Современные методы диагностики инфекционных заболеваний in vitro

Содержание

Слайд 2

Клиническая диагностика инфекционных заболеваний Эпидемиологический анамнез Анамнез больного Базисные лабораторные исследования

Клиническая диагностика инфекционных заболеваний

Эпидемиологический анамнез
Анамнез больного
Базисные лабораторные исследования
Общеклиническое исследование крови
Биохимические исследования
Специальные

лабораторные исследования
Бактериологические исследования
Серологические исследования
Молекулярная диагностика
Кибер-молекулярная диагностика

Диагностика in vitro

Слайд 3

Эволюция методов диагностики инфекционных заболеваний Бактериологические исследования Бактериоскопия Выделение бактериальной культуры

Эволюция методов диагностики инфекционных заболеваний

Бактериологические исследования
Бактериоскопия
Выделение бактериальной культуры
Серологические исследования
Молекулярная диагностика
Кибер-молекулярная диагностика

Слайд 4

Бактериологические исследования Бактериоскопия Выделение бактериальной культуры (посев)

Бактериологические исследования

Бактериоскопия

Выделение бактериальной культуры (посев)

Слайд 5

Эволюция методов диагностики инфекционных заболеваний Бактериологические исследования Серологические исследования Выявление антигенов

Эволюция методов диагностики инфекционных заболеваний

Бактериологические исследования
Серологические исследования
Выявление антигенов
Выявление антител
Молекулярная диагностика
Кибер-молекулярная диагностика

Слайд 6

Серологические исследования Иммуноферментный анализ (ИФА) Выявление антигенов Выявление антител

Серологические исследования

Иммуноферментный анализ (ИФА)

Выявление антигенов
Выявление антител

Слайд 7

Серологические исследования Выявление антигенов: антитела в твёрдой фазе Выявление антител: антигены в твёрдой фазе

Серологические исследования

Выявление антигенов: антитела в твёрдой фазе

Выявление антител: антигены в твёрдой

фазе
Слайд 8

Эволюция методов диагностики инфекционных заболеваний Бактериологические исследования Серологические исследования Молекулярная диагностика

Эволюция методов диагностики инфекционных заболеваний

Бактериологические исследования
Серологические исследования
Молекулярная диагностика
ПЦР-диагностика
Секвенирование
Флуоресцентная in situ гибридизация

(FISH)
Кибер-молекулярная диагностика
Слайд 9

Молекулярная диагностика Полимеразная цепная реакция (ПЦР, PCR – polymerase chain reaction)

Молекулярная диагностика

Полимеразная цепная реакция (ПЦР, PCR – polymerase chain reaction) –

метод получения множества копий определенных фрагментов ДНК (генов) в биологическом образце.

ПЦР-диагностика

Слайд 10

Молекулярная диагностика Секвенирование нуклеиновых кислот — определение их нуклеотидной последовательности (от

Молекулярная диагностика

Секвенирование нуклеиновых кислот — определение их нуклеотидной последовательности (от лат.

sequentum — последовательность).
В результате секвенирования получают формальное описание первичной структуры линейной макромолекулы в виде последовательности мономеров в текстовом виде.
I поколение: секвенирование по Сэнгеру (метод обрыва цепи)
II поколение: массовое параллельное секвенирование (NGS)
III поколение: одномолекулярное секвенирование

Секвенирование

Слайд 11

Молекулярная диагностика Секвенирование по Сэнгеру

Молекулярная диагностика

Секвенирование по Сэнгеру

Слайд 12

Эволюция методов диагностики инфекционных заболеваний Бактериологические исследования Серологические исследования Молекулярная диагностика Кибер-молекулярная диагностика

Эволюция методов диагностики инфекционных заболеваний

Бактериологические исследования
Серологические исследования
Молекулярная диагностика
Кибер-молекулярная диагностика

Слайд 13

Кибер-молекулярная диагностика Массовое параллельное секвенирование / секвенирование нового поколения / глубокое

Кибер-молекулярная диагностика

Массовое параллельное секвенирование / секвенирование нового поколения / глубокое секвенирование

(англ. next generation sequencing, NGS) — группа методов определения нуклеотидной последовательности ДНК и РНК для получения формального описания её первичной структуры, которые позволяют «прочитать» единовременно сразу несколько участков генома.

Массовое параллельное секвенирование (NGS)

Слайд 14

Кибер-молекулярная диагностика Массовое параллельное секвенирование (NGS)

Кибер-молекулярная диагностика

Массовое параллельное секвенирование (NGS)

Слайд 15

Кибер-молекулярная диагностика Особенности массового параллельного секвенирования: Позволяет установить последовательности миллионов фрагментов

Кибер-молекулярная диагностика

Особенности массового параллельного секвенирования:
Позволяет установить последовательности миллионов фрагментов ДНК (РНК)

за один цикл
Исследование микробиоты
Эволюция вирусов
Клиническая генетика
Онкология

Массовое параллельное секвенирование (NGS)

Слайд 16

Кибер-молекулярная диагностика Особенности массового параллельного секвенирования: Выходные данные представлены в виде

Кибер-молекулярная диагностика

Особенности массового параллельного секвенирования:
Выходные данные представлены в виде текстового файла

(в файле формата .fastq)
Огромный объём данных
Возможность работы с данными средствами программирования
Возможность автоматизации обработки данных

Массовое параллельное секвенирование (NGS)

Слайд 17

Кибер-молекулярная диагностика Особенности массового параллельного секвенирования: Как выглядит файл формата .fastq? Массовое параллельное секвенирование (NGS)

Кибер-молекулярная диагностика

Особенности массового параллельного секвенирования:
Как выглядит файл формата .fastq?

Массовое параллельное секвенирование

(NGS)
Слайд 18

Кибер-молекулярная диагностика Лабораторная часть (от подготовки образцов до получения данных секвенатора)

Кибер-молекулярная диагностика

Лабораторная часть (от подготовки образцов до получения данных секвенатора)
Программная часть

(автоматическая обработка результатов секвенирования)
Приятный бонус: результаты одного и того же секвенирования можно обрабатывать в разных программных алгоритмах

Кибер-молекулярный тест

Слайд 19

Кибер-молекулярная диагностика Возможное применение Исследование микробиоты (заменяет традиционные бактериологические методы) Исследование

Кибер-молекулярная диагностика

Возможное применение
Исследование микробиоты (заменяет традиционные бактериологические методы)
Исследование эволюции вирусов (реконструкция

цепей передачи заболевания)
Определение влияния вирусов на организм (заменяет ИФА и ПЦР методы)

Кибер-молекулярный тест

Слайд 20

Кибер-молекулярная диагностика Определение влияния вирусов на организм Использовать данные, записанные в

Кибер-молекулярная диагностика

Определение влияния вирусов на организм
Использовать данные, записанные в ДНК человека


Участки, кодирующие рецепторы B-клеток
Митохондриальная ДНК
Поиск маркёров методом data mining
Автоматизация обработки данных

Кибер-молекулярный тест

Слайд 21

Молекулярная диагностика в России ФБУН ГНЦ прикладной микробиологии и биотехнологии (Оболенск,

Молекулярная диагностика в России

ФБУН ГНЦ прикладной микробиологии и биотехнологии (Оболенск, Московская

область)
ФКУЗ РосНИПЧИ «Микроб» (Саратов)
ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» (Москва)
ФБУН Санкт-Петербургский НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера (Санкт-Петербург)
ФГБОУ ВО «Смоленский государственный медицинский университет» (Смоленск)

Организации, занимающиеся разработкой молекулярных методов

Слайд 22

Молекулярная диагностика в России ФБУН ГНЦ ВБ «Вектор» (Кольцово, Новосибирская область)

Молекулярная диагностика в России

ФБУН ГНЦ ВБ «Вектор» (Кольцово, Новосибирская область)
АО «ВЕКТОР-БЕСТ» (Кольцово,

Новосибирская область)
ФГБОУ ВО «Национальный исследовательский Нижегородский государственный университет им. Н.И. Лобачевского» (Нижний Новгород)
ООО НПО «Диагностические системы» (Нижний Новгород)

Организации, занимающиеся разработкой молекулярных методов