Содержание
- 2. Предмет эпигенетики В 1942 г. эмбриологом Конрадом Уоддингтоном был введен термин "эпигенетика", произошедший от объединения терминов
- 3. Развитие как эпигенетический процесс: генотип+эпигенотип+внешняя среда = определенный фенотип «эпигенетический фон лежит в основе развивающегося организма
- 4. По Уоддингтону процесс онтогенеза - это пространство возможностей - "эпигенетический ландшафт", представляющий собой набор эпигенетических траекторий,
- 6. Молекулярные основы эпигенетики Rollin Hotchkiss в 1948 году впервые выделил 5-метилцитозин в составе ДНК из тимуса
- 7. Молекулярные основы эпигенетики Б.Ф. Ванюшин 16 февраля 1935 Robin Holliday Впервые определил природу метилируемых последовательностей ДНК
- 9. Американцам Эндрю Файру и Крэйгу Мэллоу “за открытие фундаментального явления РНК-интерференции - подавления экспрессии генов с
- 10. В 1990 г. Робин Холлидей дал более конкретное определение эпигенетики. «Исследование механизмов временного и пространственного контроля
- 11. Геном/клетка содержит информацию двух видов – генетическую и эпигенетическую. Генетическая информация – руководство по созданию живого
- 12. Эпигенетическая регуляция - наследственные и ненаследственные изменения в экспрессии конкретного гена без каких-либо соответствующих структурных изменений
- 13. Эпигенетические механизмы регуляции экспрессии генов можно определить как наследственный код, отличный от геномной последовательности нуклеотидов, который
- 15. Уровни эпигенетической регуляции
- 17. Метилирование ДНК вовлечено в широкий круг биологических процессов, которые включают регуляцию репликации и сплайсинга ДНК, структуры
- 18. Схема метилирования цитозина Метилирование цитозиновых остатков (обратимая ковалентная модификация ДНК, при которой цитозиновый остаток метилируется в
- 21. Фенотипические проявления мутаций ДНК-метилтрансфераз и метилсвязывающих белков
- 22. Синдром Ретта MeCP2 / метил-CpG/CpH связывающий белок, Xq28
- 23. CpG-островки присутствуют в промоторных районах 60% генов, составляют от 0,5 до 1,5 т.п.н., содержание С +
- 24. Пассивное деметилирование ДНК Белки ТЕТ получили свое название за счет ten-eleven translocation (t(10;11)(q22;q23), обнаруженной в отдельных
- 25. Активное деметилирование ДНК Белки семейства ТЕТ могут последовательно окислять 5-метилцитозин до 5-гидроксиметилцитозина (5hmC), затем до 5-формилцитозина
- 26. Метил-связывающий белок MeCP2, которому достаточно одного метилированного CpG для связывания, реагирует также и на СрН. Относительная
- 27. Методы анализа метилирования 1. Метилчувствительная ПЦР (NotI, EagI, SacII, HpaII, HhaI) аналитическая чувствительность - 1: 2000;
- 28. Метилчувствительная ПЦР Схема МЧ-ПЦР Анализ метилирования гена р16 методом МЧ-ПЦР в образцах ОЛ.
- 29. Метилспецифическая ПЦР Схема МС-ПЦР Анализ метилирования гена р16 методом МС-ПЦР в образцах ОЛ. При обработке геномной
- 30. Сравнение методов МЧ-ПЦР и МС-ПЦР. МС-секвенирование с гетерогенным характером метилирования сайта узнавания рестриктазы HpaII (образец 18).
- 31. Анализ метилирования на биологических микрочипах
- 32. Схема чипа для определения метилирования генов, вовлеченных в канцерогенез
- 33. Гибридизация не гидролизованной метилчувствительными ферментами рестрикции ДНК; гибридизация контрольной гидролизованной ДНК; гибридизация клинических образцов
- 34. Синими стрелками указаны позиции метилированных (немодифицированных) остатков цитозина, красно-синяя стрелка указывает на гемиметилированный остаток цитозина. Метил-специфическое
- 35. Механизмы инактивации гена в результате метилирования промоторной области 1. Метильные группы нарушают ДНК-белковые взаимодействия, выступая в
- 38. Транскрипционные факторы могут участвовать в регуляции экспрессии вне зависимости от статуса метилирования ДНК
- 40. Характеристики эу- и гетерохроматина Хроматин существует в двух основных состояниях. Эухроматин деконденсирован, содержит основную массу активно
- 41. Основной структурной единицей хроматина является нуклеосома. Она представляет собой белковый октамер, образованный двумя молекулами каждого из
- 42. Гистоновый код - разнообразный набор модификаций N-концевых районов гистоновых белков (метилирование, ацетилирование, фосфорилирование, рибозилирование, убиквитинилирование, сумоилирование),
- 43. Гистоновый код
- 44. К маркерам активации гистонов, которые связаны с эухроматином и повышением генной экспрессии, можно отнести ацетилирование лизинов
- 45. Метилирование Н3К9, Н3К27 и Н4К20 является основной модификацией гистонов, соответствующей гетерохроматину и крупномасштабной репрессии транскрипции. При
- 47. Модификации гистонов в нормальной клетке
- 48. Повышенный уровень ацетилирования гистонов стимулирует транскрипцию, а деацетилирование приводит к полной инактивации генов. Ацетилирование/деацетилирование может быть
- 52. ВИДЫ НЕКОДИРУЮЩИХ РНК
- 53. Выявлен и охарактеризован целый ряд функциональных классов некодирующей РНК: - рибосомальная (r), - транспортная (t), -
- 54. ВИДЫ НЕКОДИРУЮЩИХ РНК
- 55. МАЛЫЕ НЕКОДИРУЮЩИЕ БЕЛОК РНК snРНК – малые ядерные РНК (или сплайсосомная РНК) являются ключевой составляющей процесса
- 56. Кольцевые РНК, 3’ -> 5’ транскрипция! Генез и функции
- 57. днРНК (>200 н.). Интронные, межгенные, антисмысловые, не имеют длинной открытой рамки считывания (>200 кодонов) и поли
- 58. Классификация днРНК
- 59. Механизмы и функции днРНК
- 60. НЕКОДИРУЮЩИЕ БЕЛОК РНК
- 61. Некодирующие РНК
- 62. ХАРАКТЕРНЫЕ ПРИЗНАКИ miРНК И siРНК. Величина - 19-25 н. miРНК образуются из коротких (70-100 н.) шпилечных
- 64. Около 40% miR человека кластерировано и экспрессируется совместно
- 65. miРНК в составе RISC ингибируют трансляцию в результате: 1) интерферен-ции с факторами инициации трансляции; 2) нарушения
- 66. РНКаза III, называемая Drosha расщепляет шпильки РНК, содержащие большие (≥10 нуклеотидов) концевые петли и вырезает предшественники
- 67. Синдром ДиДжорджи Мутации/делеции DGCR8 - белка, связывающего dsРНК в комплексе с РНКазаШ (Drosha)
- 70. Цитоплазматическая РНКаза III — Dicer осуществляет дальнейший процессинг. После расщепления нуклеазой Dicer короткие дуплексы РНК встраиваются
- 72. Образованный дуплекс miРНК раскручивается с помощью хеликаз, одна из его цепей входит в состав РНК-зависимого комплекса
- 74. Возможные механизмы инактивации трансляции с использованием miРНП комплексов
- 75. Механизмы действия miРНК и siРНК
- 77. Интегральная схема эпигенетической инактивации экспрессии гена
- 78. miРНК и siРНК - инструмент избирательного временного подавления экспрессии гена. Потенциальная терапия социально значимых заболеваний (инфекционных,
- 79. miРНК активно участвуют в эмбриональном развитии. В процессе формирования конечностей участвуют miРНК lin-41, let-7 и miR-196;
- 80. миРНК обнаружены в Hox-кластерах. В miR-196 выявлена протяженная консервативная последовательность, комплементарная HoxA7, HoxB8, HoxC8 и HoxD8.
- 81. Эктопическая гиперэкспрессия miR-181 у мыши в гемопоэтических стволовых клетках/клетках-предшественниках увеличивает процент клеток B-лимфоцитарной линии как in
- 82. Тиксельская порода овец (Бельгия) знаменита своей мясистостью. Причиной этого признака является полиморфный вариант +6723G - A
- 83. Возможное использование miРНК и siРНК Практическое: - могут являться маркерами какого-либо патологического процесса (злокачественного, неврологического, аутоиммунного
- 85. Развитие как эпигенетический процесс: генотип+эпигенотип+внешняя среда = определенный фенотип «эпигенетический фон лежит в основе развивающегося организма
- 86. - Если вы хотите использовать термин «эпигенетика» для описания клеточной памяти, поддержания гомеостаза при отсутствии внешних
- 88. Да здравствует функциональная геномика!
- 89. Варианты метилспецифической ПЦР в реальном времени. А – MethyLight. Б – Heavy Methyl. CG – зонд,
- 90. Rdp1 - РНК-зависимая РНК полимераза, Dsr1 – Дайсер, Pol II – РНК полимераза, Ago1 – Аргонафт,
- 91. днРНК действуют как на уровне транскрипции, так и посттранскрипционно. На уровне транскрипции днРНК рекрутируют факторы транскрипции
- 92. МАЛЫЕ НЕКОДИРУЮЩИЕ БЕЛОК РНК snРНК – малые ядерные РНК (или сплайсосомная РНК) являются ключевой составляющей процесса
- 93. МАЛЫЕ НЕКОДИРУЮЩИЕ БЕЛОК РНК PASRs – малые РНК, ассоциированные с промоторами. РНК-опосредованная инактивация/активация транскрипции? TSSa-РНК –
- 94. днРНК действуют как на уровне транскрипции, так и посттранскрипционно. На уровне транскрипции днРНК рекрутируют факторы транскрипции
- 97. Профессор фармакологии Моше Сциф (Монреаль/ Канада) одним из первых связал эпигенетическиe маркеры (гипометилирование и гиперметилирование генетической
- 100. Скачать презентацию