Нуклеозиды, нуклеотиды, нуклеиновые кислоты: функции и обмен

Содержание

Слайд 2

Нуклеотиды Нуклеотиды – это низкомолекулярные вещества, которые выполняют функции биорегуляторов (НАД,

Нуклеотиды

Нуклеотиды – это низкомолекулярные вещества, которые выполняют функции биорегуляторов (НАД, НАДФ,

ФМН, ФАД, АТФ, АДФ, АМФ и др.), либо входят в состав полимерных молекул ДНК и РНК (пуриновые и пиримидиновые рибо- и дезоксирибонуклеотиды).
Слайд 3

Азотистые основания При гидролизе нуклеиновых кислот образуются пуриновые (аденин, гуанин) и

Азотистые основания

При гидролизе нуклеиновых кислот образуются пуриновые (аденин, гуанин) и пиримидиновые

(тимин, цитозин, урацил) основания, углевод (рибоза или дезоксирибоза) и фосфорная кислота.
Отличиями в строении ДНК и РНК являются: в ДНК углевод дезоксирибоза, в РНК – рибоза; в ДНК содержится тимин, в РНК – урацил.
Слайд 4

Слайд 5

Нуклеозиды, нуклеотиды Нуклеозид - азотистое основание + углеводный компонент Нуклеотид -

Нуклеозиды, нуклеотиды

Нуклеозид - азотистое основание + углеводный компонент
Нуклеотид - азотистое

основание + углеводный компонент + фосфорная кислота (1,2,3 остатка)
Слайд 6

Нуклеозид Нуклеотид

Нуклеозид

Нуклеотид

Слайд 7

Слайд 8

Пуриновые азотистые основания, образующиеся в процессе переваривания нуклеиновых кислот в кишечнике,

Пуриновые азотистые основания, образующиеся в процессе переваривания нуклеиновых кислот в кишечнике,

в дальнейшем практически не используются.
Поэтому их синтез осуществляется de novo из низкомолекулярных предшественников, продуктов обмена углеводов и белков.
Основное место синтеза – печень. В эритроцитах, лейкоцитах и мозге синтез не происходит.
Слайд 9

Биосинтез пуринов На основе 5-фосфорибозил-1-пирофосфата строится имидазольное кольцо, затем – пуриновое.

Биосинтез пуринов

На основе 5-фосфорибозил-1-пирофосфата строится имидазольное кольцо, затем – пуриновое.
Общий предшественник

пуриновых нуклеотидов – инозинмонофосфат,
ИМФ превращается в АМФ и ГМФ
10-20% аденина и гуанина используются в готовом виде (в эмбриогенезе, у взрослых – в нервной ткани).
Слайд 10

Происхождение атомов пуринового кольца

Происхождение атомов пуринового кольца

Слайд 11

Синтез АМФ и ГМФ Синтез АМФ и ГМФ осуществляется из ИМФ.

Синтез АМФ и ГМФ

Синтез АМФ и ГМФ осуществляется из ИМФ.
Для

синтеза ГМФ необходимы НАД+, АТФ, глутамин
Для синтеза АМФ необходимы аспарагиновая кислота, ГТФ, Mg2+
Слайд 12

Слайд 13

Регуляция синтеза пуриновых нуклеотидов Синтез пуриновых нуклеотидов тормозится конечными продуктами АМФ

Регуляция синтеза пуриновых нуклеотидов

Синтез пуриновых нуклеотидов тормозится конечными продуктами АМФ и

ГМФ по принципу обратной связи путем ингибирования амидотрансферазной реакции.
Для синтеза АМФ необходим ГТФ, для синтеза ГМФ – АТФ, что обеспечивает баланс синтеза этих нуклеотидов.
Слайд 14

Особенностью синтеза пиримидиновых нуклеотидов является то, что вначале происходит синтез пиримидинового

Особенностью синтеза пиримидиновых нуклеотидов является то, что вначале происходит синтез пиримидинового

основания, а затем к нему присоединяется остаток рибозы
Слайд 15

Биосинтез пиримидинов Биосинтез пиримидинов начинается с построения гетероцикла с участием NH3,,СО2,глу,

Биосинтез пиримидинов

Биосинтез пиримидинов начинается с построения гетероцикла с участием NH3,,СО2,глу, асп.
Общий

предшественник пиримидинов оротовая кислота соединяется с 1-фосфорибозил-5-пирофосфатом, образуя ОМФ ? УМФ.
УМФ + глн ? ЦМФ.
Тимидиловый нуклеотид образуется только на базе дезоксирибозы из dУДФ или dЦДФ.
Слайд 16

Происхождение атомов азота пиримидинового кольца

Происхождение атомов азота пиримидинового кольца

Слайд 17

Катаболизм пуринов АМФ ?аденозин ?инозин ? гипоксантин ? ксантин ? мочевая

Катаболизм пуринов

АМФ ?аденозин ?инозин ? гипоксантин ? ксантин ? мочевая кислота
ГМФ

? гуанозин ? гуанин ? ксантин ? мочевая кислота
Ключевой фермент – ксантиноксидаза (кофакторы – ФМН+, Мо2+, Fe2+), конкурентный ингибитор – аллопуринол
Накопление мочевой кислоты – камни мочевыводящих путей; подагра.
Слайд 18

Катаболизм пиримидинов ЦМФ ? УМФ ? урацил ТМФ ? тимин Восстановление

Катаболизм пиримидинов

ЦМФ ? УМФ ? урацил ТМФ ? тимин
Восстановление и гидролиз пиримидинов

? раскрытие кольца ? отщепление NH3 и CO2 с образованием β-аланина, а в случае распада тимина – β-аминобутирата.
Нарушение распада пиримидиновых нуклеотидов ? накопление НТФ в эритроцитах ? гемолиз; нарушения нервной системы.
Слайд 19

Синтез дезоксинуклеотидов Все нуклеотиды образуются с участием фосфорибозилпирофосфата. Дезоксирибонуклеотиды образуются при

Синтез дезоксинуклеотидов

Все нуклеотиды образуются с участием фосфорибозилпирофосфата.
Дезоксирибонуклеотиды образуются при восстановлении рибозы

до дезоксирибозы в составе готовых нуклеотидов.
Ферменты рибонуклеотидредуктаза (Fe2+), тиоредоксин редуктаза (глутатион, НАДФH).
Слайд 20

Нуклеиновые кислоты

Нуклеиновые кислоты

Слайд 21

НУКЛЕОПРОТЕИНЫ Нуклеопротеины – сложные белки, которые состоят из белковой части и

НУКЛЕОПРОТЕИНЫ

Нуклеопротеины – сложные белки, которые состоят из белковой части и небелковой

части – простетической группы, которая представлена нуклеиновыми кислотами.
Существует 2 типа нуклеопротеинов, которые отличаются по составу, размеру и физико-химическим свойствам: дезоксирибонуклеопротеины (простетическая группа ДНК) и рибонуклеопротеины (простетическая группа РНК).
Дезоксирибонуклеопротеины локализованы преимущественно в ядре клеток и в митохондриях. Рибонуклеопротеины – в цитоплазме, ядре и ядрышках.
Слайд 22

ФУНКЦИИ ДНК (ПО А. ЛЕНИНДЖЕPУ) хpанение запаса генетической инфоpмации, необходимой для

ФУНКЦИИ ДНК (ПО А. ЛЕНИНДЖЕPУ)

хpанение запаса генетической инфоpмации, необходимой для кодиpования

стpуктуpы всех белков и всех РНК каждого вида оpганизма;
pегуляция во вpемени и пpостpанстве биосинтеза компонентов клеток и тканей;
опpеделение деятельности оpганизма в течение его жизненного цикла;
обеспечение индивидуальности данного оpганизма.
Слайд 23

ВИДЫ ДНК ядерные (хромосомные) ДНК; ДНК плазмид; ДНК хлоропластов; ДНК митохондрий; ДНК вирусов.

ВИДЫ ДНК

ядерные (хромосомные) ДНК;
ДНК плазмид;
ДНК хлоропластов;
ДНК митохондрий;
ДНК

вирусов.
Слайд 24

Виды РНК матричные (информационные) транспортные рибосомальные

Виды РНК

матричные (информационные)
транспортные
рибосомальные

Слайд 25

Пространственная структура нуклеиновых кислот Первичная структура – последовательность нуклеотидов Вторичная структура

Пространственная структура нуклеиновых кислот

Первичная структура – последовательность нуклеотидов
Вторичная структура – двойная

спираль ДНК (А,В,С,Д – переходные конформации); «петлеобразная» структура РНК
Третичная структура – суперспирали, кольцевые структуры
Слайд 26

Правила Чаргаффа Количество пуриновых оснований равно количеству пиримидиновых оснований: А +

Правила Чаргаффа
Количество пуриновых оснований равно количеству пиримидиновых оснований:
А + Г

= Ц + Т или (А + Г)/(Ц + Т)=1
Количество аденина и цитозина равно количеству гуанина и тимина:
А + Ц = Г + Т или (А + Ц)/(Г + Т)=1
Количество аденина равно количеству тимина, а количество гуанина равно количеству цитозина:
А = Т и Г = Ц или А/Т=1; Г/Ц=1
Коэффициент специфичности, который отражает для эукариот этот коэффициент ниже единицы (0,54 – 0,94), для прокариот – выше единицы.
Слайд 27

ВОДОРОДНЫЕ СВЯЗИ МЕЖДУ АЗОТИСТЫМИ ОСНОВАНИЯМИ

ВОДОРОДНЫЕ СВЯЗИ МЕЖДУ АЗОТИСТЫМИ ОСНОВАНИЯМИ

Слайд 28

ВТОРИЧНАЯ СТРУКТУРА ДНК

ВТОРИЧНАЯ СТРУКТУРА ДНК

Слайд 29

Матричные синтезы

Матричные синтезы

Слайд 30

Виды передачи генетической информации ДНК → ДНК – репликация ДНК →

Виды передачи генетической информации

ДНК → ДНК – репликация
ДНК → РНК

– транскрипция
РНК → белок – трансляция
Слайд 31

Слайд 32

Репликация ДНК Вариант матричного синтеза, представляет собой удвоение цепей ДНК. Матрицей

Репликация ДНК

Вариант матричного синтеза, представляет собой удвоение цепей ДНК. Матрицей служит

каждая из одноцепочечных последовательностей «материнской» ДНК.
Репликация связана с S-периодом клеточного цикла (подготовка клетки к делению).
Механизм репликации – комплементарность и полуконсервативность
Образуются двухроматидные хромосомы, число хромосом не увеличивается!!!
Слайд 33

Слайд 34

Полуконсервативная репликация

Полуконсервативная репликация

Слайд 35

Репликация ДНК Три этапа: инициация, элонгация, терминация (созревание). Репарация ошибок и

Репликация ДНК

Три этапа: инициация, элонгация, терминация (созревание).
Репарация ошибок и повреждений.
В

репликации участвуют: 1) белки-регуляторы 2) ферменты: топоизомеразы, хеликазы, ДНК-полимеразы α, β, ε, Δ и ДНК-лигаза
Слайд 36

Характеристики репликации матричный — последовательность синтезируемой цепи ДНК однозначно определяется последовательностью

Характеристики репликации

матричный — последовательность синтезируемой цепи ДНК однозначно определяется последовательностью материнской

цепи в соответствии с принципом комплементарности;
полуконсервативный — одна цепь молекулы ДНК, образовавшейся в результате репликации, является вновь синтезированной, а вторая — материнской;
идёт в направлении от 5’-конца новой молекулы к 3’-концу;
полунепрерывный — одна из цепей ДНК синтезируется непрерывно, а вторая — в виде набора отдельных коротких фрагментов (фрагментов Оказаки);
начинается с определённых участков ДНК, которые называются сайтами инициации репликации
Необходима затравка (праймер)
Слайд 37

Слайд 38

Ответ ДНК на повреждение Активация контрольной точки клеточного цикла Активация транскрипционной

Ответ ДНК на повреждение

Активация контрольной точки клеточного цикла

Активация транскрипционной программы

Репарация ДНК

Клеточный

метаболизм

Вирусные инфекции

Радиация

Химические
вещества

Апоптоз

Ошибки репликации

Повреждения ДНК

Слайд 39

Репарация ДНК Измененный участок ДНК распознается и удаляется при помощи ферментов

Репарация ДНК

Измененный участок ДНК распознается и удаляется при помощи ферментов ДНК-репарирующих

эндонуклеаз.
ДНК-полимераза I связывается с 3′-концом поврежденной цепи ДНК и заполняет брешь, присоединяя нуклеотиды друг за другом комплементарно неповрежденной цепи ДНК.
ДНК-лигаза сшивает фрагменты ДНК и, тем самым, завершает восстановление структуры ДНК.
Слайд 40

Транскрипция Транскрипция - биосинтез РНК на матрице ДНК Последовательность рибонуклеотидов в

Транскрипция

Транскрипция - биосинтез РНК на матрице ДНК
Последовательность рибонуклеотидов в молекуле РНК

комплементарна последовательности дезоксирибонуклеотидов одной из цепи ДНК.
Цепь ДНК, по которой непосредственно идет транскрипция РНК-молекул, называется кодирующей цепью.
Другую цепь называют некодирующей цепью соответствующего гена.
Слайд 41

Ферменты У эукариот три РНК-полимеразы: I – синтезирует тРНК, II –

Ферменты

У эукариот три РНК-полимеразы: I – синтезирует тРНК, II – мРНК,

III – рРНК. У прокариот одна РНК-полимераза синтезирует все виды РНК.
Транскрипция не связана с определенным этапом клеточного цикла. Она предшествует трансляции – синтезу белка.
Слайд 42

Транскрипция 3 стадии транскрипции: инициация, элонгация, терминация ИНИЦИАЦИЯ синтеза начинается с

Транскрипция

3 стадии транскрипции: инициация, элонгация, терминация
ИНИЦИАЦИЯ синтеза начинается с «узнавания»

полимеразой промоторного сайта (не менее 25 нуклеотидов от начала матрицы).
Промотор (примерно 40 нуклеотидов) ограничен -TATA- и -CAAT- боксами. Их узнают особые белки – регуляторы начала транскрипции.
Слайд 43

Оперон и транскриптон Единицей транскрипции у прокариот является оперон Единицей транскрипции у эукариот транскриптон

Оперон и транскриптон

Единицей транскрипции у прокариот является оперон
Единицей транскрипции у

эукариот транскриптон
Слайд 44

Структура оперона Промотор - место инициации транскрипции, к которому присоединяется фермент

Структура оперона

Промотор - место инициации транскрипции, к которому присоединяется фермент РНК-полимераза;

в ДНК E. coli имеется 2000 промоторов на 4,8×106 пар оснований;
Ген-оператор (или акцепторная зона у эукариот) - место связывания регуляторных белков, например, белка-репрессора;
Структурные гены, включающие информативные участки - экзоны и неинформативные участки - интроны;
Терминатор - последовательность нуклеотидов, сигнализирующая о завершении транскрипции.
Слайд 45

Слайд 46

Посттрансляционная модификация РНК В результате транскрипции образуются три типа предшественников РНК

Посттрансляционная модификация РНК

В результате транскрипции образуются три типа предшественников РНК (первичные

транскрипты): предшественник мРНК, или гетерогенная ядерная РНК (пре-мРНК или гяРНК), предшественники рРНК (прерРНК).
Они представляют собой копию оперона и содержат информативные и неинформативные последовательности.
Образование функционально активных молекул РНК называется процессингом и продолжается после завершения транскрипции.
Слайд 47

Трансляция Перевод генетической информации с кодонов м РНК на аминокислотную последовательность

Трансляция

Перевод генетической информации с кодонов м РНК на аминокислотную последовательность белка

(экспрессия гена).
Генетический код: триплетный, линейный, неперекрывающийся, специфический, универсальный, избыточный, непрерывный.
Соответствие кодонов и аминокислот было расшифровано с помощью синтеза пептидов на искусственных полирибонуклеотидах (ААА-ААА ?лиз–лиз).
Слайд 48

Для перевода нуклеотидного кода в аминокислотную последовательность служат молекулы-адаптеры аминоацил-тРНК: на

Для перевода нуклеотидного кода в аминокислотную последовательность служат молекулы-адаптеры аминоацил-тРНК: на

3’-конце – аминокислота, а в другой части молекулы - триплет нуклеотидов (антикодон), комплементарный кодону мРНК.
Слайд 49

Трансляция для синтеза белка необходимы: 20 аминокислот мРНК Рибосома 50 тРНК

Трансляция

для синтеза белка необходимы:
20 аминокислот
мРНК
Рибосома
50 тРНК (одна тРНК может

связывать несколько кодонов мРНК – эффект «качания» 61)
20 аминоацил-тРНК-синтетаз
АТФ, ГТФ
Белковые факторы регуляции инициации, элонгации, терминации.
Слайд 50

РИБОСОМНЫЙ ЦИКЛ ДЖ.УОТСОНА В начале синтеза полипептидной цепи субъединицы рибосомы объединяются

РИБОСОМНЫЙ ЦИКЛ ДЖ.УОТСОНА

В начале синтеза полипептидной цепи субъединицы рибосомы объединяются на

5’-конце мРНК в функционирующую рибосому, а в конце синтеза диссоциируют на субъединицы.
Для синтеза каждой новой полипептидной цепи необходимо собрать рибосому на 5’-конце мРНК.
С одной мРНК одновременно могут транслироваться несколько полипептидных цепей, каждая своей рибосомой.
Слайд 51

ПЕРЕДАЧА ГЕНЕТИЧЕСКОЙ ИНФОРМАЦИИ ПРИ СИНТЕЗЕ БЕЛКА ДНК: информация о последовательности аминокислот

ПЕРЕДАЧА ГЕНЕТИЧЕСКОЙ ИНФОРМАЦИИ ПРИ СИНТЕЗЕ БЕЛКА

ДНК: информация о последовательности аминокислот в

полипептидной цепи записана в структурных генах в виде последовательности триплетов дезоксирибонуклеотидов.
мРНК: в процессе транскрипции на мРНК создается аналогичная последовательность триплетов рибонуклеотидов (кодонов).
тРНК: каждая из 20 протеиногенных аминокислот включается в 1-4 аминоацил-тРНК, имеющих одинаковый антикодон – триплет рибонуклеотидов, комплементарный соответствующему кодону мРНК.
Слайд 52

Генетический код

Генетический код

Слайд 53

Белоксинтезирующая система клетки мРНК – матрица, на которой записана последовательность аминокислот

Белоксинтезирующая система клетки

мРНК – матрица, на которой записана последовательность аминокислот белка

в виде последовательности триплетов.
Рибосомы (полирибосомы) – место ферментативного соединения аминокислот.
Набор всех типов аа-тРНК (64 типа, по числу кодонов генетического кода).
АТФ, ГТФ, ионы магния, регуляторные и вспомогательные факторы белковой природы.
Слайд 54

Слайд 55

Слайд 56

Слайд 57

Фолдинг и процессинг От синтезированного пептида в цитозоле отщепляется инициирующая аминокислота

Фолдинг и процессинг

От синтезированного пептида в цитозоле отщепляется инициирующая аминокислота (формил)метионин.
Сигнальная

последовательность на N-конце позволяет проникнуть через мембрану ЭПР.
Складывание трехмерной сируктуры с помощью шаперонинов и отбраковка – с помощью белков теплового шока (семейство HSP).
Модификация (гликозилирование, фосфорилирование и пр.).