Исследование активности аланинаминотрансферазы и аспартатаминотрансферазы

Содержание

Слайд 2

Аспартатаминотрансфераза Аминотрансферазы Аланинаминотрансфераза 2

Аспартатаминотрансфераза

Аминотрансферазы

Аланинаминотрансфераза

2

Слайд 3

Цель работы: Сравнительный анализ активности аминотрансфераз в культуре мезенхимальных стволовых клеток, полученных от разных доноров. 3

Цель работы:
Сравнительный анализ активности аминотрансфераз в культуре мезенхимальных стволовых клеток, полученных

от разных доноров. 

3

Слайд 4

Материалы Материалы предоставлены научной лабораторией регенеративной медицины НИИ экспериментальной онкологии и

Материалы

Материалы предоставлены научной лабораторией регенеративной медицины НИИ экспериментальной онкологии и биомедицинских

технологий.
Клеточные лизаты культивированных мезенхимальных стволовых клеток, выделенных из жировой ткани (МСК-ЖТ) двух доноров.

4

Донор №1 европейка
26 лет
Донор №2 европейка
27 лет

МСК культивировали в среде ά-МЕМ с добавлением антибиотиков (пенициллин/
стрептомицин), глутамина и 15% эмбриональной телячьей сыворотки

Культивирование проходило во флаконах «Costar» во влажной атмосфере при 5% СО2, температуре 37°С.

Клетки снимали с поверхности пластика с помощью 0,25% раствора трипсина в версене.

Использовали клетки 3-4 пассажа. Их центрифугировали при 100g в течение 5 минут. Надосадочную жидкость сливали, а осажденную клеточную суспензию лизировали с помощью 3-кратных циклов замораживании и быстрого размораживания.

Слайд 5

5 Эмбриональное развитие, пролиферация во время нейрогенеза (Rybko V.A. et al.,2011)

5

Эмбриональное развитие, 
пролиферация во время нейрогенеза (Rybko V.A. et al.,2011)

Эмбриональное развитие, пролиферация и

миграция клеток, канцерогенез (Tatarskiy V. V., 2016)

Эмбриональное развитие, регенерация тканей,  пролиферативная активность (Cherepanov S. A. et al., 2015)

Notch

 Сигнальные пути

Sonic Hedgehog/
Patched
Wnt/β–катенин

Слайд 6

Белок определяли набором «Белок по Лоури-200-СПб». Использовались базы данных String, UniProt,

Белок определяли набором «Белок по Лоури-200-СПб». 

Использовались базы данных String, UniProt, языка программирования

R в RStudio 3.5.1 с дополнительными пакетами ggplot2, tidyverse, hrbrthemes, viridis.

Фотометрические

Методы

Биоинформационный анализ

6

АcАт и АлАт определялась при помощи наборов реагентов DiaSys (Германия) с использованием спектрофотометра UV-mini-1240, Shimadzu (длина волны - 340 нм).

Принцип метода: Активность аминотрансфераз определяется по скорости уменьшения NADH, оптическая плотность которого измеряется при 340 нм (в реакции с участием лактатдегидрогеназы)

Слайд 7

7 Донор 1 Донор 2 Активность АлАт, Е/л/кл. Донор 1 Донор

7

Донор 1

Донор 2

Активность АлАт, Е/л/кл.

Донор 1

Донор 2

Активность АлАт, Е/л/г. белка

Результаты собственных

исследований
Слайд 8

8 Донор 1 Донор 2 Активность АсАт, Е/л/кл. Донор 1 Донор

8

Донор 1

Донор 2

Активность АсАт, Е/л/кл.

Донор 1

Донор 2

Активность АсАт, Е/л/г. белка

Результаты собственных

исследований
Слайд 9

Донор 2 Донор 1 9 Скорость удвоения МСК, ч. Данные предоставлены

Донор 2

Донор 1

9

Скорость удвоения МСК, ч.

Данные предоставлены Алейник Д. Я. Ст.н.с.

лаборатории регенеративной медицины НИИ ЭОиБИТ
Слайд 10

10 Белок-белковые взаимодействия АсАт (GOT-1) Карбамоилфосфат- синтетаза II Аспартаттрас- карбомилаза Дигидрооротаза

10

Белок-белковые взаимодействия АсАт (GOT-1)

Карбамоилфосфат-
синтетаза II

Аспартаттрас-
карбомилаза

Дигидрооротаза

Начальный этап синтеза пиримидина (Raushel F. M. et

al., 1998)
Слайд 11

11 Центральная роль аспартатаминотрансферазы AsAt

11

Центральная роль аспартатаминотрансферазы

AsAt

Слайд 12

12 Белок-белковые взаимодействия АлАт (GPT) Глюкозо-аланиновый цикл (Karmen A. et al., 1955)

12

Белок-белковые взаимодействия АлАт (GPT)

Глюкозо-аланиновый цикл (Karmen A. et al., 1955)

Слайд 13

Вывод: Использование методов биохимического и биоинформационного анализа не позволило выявить взаимосвязь

Вывод: 
Использование методов биохимического и биоинформационного анализа не позволило выявить взаимосвязь активности

аланинаминотрансферазы и аспартатаминотрансферазы с пролиферативной активностью мезенхимальных стволовых клеток. Вероятнее всего, участие данных аминотрансфераз в клеточном делении ограничивается их метаболической функцией.

13

Слайд 14

14 Спасибо за внимание!

14

Спасибо за внимание!

Слайд 15

Список литературы: 15 1.Salomone F. et al. Efficacy of adipose tissue-mesenchymal

Список литературы:

15

1.Salomone F. et al. Efficacy of adipose tissue-mesenchymal stem cell

transplantation in rats with acetaminophen liver injury //Stem Cell Research. – 2013. – Т. 11. – №. 3. – С. 1037-1044.
2. Zare H. et al. Bone marrow or adipose tissue mesenchymal stem cells: comparison of the therapeutic potentials in mice model of acute liver failure //Journal of cellular biochemistry. – 2018. – Т. 119. – №. 7. – С. 5834-5842.
3. del Caño-Ochoa F., Moreno-Morcillo M., Ramón-Maiques S. CAD, A Multienzymatic Protein at the Head of de Novo Pyrimidine Biosynthesis //Macromolecular Protein Complexes II: Structure and Function. – Springer, Cham, 2019. – С. 505-538.
4. Sato T. et al. Rheb protein binds CAD (carbamoyl-phosphate synthetase 2, aspartate transcarbamoylase, and dihydroorotase) protein in a GTP-and effector domain-dependent manner and influences its cellular localization and carbamoyl-phosphate synthetase (CPSase) activity //Journal of Biological Chemistry. – 2015. – Т. 290. – №. 2. – С. 1096-1105.
5. Rybko V.A., Kopnin B.P., Khromova N.V. et al. Role of Notch signaling in tumorigenesis: multiple mechanisms and therapeutic potential. Klinicheskaya onkogematologiya -Clinical Oncohematology 2011;4(2):103–10. 
6. MacDonald B.T., He X. Frizzled and LRP5/6 receptors for Wnt/-сatenin signaling. Cold Spring Harb Perspect Biol 2012;4(12).
7. Cherepanov S. A. et al. Hedgehog signaling in the pathogenesis of neuro-oncology diseases //Biomeditsinskaya khimiya. – 2015. – V. 61. – №. 3. – P. 332-342.
8. Tatarskiy V. V. The Wnt signaling pathway: prospects for pharmacological regulation //Advances in molecular oncology. – 2016. – Т. 3. – №. 1. – С. 28-31.