ОСНОВЫ БИОТЕХНОЛОГИИ ТРАНСГЕНЕЗ. МИКРООРГАНИЗМЫ Лекция 5

Содержание

Слайд 2

Перспективы развития генетической инженерии

Перспективы развития генетической инженерии

Слайд 3

РЕКОМБИНАЦИЯ ТРАНСГЕНЕЗ. МИКРООРГАНИЗМЫ. Лекция 5

РЕКОМБИНАЦИЯ

ТРАНСГЕНЕЗ. МИКРООРГАНИЗМЫ. Лекция 5

Слайд 4

Рекомбинация – процесс реорганизации генома, обмен участками ДНК Словарь

Рекомбинация – процесс реорганизации генома, обмен участками ДНК

Словарь

Слайд 5

Виды рекомбинационных событий

Виды рекомбинационных событий

Слайд 6

Классификация рекомбинационных явлений

Классификация рекомбинационных явлений

Слайд 7

Схема сайт-специфической рекомбинации бактериофага лямбда А) линейная (вирионная) ДНК фага Б)

Схема сайт-специфической рекомбинации
бактериофага лямбда

А) линейная (вирионная) ДНК фага
Б) ДНК

фага после инфекции в E. coli замыкается в кольцо, и находящийся в ней сайт attP вступает в рекомбинацию с сайтом attB в хромосоме бактерии
В) продукт рекомбинации - профаг в составе хромосомы бактерии
Г) запись процесса рекомбинации в общем виде
Слайд 8

РЕКОМБИНОГЕНЕЗ ТРАНСГЕНЕЗ. МИКРООРГАНИЗМЫ. Лекция 5

РЕКОМБИНОГЕНЕЗ

ТРАНСГЕНЕЗ. МИКРООРГАНИЗМЫ. Лекция 5

Слайд 9

позволяет кардинально изменять живые организмы на генетическом уровне, вплоть до создания

позволяет кардинально изменять живые организмы на генетическом уровне, вплоть до создания

новых видов с новыми заданными свойствами

СОВРЕМЕННЫЕ

РЕКОМБИНОГЕНЕЗ

Клеточная инженерия
культивирование гибридизация реконструкция

Генетическая инженерия
метод рекомбинантных ДНК
или
молекулярное клонирование

Методы селекции

Белковая инженерия
рациональный дизайн направленная эволюция

Слайд 10

Открытие явления трансформации 1928 г. открытие явления трансформации Фредерик Гриффит Streptococcus

Открытие явления трансформации

1928 г.
открытие явления трансформации

Фредерик Гриффит

Streptococcus pneumoniae – пневмококки.


Бактерии, вызывающие пневмонию.
Капсульный S-штамм – патогенный
Бескапсульный R-штамм – непатогенный
Слайд 11

Метод создания новых генетических программ путем конструирования и внесения новой генетической

Метод создания новых генетических программ путем конструирования и внесения новой генетической

информации в уже существующие живые организмы

Генетическая инженерия или молекулярное клонирование

Слайд 12

Berg, Paul (США) (р. 1926) Нобелевская премия по химии, 1980 История

Berg, Paul (США)
(р. 1926) Нобелевская премия по химии, 1980


История
метода

1972 г. – появление методологии
Пол Берг сконструировал rДНК из фрагмента ДНК вируса SV40, бактериофага λ и оперона E. Coli

Слайд 13

1972 г. Анни Чанг Герберт Бойер Поль Берг Стенли Коэн установили,

1972 г. Анни Чанг
Герберт Бойер
Поль Берг
Стенли

Коэн
установили, что при помощи ферментов рестриктаз можно порезать две любые молекулы ДНК и сделать из них одну рекомбинантную ДНК

Поль Берг

Стенли Коэн

Герберт Бойер

Анни Чанг

Слайд 14

ОСНОВНЫЕ ТИПЫ ФЕРМЕНТОВ ТРАНСГЕНЕЗ. МИКРООРГАНИЗМЫ. Лекция 5

ОСНОВНЫЕ ТИПЫ ФЕРМЕНТОВ

ТРАНСГЕНЕЗ. МИКРООРГАНИЗМЫ. Лекция 5

Слайд 15

«Генетическая инженерия – потомок молекулярной генетики, но своим рождением обязана успехам

«Генетическая инженерия – потомок молекулярной генетики, но своим рождением обязана успехам

генетической энзимологии и химии нуклеиновых кислот, так как инструментами молекулярного манипулирования являются ферменты»
З.И.Абрамова
Слайд 16

Слайд 17

Слайд 18

Суть метода

Суть метода

Слайд 19

Рекомбинантная ДНК – искусственно сконструированная ДНК, несущая фрагменты генетической информации разных

Рекомбинантная ДНК – искусственно сконструированная ДНК, несущая фрагменты генетической информации разных

организмов
Трансгенез – процесс перенос гена или группы генов из одного организма в другой и создание условий для его/их экспрессии
Векторы – системы доставки трансгена, обеспечивающие его интеграцию, амплификацию и экспрессию

Словарь

Слайд 20

I этап Получение гена II этап Создание рекомбинантной ДНК III этап

I этап Получение гена

II этап Создание рекомбинантной ДНК

III этап Создание трансгенного

организма

IV этап Отбор модифицированных систем

ТЕХНИКА ГЕНЕТИЧЕСКОЙ ИНЖЕНЕРИИ

Слайд 21

I ЭТАП. ПОЛУЧЕНИЕ ГЕНА ТРАНСГЕНЕЗ. МИКРООРГАНИЗМЫ. Лекция 5

I ЭТАП. ПОЛУЧЕНИЕ ГЕНА

ТРАНСГЕНЕЗ. МИКРООРГАНИЗМЫ. Лекция 5

Слайд 22

I этап Получение гена Цель: получение гена-матрицы для молекулярного клонирования Методы:

I этап Получение гена

Цель:
получение гена-матрицы для молекулярного клонирования

Методы:
1) рестриктазный
2)

химико-ферментативный синтез
3) синтез на основе мРНК
Слайд 23

Рестриктазы – ферменты, узнающие особые последовательности нуклеотидов в ДНК (сайты рестрикции)

Рестриктазы – ферменты, узнающие особые последовательности нуклеотидов в ДНК (сайты рестрикции)

Слайд 24

Рестриктазы. Типы рестрикции.

Рестриктазы.
Типы рестрикции.

Слайд 25

Слайд 26

Химико-ферментативный синтез гена Разработан X. Кораной хим. синтез комплементарных, взаимоперекрывающихся олигонуклеотидов

Химико-ферментативный синтез гена

Разработан X. Кораной
хим. синтез комплементарных, взаимоперекрывающихся олигонуклеотидов
соединение

(лигирование) олигонуклеотидов с помощью фермента Т4 ДНК-лигазы.
Слайд 27

ДНК экзон интрон экзон экзон интрон Транскрипция РНК первичный транскрипт Сплайсинг

ДНК

экзон

интрон

экзон

экзон

интрон

Транскрипция

РНК первичный транскрипт

Сплайсинг

Матричная РНК

Обратная транскрипция

Клональная ДНК

Синтез на основе mРНК

Слайд 28

Слайд 29

II ЭТАП. ПОЛУЧЕНИЕ РЕКОМБИНАНТНОЙ ДНК ТРАНСГЕНЕЗ. МИКРООРГАНИЗМЫ. Лекция 5

II ЭТАП. ПОЛУЧЕНИЕ РЕКОМБИНАНТНОЙ ДНК

ТРАНСГЕНЕЗ. МИКРООРГАНИЗМЫ. Лекция 5

Слайд 30

I этап Получение гена II этап Создание рекомбинантной ДНК Цель: внесение гена-матрицы (трансгена) в вектор

I этап Получение гена

II этап Создание рекомбинантной ДНК

Цель:
внесение гена-матрицы (трансгена)

в вектор
Слайд 31

ВЕКТОРА (лат. vector – несущий) молекулы способные к самостоятельной репликации и

ВЕКТОРА (лат. vector – несущий)

молекулы способные к самостоятельной репликации

и обеспечивающие интеграцию, амплификацию и экспрессию трансгена
Слайд 32

Словарь Амплификация – увеличение количества копий rДНК (трансген + вектор) Интеграция

Словарь

Амплификация – увеличение количества копий rДНК (трансген + вектор)
Интеграция –

встраивание rДНК в ДНК хозяина
Экспрессия – транскрипция трансгена аппаратом клетки хозяина
Слайд 33

Требования к векторным молекулам

Требования к векторным молекулам

Слайд 34

Классификация векторов по реципиентным системам Естественные плазмиды бактериофаги Искусственные космиды фазмиды

Классификация векторов
по реципиентным системам

Естественные
плазмиды
бактериофаги

Искусственные космиды
фазмиды
бакмиды

Естественные
плазмиды
вирусы

Искусственные челночные векторы

Вектора прокариот

Вектора

эукариот
Слайд 35

Словарь Бакмиды – челночные векторы на основе генома бакуловируса, способные существовать

Словарь

Бакмиды – челночные векторы на основе генома бакуловируса, способные существовать в

клетках E.coli
Космиды – плазмидные векторы, в ко­торые встроен участок генома фага λ, обеспечи­вающий возможность упаковки молекулы в фаговую частицу
Фазмиды – векторы, которые содержат генетические элементы плазмид и бактериофагов
Слайд 36

http://rudocs.exdat.com

http://rudocs.exdat.com

Слайд 37

Классификация векторов по функциям Клонирующие вектора, обеспечивающие репликацию гибридной молекулы в

Классификация векторов
по функциям

Клонирующие

вектора, обеспечивающие репликацию гибридной молекулы в клетке

Экспрессирующие


вектора, обеспечивающие правильную и эффективную экспрессию чужеродной ДНК в клетке-реципиенте

Интегративные

вектора, обеспечивающие интеграцию чужеродной ДНК в геном реципиента

Слайд 38

I этап Получение гена II этап Создание рекомбинантной ДНК Методы введения гена в вектор: рестриктазно-лигазный коннекторный

I этап Получение гена

II этап Создание рекомбинантной ДНК

Методы введения гена в

вектор:
рестриктазно-лигазный
коннекторный
Слайд 39

Применим для гена и вектора с комплементарными «липкими» концами Рестриктазо-лигазный метод

Применим для гена и вектора с комплементарными «липкими» концами

Рестриктазо-лигазный метод

Слайд 40

Впервые был применен С. Коэном в 1973 году. Рестриктазы, вносят в

Впервые был применен С. Коэном в 1973 году.
Рестриктазы, вносят в

цепи ДНК симметричные, расположенные наискось друг от друга разрывы на равных расстояниях от центра сайта узнавания и образуют "ступеньку"

Рестриктазо-лигазный метод

Слайд 41

Слайд 42

http://zhurnal.lib.ru/

http://zhurnal.lib.ru/

Слайд 43

Применим для гена и вектора с некомплементарными «тупыми» концами Коннекторный метод

Применим для гена и вектора с некомплементарными «тупыми» концами

Коннекторный метод

Впервые

был выполнен в 1972 году П.Бергом.
Экзонуклеаза отрезает «тупые» концы
Терминальная трансфераза пришивает линкерные молекулы
к 3’-концам фрагментов ДНК вектора достраивают одноцепочечные олиго (dA)-сегменты, а к 3’-концам фрагмента трансгена олиго (dT)-сегменты
линкеры соединяются за счет комплементарности (dА)- и (dT)-последовательностей
Слайд 44

Слайд 45

III ЭТАП. СОЗДАНИЕ ТРАНСГЕННОГО ОРГАНИЗМА ТРАНСГЕНЕЗ. МИКРООРГАНИЗМЫ. Лекция 5

III ЭТАП. СОЗДАНИЕ ТРАНСГЕННОГО ОРГАНИЗМА

ТРАНСГЕНЕЗ. МИКРООРГАНИЗМЫ. Лекция 5

Слайд 46

I этап Получение гена II этап Создание рекомбинантной ДНК III этап

I этап Получение гена

II этап Создание рекомбинантной ДНК

III этап Создание трансгенного

организма

Цель:
введение гена-матрицы в организм-реципиент

Методы введения рДНК в клетку:
конъюгация
трансдукция
трансфекция
трансформация

Слайд 47

Естественные Конъюгация Трансдукция Трансфекция Искусственные Трансформация Методы введения рДНК в клетку-реципиент

Естественные

Конъюгация

Трансдукция

Трансфекция

Искусственные

Трансформация

Методы введения рДНК в
клетку-реципиент

Слайд 48

Методы введения rДНК в клетку-реципиент трансдукция (вектор с элементами генома бактериофага) http://sd1.uchebalegko.ru

Методы введения rДНК в клетку-реципиент трансдукция
(вектор с элементами генома бактериофага)

http://sd1.uchebalegko.ru

Слайд 49

Методы введения rДНК в клетку-реципиент трансфекция (вектор с элементами генома вируса)

Методы введения rДНК в клетку-реципиент трансфекция
(вектор с элементами генома вируса)

Слайд 50

Методы введения rДНК в клетку-реципиент коньюгация (вектор с элементами генома плазмид)

Методы введения rДНК в клетку-реципиент коньюгация
(вектор с элементами генома плазмид)

Слайд 51

Методы введения rДНК в клетку-реципиент трансформация (при физиологической некомпетентности) микроиньекция электропорация липофекция биобаллистика http://rudocs.exdat.com

Методы введения rДНК в клетку-реципиент трансформация
(при физиологической некомпетентности)

микроиньекция

электропорация

липофекция

биобаллистика

http://rudocs.exdat.com

Слайд 52

IV ЭТАП. ОТБОР ТРАНСГЕНЕЗ. МИКРООРГАНИЗМЫ. Лекция 5

IV ЭТАП. ОТБОР

ТРАНСГЕНЕЗ. МИКРООРГАНИЗМЫ. Лекция 5

Слайд 53

I этап Получение гена II этап Создание рекомбинантной ДНК III этап

I этап Получение гена

II этап Создание рекомбинантной ДНК

III этап Создание трансгенного

организма

IV этап Отбор модифицированных систем

Цель:
оценка результата молекулярного клонирования

Методы:
маркерный, иммунологическая детекция, скрининг, картирование, секвенирование

Слайд 54

1. Отбор клеток, несущих вектор 2. Отбор клеток, несущих ген-мишень Методы отбора

1. Отбор клеток, несущих вектор

2. Отбор клеток, несущих ген-мишень

Методы отбора

Слайд 55

а) Применение репортерных (маркерных) генов первого, второго и третьего поколений: -

а) Применение репортерных (маркерных) генов первого, второго и третьего поколений:

- NPT-ген (неомицинфосфотрансфераза и других антибиотикоустойчивых генов)
- GUS-ген (глюкуронидаза)
- GFP-ген (greenfluorescenceprotein)
б) Селекция клеток на средах с антибиотиками
в) Обнаружение продуктов экспрессии репортерных генов и/или их активности

Отбор по векторам
Селективные, репортерные маркеры

Слайд 56

верхнем правом углу много мелких названий – это перечислены сайты рестрикции

верхнем правом углу много мелких названий – это перечислены сайты рестрикции

Rep – это участок отвечающий за репликацию (размножение) плазмиды в клетке
Amp – репортерный ген устойчивости к антибиотику – ампициллину
Слайд 57

Отбор по векторам Устойчивость к антибиотику

Отбор по векторам
Устойчивость к антибиотику

Слайд 58

Отбор по векторам. GFP

Отбор по векторам.
GFP

Слайд 59

Отбор по трансгену блот-анализа по Саузерену 1. Синтезируют меченые нуклеотиды (ДНК

Отбор по трансгену
блот-анализа по Саузерену

1. Синтезируют меченые нуклеотиды (ДНК зонды)
2.

Фрагмент целевой ДНК переводят на нитроцеллюлозный фильтр.
3. Связавшиеся молекулы ДНК обрабатывают щелочным раствором, в результате одна нить ДНК «отрывается» от другой.
4. На фильтр наносят раствор с ДНК-зондом, комплементарные участки
совпадают, происходит гибридизация.
5. Сканируют фильтр
Слайд 60

Первые достижения

Первые достижения