Высшим органом ИКОМ является генеральная ассамблея, которая собирается раз в три
года. Каждые три года в том же городе и в те же сроки собирается генеральная конференция ИКОМ.
Также в ИКОМ существуют 28 международных комитетов, представляющих все типы музеев (художественные, исторические, литературные) или различные дисциплины (реставрация, подготовка персонала, новые музейные технологии).
Между генеральными ассамблеями обязанности руководящего органа выполняет Исполнительный совет ИКОМ, который проводит свои заседания два раза в год и состоит из 11 членов.