мер защиты – присутствие в секрете железы небольшого белка – панкреатического ингибитора трипсина. При лечении используют его структурные аналоги (апротинин, входит в состав трасилола и гордокса).

Слайд 34

Слайд 35

Частичный протеолиз. Ряд Е вырабатывается клетками в виде проферментов или зимогенов

Частичный протеолиз. Ряд Е вырабатывается клетками в виде проферментов или зимогенов

(kat неактивны). В результате частичного протеолиза (отщепления пептида) изменяются 10, Mr, конформация, повышается сродство к S.

Синтез пептидаз в неактивной форме предотвращает их разрушающее действие на клетки органов, в которых они образуются. Данный процесс регуляции необратим.

Слайд 36

Регуляция активности Е путем ассоциации-диссоциации протомеров

Регуляция активности Е путем ассоциации-диссоциации протомеров

Слайд 37

Номенклатура ферментов Тривиальная (по случайным признакам) Пепсин - «пищиварение», трипсин -

Номенклатура ферментов

Тривиальная (по случайным признакам)
Пепсин - «пищиварение», трипсин - «разжижающий»,
клетка цвет
Цитохромы

- окрашенные внутриклеточные ферменты, kat О-В реакции
Рациональная - по названию S (в окончании «-аза», н-р сахараза)
По типу каталитической реакции и характеру S - сукцинатдегидрогеназа
По названию простетической группы - геминфермент (гем), перидоксальфермент.

13

Слайд 38

По химическому составу фермента В 1961 г. Международная комиссия по номенклатуре

По химическому составу фермента

В 1961 г. Международная комиссия по номенклатуре представила

V Международному биохимическому конгрессу проект номенклатуры, построенной на строго научных принципах:
Например: пиридоксальфермент – L-аланин2кетоглутаратаминотранфераза
В связи с усложнением научных названий новая номенклатура допускает сохранение наряду с новыми старых тривиальных названий. Например, уреаза – карбамид-аминотрансфераза.
Шифрование ферментов
Международной комиссией был составлен список всех известных в то время ферментов, дополненный в 1972 г. Каждому ферменту присвоен шифр (1-я цифра – класс фермента, 2 – п/кл, 3- п/п/кл, 4-я – порядковый № фермента в этом п/п/кл.

14

Слайд 39

ЕС 2. 7. 1. 1 класс 2 – трансфераза подкласс 7

ЕС 2. 7. 1. 1

класс 2 – трансфераза

подкласс 7 –

перенос фосфата

подподкласс 1 – акцептором фосфата является ОН-группа

D-гексозо-6-фосфотрансфераза

Слайд 40

Классификация ферментов (6 классов) Оксидоредуктазы (О-В ферменты) катализируют перенос атомов Н

Классификация ферментов (6 классов)

Оксидоредуктазы (О-В ферменты) катализируют перенос атомов Н и

ē (180-200 Е).
Трансферазы (ферменты переноса) - катализируют перенос функциональных групп и молекулярных остатков (реакции фосфорилирования, переаминирования).
Гидролазы катализируют реакции гидролитического распада .
Лиазы катализируют негидролитическое отщепление каких-либо групп от субстратов (альдолаза, декарбоксилазы, реакции дезаминирования).
Изомеразы ускоряют пространственные или структурные изменения в пределах одной молекулы (реакции изомеризации).
Лигазы (синтетазы) катализируют реакции синтеза, сопряженные с распадом макроэргических связей в молекуле АТФ.

15

Слайд 41

16 Класс 1: Оксидоредуктазы. Катализируют окислительно-восстановительные реакции, в которых, как правило,

16

Класс 1: Оксидоредуктазы.

Катализируют окислительно-восстановительные реакции, в которых, как правило, участвуют два

субстрата

общее название оксидоредуктаз, отщепляющих атомы водорода или электроны и переносящих их на любой акцептор, кроме кислорода, представлено дегидрогеназами.

Как альтернатива, некоторые ферменты, которые преимущественно характеризуются восстанавливающим действием, носят название редуктаз. Оксидоредуктазы, использующие кислород в качестве акцептора атомов водорода или электронов, называются оксидазами. Ферменты, осуществляющие перенос электронов, называются цитохромами.

Подкласс 1.1 составляют оксидоредуктазы, действующие на спиртовые группы доноров, окисляя их до альдегидных или кето-групп.

Подкласс 1.2 оксидиредуктаз включает ферменты, действующие на карбонильные (альдегидные или кето-группы) группы доноров. Эти ферменты окисляют альдегиды и кетоны до карбоновых кислот.
Пример: глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназа (D-глицеральдегид-3-фосфат: NAD-оксидоредуктаза (фосфорилирующая), КФ 1.2.1.12) катализирует одну из промежуточных реакций гликолитического распада глюкозы:

Слайд 42

катализируют реакции переноса функциональных групп и молекулярных остатков от одного соединения

катализируют реакции переноса функциональных групп и молекулярных остатков от одного соединения

к другому ( ≈ 500 ферментов).

17

2 класс: Трансферазы.

Слайд 43

катализируют реакции гидролитического распада 18 3 класс: Гидролазы. Пример: триацилглицероллипаза (гидролаза

катализируют реакции гидролитического распада

18

3 класс: Гидролазы.

Пример:
триацилглицероллипаза (гидролаза эфиров глицерола, КФ 3.1.1.3), катализирует

реакцию гидролиза сложноэфирных связей в молекуле триацилглицерола:
Слайд 44

4 кл. Лиазы катализируют негидролитическое отщепление определенной группы с образованием –

4 кл. Лиазы

катализируют негидролитическое отщепление определенной группы с образованием – С

= С – (или присоединение группы атомов по – С = С –), при этом выделяются такие продукты как СО2, Н2О, NH3 и т.д.

19

Слайд 45

Слайд 46

Металлы, содержащиеся в ферментах

Металлы, содержащиеся в ферментах

Слайд 47

Классификация коферментов По химическому строению 1. Алифатические (липоевая кислота); 2. Ароматические

Классификация коферментов

По химическому строению
1. Алифатические (липоевая кислота);
2. Ароматические (коэнзим Q);
3. Гетероциклические

(ТПФ, ПФ);
4. Нуклеотиды (НАД, НАДФ, ФАД, ФМН)
Слайд 48

Слайд 49

Слайд 50

Слайд 51

Слайд 52

Липоевая кислота

Липоевая кислота

Слайд 53

КоQ (коэнзим Q, убихинон)

КоQ (коэнзим Q, убихинон)

Слайд 54

Тиаминпирофосфат (ТПФ)

Тиаминпирофосфат (ТПФ)

Слайд 55

Никотинамидадениндинуклеотид (НАД+) никотинамид (vit B5)

Никотинамидадениндинуклеотид (НАД+)

никотинамид (vit B5)

Слайд 56

Флавинмононуклеотид (ФМН)

Флавинмононуклеотид (ФМН)

Слайд 57

По выполняемым функциям 1. Переносчики протонов и электронов (НАД, ФАД, Ко

По выполняемым функциям

1. Переносчики протонов и электронов (НАД, ФАД, Ко Q);
2.

Переносчики групп (ТПФ, ПФ, КоА);
3. Коферменты синтеза и изомеризации
Слайд 58

По механизму действия 1. Коферменты с высоким потенциалом переноса энергии (переносчики

По механизму действия

1. Коферменты с высоким потенциалом переноса энергии (переносчики энергии);
2.

Коферменты, участвующие в окислительно-восстановительных реакциях;
3. Коферменты, формирующие активный центр фермента.
Слайд 59

Единицы измерения количества и активности фермента 1 мкмоль превращенного S 1 мин 1МЕ =

Единицы измерения количества и активности фермента

1 мкмоль превращенного S
1

мин

1МЕ =

Слайд 60

nМЕ – количество единиц активности Кол-во превращенного S (мкмоль) nМЕ = Время (мин)

nМЕ – количество единиц активности
Кол-во превращенного S (мкмоль)
nМЕ =
Время

(мин)
Слайд 61

Катал 1 моль превращенного S 1 катал = 1 секунда

Катал
1 моль превращенного S
1 катал =
1

секунда
Слайд 62

Связь международной единицы ферментативной активности с каталом

Связь международной единицы ферментативной активности с каталом

Слайд 63

Применение ферментов в медицине Энзимодиагностика – определение активности ферментов в природном

Применение ферментов в медицине

Энзимодиагностика – определение активности ферментов в природном биоматериале

(кровь, моча, спинномозговая жидкость, слюна, кишечный сок) с целью диагностики.
Требования к ферментам в энзимодиагностике
органоспецифичность (тканеспецифичность);
выход фермента в кровь при повреждении органа или ткани;
низкая активность фермента в крови в норме.
Условно различают
неспецифические ферменты – присутствуют во всех тканях в разных количествах;
тканеспецифические ферменты – присутствуют в конкретных тканях или органах.

По локализации в клетке различают цитоплазматические, митохондриальные, ядерные, лизосомные ферменты.
При воспалительных процессах повышается проницаемость мембран и в крови обнаруживаются цитоплазматические ферменты.
При некрозе ткани (разрушение клеток) в крови определяют митохондриальные ферменты.

Слайд 64

Неспецифические ферменты могут быть представлены в тканях различными изоформами

Неспецифические ферменты могут быть представлены в тканях различными изоформами

Слайд 65

Мозг миокард мыщцы

Мозг миокард мыщцы