Особо выделяется функция взимания таможенных платежей — таможенных пошлин и таможенных сборов. Наряду с внутренними налогами и
доходами от управления государственным имуществом таможенные платежи являются одним из основных видов доходов федерального бюджета.
ФТС России сообщает, что за сентябрь 2012 года сумма доходов федерального бюджета, администрируемых таможенными органами, составляет 501,77 млрд. рублей.
Таким образом, за девять месяцев 2012 года сумма доходов федерального бюджета, администрируемых таможенными органами, составила 4726,36 млрд. рублей или 71,8% к прогнозным показателям доходов федерального бюджета на 2012 год