Темновая фаза фотосинтеза

Содержание

Слайд 2

Схема восстановительного пентозо-фосфатного цикла 6CO2 1C6

Схема восстановительного пентозо-фосфатного цикла

6CO2

1C6

Слайд 3

Цикл Кальвина: энергетика 1 НАДФН = 1.15в х 2 = 230

Цикл Кальвина: энергетика

1 НАДФН = 1.15в х 2 = 230 кдж

( 1в ~ 100 кдж., в НАДФН - 2 е-)
1 АТФ = 30 кдж
Затраты: 12 НАДФН = 2760 кдж
18 АТФ = 540 кдж
Всего: 3300 кдж
Сжигание 1 моля глюкозы: 2800 кдж
Эффективность преобразования энергии – 85%. Неплохо.
Разность в 500 кдж заставляет цикл «крутиться» в нужную сторону
Общая эффективность фотосинтеза «от кванта»:
на 1 СО2 (на 2 Н2О) идет 8 е- (по 4 е- на каждую фотосистему)
1 моль квантов 700нм = 1.77в = 176 кдж.
176 х 8 х 6 = 8450 кдж. Эффективность 33%. Очень неплохо.
Слайд 4

Восстановительный пентозо-фосфатный цикл (ВПЦ)

Восстановительный пентозо-фосфатный цикл (ВПЦ)

Слайд 5

Восстановительный пентозо-фосфатный цикл. Немного истории. Нобелевская премия за 1961 год. Работы

Восстановительный пентозо-фосфатный цикл. Немного истории.

Нобелевская премия за 1961 год.
Работы лорда Мельвина

Кальвина с сотрудниками. Фотосинтезирующей хлорелле давали меченный 14СО2 , через короткие промежутки времени ее (хлореллу) фиксировали кипящим спиртом (садизм), и проводили двумерную бумажную хроматографию получившихся меченых продуктов. Одним из первых обнаруживался меченый ФГА – С3 соединение.

Bassham, 1965

Слайд 6

Фаза карбоксилирования ВПЦ ΔG = -8,4ккал

Фаза карбоксилирования ВПЦ

ΔG = -8,4ккал

Слайд 7

Рибулозо-бисфосфат карбоксилаза-оксигеназа (Rubisco) самый главный фермент на планете Земля (10млн. тонн)

Рибулозо-бисфосфат карбоксилаза-оксигеназа (Rubisco) самый главный фермент на планете Земля (10млн. тонн)

М.в.

~560 kDa,
8L (55 kDa), 8S (15 kDa)
KmCO2 = 12μM
KmO2 = 250μM
KmРУБФ = 40μM
Слайд 8

Решение проблемы низкого СО2 : активация Rubisco (активаза) Активный центр в темноте

Решение проблемы низкого СО2 : активация Rubisco (активаза)

Активный центр
в темноте

Слайд 9

Рибулозо-бисфосфат карбоксилаза-оксигеназа (Rubisco) Активный центр формируют аминокислотные остатки С- и N- концов двух соседних L-субъединиц

Рибулозо-бисфосфат карбоксилаза-оксигеназа (Rubisco)

Активный центр
формируют
аминокислотные
остатки С- и N-
концов двух


соседних
L-субъединиц
Слайд 10

Rubisco катализирует две взаимоисключающие реакции

Rubisco катализирует две взаимоисключающие реакции

Слайд 11

Решение проблемы низкого СО2: «запас» СО2 (физ-хим. + карбоангидраза) pH 5,0 Тилакоид ?

Решение проблемы низкого СО2: «запас» СО2 (физ-хим. + карбоангидраза)

pH 5,0

Тилакоид

?

Слайд 12

Восстановительная фаза цикла Кальвина: «гликолиз наоборот» Km ФГК = 0,5mM Km

Восстановительная фаза цикла Кальвина: «гликолиз наоборот»

Km ФГК = 0,5mM
Km ATФ =

0,1mM
Мв 47 kDa
ΔG = +4,5 ккал

Km ДФГК = 1μM
Km НАДФН =4 μM
Мв 600 kDa
ΔG = -1,5 ккал

Слайд 13

Фаза регенерации: общая схема перегруппировок

Фаза регенерации: общая схема перегруппировок

Слайд 14

Фаза регенерации: образование фруктозо-1,6-бисфосфата Km ДГАФ = 1,1 mM Km ФГА

Фаза регенерации: образование фруктозо-1,6-бисфосфата

Km ДГАФ = 1,1 mM
Km ФГА

= 0,3 mM
Мв 53 kDa
ΔG = -1,8 ккал

Km ФГА = 0,3 mM
Km ФБФ = 20 μM
Мв 150 kDa
ΔG = -5,5 ккал

Слайд 15

Фаза регенерации: образование фруктозо-6-фосфата Km ФБФ = 0,2 mM Мв 160

Фаза регенерации: образование фруктозо-6-фосфата

Km ФБФ = 0,2 mM
Мв 160 kDa
ΔG =

- 4,0 ккал
Слайд 16

Фаза регенерации: первая транскетолазная реакция Мв 140 kDa ΔG = - 1.5 ккал

Фаза регенерации: первая транскетолазная реакция

Мв 140 kDa
ΔG = - 1.5 ккал

Слайд 17

Фаза регенерации: образование седогептулезо-1,7-бисфосфата Та же самая альдолаза Km ФГА =

Фаза регенерации: образование седогептулезо-1,7-бисфосфата

Та же самая
альдолаза
Km ФГА = 0,3 mM
Km

ФБФ = 20 μM
Мв 150 kDa
ΔG = -5,5 ккал

GAP # 5
used here

Слайд 18

Фаза регенерации: образование седогептулезо-7-фосфата Km СБФ = 0,24 Мв 50 kDa ΔG = - 4,0 ккал

Фаза регенерации: образование седогептулезо-7-фосфата

Km СБФ = 0,24
Мв 50 kDa
ΔG =

- 4,0 ккал
Слайд 19

Фаза регенерации: вторая транскетолазная реакция Та же самая транскетолаза Мв 140

Фаза регенерации: вторая транскетолазная реакция

Та же самая
транскетолаза
Мв 140 kDa
ΔG = -

1.5 ккал
Слайд 20

Фаза регенерации: образование рибулезо-5-фосфата Km Р5Ф = 2.0 mM Мв 54

Фаза регенерации: образование рибулезо-5-фосфата

Km Р5Ф = 2.0 mM
Мв 54 kDa
ΔG =

0,64 ккал

Km Ку5Ф = 0,5 mM
Мв 46 kDa
ΔG = -0,13 ккал

2

2

Н

2

Н

Слайд 21

Фаза регенерации: образование рибулезо-1,5-бисфосфата Km Ру5Ф = 0,2 mM Km АТФ

Фаза регенерации: образование рибулезо-1,5-бисфосфата

Km Ру5Ф = 0,2 mM
Km АТФ = 0.1mM
Мв

240 kDa
ΔG = -5,2 ккал

2

Н

Слайд 22

Восстановительный пентозо-фосфатный цикл: общий вид

Восстановительный пентозо-фосфатный цикл: общий вид

Слайд 23

Светом регулируется активность минимум пяти ферментов ВПЦ ФБФ-за СБФ-за Ру5Ф-киназза Триозофосфат-

Светом регулируется активность минимум пяти ферментов ВПЦ

ФБФ-за
СБФ-за
Ру5Ф-киназза
Триозофосфат-
дегидрогеназа
Рубиско:
а/ присоединение
активазы, которая «выталкивает»

РУбисФ или КСбисФ из активного центра
б/ активирование карбамилизацией
с/ активация генов
S-субъединиц через фитохром и криптохром
Слайд 24

Транспорт интермедиатов через хлоропластную мембрану Картинка 20-летней давности

Транспорт интермедиатов через хлоропластную мембрану

Картинка 20-летней давности

Слайд 25

А как экспортируются сахара? УДФ- и АДФ-гексозы – активированные формы сахаров

А как экспортируются сахара? УДФ- и АДФ-гексозы – активированные формы сахаров

Слайд 26

Конечные продукты фиксации СО2 - крахмал в пластидах и сахароза в

Конечные продукты фиксации СО2 - крахмал в пластидах и сахароза в

цитозоле.

ПЛАСТИДА

ЦИТОЗОЛЬ

Однако трансген с «выключенным» триозным транспортером жизнеспособен…

Отлична от
пластидной

Пулы гексоз

Слайд 27

Образование транзиторного крахмала в хлоропластах – сложный процесс.. Крахмал – полимер

Образование транзиторного крахмала в хлоропластах – сложный процесс..

Крахмал – полимер глюкозы.

Состоит из амилозы (линейный α-D-1,4-полимер) и амилопектина (разветвленный по α-D-1,6-гликозидной связи полмер)
Транзиторный крахмал образуется в хлоропластах в течение дня и расходуется в течение ночи. Это позволяет постоянно снабжать гетеротрофные части растения сахарозой, то есть транзиторный крахмал явдляется своеобразным «буфером» в снабжении растения сахарозой. Однако механизмы этого процесса стали известны только в последние 3 – 4 года..
Слайд 28

Гидролиз транзиентного крахмала требует фосфорилирования амилопектина. NB – в мембране хлоропласта

Гидролиз транзиентного крахмала требует фосфорилирования амилопектина.

NB – в мембране хлоропласта есть

переносчики не только триоз, но и мальтозы и глюкозы

Эта дикиназа фосфорилирует один на 2000 гликозильных остатков, однако ее выключение на порядок тормозит ночной гидролиз крахмала

ее выключение не влияет
на гидролиз крахмала

ее выключение тормозит
гидролиз крахмала

Цитозоль

Триозный путь работает
днем, но не ночью, т.к.
цитозольная ФБФ-за
выключается
фр-2,6-бисфосфатом…

MEX1

Слайд 29

Снова к шизофреничному ферменту.. Итак, Rubisco катализирует две взаимоисключающие реакции

Снова к шизофреничному ферменту.. Итак, Rubisco катализирует две взаимоисключающие реакции

Слайд 30

Фотодыхание – процесс, происходящий в трех органеллах Клетка мезофилла молодого листа

Фотодыхание – процесс, происходящий в трех органеллах

Клетка мезофилла молодого листа табака

Nicotiana tabacum (x 48 000)
1 – пероксисома, 2 – митохондрия, 3 – хлоропласт
Слайд 31

Общая схема фотодыхания

Общая схема фотодыхания

Слайд 32

Глицин-декарбоксилазный комплекс в митохондриях

Глицин-декарбоксилазный комплекс в митохондриях

Слайд 33

Соотношения карбоксилазной и оксигеназной функции Рубиско Только карбоксилазная функция: полная «загрузка»

Соотношения карбоксилазной и оксигеназной функции Рубиско

Только карбоксилазная функция:
полная «загрузка» Рубиско,
из всей

фиксированной СО2
образуется триозофосфат

Соотношение карбоксилазной и
оксигеназной функции 1 : 2 -
(компенсационная точка):
весь фиксированный СО2
растрачивается в фотодыхании

Смысл фотодыхания - ? Снабжение аминокислотами? Или защита при
недостатке СО2 - циклы должны крутиться… Или хорошая мина при плохой игре?

Слайд 34

С4-фотосинтез: Кранц-анатомия Клетки мезофилла Клетки обкладки

С4-фотосинтез: Кранц-анатомия

Клетки мезофилла

Клетки обкладки

Слайд 35

С4-фотосинтез: «СО2-насос», принципиальная схема Главная реакция С4 –растения: Двудольные: 15 семейств,

С4-фотосинтез: «СО2-насос», принципиальная схема

Главная реакция

С4 –растения:
Двудольные: 15 семейств, 2000 видов
Однодольные: 3

семейства, 6000 видов

ФЕП-карбоксилаза:
Использует НСО3-,
Нечувствительна к О2,
Км = 0,2 – 0,4 mM,
Локализуется в цитозоле

Слайд 36

ФЕП-карбоксилаза: структура и механизм работы Тетрамер ФЕП-карбоксилазы; Мономер (соответствует «красному» в

ФЕП-карбоксилаза: структура и механизм работы

Тетрамер ФЕП-карбоксилазы;
Мономер (соответствует
«красному» в тетрамере) и


его консервативные участки.
Механизм работы ( желтым
показан гидрофобный
«карман»)
Слайд 37

Регулирование активности ФЕП-карбоксилазы

Регулирование активности ФЕП-карбоксилазы

Слайд 38

«Запас» СО2 (карбоангидраза) для С4 растений pH 5,0 Тилакоид

«Запас» СО2 (карбоангидраза) для С4 растений

pH 5,0

Тилакоид

Слайд 39

Электронная фотография хлоропластов мезофилла (вверху) и клеток обкладки (внизу) С4 растения (сорго)

Электронная фотография хлоропластов мезофилла (вверху) и клеток обкладки (внизу) С4 растения

(сорго)
Слайд 40

С4-фотосинтез: участники игры С3 С4 С5 ПВК, пируват ФЕП ЩУК, оксалоацетат Малат Аспартат α-кетоглутарат Глутамат Аланин

С4-фотосинтез: участники игры

С3

С4

С5

ПВК,
пируват

ФЕП

ЩУК,
оксалоацетат

Малат

Аспартат

α-кетоглутарат

Глутамат

Аланин

Слайд 41

Три варианта С4 – растений: ФЕП- карбоксикиназный НАДФ -малатдегидрогеназный НАД -малатдегидрогеназный

Три варианта С4 – растений:

ФЕП- карбоксикиназный

НАДФ -малатдегидрогеназный

НАД -малатдегидрогеназный

Слайд 42

Распределение ферментов при С4-фотоситезе. НАДФ-МЕ НАД-МЕ ФЕП-КК Halothamnus glaucus Salsola laricina

Распределение ферментов при С4-фотоситезе.

НАДФ-МЕ НАД-МЕ ФЕП-КК
Halothamnus glaucus Salsola laricina Spartina

anglica

Рубиско

ФЕП - карбоксилаза

Декарбоксилаза

Слайд 43

Три варианта С4 – растений: НАДФ-МДГ (малик-энзим) Транспорт – малат. СО2 выделяется в пластидах.

Три варианта С4 – растений: НАДФ-МДГ (малик-энзим)

Транспорт – малат.
СО2 выделяется в
пластидах.

Слайд 44

Три варианта С4 – растений: НАД-МДГ (малик-энзим) Транспорт – аспартат. СО2 выделяется в митохондриях.

Три варианта С4 – растений: НАД-МДГ (малик-энзим)

Транспорт – аспартат.
СО2 выделяется в
митохондриях.

Слайд 45

Три варианта С4 – растений: ФЕП-КК (карбоксикиназный) Транспорт – аспартат и

Три варианта С4 – растений: ФЕП-КК (карбоксикиназный)

Транспорт – аспартат и
возможно

малат
СО2 выделяется в
цитозоле и возможно
в митохондриях
Слайд 46

Фиксация СО2 у С3 и С4 растений в зависимости от ее

Фиксация СО2 у С3 и С4 растений в зависимости от ее

концентрации

Скорость фотосинтеза:
С3 – 15–40 мг СО2/дм2 час
С4 – 40–80 мг СО2/дм2 час
Потери воды при росте:
С3 – 450-950г /г сух. массы
С4 – 250-350г /г сух. массы

Слайд 47

Распространение С3 и С4 растений в степях и саваннах…

Распространение С3 и С4 растений в степях и саваннах…

Слайд 48

Распространение С3 и С4 растений

Распространение С3 и С4 растений

Слайд 49

САМ-метаболизм: временное разделение карбоксилирования и фиксации СО2

САМ-метаболизм: временное разделение карбоксилирования и фиксации СО2

Слайд 50

САМ-метаболизм: малат может поступает в вакуоль не только из цитозоля, но и из митохондрий.

САМ-метаболизм: малат может поступает в вакуоль не только из цитозоля, но

и из митохондрий.
Слайд 51

С3, С4 и САМ–метаболизм: адаптационные приспособления и переключения. «Хрустальная травка». При

С3, С4 и САМ–метаболизм: адаптационные приспособления и переключения.

«Хрустальная травка».
При засолении

и засухе может переключать свой метаболизм с С3 на САМ
Слайд 52

С3 и С4–метаболизм: возможны варианты?. Присутствие «С4-подобного» фотосинтеза предполагается у ряда

С3 и С4–метаболизм: возможны варианты?.

Присутствие «С4-подобного» фотосинтеза предполагается у ряда С3

растений в клетках, окружающих сосудистые системы.
Например, в клетках табака, расположенных рядом с флоэмой и ксилемой, присутствуют ферменты С4 фотосинтеза (ФЭП-крбоксилаза и маликэнзим), они используют малат, поступающий из сосудистой системы в качестве источника СО2 .
Независимое и многократное возникновение С4 фотосинтеза или его элементов у разных групп растений?
Слайд 53

Маленькая сенсация – одноклеточный С4-фотосинтез. Флуоресценция хлоропластов в клетках Borszczowia aralocaspica (A) и Bienertia cycloptera (B)

Маленькая сенсация – одноклеточный С4-фотосинтез.

Флуоресценция хлоропластов в клетках
Borszczowia aralocaspica

(A) и Bienertia cycloptera (B)