Целями международного таможенного сотрудничества являются:
1. Защита экономической безопасности государств (путем осуществления
таможенного контроля воспрепятствование доступа на территорию государства запрещенных к ввозу товаров и вывозу с этой территории запрещенных к вывозу товаров, стимулирование ввоза или вывоза тех или иных категорий товаров).
2. Согласование таможенных систем государств (путем сближения правового регулирования таможенных отношений. Выстраивание таможенных технологий на уровне международных стандартов).
3. Содействие развитию международной торговли (содействие безопасности международной торговли и содействие таможенными средствами облегчению международной торговли. Путем совершенствования таможенных процедур на основе их упрощения и ускорения процесса их прохождения. Взаимное признание таможенных документов.
4. Объединение усилий в решении таких задач, как противодействие контрабанде и другим правонарушениям в области таможенного дела, борьба с международным терроризмом и наркобизнесом и т.д.