Ферменты. Уравнение Михаэлиса-Ментен

Содержание

Слайд 2

ФЕРМЕНТЫ (ЭНЗИМЫ) это высокоспецифичные белки, выполняющие функции биологических катализаторов. Катализатор -

ФЕРМЕНТЫ (ЭНЗИМЫ)

это высокоспецифичные белки, выполняющие функции биологических катализаторов.
Катализатор - это

вещество, которое ускоряет химическую реакцию, но само в ходе этой реакции не расходуется
Слайд 3

КЛАССИФИКАЦИЯ ФЕРМЕНТОВ

КЛАССИФИКАЦИЯ ФЕРМЕНТОВ

Слайд 4

Белок~кофактор белок кофактор Связь может быть ковалентной или нековалентной Холофермент (оптимальная

Белок~кофактор

белок

кофактор

Связь может быть
ковалентной или
нековалентной

Холофермент
(оптимальная каталитическая
активность)

Апофермент;
неактивен
или менее активен

(Неорганический ион
или органическое

соединение

Некоторые ферменты требуют два или три различных кофактора

Строение ферментов

Слайд 5

Энергия исходных продуктов Энергетический порог реакции без катализатора Энергетический порог реакции

Энергия исходных
продуктов

Энергетический
порог реакции
без катализатора

Энергетический
порог реакции
с катализатором

КАТАЛИЗАТОР

- это вещество, которое направляет реакцию по пути, характеризующемуся более низкой энергией переходного состояния.
Слайд 6

Связывание фермента с субстратом происходит в активном центре В активном центре

Связывание фермента с субстратом происходит
в активном центре

В активном центре
участвуют
аминокислотные


остатки, имеющие
химически активные
боковые цепи:
Cys, Ser, Thr, Asp, Glu,
Lys, Arg, Tyr, His
Слайд 7

Высокая избирательность действия фермента обеспечивается тем, что субстрат связывается в активном

Высокая избирательность действия фермента
обеспечивается тем, что субстрат связывается
в активном

центре фермента в нескольких точках

Типы взаимодействия «фермент - субстрат»

«Ключ - замок»

«Перчатка - рука»

Индуцированное
соответствие

Жесткая матрица
Э. Фишер

Г. Кошланд

Слайд 8

Способы регуляции: 1. Аллостерическая регуляция 2. Ковалентная модификация 3. Диссоциация неактивного предшественника (зимогена), на активный фермент

Способы регуляции:
1. Аллостерическая регуляция
2. Ковалентная модификация
3. Диссоциация неактивного
предшественника (зимогена),
на активный

фермент
Слайд 9

1. Аллостерическая регуляция эффектор Каталитическая субъединица с активным центром Неактивный фермент

1. Аллостерическая регуляция

эффектор

Каталитическая
субъединица
с активным центром

Неактивный фермент

Регуляторная субъединица
с аллостерическим центром

Активный фермент

S

субстрат

S

ES-ферментсубстратный
комплекс

Слайд 10

2. Ковалентная модификация Неактивный Е СН2ОН Акт.Е СН2О-РО3Н2 АТР АDP Н3РО4

2. Ковалентная модификация

Неактивный
Е

СН2ОН

Акт.Е

СН2О-РО3Н2

АТР

АDP

Н3РО4

Фосфорилирование - дефосфорилирование

a)

б) активация зимогенов - предшественников ферментов

трипсиноген

+

Val-(Asp)4-Lys

Энтеро-
пептидаза

Не активен

трипсин

активен

Слайд 11

Регуляция действия ферментов E4 E3 E2 E1 A B C D

Регуляция действия ферментов

E4

E3

E2

E1

A

B

C

D

P

Ингибирование по принципу
обратной связи

Исходный субстрат

Конечный продукт

Мультиферментная
система, осуществляющая
превращение А в

Р в ходе
четырех
последовательных
ферментативных реакций
Слайд 12

ИНГИБИТОРЫ специфические неспецифические обратимые необратимые конкурентные неконкурентные

ИНГИБИТОРЫ

специфические

неспецифические

обратимые

необратимые

конкурентные

неконкурентные

Слайд 13

Необратимое ингибирование путем ковалентной модификации Фермент - ацетилхолин- эстераза Ингибитор - диизопропил- фторфосфат Неактивный фермент

Необратимое ингибирование
путем ковалентной модификации

Фермент -
ацетилхолин-
эстераза

Ингибитор -
диизопропил-
фторфосфат

Неактивный
фермент

Слайд 14

Обратимое ингибирование ферментов Конкурентное ингибирование Неконкурентное ингибирование E EI ES E

Обратимое ингибирование ферментов

Конкурентное ингибирование

Неконкурентное ингибирование

E

EI

ES

E + P

I

E

ES

E + P

ESI

EI

I

I

S

S

Слайд 15

Иммобилизация фермента - закрепление на полимерном носителе (полистироле) Иммобилизованный фермент не

Иммобилизация фермента - закрепление
на полимерном носителе (полистироле)

Иммобилизованный фермент не смешивается
с

продуктами реакции, более устойчив к
денатурации
Слайд 16

Каждый фермент имеет определенный оптимум рН Относи- тельная скорость Активность пепсина-

Каждый фермент имеет определенный оптимум рН

Относи-
тельная
скорость

Активность пепсина-
фермента желудочного
сока максимальна при
рН~ 1

- 2

Активность ферментов
печени максимальна
при рН ~ 7,2

Слайд 17

Оптимальная температура 00 700 Активность ферментов зависит от температуры А к

Оптимальная температура

00

700

Активность ферментов зависит от температуры

А
к
т
и
в
н
о
с
т
ь

Температура, 0С

Для большинства
ферментов
tопт = 37

- 40 0С

При высоких
температурах
реализуется
денатурация
ферментов

Слайд 18

Кинетика ферментативных реакций Влияние концентрации субстрата на скорость реакции

Кинетика ферментативных реакций

Влияние концентрации субстрата на скорость реакции

Слайд 19

УРАВНЕНИЕ МИХАЭЛИСА-МЕНТЕН В чем его смысл? — Позволяет получить формальные характеристики

УРАВНЕНИЕ МИХАЭЛИСА-МЕНТЕН

В чем его смысл? — Позволяет получить формальные характеристики скорости

ферментативной реакции вида
Уравнение реакции превращения субстрата (S) в продукт (P), катализируемой ферментом (E);
Уравнение Михаэлиса-Ментен описывает зависимость скорости реакции от концентрации субстрата и, в частности, демонстриует явление насыщения. Условия, при которых работает уравнение Михаэлиса-Ментен:
Стационарная фаза реакции, т.е. [ES]=const, d[ES]/dt=0;
Измеряется начальная скорость; [S] ≈ [S0]
[E] = [E0] – [ES]
Слайд 20

Анализ уравнения Михаэлиса -Ментен 3. Km = [S], тогда V0 =

Анализ уравнения Михаэлиса -Ментен

3. Km = [S], тогда V0 = 1/2

Vmax

Vmax [S]

Km + [S]

V0 =

1. [S] << Km, тогда V ~ K [S]

1

2

1

2. [S] >> Km, тогда V0 ~ Vmax

2

3

3

Слайд 21

СМЫСЛ KM Km выводится из констант скоростей Km в условиях Михаэлиса-Ментен

СМЫСЛ KM

Km выводится из констант скоростей
Km в условиях Михаэлиса-Ментен определяет скорость

распада фермент-субстратного комплекса
при равновесии,
Константа диссоциации
Маленькая Km означает сильное связывание; высокая Km означает слабое связывание.
Km равна концентрации субстрата, при которой скорость реакции равна половине максимальной v=1/2vmax