Электрон - транспортная цепь митохондрий

Содержание

Слайд 2

Дыхание растений

Дыхание растений

Слайд 3

Общая схема дыхательной ЭТЦ: четыре белковых комплекса, объединяемые подвижными переносчиками е-

Общая схема дыхательной ЭТЦ: четыре белковых комплекса, объединяемые подвижными переносчиками е-

Переносчики

е- в ЭТЦ выстаиваются согласно своим Red/Ox потенциалам – «под горку»

НАДН → ФП (ФМН) → FeS (min 5шт) → UQ(пул) →
-0,32v -(0,3 – 0,1)v -(0,37-0,02)v 0v
→ цит b → FeS → цит с1 → цит с → цит а-а3 → О2
0.1v 0,28v 0,22v 0,25v 0,29-0,55v 0,82v

Слайд 4

Хиноны (убихиноны и пластохиноны) – липофильные молекулы с Red-Ox свойствами: перенос

Хиноны (убихиноны и пластохиноны) – липофильные молекулы с Red-Ox свойствами: перенос

2ē + 2Н+

E0’: от 0,0 до +0,10 V
(в связанном виде – до -0,3 V)
в среднем – около 0 V

Слайд 5

Флавинадениндинуклеотид (ФАД, FAD) и флавинмононуклеотид (ФМН, FMN) – компоненты многих Red-Ox

Флавинадениндинуклеотид (ФАД, FAD) и флавинмононуклеотид (ФМН, FMN) – компоненты многих Red-Ox

ферментов: перенос 2ē + 2Н+

Eo : от -0,5 до +0,2 V
в зависимости от белка,
стабилизации кольца, резонанса

Слайд 6

Железо-серные белки - 2Fe-2S и 4Fe-4S: перенос только одного ē Eо’:

Железо-серные белки - 2Fe-2S и 4Fe-4S: перенос только одного ē

Eо’:
от

– 0,42V (Fd)
до + 0,35V
(Fe-S бел. Риске)
Слайд 7

Гемы – коферменты цитохромов: перенос только одного ē Eо’: от -0,18

Гемы – коферменты цитохромов: перенос только одного ē

Eо’:
от -0,18

V (cyt b6)
до +0,55 V (cyt a3)

Cyt b

Cyt с

Cyt а

Слайд 8

Подвижные переносчики: Убихиноны – их много («пул убихинонов») 2. Цитохром с

Подвижные переносчики:
Убихиноны – их много («пул убихинонов»)
2. Цитохром с –

104 ак. Локализован с наружной стороны внутренней
мембраны. Гем ковалентно связан с белком (через cys14 и cys17)
Примерная стехиометрия: 1 комплекс I : 3 bc1 : 7 aa3 : 9 cyt c : 50 UQ

Общая схема дыхательной ЭТЦ: четыре белковых комплекса, объединяемые подвижными переносчиками е-

Слайд 9

Комплекс I: NADH-дегидрогеназа – похож на старый башмак Матрикс Межмембранное пространство Мембрана

Комплекс I: NADH-дегидрогеназа
– похож на старый башмак

Матрикс

Межмембранное пространство

Мембрана

Слайд 10

Комплекс I Матрикс Межмембранное пространство Мембрана ФМН НАДН- связывающий сайт FeS-кластеры

Комплекс I

Матрикс

Межмембранное пространство

Мембрана

ФМН

НАДН- связывающий сайт

FeS-кластеры

FeS-кластер

Убихинон- связывающий сайт

Карбоангидраза (растения!)

Галактонолактондегидрогеназа (растения!)

Слайд 11

Комплекс I: NADH-дегидрогеназа

Комплекс I: NADH-дегидрогеназа

Слайд 12

Особенность ЭТЦ дыхания растений – дополнительные NAD(P)H-дегидрогеназы

Особенность ЭТЦ дыхания растений – дополнительные NAD(P)H-дегидрогеназы

Слайд 13

КомплексII: сукцинатдегидрогеназа Единственный фермент цикла Кребса, встроенный в мембрану митохондрий

КомплексII: сукцинатдегидрогеназа
Единственный фермент цикла Кребса, встроенный в мембрану митохондрий

Слайд 14

Структура: димер, мономер - до 11 белков, min – 3 белка:

Структура: димер,
мономер - до 11 белков,
min – 3 белка:
Cyt b

(2 гема bL и bH), 45kDa
FeS-белок (2Fe2S), 21,5kDa
Cyt c1, 27kDa, 240а-к

Комплекс III: убихинол-цитохром c-оксидоредуктаза; цитохром b/c1-комплекс

Слайд 15

Комплекс III: почти как в фотосинтезе Межмембранное пространство Межмембранное пространство матрикс матрикс

Комплекс III: почти как в фотосинтезе

Межмембранное пространство

Межмембранное пространство

матрикс

матрикс

Слайд 16

Цитохром с: белок, ассоциированный с мембраной D-L DH D-Лактат Пируват GL

Цитохром с: белок, ассоциированный с мембраной

D-L DH

D-Лактат

Пируват

GL DH

L-Галактоно-
лактон

L-Аскорбат

cyt c

Пул
UQ

Слайд 17

Комплекс IV: цитохром a/a3, цитохромоксидаза Структура: димер 125 kDa. Мономеры: 3

Комплекс IV: цитохром a/a3, цитохромоксидаза

Структура: димер 125 kDa.
Мономеры: 3 больших

полипептида, кодируются в m:
I - 57, II - 26 и III - 30kDa, 9 небольших белков ядерного кодирования.
4 Red-Ox центра: два гема а (a и a3) и два Cu-центра: СuА (2атома) и CuВ.
Гемы и CuB – на I белке, CuA – на II.
Слайд 18

Комплекс IV: цитохром a/a3, цитохромоксидаза CuA гем а гем а3 -СuB

Комплекс IV: цитохром a/a3, цитохромоксидаза

CuA

гем а

гем а3 -СuB

H+ H+ H+

D K H
H+ H+

цит с ē

II

I

межмембранное пространство

«двуядерный» центр гем а3–СuВ,

O2

2H2O

СuA

Слайд 19

Предполагаемая схема работы цитохрома а-а3 O2 О● ē 2H+ O H

Предполагаемая схема работы цитохрома а-а3

O2

О●

ē
2H+

O

H

H

2H2O

ē
2H+

ē

ē

= O

– O

A

P

F

O

H

R

К-канал

D-канал

D-канал

Слайд 20

АТФ-синтаза: вальсирующий комплекс Структура: Две субъединицы: F0 и F1 F1: α3β3γδε

АТФ-синтаза: вальсирующий комплекс

Структура:
Две субъединицы: F0 и F1
F1: α3β3γδε
α - 59, β

- 56, γ - 36
δ - 17.5, ε - 13,5kDa
F0: а (I), 15kDa,
b (II), 12.5kDa
c (III), 8kDa
а:b:с – 1:2:(6-15)
α , β, ε субъединицы F1
и субъединица а (I) F0 кодируются в митохондриальном геноме.
Слайд 21

Альтернативная оксидаза

Альтернативная оксидаза

Слайд 22

2QH2 +O2 → 2Q + 2H2O Альтернативная оксидаза Термогенез ароидных растений

2QH2 +O2 → 2Q + 2H2O

Альтернативная оксидаза

Термогенез ароидных растений
Arum maculatum,

Symplocarpus foetidus, Sauromatum guttatum, Philodendron selloum.
Альтернативная оксидаза
Один полипептид Один ядерный ген АОХ1
В мембране Мх: мономерная или димерная форма
Впервые белок АО был получен из мтх
Sauromatum guttatum
Слайд 23

Sauromatum guttatum

Sauromatum guttatum

Слайд 24

Symplocarpus foetidus

Symplocarpus foetidus

Слайд 25

Helicodeceros muscivorus

Helicodeceros muscivorus

Слайд 26

Особенность ЭТЦ дыхания растений – альтернативная оксидаза Гомодимер, 37 kDa, ~

Особенность ЭТЦ дыхания растений – альтернативная оксидаза

Гомодимер, 37 kDa, ~ 350

а-к. Передает ē от убихинона на кислород.
Устойчива к цианиду!
Есть изозимы (минимум 2): конститутивная и индуцибельная АО
Две формы: окисленная и восстановленная. Окисленная неактивна.
Слайд 27

Альтернативная оксидаза

Альтернативная оксидаза

Слайд 28

Зачем нужна альтернативная оксидаза и как она включается? Гипотезы: 1. Для

Зачем нужна альтернативная оксидаза и как она включается?

Гипотезы:
1. Для шунтирования ЭТЦ

– модели «перелива» и «распределения»
2. Для снижения уровня активных форм кислорода (АФК)
3. Для быстрого генерирования энергии (например, при стрессе)
Слайд 29

Регуляция экспрессии и активности альтернативной оксидазы

Регуляция экспрессии и активности альтернативной оксидазы

Слайд 30

Вторичный метаболизм: цианогенные гликозиды Лирическое отступление

Вторичный метаболизм: цианогенные гликозиды

Лирическое отступление

Слайд 31

Откуда берется цианид? Цианогенные гликозиды C≡N ⎟ глюкоза – О –

Откуда берется цианид?

Цианогенные гликозиды

C≡N

глюкоза – О – C –

СН3

R
R – CH3 (ЛИНАМАРИН) Trifolium sp., Maniholt sp.
R – фенил (ПРУНАЗИН) Prunus sp (Rosaceae) Vicia sp., Sorghum sp.,
Linum sp.
Слайд 32

Цианогенные гликозиды

Цианогенные гликозиды

Слайд 33

Цианогенные гликозиды продуцируют 2500-3000 видов растений сем. бобовых, розоцветных, мимозовых Клевер,

Цианогенные гликозиды продуцируют 2500-3000 видов растений сем. бобовых, розоцветных, мимозовых
Клевер, кассава,

лен, сорго, лотос, гевея, пассифлора, ячмень, абрикос, акации
Слайд 34

Цианогенные гликозиды Trifolium repens Клевер ползучий Lupinus polyphyllus Люпин многолистный Syringa

Цианогенные гликозиды

Trifolium repens
Клевер ползучий

Lupinus polyphyllus
Люпин многолистный

Syringa pannonica
Сирень венгерская

Padus racemosa
Черемуха обыкновенная

Padus serotina
Черемуха

виргинская
Слайд 35

Маниок съедобный ( Manihot esculenta ) Сем. Молочайные ( Euphorbiaceae )

Маниок съедобный ( Manihot esculenta ) Сем. Молочайные ( Euphorbiaceae )


Слайд 36

Маниок съедобный ( Manihot esculenta ) Сем. Молочайные ( Euphorbiaceae )

Маниок съедобный ( Manihot esculenta ) Сем. Молочайные ( Euphorbiaceae )


Родина: Бразилия
(культивируется 6–7 тыс. лет)
Синонимы:
Маниок, тапиока, кассава, «юкка»

Корнеклубни:
Длина – до 1 м
Вес – до 15 кг
Урожайность – в среднем 120 ц/га
Рекорд – 348 ц/га

Слайд 37

Маниок съедобный ( Manihot esculenta ) Сем. Молочайные ( Euphorbiaceae )

Маниок съедобный ( Manihot esculenta ) Сем. Молочайные ( Euphorbiaceae )


Слайд 38

Маниок съедобный ( Manihot esculenta ) Сем. Молочайные ( Euphorbiaceae )

Маниок съедобный ( Manihot esculenta ) Сем. Молочайные ( Euphorbiaceae )


HCN
цианид,
синильная кислота

Линамарин: 100–500 мг/кг

Слайд 39

C≡N ⎟ глюкоза – О – C – СН3 ⎟ R

C≡N

глюкоза – О – C – СН3

R

О
⎟⎟
C – СН3 + НCN

СН3
ацетон

H2O

глюкоза

лиаза

CN

НО – C – СН3

СН3
ЦИАНОГИДРИН АЦЕТОНА

линамараза

Слайд 40

Маниок съедобный ( Manihot esculenta ) Сем. Молочайные ( Euphorbiaceae )

Маниок съедобный ( Manihot esculenta ) Сем. Молочайные ( Euphorbiaceae )


Слайд 41

Маниок съедобный ( Manihot esculenta ) Сем. Молочайные ( Euphorbiaceae )

Маниок съедобный ( Manihot esculenta ) Сем. Молочайные ( Euphorbiaceae )


Слайд 42

Дыхание растений: итоги

Дыхание растений: итоги

Слайд 43

Итак, ЭТЦ дыхания растений: У растений обнаружили UCP (разобщающий белок), как и у животных

Итак, ЭТЦ дыхания растений:

У растений обнаружили UCP (разобщающий белок), как и

у животных
Слайд 44

NADPH Порины Порины Цитозоль (симпласт) Пластида Митохондрия ЭТЦ Н2О Цит b/f

NADPH

Порины

Порины

Цитозоль (симпласт)

Пластида

Митохондрия

ЭТЦ

Н2О

Цит b/f

ФC II

ФC I

3-ФГК (С3)

3-ФГА(С3)

NADP+

NADH

NAD+

О2

Н2О

ē

Гликолиз

Гликолиз,
Цикл Кальвина

1,3-ДФГК (С3)

АТФ

АДФ

3-ФГК (С3)

3-ФГА (С3)

1,3-ДФГК (С3)

АТФ

АДФ

Ф

Ф

Ф

Ф

Слайд 45

NAD+- зависимая МДГ декарб. Пируват- карбоксилаза СО2 Пируват (С3) NADPH Порины

NAD+-
зависимая
МДГ декарб.

Пируват- карбоксилаза

СО2

Пируват (С3)

NADPH

Порины

Порины

Цитозоль (симпласт)

Пластида

Митохондрия

ЭТЦ

Н2О

Цит b/f

ФC II

ФC I

Оксалоацетат (С4)

Малат (С4)

NADP+-
зависимая
МДГ декарб.

Оксалоацетат (С4)

Малат

Оксалоацетат

NADP+

СО2

NADH

NAD+

Пируват (С3)

О2

Н2О

NADH

NAD+

Малат

(С4)

АТФ

АДФ+Ф

ē

ФЕП-кар-
боксилаза

Гликолиз

Гликолиз

Гликолиз

NAD+-
зависимая
МДГ декарб.

МАЛИК-ЭНЗИМ: NADP+-
зависимая
МДГ декарб.

Слайд 46

ЭТЦ дыхания растений: последние новости… DHO DH Дигидро- оротат Оротат Пиримидины

ЭТЦ дыхания растений: последние новости…

DHO DH

Дигидро-
оротат

Оротат

Пиримидины

G-3-P DH

3-Ф-глицерин

ДГАФ

Гликолиз

Pro DH

Пролин

Пирролин-
-5-карбоксилат

Пул UQ

D-L DH

D-Лактат

Пируват

GL DH

L-Галактоно-
лактон

L-Аскорбат

cyt

c

О2

NDH A1
NDH A2

НАДН

НАД+

NDH C1

НАДФН

НАДФ+

NDH В1
NDH B2
NDH B3
NDH B4

Брожение

НАД(Ф)Н

НАД(Ф)+

НАДН

НАД+

II

Сукцинат

Фумарат

Липиды

Слайд 47

ЭТЦ дыхания растений: образование суперкомплексов, респирасома Состав суперкомплексов: I+III2 I2+III4 III2+IV

ЭТЦ дыхания растений: образование суперкомплексов, респирасома

Состав суперкомплексов:
I+III2
I2+III4
III2+IV
III2+IV2
I+III2+IV
I+III2+IV2
I+III2+IV4
I2+III2+IV2

В суперкомплексы НЕ входят:
Альтернативная Оксидаза

(АО)
Сукцинатдегидрогеназа (комплекс II)
Слайд 48

ЭТЦ дыхания растений: образование суперкомплексов КС-I КС-III КС-IV I2+III2+IV2

ЭТЦ дыхания растений: образование суперкомплексов

КС-I

КС-III

КС-IV

I2+III2+IV2

Слайд 49

ЭТЦ дыхания растений: образование суперкомплексов АТФ-синтазы Места сборки супрекомплексов АТФ-синтазы соответствуют местам инициации крист

ЭТЦ дыхания растений: образование суперкомплексов АТФ-синтазы

Места сборки супрекомплексов АТФ-синтазы соответствуют местам

инициации крист
Слайд 50

ЭТЦ дыхания растений: образование суперкомплексов АТФ-синтазы Кристы работают как протонные «ловушки»

ЭТЦ дыхания растений: образование суперкомплексов АТФ-синтазы

Кристы работают как протонные «ловушки»

Слайд 51

Генетическая функция митохондрий

Генетическая функция митохондрий

Слайд 52

Множество кольцевых молекул митохондриальной ДНК растений – результат гомологичных рекомбинаций по повторам.

Множество кольцевых молекул митохондриальной ДНК растений – результат гомологичных рекомбинаций

по повторам.
Слайд 53

Предполагаемая структура «мастер-хромосомы» митохондрий кукурузы

Предполагаемая структура «мастер-хромосомы» митохондрий кукурузы

Слайд 54

Линейная ДНК митохондрий хламидомонады

Линейная ДНК митохондрий хламидомонады

Слайд 55

Сопоставление хлоропластного и митохондриального геномов риса

Сопоставление хлоропластного и митохондриального геномов риса

Слайд 56

Варианты редактирования хлоропластных и митохондриальных РНК растений

Варианты редактирования хлоропластных и митохондриальных РНК растений

Слайд 57

Гены митохондрий Синтез белка. - 3 гена рРНК (оперон rrn) -

Гены митохондрий

Синтез белка. - 3 гена рРНК (оперон rrn)
- 10

генов белков пластидных рибосом (rpl/rps)
- 16 генов тРНК (trn) – не хватает! – импорт!
2. Дыхание - 9 генов белков НАД Н дегидрогеназы (nad)
- ген апоцитохрома b (cob);
- 5 генов белков биосинтеза цитохрома с (ccb)
- 3 гена субъединиц цитохромоксидазы (гены сох).
- 3 гена субъединиц сукцинатдегидрогеназы (sdh)
у печеночников
- 4 гена АТФ-синтазы (atp)
Всего: около 50 генов (у печеночных мхов – более 100) ,
из них около 20 - «рабочих» и около 30 - «домашнего хозяйства».
Слайд 58

Ядерный генов контролирует : некоторые т РНК ДНК – полимеразу РНК

Ядерный генов контролирует :
некоторые т РНК
ДНК – полимеразу
РНК – полимеразу
Некоторые рибосомальные

белки
Синтез белков, входящие в состав комплексов электрон – транспортной цепи дыхания
Синтез ферментов ЦТК
Слайд 59

Слайд 60

Fzo – это гигантские ГТФ-азы, расположенные во внешней мембране митохондрий Fzo (fuzzy onion)

Fzo – это гигантские ГТФ-азы, расположенные во внешней мембране митохондрий

Fzo (fuzzy

onion)
Слайд 61

Цитоплазматическая мужская стерильность (ЦМС) «Техасская» - Т-ЦМС «USDA»-тип - S-ЦМС «Молдавская»

Цитоплазматическая мужская стерильность (ЦМС)

«Техасская» - Т-ЦМС

«USDA»-тип - S-ЦМС
«Молдавская» - M-ЦМС

«Парагвайская»


(Charrua-тип) - С-ЦМС

стерильность

восстановление
фертильности

Ядерный ген
Restorer of Fertility =
= Rf

Ядерный ген Rf3

Ядерный ген Rf4

Слайд 62

АТФ-синтаза: ключевой фермент «Техасской» ЦМС 13 kDa-белок появляется в митохондриях как

АТФ-синтаза: ключевой фермент «Техасской» ЦМС
13 kDa-белок
появляется
в митохондриях
как результат


незаконной
рекомбинации
c геном atp6
и встраивается
в АТФ-синтазу,
вызывая ЦМС
Слайд 63

АТФ-синтаза: ключевой фермент «Техасской» ЦМС 13 kDa-белок появляется в митохондриях как

АТФ-синтаза: ключевой фермент «Техасской» ЦМС
13 kDa-белок
появляется
в митохондриях
как результат


незаконной
рекомбинации
c геном atp6
и встраивается
в АТФ-синтазу,
вызывая ЦМС

Гельминтоспориоз!

Слайд 64

АТФ-синтаза: ключевой фермент ЦМС у петунии У петунии незаконная рекомбинация происходит

АТФ-синтаза: ключевой фермент ЦМС у петунии
У петунии
незаконная
рекомбинация
происходит
с

участием
гена atp9.
Изменения
в АТФ-синтазном
комплексе
вызывают ЦМС
Слайд 65

Цитоплазматическая мужская стерильность (ЦМС) «USDA»-тип - S-ЦМС «Молдавская» - Т-ЦМС Ядерный

Цитоплазматическая мужская стерильность (ЦМС)

«USDA»-тип - S-ЦМС
«Молдавская» - Т-ЦМС

Ядерный ген Rf3

При

S-ЦМС(=М-ЦМС)
появляются
линейные фрагменты
в митохондриальном геноме:
S1 и S2 – эписомы.
Возможно, более крупные
кольцевые молекулы мт-ДНК
за счет рекомбинации
могут линеаризоваться.
Слайд 66

Цитоплазматическая мужская стерильность (ЦМС): спорофитный и гаметофитный контроль Стерильность Полное (!)

Цитоплазматическая мужская стерильность (ЦМС): спорофитный и гаметофитный контроль

Стерильность

Полное (!)
восстановление
фертильности

«USDA»-тип - S-ЦМС
«Молдавская»

- M-ЦМС

Ядерный ген Rf3

Восстановление
фертильности

Спорофитный (2n) контроль

Слайд 67

Цитоплазматическая мужская стерильность (ЦМС): спорофитный и гаметофитный контроль «Техасская» - Т-ЦМС

Цитоплазматическая мужская стерильность (ЦМС): спорофитный и гаметофитный контроль

«Техасская» - Т-ЦМС

Ядерные гены

Rf1 и Rf2

Rf2-ген –
доминантная
гомозигота

Стерильность

Половина (!)
пыльцевых зерен
фертильна

Восстановление
фертильности

Гаметофитный (1n) контроль

Слайд 68

Слайд 69

Слайд 70

Локализация ферментов глиоксилатного цикла

Локализация ферментов глиоксилатного цикла

Слайд 71

РАСТИТЕЛЬНЫЕ ПЕРОКСИСОМЫ – ИСТОЧНИК СИГНАЛЬНЫХ МОЛЕКУЛ

РАСТИТЕЛЬНЫЕ ПЕРОКСИСОМЫ – ИСТОЧНИК СИГНАЛЬНЫХ МОЛЕКУЛ

Слайд 72

Метаболический переход от гетеротрофного к фототрофному питанию

Метаболический переход от гетеротрофного к фототрофному питанию