Вирусы животных ss(+)РНК

Упрощенная классификация вирусов

ssDNA

dsDNA

dsRNA

ssRNA

ssRNA+

ssRNA-

ssRNA-RT

dsDNA-RT

Picorna
Calici

Flavi
Toga
Corona

Orthomyxo
Paramyxo
Rhabdo
Filo

Reoviridae
Rotavirus

Birnaviridae

Circo
Parvo

Adeno
Herpes
Pox
Baculo

Hepadna

Retro

Особенности вирусов ssРНК(+)

Геномная РНК вирусов инфеционна, непосредственно транслируется в белки
Вирусы не

Стратегии экспрессии

Синтез мРНК на матрице (-) интермедиата; RdRp служит транскриптазой
Синтез полипротеина

Кэп-зависимая трансляция

15

Кэп-независимая трансляция

Family PICORNAVIRIDAE (pico-RNA-viridae)

Genus Aphthovirus. Foot-and-mouth disease – ящур.
Enterovirus. Poliovirus- полиомиелит, Echo, Coxsackie,

Филогенетическое древо Picornaviridae

Polio
CV A16
EV71

Clinically
Similar
Disease

Строение частиц пикорнавирусов

Диаметр частиц – 30нм; Капсид пикорна-
вирусов состоит из 3-х

Строение генома энтеровирусов

Геном полиовируса

3D POL

3C PRO

Capsid

Рецепторы пикорнавирусов

Rhinoviruses use CD54 or ICAM-1 (intercellular adhesion molecule-1)
Poliovirus uses CD155.

Picornavirus Replication Cycle

Schematic representation of the signaling pathways involved in the
EV71-induced VCAM-1 expression

Pleconaril - ингибитор декапсидации энтеровирусов:

Pleconaril

Active against Polio, CAV, CBV, but not

«Плеконарил» блокирует связывание риновирусов с рецепторами ICAM

Высвобождение пикорнавирусной РНК
в цитоплазму клетки- мишени блокируется
препаратом «плеконарил»
(на рис. –

Механизм нейтрализации инфекционной активности пикорнавирусов антителами

1.Блокирование
рецепторных
карманов

2. Блокирование выхода

F. CALICIVIRIDAE

Lagovirus. Геморрагическая болезнь кроликов (RHDV), синдром коричневого уха зайцев и

Human Sapovirus

CALICIVIRIDAE
Calicivirus prototypes –
Vesicular Exanthema of Swine Virus (VESV),
Human

Morphology of caliciviruses

RHDV

Pan-1

Noro

Sapo

Vesivirus

Phylogram comparing entire capsid gene of the family Caliciviridae

Calicivirus genomes

Особенности норовирусов

Высокое генетическое разнообразие – 5 геногрупп с десятками кластеров, многие

Norovirus structure

ORF2

ORF3

Genomic ssRNA+ 7,6kb

Subgenomic RNA

5’

3’

Particle structure

Hardy M.E., 2005

ORF1

180 copies
of VP1

VPg

CELL

Реассортация - возникновение потомства смешанного генотипа у норавирусов

Доля ротавирусов и норовирусов в этиологии вирусных гастроэнтеритов (ВГЭ) у детей

San Miguel Sea lion virus (SMSV) 1972, 1996

Сыпь на ластах морских

Типичные условия возникновения особо опасных вирусных инфекций

Высокая плотность популяции хозяина
Моногенетика

F. FLAVIVIRIDAE flavus - Yellow (yellow fever virus)- желтая лихорадка

G. Flavivirus -

Схема строения вирионов флавивирусов

Lipid Bilayer

ssRNA+

Capsid

Envelope Protein I
E1 (HCV)

Envelope Protein II

Genomic organization of members of the Flaviviridae

The viral genome consists

Replicative cycle of the Flaviviridae. (G. Flavivirus)

B

Genomic RNA is Caped

Hepatitis C virus (HCV)

Около 200 000 инфицированных HCV в мире
HCV передается

Hepatitis C virus (HCV) E2 and NS5a

IRES

NS5A is involved in genomic

Рецепторы HCV

CD81 - tetraspanin family,high affinity for E2 binding, expressed in