Современное использование
В декабре 2005 года Законодательное собрание Санкт-Петербурга выдвинуло предложение использовать здания Сената
и Синода для размещения «институтов высшей судебной власти или создание музея»; первоначально идея была высказана председателем Совета Федерации Сергеем Мироновым . 22 марта 2006 года Государственная дума Российской Федерации приняла в первом чтении законопроект о переводе Конституционного суда из Москвы в Санкт-Петербург, поддержав законодательную инициативу Заксобрания. 27 мая 2008 года в здании Сената и Синода прошло первое заседание Конституционного суда.
В мае 2008 года был обнародован проект реконструкции бывшего здания Синода для размещения в нём президентской библиотеки имени Бориса Ельцина; в рамках проекта в библиотеке предусматривалось возможное размещение патриарших покоев и апартаментов главы государства с отдельными входами в воссоздаваемый зал «общего присутствия» — для встреч светской и духовной власти. 27 мая 2009 года библиотека была открыта; в здании размещены кабинет патриарха и представительская зона президента России.