Анализ данных секвенирования

Слайд 2

Визуализаторы FinchTV (бесплатный) Sequencher (платный) TraceEditor (входит в пакет ПО MEGA) Sequence Scaner (бесплатный)

Визуализаторы

FinchTV (бесплатный)
Sequencher (платный)
TraceEditor (входит в пакет ПО MEGA)
Sequence Scaner (бесплатный)

Слайд 3

TraceEditor (1)

TraceEditor (1)

Слайд 4

TraceEditor (2)

TraceEditor (2)

Слайд 5

TraceEditor (3)

TraceEditor (3)

Слайд 6

TraceEditor (4) 5’-TTAGTGAGCCACCACCAGCCATC-3’

TraceEditor (4)

5’-TTAGTGAGCCACCACCAGCCATC-3’

Слайд 7

Alignment

Alignment

Слайд 8

Megablast (1)

Megablast (1)

Слайд 9

Megablast (2)

Megablast (2)

Слайд 10

Слайд 11

Слайд 12

Слайд 13

Слайд 14

Формат данных FastQ

Формат данных FastQ

Слайд 15

FastQC

FastQC

Слайд 16

FastQC

FastQC

Слайд 17

FastQC

FastQC

Слайд 18

Алгоритмы сборки de novo OLC – overlap-layout-consensus (Arachne, Celera, CAP3, Phrap)

Алгоритмы сборки de novo

OLC – overlap-layout-consensus (Arachne, Celera, CAP3, Phrap)
Графы де

Брёйна (Velvet, SOAPdenovo, SPAdes)
Слайд 19