Фотобиология. Основные термины

Содержание

Слайд 2

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии Фотобиология (ФБ, квантовая биофизика)

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Фотобиология (ФБ, квантовая биофизика) –

наука, изучающая закономерности и механизм действия света на биосистемы. ФБ изучает фотобиологические процессы, протекающие в организмах под действием видимого (380-760 нм), ультрафиолетового (12-380 нм) и ближнего инфракрасного (760-900 нм) света.
Слайд 3

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Слайд 4

Шкала электромагнитных колебаний ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии Оптическая область спектра

Шкала электромагнитных колебаний

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Оптическая область спектра

Слайд 5

Закон Бугера-Ламберта-Бера ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Закон Бугера-Ламберта-Бера

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Слайд 6

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Слайд 7

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии Основные стадии фотобиологического процесса

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Основные стадии фотобиологического процесса
1.Фотофизическая (поглощение

кванта света, размен и миграция энергии)
2.Первичная фотохимическая (образование первичного фотопродукта)
3.Вторичная фотохимическая (образование стабильного продукта)
4.Темновые реакции (цепь биохимических реакций или перестройки клеточных структур)
5.Биологический эффект (физиологический ответ на действие света)
Слайд 8

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Слайд 9

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Слайд 10

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Слайд 11

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии Поглощение и испускание света

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Поглощение и испускание света иллюстрирует

диаграмма уровней энергии, предложенная Яблонским
Слайд 12

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии Взаимодействие молекул с фотонами

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Взаимодействие молекул с фотонами
Возбуждение молекулы

→переход электрона из основного состояния в возбужденное с большей энергией →переход в основное состояние + hν. Энергия молекуля складывается из 3 частей:

Различают два главных состояния электронных оболочек:
1) синглетное основное и воезбужденное состояние (все спины электронов антипараллельны, неспаренные электроны отсутствуют) и
2) триплетное основное и возбужденное состояние (спины электронов параллельны, имеются неспаренные электроны).
Основное состояние для большинства веществ - синглетное, за исключением кислорода, для которого основное состояние – триплетное.

Емол = Ее + Екол + Евр
Ее >> Екол >> Евр

Слайд 13

Идеализированный спектр поглощения ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Идеализированный спектр поглощения

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Слайд 14

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Слайд 15

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии Все электронные переходы происходят

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Все электронные переходы происходят без

изменения межъядерного расстояния. Электронные переходы являются настолько быстрыми (10-14 – 10-15 с) по сравнению с движением ядер в молекуле (10-12 – 10-13 с), что за время электронного перехода относительное расположение ядер и их кинетическая энергия не изменяются.

Принцип Франка - Кондона.

Слайд 16

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии Преобразование энергии возбужденных электронных состояний

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Преобразование энергии возбужденных электронных состояний

Слайд 17

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии Трансформация энергии электронного возбуждения (внутренняя конверсия)

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Трансформация энергии электронного возбуждения (внутренняя

конверсия)
Слайд 18

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии Индуктивно-резонансный механизм передачи энергии.

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Индуктивно-резонансный механизм передачи энергии.

Индуктивно-резонансный механизм

передачи энергии осуществляется при слабых энергиях взаимодействия между молекулами.
Время миграции τ м >> 10-12 с.
Расстояния переноса энергии 2-10 нм
Слайд 19

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Слайд 20

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии При экситонном переносе энергии

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

При экситонном переносе энергии возбуждение

«бежит» по верхним колебательным уровням взаимодействующих молекул, не успевая локализоваться на каждой из них в отдельности.
Время миграции τ м << 10-12 с.

Экситонный механизм передачи энергии.

Слайд 21

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии Основные типы фотохимических реакций 1.Фотораспад 2.Фотоперегруппировка Фотоизомеризация Фототаутомеризация

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Основные типы фотохимических реакций

1.Фотораспад

2.Фотоперегруппировка
Фотоизомеризация

Фототаутомеризация
Слайд 22

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии 3. Фотоприсоединение Фотодимеризация А*

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

3. Фотоприсоединение
Фотодимеризация А* +

А = (А*….А) = А2
Фотогидратация А* + Н2О = НАОН
4. Фотоперенос электронов
Фотоокисление А* + В = А+ + Х-
Фотовосстановление А* + С = А- + С+ 5.
5. Фотоперенос протона
фотоприсоединение Н+ А + ВН =АН+ + В-
фотоотдача Н+ АН+ + В = А- + Н+В
6. Фотогидролиз
А-В → А-В* + Н2О → АН + ВОН
Слайд 23

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Слайд 24

Люминесценция – свечение атомов, ионов, молекул, возникающее в результате электронного перехода

Люминесценция – свечение атомов, ионов, молекул, возникающее в результате электронного перехода

при их возвращении из возбужденного состояния в основное. При этом молекула преобразует поглощенную энергию в собственное излучение.
Люминесценцию называют холодным свечением
Люминесцирующие вещества могут находиться в любом агрегатном состоянии
Длительность люминесценции от 10-10 с до нескольких часов
Слайд 25

Характеристики люминесцирующих молекул Спектр возбуждения люминесценции - зависимость интенсивности люминесценции I

Характеристики люминесцирующих молекул

Спектр возбуждения люминесценции - зависимость интенсивности люминесценции I от

длины волны возбуждающего света
Спектр люминесценции - зависимость интенсивности люминесценции от длины волны люминесценции
I = f(λ); I = f(v)
Время жизни люминесценции – время, за которое интенсивность излучения уменьшится в е раз, поскольку затухание люминесценции происходит по закону: It = I0 e-t/τ
t - время люминесценции
τ – время затухания люминесценции
Слайд 26

Классификация видов фотолюминесценции По длительности свечения 2. По способу возбуждения

Классификация видов фотолюминесценции

По длительности свечения
2. По способу возбуждения

Слайд 27

Классификация фотолюминесценции по длительности свечения 1.Флуоресценция (~10-8 c) – вид фотолюминесценции,

Классификация фотолюминесценции по длительности свечения

1.Флуоресценция (~10-8 c) – вид фотолюминесценции,

при котором молекула переходит в основное состояние S0 из короткоживущего возбужденного состояния S*. Наблюдается сразу же после поглощения квантов света и быстро затухает в результате столкновений излучающей молекулы с другими молекулами в растворе.
2.Фосфоресценция (10-3 с - секунды) – вид фотолюминесценции, при котором молекула переходит в основное состояние S0 из относительно долгоживущего возбужденного состояния S* → Т* → S0, называется послесвечением. Для фосфоресценции характерны большая длина волны излучения, меньшая интенсивность.
Слайд 28

Диаграмма Яблонского ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Диаграмма Яблонского

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Слайд 29

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Слайд 30

Спектр фосфоресценции лежит в области более длинных волн, чем спектр флуоресценции

Спектр фосфоресценции лежит в области более длинных волн, чем спектр флуоресценции

Слайд 31

Классификация люминесценции по способу возбуждения Фотолюминесценция Термолюминесценция Электролюминесценция Сонолюминесценция Триболюминесценция Хемилюминесценция

Классификация люминесценции по способу возбуждения

Фотолюминесценция
Термолюминесценция
Электролюминесценция
Сонолюминесценция
Триболюминесценция
Хемилюминесценция
Биолюминесценция

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Слайд 32

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии Законы люминесценции 1.Закон Стокса

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Законы люминесценции
1.Закон Стокса - спектр

флуоресценции лежит в более длинноволновой области по сравнению со спектром поглощения, т.к. энергия испускаемого кванта ниже, чем энергия поглощенного кванта.
Слайд 33

2.Правило Каши – спектр флуоресценции (и фосфоресценции) не зависит от длины

2.Правило Каши – спектр флуоресценции (и фосфоресценции) не зависит от длины

волны возбуждающего света, т.к. излучательный переход может происходить только с самого нижнего возбужденного колебательного уровня.
Слайд 34

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии 3.Закон Вавилова – квантовый

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

3.Закон Вавилова – квантовый выход

флуоресценции (Q) не зависит от длины волны возбуждающего света, т.к. излучательный переход может происходить только с самого нижнего возбужденного колебательного уровня.
Квантовый выход Q. - отношение числа излучаемых квантов к числу поглощенных квантов светового потока.

Q (φ) = N/ No
N – количество излучаемых квантов
No – количество поглощенных квантов

Слайд 35

4.Закон зеркальной симметрии (правило Левшина) – спектр испускания флуоресценции представляет собой

4.Закон зеркальной симметрии (правило Левшина) – спектр испускания флуоресценции представляет

собой зеркальное отражение спектра поглощения, поскольку структура колебательных подуровней одинакова в основном и возбужденном состоянии.
Слайд 36

Cпектрофлуориметр фирмы Horiba Fluoromax - 4

Cпектрофлуориметр фирмы Horiba Fluoromax - 4

Слайд 37

Хемилюминесценция (ХЛ) – это свечение, сопровождающее биохимические реакции Процесс хемилюминесценции включает

Хемилюминесценция (ХЛ) – это свечение, сопровождающее биохимические реакции

Процесс хемилюминесценции включает 2

стадии:
Образование продукта в возбужденном состоянии (хемилюминесцентная реакция)
А + В → Р*
2. Испускание кванта света (люминесценция)
Р* → Р + фотон

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Слайд 38

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Слайд 39

Виды хемилюминесценции (ХЛ) в живых системах Митогенетическое излучение Сверхслабое свечение (собственная

Виды хемилюминесценции (ХЛ) в живых системах

Митогенетическое излучение
Сверхслабое свечение (собственная хемилюминесценция СХЛ)

клеток и тканей
Биолюминесценция (БЛ)
Активированная хемилюминесценция (АХЛ)

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Слайд 40

Эмпирические правила ХЛ 1.Спектр хемилюминесценции подобен спектру фосфоресценции, а не спектру

Эмпирические правила ХЛ

1.Спектр хемилюминесценции подобен спектру фосфоресценции, а не спектру флуоресценции.


2. Абсолютная величина квантового выхода в хемилюминесцентных реакциях имеет невысокие значения.
3. Энергия испускаемого фотона равна сумме энтальпии реакции и энергии активации люминесценции (правило Одюбера).
hν = Eа + ∆H

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Слайд 41

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии 1.Митогенетическое излучение В 1923

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

1.Митогенетическое излучение
В 1923 году А.Гурвич обнаружил

митогенетическое излучение делящихся клеток и определил его диапазон - область ультра-фиолетового излучения
(λ = 180-300 нм).  Создал концепцию морфогенетического поля организма, которое создает и поддерживает в живых системах специфическую молекулярную упорядоченность.
Слайд 42

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии При помощи биологических объектов

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

При помощи биологических объектов возможно

производить индукцию митозов на расстоянии, т. е. можно увеличивать количество митозов в биологическом объекте без непосредственного соприкосновения. 
Слайд 43

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии 2. Собственная ХЛ. Измерение собственного свечения органов животного

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

2. Собственная ХЛ. Измерение собственного

свечения органов животного
Слайд 44

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии 1) реакциями активированных кислородных

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

1) реакциями активированных кислородных метаболитов

(АКМ) 2) реакциями перекисного окисления липидов 3) реакции с участием оксида азота

Собственная ХЛ или сверхслабое свечение обусловлено реакциями 3 типов

Слайд 45

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии Реакции, сопровождающиеся сверхслабым свечением

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Реакции, сопровождающиеся сверхслабым свечением

Слайд 46

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии 3.Биолюминесценция (БХЛ)— способность живых

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

3.Биолюминесценция (БХЛ)— способность живых организмов

светиться, которая достигается самостоятельно или с помощью симбионтов.
Это видимое глазом свечение, связанное со специфическими ферментативными реакциями, при которых освобождающаяся энергия выделяется в виде света. Специфический фермент называется люциферазой, а его субстрат – люциферином.
БХЛ была открыта в 1887 г. Р. Дюбуа, который показал, что за БХЛ отвечают 2 фракции: 1)низкомолекулярная, устойчивая к нагреванию - люциферин; 2) белковая, инактивирующаяся при нагревании, - люцифераза.
Люциферины окисляются в присутствии люциферазы с образованием оксилюциферина и фотона.
Слайд 47

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии Типы биолюминесценции (БЛ): 2.1.Адениннуклеотидная

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Типы биолюминесценции (БЛ): 2.1.Адениннуклеотидная  ЛН2 + АТФ

+ О2 → оксиЛ* +АМФ + СО2 + Н2О + hν↑ (λ=560 нм)  2.2.Пиридиннуклеотидная RCHO + O2 + НАДН2 + ФМН2 → RCOOH + Н2О + НАДН+ + ФМН + hν↑ (λ=490 нм)  2.3.Фотопротеины Целентеразин + Ca2+ = Целентерамид* + CO2 = Целентеразин + hν (469 нм)
Слайд 48

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии Люциферины живых организмов Люциферин

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Люциферины живых организмов

Люциферин светляков

люциферин дождевых

червей

целентеразин

варгулин

люциферин улитки

люциферин грибов

Слайд 49

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии 2.1. Адениннуклеотидный тип БЛ - биолюминесценция жуков-светляков

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

2.1. Адениннуклеотидный тип БЛ -

биолюминесценция жуков-светляков
Слайд 50

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии Каракатица Каракатица Ночесветка Удильщик

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Каракатица

Каракатица

Ночесветка

Удильщик

2.2. Пиридиннуклеотидный тип БЛ -

организмы, которые светятся с помощью бактерий
Слайд 51

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии Сибирский биолюминесцентный червь Fridericia

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Сибирский биолюминесцентный червь Fridericia heliota и структура

люциферина F. heliota.
Слайд 52

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии 2.3. Фотопротеины - биолюминесценция

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

2.3. Фотопротеины - биолюминесценция медузы

эквореи

Экворин — люминесцентныйлюминесцентный белок из медузы эквореи (Aequorea victoria) и некоторых других морских организмов. Впервые выделен в 1961—1962 годах американскими учеными Джонсоном и Шимомурой. Состоит из белковой части (апопротеин) и простетической группы целентеразина Люминесцирует в присутствии ионов кальция.

целентеразин

Слайд 53

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии Фотопротеины Исследование биолюминесцентной системы

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Фотопротеины
Исследование биолюминесцентной системы медузы

Aequorea victoria Осама Шимомурой привели к открытию 2 белков – Са-регулируемого фотопротеина экворина и зеленого флуоресцирующего
белка (GFP).
Биолюминесценция экворина инициируется ионами Са и не зависит от кислорода. Фотопротеин состоит из апопротеина и простетической группы –целентеразина (имидазолпиразина).
Слайд 54

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии Проблема, с которой всегда

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Проблема, с которой всегда сталкиваются специалисты

по биолюминесценции, — получение достаточного количества биомассы для выделения и исследования веществ, участвующих в реакции. Характерно в этом смысле описание сбора материала на биостанции Фрайди Харбор, которое дал Шимомура в своей нобелевской лекции: «Мы начинали собирать медуз в шесть утра, а в восемь - часть нашей группы принималась отрезать кольца (краевые участки зонтика медузы, наиболее ярко светящиеся). Всю вторую половину дня мы проводили, экстрагируя экворин из колец. Потом мы снова собирали медуз с семи до девяти вечера, на завтра. Наша лаборатория выглядела как фабрика по переработке медуз, и пахло в ней медузами».
Слайд 55

Экворин – апопротеин + целентеразин (189 АК, 22 кДа) Целентеразин +

Экворин – апопротеин + целентеразин (189 АК, 22 кДа) Целентеразин + Ca2+

= Целентерамид* + CO2 = Целентеразин + hν (469 нм) Экворин с простетической группой целентеразином, используется как индикатор присутствия ионов Са2+

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Слайд 56

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии Шимомура обнаружил, что выделенный

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Шимомура обнаружил, что выделенный из

медузы и очищенный экворин in vitro излучает синий свет, в то время как живая медуза светится зелёным. Дальнейшие исследования показали, что за зелёное свечение ответственен другой белок — GFP (green fluorescent protein — зелёный флуоресцентный белок), флуоресцирующий зелёным светом под действием голубого излучния экворина.
Слайд 57

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии Осама Шимомура Нобелевскую премию

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Осама Шимомура 

Нобелевскую премию по химии

2008 года получили О.Шимомура, М.Чалфи, Р.Тсьен «за открытие зелёного флуоресцирующего белка и за разработку новых методов исследований на его основе»

Зелёный флуоресцирующий белок (green fluorescent protein, GFP) впервые обнаружили в 1962 году в организме медузы Aequorea victoria.

Медуза Aequorea victoria (а) обитает в Тихом океане, у западного побережья Северной Америки. Её биолюми-несцентные органы расположены по краю «зонтика» (б, в).
Зелёный флуоресцирующий белок состоит из 238 аминокислот (27 кДа). Аминокислотная цепочка свёрнута в форме «бочки». Внутри расположена хромофорная группа, которая поглощает синий свет, а излучает зелёный.

Слайд 58

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии Структура зеленого флуоресцентного белка

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Структура зеленого флуоресцентного белка (GFP),

выделена хромофорная группа – циклический трипептид Ser65-Tyr66-Gly67. Флуоресцентные белки имеют бочкообразную структуру, состоящую из плотно подогнанных 11 β-листов, хорошо экранирующих от внешней среды хромофорную группу. Превращения, происходящие с хромофорной группой внутри этой макромолекулы при освещении определенными длинами волн, лежат в основе фотофизических свойств фотобелков.
Слайд 59

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Слайд 60

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Слайд 61

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии Скульптурная композиция, посвящённая GFP (Вашингтон, США).

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Скульптурная композиция, посвящённая GFP (Вашингтон,

США).
Слайд 62

GFP – флуоресцентная метка для изучения экспрессии клеточных белков ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

GFP – флуоресцентная метка для изучения экспрессии клеточных белков

ФГОУ ВПО ЮФУ

каф. биохимии и микробиологии
Слайд 63

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии Разноцветные GFP-подобные бели коралловых полипов

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Разноцветные GFP-подобные бели коралловых полипов

Слайд 64

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии Визуализация различных компонент живых клеток с помощью флуоресцентных белков.

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Визуализация различных компонент живых клеток

с помощью флуоресцентных белков.
Слайд 65

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии Клеточный белок актин, меченный

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Клеточный белок актин, меченный красным

флуоресцирующим белком (RFP), выглядит под флуоресцентным микроскопом как изящная пирамидка.

Только что синтезированный в клетке рецепторный белок LAMP2 светится голубым, аппарат Гольджи — зелёным, а рецепторные белки дают красную флуоресценцию.

Внутри клетки на фоне зелёного свечения клеточной цитоплазмы видны красные нити белка тубулина.

Слайд 66

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии Американские ученые создали котов,

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Американские ученые создали котов,

невосприимчивых к кошачьему вирусу иммунодефицита (ВИК). Чтобы посмотреть, насколько ген, обеспечивающий невосприимчивость, активен в разных клетках животного, исследователи добавили к нему ген флуоресцирующего белка, благодаря которому генно-инженерные коты в ультрафиолетовых лучах светятся зеленым светом.
С помощью вирусного вектора внедрили в ДНК кошачьей яйцеклетки ген противовирусного фактора макаки TRIMCyp, снабжающего клетки устойчивостью к вирусу иммунодефицита. Чтобы проверить, не используя сложных инструментальных методик, насколько этот ген будет активен в различных тканях трансгенных животных, ученые добавили к нему ген зеленого флуоресцирующего белка медузы Aequorea victoria.

Зеленые кошки не болеют СПИДом

Слайд 67

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии Поросенок со встроенным геном

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Поросенок со встроенным геном желтого

белка

Головастики африканской шпорцевой лягушки — нормальный
(справа) и генетически модифицированный

Детеныш макака резуса со встроенным геном GFP

Слайд 68

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии Флуоресцентное «творчество». А. «Рисунок»

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Флуоресцентное «творчество».
 А. «Рисунок» бактериями, экспрессирующими гены

различных флуоресцентных белков, на чашке петри.
Б. Мыши, несущие ген зеленого флуоресцентного белка, и обычные мыши.
Слайд 69

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии Пространственные структуры белка miniSOG

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Пространственные структуры белка miniSOG и

его активного центра

При облучении синим светом miniSOG производит синглетный кислород, чрезвычайно токсичный для клеток. 

Фототоксический флуоресцентный белок miniSOG генно-инженер-ными методами получен из домена рецептора синего света растений.

Слайд 70

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии Апоптотическая гибель клеток HeLaKyoto,

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Апоптотическая гибель клеток HeLaKyoto,

содержащих miniSOG в митохондриях. Видны специфические для апоптоза пузырьковые структуры.

miniSOG является эффективным генетически кодируемым фотосенсибилизатором, вызывающим гибель клеток в ответ на облучение.

Слайд 71

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии Направленный апоптоз клеток с

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Направленный апоптоз клеток с помощью

белка KillerRed, экспрессированного в митохондриях

KillerRed (красный киллер) - флуоресцентный мутант красного белка из антомедузы, облучение которого в клетках бактерий приводит к их массовой гибели. Его индуцируемая светом токсичность определяется продукцией АФК.
KillerRed - фотосенсетайзер. При облучении зеленым светом он теряет способность флуоресцировать и начинает продуцировать АФК.

Слайд 72

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Слайд 73

Биолюминесцентный имиджинг (БИ) БИ основан на реакции окисления люциферазой субстрата, которая

Биолюминесцентный имиджинг (БИ)

БИ основан на реакции окисления люциферазой субстрата, которая сопровождается

испусканием кванта света.
ДНК, кодирующую люциферазу, встраивают в геном целевых клеток, а субстрат вводится системно.
БИ с использованием маркера luc2 - быстрый, крайне чувствительный и неинвазивный метод исследования, в том числе и онкологических процессов.
Продемонстрирована возможность изучения :
- генной экспрессии,
- активности клеточных рецепторов,
- путей сигнальной передачи,
- процессинга РНК,
- белок-белковых взаимодействий,
- жизнедеятельности стволовых клеток,
- процесса апоптоза

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Слайд 74

4. Активированная ХЛ Химические активаторы ХЛ – это соединения, вступающие в

4. Активированная ХЛ

Химические активаторы ХЛ – это соединения, вступающие в

химические реакции с активными формами кислорода (АФК) или органическими радикалами R•, в ходе которых образуются продукты в возбужденном состоянии.
R• + А → РА* → РА + hν
Активаторы: люминол – 3-аминофталевый гидразид

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Слайд 75

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии Биофизика зрительного восприятия 1877

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии
Биофизика зрительного восприятия
1877 г. -

Франц Болл открыл зрительный пурпур – родопсин сетчатки глаза, наблюдая выцветание сетчатки лягушки при освещении.
1967 г. – Джордж Уолд - Нобелевская премия по физиологии и медицине «за открытия, связанные с первичными физиологическими и химическими зрительными процессами»
Слайд 76

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии Механизм зрительного восприятия. Строение глаза.

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Механизм зрительного восприятия. Строение глаза.

Слайд 77

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии Строение сетчатки и зрительной клетки-фоторецептора - палочки

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Строение сетчатки и зрительной клетки-фоторецептора

- палочки
Слайд 78

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии Механизм зрительного восприятия. Строение палочки.

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Механизм зрительного восприятия. Строение палочки.

Слайд 79

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии Механизм зрительного восприятия. Строение глаза и сетчатки .

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Механизм зрительного восприятия. Строение глаза

и сетчатки .
Слайд 80

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Слайд 81

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии Пространственная структура зрительного родопсина

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Пространственная структура зрительного родопсина

Слайд 82

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии Лауреаты Нобелевской премии 2012

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Лауреаты Нобелевской премии 2012 г.

по химии «за раскрытие подробной схемы того, как работают рецепторы, связанные с G-белками (GPCRs)»

Роберт Лефковиц

Брайан Кобилка

Слайд 83

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии Механизм зрительного восприятия. Строение

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Механизм зрительного восприятия. Строение ретиналя.

Помимо

белковой части – опсина, молекула родопсина включает остаток
11-цис-ретиналя, связанный ковалентно с
ε- аминогруппой остатка лизина. Родопсин обладает характерным спектром поглощения при 500 нм.
Поглощение молекулой кванта света индуцирует изомеризацию 11-цис-ретиналя в полностью транс-форму. В результате изменяется геометрия ретиналя, а спустя 10 мс происходит аллостерический переход родопсина в его активную форму
Слайд 84

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии Цикл фотопревращений родопсина.

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Цикл фотопревращений родопсина.

Слайд 85

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Слайд 86

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Слайд 87

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии Схема активации зрительного каскада

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Схема активации зрительного каскада

Слайд 88

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Слайд 89

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Слайд 90

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Слайд 91

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Слайд 92

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Слайд 93

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии Пурпурная мембрана и бактериородопсин

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Пурпурная мембрана и бактериородопсин

Светозависимый синтез

АТФ в клетках H. halobium

В 1971 году В. Стоккениус и Д. Остер-хельт выделили из галофильных бактерий Halobacterium halobium хромопротеид интенсивного пурпурного цвета.

В качестве хромофорной части группы бактериородопсин содержит 13-цис и транс-ретиналь. Бактериородопсин выполняет роль светозависимого протонного насоса, создающего градиент ионов водорода, энергия которых используется для синтеза АТФ

Слайд 94

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии Пруды на юге Мертвого моря с галобактериями

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Пруды на юге Мертвого моря

с галобактериями
Слайд 95

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии Бактериородопсин в мембране (а

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Бактериородопсин в мембране (а -

вид вдоль мембраны, б - вид на мембрану сверху). Цилиндрами показаны семь спиралей этого белка. Показаны и соединяющие эти спирали петли, а также (голубым цветом) молекула ретиналя, прикрепленная внутри бактериородопсина.    
Слайд 96

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии Структура бактериородопсина и путь протона

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Структура бактериородопсина и путь протона

Слайд 97

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии Механизм перекачивания протонов за

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Механизм перекачивания протонов за счет

энергии света у H. halobium
Слайд 98

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Слайд 99

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии Технические приложения бактериородопсина (проекты):

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Технические приложения бактериородопсина (проекты):
протонный транспорт:
генерация

АТФ в реакторах;
опреснение морской воды;
генерация электрической энергии из света;
фотоэлектрические применения:
ультрабыстрая световая детекция;
искусственная сетчатка;
детекция подвижности;
фотохромные применения:
хранение информации:
2D-носители;
3D-носители;
голографические носители;
различные применения:
детекция радиации;
биосенсорные приложения.
Слайд 100

Роль синглетного кислорода 1О2 1. Важный путь образования 1О2 – фотодинамические

Роль синглетного кислорода 1О2

1. Важный путь образования 1О2 – фотодинамические

реакции с участием пигментов - сенсибилизаторов.
Токсичность пигментов и красителей, которая появляется на свету и в присутствии кислорода, называется фотодинамическим действием.
2.Вызывает развитие фотодинамических болезней человека, животных, растений (гиперицизм, фагопиризм, порфирии, церкоспороз).
3.Создание новых медицинских технологий - фотодинамическая терапия рака (Т.Догерти, 1970); внутривенное лазерное облучение крови (ВЛОК).
Фотосенсибилизаторы - это вещества, которые способны "усиливать" действие света за счет передачи его энергии другим веществам и тем самым запускать цепь различных физических и химических процессов.
Слайд 101

Фотодинамические болезни 1. Порфирии – клинические расстройства, связанные с нарушениями в

Фотодинамические болезни
1. Порфирии – клинические расстройства, связанные с нарушениями в синтезе

гема, что приводит к появлению необычно большого количества фотосенсибилизаторов - порфиринов в крови, тканях и моче.


Важнейшие симптомы: сверхчувствительность кожи к свету - эритемы, язвы, желудочно-кишечные расстройства, боли, онемения мускулов. Некоторые формы порфирии поражают ЦНС (недостаток производного порфирина витамина В12 ), диапазон проявлений: от раздражительности и мрачности до полной психической ненормальности.

Слайд 102

протопорфирин Порфирины (ПФ)— самые распространенные пигменты в природе. К ним относятся

протопорфирин

Порфирины  (ПФ)— самые распространенные пигменты в природе. К ним относятся хлорофиллы, гем,

ПФ входят в состав цитохромов и других ферментов
Слайд 103

Зверобой содержит гиперицин - вещество, повышающее чувствительность кожи к видимому свету

Зверобой содержит гиперицин - вещество, повышающее чувствительность кожи к видимому свету

и ультрафиолетовым лучам, вызывает заболевание животных гиперицизм
Слайд 104

Фагопирин Гречиха содержит фагопирин - пигмент, повышающий чувствительность кожи к видимому

Фагопирин

Гречиха содержит фагопирин - пигмент, повышающий чувствительность кожи к видимому свету

и ультрафиолетовым лучам, вызывает заболевание животных фагопиризм
Слайд 105

Церкоспороз листьев (сероватая пятнистость) – поражение растения грибром р.Cercospora (содержит белок

Церкоспороз листьев (сероватая пятнистость) – поражение растения грибром р.Cercospora (содержит белок

церкоспорин, запускающий реакцию фотосенсибилизации и образование АФК).
Слайд 106

Фотодинамическая терапия (ФДТ) – новый способ лечения некоторых видов рака -

Фотодинамическая терапия (ФДТ) – новый способ лечения некоторых видов рака -

активно развивается во многих странах мира

Принцип метода: опухолевые клетки разрушаются под действием активных форм кислорода, которые образуются в фотохимической реакции фотосенсибилизации.

Необходимые условия ФДТ :
свет определенной длины волны,
Фотосенсибилизатор (ФС), избирательно накапливающийся в опухолевых клетках,
кислород.
ФС переносит энергию света на кислород, благодаря чему последний переходит в возбужденное синглетное состояние и вызывает разрушение опухолевых клеток.

Слайд 107

Основные этапы фотодинамической терапии рака.

Основные этапы фотодинамической терапии рака.

Слайд 108

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Слайд 109

Летальные реакции Приводят к гибели организма УФ-излучением. В случае микроорганизмов различают

Летальные реакции

Приводят к гибели организма УФ-излучением. В случае микроорганизмов различают бактериостатический

(клетки живут, но не размножаются) и бактерицидный (клетки гибнут) эффекты.
Фотодинамический эффект – сенсибилизация организма к действию видимого света в присутствии красителя и кислорода. Данный эффект был открыт Оскаром Раабом, студентом профессора Херманна фон Таппайнера в Мюнхенском Фармакологическом и нституте в 1888 г. Суть открытия Рааба состояла в том, что, когда интенсивность света в поле микроскопа была достаточно большой, окрашенные акридином или другими флуоресцирующими красителями клетки парамеции прекращают движение и погибают, причем спектр действия этого эффекта соответствует спектрам поглощения красителей.

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Слайд 110

Фотодеструктивные процессы 1.Действие УФ-излучения на белковые системы 1.1. Фотоионизация ароматических аминокислот

Фотодеструктивные процессы

1.Действие УФ-излучения на белковые системы
1.1. Фотоионизация ароматических аминокислот с образованием

катион-радикала и сольватированного электрона. При распаде катион-радикала возникает нейтральный радикал.
АН + hν = АН* = AH+• + esolv
AH+• = A• + H+
1.2. Фотолиз цистина с разрывом S-S связей и возникновение радикала цистеина – тиильного радикала (CS•)
2.Действие УФ-излучения на нуклеиновые кислоты
2.1. Образование фотодимеров тимина, урацила, цитозина и смешанных димеров.
2. 2. Реакция гидратации урацила и цитозина.
2.3. Разрывы полинуклеотидной цепи ДНК.
2.4. Образование внутримолекулярных ковалентных сшивок между двумя комплементарными цепями ДНК в растворе.
2.5. Фотоденатурация ДНК.
2.6. Индукция сшивок нуклеиновая кислота-белок в составе РНП и ДНП.

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии

Слайд 111

3.Действие УФ-излучения на липиды и биологические мембраны. 3.1. Перекисное фотоокисление липидов.

3.Действие УФ-излучения на липиды и биологические мембраны.

3.1. Перекисное фотоокисление липидов.
3.2.

Повышение проницаемости биомембран для различных веществ, и прежде всего для ионов.

ФГОУ ВПО ЮФУ каф. биохимии и микробиологии