Селекция3а

Примеры

Двоичные признаки
присутствие/ отсутствие болезни
Количественные признаки
Давление крови
Время выживания
Масса опухоли
И т.д.

QTL

QTL = основные гены, контролирующие количественные признаки
     Результат - непрерывные фенотипические

Скрещивание

P1 -- NOD

P2 -- C57BL/6

F1 -- Agouti coat

Скрещивание

P1

P2

X

F1

F1

X

F2

Распределение Y : один двуаллельный локус

Обратное скрещивание

P1

P2

X

F1

P1

X

BC1

QTL

АА и аа индивидуумы могут визуально не различаться
Некоторые линии АА будут

QTL. Эффект

Аддитивный эффект одного аллеля QTL = a
Среднее значение признака в

Графически

QTL. Эффект

Маркеры ДНК могут быть использованы
для картирования полезных генов с

QTL. Эффект

Таким образом, R -- эффект маркера М
является функцией:
(1) расстояния

QTL. Эффект

Линии ММ легко отделяются от линий mm,
но линии АА

Маркеры ДНК применяются для картирования полезных генов с использованием частот рекомбинации

Все эксперименты по картированию на основе маркеров имеют одну и ту

IRRI: Planning Breeding Programs for Impact

Выбор родителей, отличающихся по признаку
Сканирование двух

Стратегия картированияQTL: одномаркерный анализ

IRRI: Planning Breeding Programs for Impact

Измерение вклада QTL в σP2

IRRI: Planning Breeding Programs for Impact

Измерение вклада маркера в σP2

Наследуемость в широком смысле для эксперимента, в котором обнаружен один QTL

Наследуемость в узком смысле (аддитивная) для эксперимента, в котором обнаружен один

Проблемы с одномаркерным анализом:
Плохая точность определения позиции QTL из-за рекомбинации между

Маркируемый интервал = интервал между двумя маркерами
Методы отображения интервалов используют информацию

Маркеры ДНК могут быть использованы для картирования полезных генов с использованием

Продукты двойного кроссинговера выглядят как родительские типы, что приводит к недооценке

LOD 2 означает, что 100 раз более вероятно, что QTL находится

Для того, чтобы быть полезным в реальной селекции, интересующий нас ген

QTL картирование -- локализация генов, влияющих на количественные признаки, используя молекулярные

До сих пор только успешные гены устойчивости к болезням и стрессоустойчивости

Литература

Kearsey, M.J. and Pooni, H.S. 1996. The genetical analysis of quantitative

Многомерная наследуемость

H = GP-1

Многомерный аналог коэффициента наследуемости
Lande R (1979). Quantitative genetic

Родители (X) Потомки (Y)

P = RX/X

G = RX/Y

Поиск осей с максимальной наследуемостью
(в узком смысле)
Ott J, Rabinowitz D (1999).

Расположение центроидов родительских и гибридных выборок
в многомерном пространстве признаков
при аддитивно-доминантной

F1 - F# – ось гетерозиготности H
P1 - P2 – ось

Материал

Родственные связи

Родственные связи

Коэффициенты корреляции родителей с потомками
по первым пяти компонентам
с максимальной аддитивной наследуемостью
(выделены

Коэффициент наследуемости

через корреляции “родитель-потомок”:

один родитель - потомок

(в случае отсутствия

Расположение семей на плоскости первых двух компонент
аддитивной наследуемости

Корреляция между родителями и детьми
по первой компоненте аддитивной наследуемости

Корреляция между родителями (ассортативность)
по первой компоненте аддитивной наследуемости

Корреляция между дедушками и бабушками
по первой компоненте аддитивной наследуемости

Корреляция между родителями (два поколения)

После учета ассортативности выявилось,
что четыре компоненты шкалирования
имеют значимые коэффициенты наследуемости