Строение и свойства ДНК

Июль 26, 2022

Главная
Биология
Строение и свойства ДНК

Содержание

2. План: Стабилизация двойной спирали ДНК Основные физико-химические свойства ДНК Измерение спектров поглощения ДНК Гипохромизм ДНК Денатурация
3. Стабилизация двойной спирали ДНК
4. A•T - 2 водородные связи G•C - 3 водородные связи Водородные связи
5. 2) Стэкинг-взаимодействия Стэкинг ароматических колец азотистых оснований стабилизруется гидрофобными взаимодействиями и дипольными взаимодействиями. Различные последовательности имеют
6. 3) Ионные взаимодействия Основания гидрофобны; PО-2 – гидрофильны, но электростатическое отталкивание дестабилизирует двойную спираль. Для стабилизации
7. Кислотно-основные свойства ДНК – многоосновная кислота, Фосфатные группы определяют заряд. Устойчивость двуцепочечной ДНК является фунцией рН
8. Поглощение в УФ диапазоне
9. Поглощение в УФ диапазоне
10. The absorbance at 260 nm of a DNA solution increases when the double helix is melted
11. Переход ДНК из упорядоченной структуры в неупорядоченную протекает с образованием промежуточных состояний – петлеобразных частично расплетенных
12. Денатурация ДНК заключается в разрыве Н-связей и стэкинг-взаимодействий, что приводит к расплетанию и разделению цепей. (БЕЗ
13. Hyperchromic effect: stacking of nucleotide bases decreases ε. bases in ss absorb more than bases in
14. Кривая плавления Tпл – температура середины перехода ΔТпл – температурный интервал перехода Если бы препараты ДНК
15. Абсцисса точки перегиба, соответствующая половине гиперхромного эффекта, принимается как температура плавления Тпл. Наиболее тугоплавкими являются ДНК,
16. Денатурация ДНК Average base composition (G-C content) can be determined from the melting temperature of DNA
17. Ренатурация ДНК
18. Если свести вместе продукты денатурации целых молекул ДНК, лишь частично совпадающих по нуклеотидным последовательностям, то в
19. Связывание лигандов с ДНК
20. Связывание лигандов с ДНК
22. Скачать презентацию

Слайд 2

План:
Стабилизация двойной спирали ДНК
Основные физико-химические свойства ДНК
Измерение спектров поглощения ДНК
Гипохромизм ДНК
Денатурация

ДНК. Кривые плавления
Определение гиперхромного эффекта ДНК
Ренатурация
Связывание лигандов с ДНК

Слайд 3

Стабилизация
двойной спирали ДНК

Слайд 4

A•T - 2 водородные связи
G•C - 3 водородные связи
Водородные

связи

Слайд 5

2) Стэкинг-взаимодействия
Стэкинг ароматических колец азотистых оснований стабилизруется гидрофобными взаимодействиями и

дипольными взаимодействиями.
Различные последовательности имеют различные стэкинг-взаимодействия,.

Термодинамические параметры могут быть
расcчитаны для различных динуклеотидных шагов.

Слайд 6

3) Ионные взаимодействия
Основания гидрофобны; PО-2 – гидрофильны, но электростатическое отталкивание дестабилизирует

двойную спираль. Для стабилизации необходимы противоионы – одновалентные катионы металлов.

4) Гидратация
Упорядоченная гидратная (связанная) вода
(хребет гидратации в малом желобке).

Слайд 7

Кислотно-основные свойства
ДНК – многоосновная кислота, Фосфатные группы определяют заряд. Устойчивость двуцепочечной

ДНК является фунцией рН в диапазоне от 4 до 11 единиц.
Плотность
нуклеиновых кислот близкая к 1,7, являющаяся следствием значительного содержания фосфора.
Вязкость
Упругие нитевидные молекулы большой длины определяют очень высокую вязкость и её зависимость от молекулярного веса.
Следует учитывать ломкость её молекул даже при небольших градиентах скорости среды.
Оптические свойства
нуклеотиды имеют максимум поглощения света вблизи 260 нм. Вхождение нуклеотидов в состав нуклеиновых кислот практически не изменяет положение максимума, но значительно снижает интенсивность поглощения - гипохромный эффект, обусловлен строго упорядоченным, параллельным расположением плоскостей гетероциклических колец оснований

Физико-химические свойства ДНК

Слайд 8

Поглощение в
УФ диапазоне

Слайд 9

Поглощение в
УФ диапазоне

Слайд 10

The absorbance at 260 nm of a DNA solution increases
when

the double helix is melted into single strands.

Гипохромизм

Слайд 11

Переход ДНК из упорядоченной структуры в неупорядоченную протекает с образованием промежуточных

состояний – петлеобразных частично расплетенных структур

Слайд 12

Денатурация ДНК заключается в разрыве Н-связей и стэкинг-взаимодействий, что приводит к

расплетанию и разделению цепей. (БЕЗ РАЗРЫВА КОВАЛЕНТНЫХ СВЯЗЕЙ!) под действием температуры или рН.
Гипохромизм двуцепочечных нуклеиновых кислот обусловливает при денатурации обратный гиперхромный эффект.

Денатурация ДНК

Слайд 13

Hyperchromic effect:
stacking of nucleotide bases decreases ε.
bases in ss

absorb more than bases in ds.
absorbance increases as DNA denatures.

Гиперхромизм

Слайд 14

Кривая плавления
Tпл – температура середины перехода
ΔТпл – температурный интервал перехода
Если

бы препараты ДНК представляли собой смесь абсолютно одинаковых молекул, то кривая плавления образовала бы очень резкий переход – почти ступеньку – при температуре плавления. В действительности регистрируются довольно отлогие S-образные кривые, почти симметричные в точке перегиба.

Слайд 15

Абсцисса точки перегиба, соответствующая половине гиперхромного эффекта, принимается как температура плавления

Тпл.
Наиболее тугоплавкими являются ДНК, богатые ГЦ-парами, а легче всего плавятся ДНК АТ-типа.

Кривая плавления

Слайд 16

Денатурация ДНК
Average base composition
(G-C content) can be determined from the

melting temperature of DNA

Слайд 17

Ренатурация ДНК

Слайд 18

Если свести вместе продукты денатурации целых молекул ДНК, лишь частично совпадающих

по нуклеотидным последовательностям, то в условиях ренатурации будут возникать двуцепочечные молекулы не только из гомологичных цепей, но и из цепей разных ДНК. Этот процесс называют молекулярной гибридизацией.
Чем ближе по первичной структуре сводимые ДНК, тем будет больше протяжённость спирализованных участков в гибридной молекуле. По доле последних можно количественно оценивать сходство нуклеотидных последовательностей ДНК разных организмов и таким образом судить о степени их генетической близости.

Молекулярная гибридизация

Слайд 19

Связывание лигандов
с ДНК

Слайд 20

Строение и свойства ДНК

Содержание

План:Стабилизация двойной спирали ДНКОсновные физико-химические свойства ДНКИзмерение спектров поглощения ДНКГипохромизм ДНКДенатурация

Стабилизация двойной спирали ДНК

A•T - 2 водородные связи G•C - 3 водородные связиВодородные

2) Стэкинг-взаимодействия Стэкинг ароматических колец азотистых оснований стабилизруется гидрофобными взаимодействиями и

3) Ионные взаимодействияОснования гидрофобны; PО-2 – гидрофильны, но электростатическое отталкивание дестабилизирует

Кислотно-основные свойстваДНК – многоосновная кислота, Фосфатные группы определяют заряд. Устойчивость двуцепочечной

Поглощение в УФ диапазоне

Поглощение в УФ диапазоне

The absorbance at 260 nm of a DNA solution increases when

Переход ДНК из упорядоченной структуры в неупорядоченную протекает с образованием промежуточных

Денатурация ДНК заключается в разрыве Н-связей и стэкинг-взаимодействий, что приводит к

Hyperchromic effect: stacking of nucleotide bases decreases ε. bases in ss

Кривая плавленияTпл – температура середины переходаΔТпл – температурный интервал перехода Если

Абсцисса точки перегиба, соответствующая половине гиперхромного эффекта, принимается как температура плавления

Денатурация ДНКAverage base composition (G-C content) can be determined from the

Ренатурация ДНК

Если свести вместе продукты денатурации целых молекул ДНК, лишь частично совпадающих

Связывание лигандов с ДНК

Связывание лигандов с ДНК

Похожие презентации

План:
Стабилизация двойной спирали ДНК
Основные физико-химические свойства ДНК
Измерение спектров поглощения ДНК
Гипохромизм ДНК
Денатурация

Стабилизация
двойной спирали ДНК

A•T - 2 водородные связи
G•C - 3 водородные связи
Водородные

2) Стэкинг-взаимодействия
Стэкинг ароматических колец азотистых оснований стабилизруется гидрофобными взаимодействиями и

3) Ионные взаимодействия
Основания гидрофобны; PО-2 – гидрофильны, но электростатическое отталкивание дестабилизирует

Кислотно-основные свойства
ДНК – многоосновная кислота, Фосфатные группы определяют заряд. Устойчивость двуцепочечной

Поглощение в
УФ диапазоне

Поглощение в
УФ диапазоне

The absorbance at 260 nm of a DNA solution increases
when

Hyperchromic effect:
stacking of nucleotide bases decreases ε.
bases in ss

Кривая плавления
Tпл – температура середины перехода
ΔТпл – температурный интервал перехода
Если

Денатурация ДНК
Average base composition
(G-C content) can be determined from the

Связывание лигандов
с ДНК

Связывание лигандов
с ДНК