Содержание
- 2. Рентгеноструктурный анализ биомакромолекул Литература: В.А. Жемков, А.А. Болгов, О.Л. Власова, И.Б. Безпрозванный. Биофизические и биохимические методы
- 3. Структурная биология как область знаний обязана своим появлением становлению метода рентгеноструктурного анализа (РСА). Кристаллографический анализ занимал
- 4. Интересно отметить, что начиная с 1901 г. по 2016 г., 67 Нобелевских премий получили структурные биологи
- 5. Это Ричард Хендерсон (Великобритания), Йоахим Франк (США) и швейцарец Жак Дебуши. Как объявил в среду в
- 6. Первым этапом РСА является получение кристалла интересующего вещества, или этап кристаллизации. В этом этапе кроется еще
- 7. Особенности дифракции белковых кристаллов по сравнению с кристаллами малых молекул
- 8. Симметрия кристаллов Понятие симметрии лежит в основе кристаллографии. Суть симметрии заключается в возможности произвести преобразование объекта,
- 9. Может быть выбрана элементарная ячейка кристалла – параллелепипед минимального объема, имеющий симметрию ту же, что и
- 10. Сингония, или кристаллическая система позволяет классифицировать кристаллы с одинаковой совокупностью углов между гранями. Кристаллы каждой сингонии
- 11. Рентгеновский дифрактометр состоит из источника рентгеновского излучения, рентгеновского гониометра, в который помещают исследуемый образец, детектора излучения
- 12. Рентгеновский дифрактометр
- 13. Обработка результатов рентгеновского эксперимента базируется на мощном математическом аппарате. Когда монохроматический рентгеновский луч падает на определенным
- 14. Индексирование Поиск пиков и индексирование в HKL2000 Определение кристаллической системы, симметрии Обработка данных начинается с индексации
- 15. Индексы Миллера Индексы Миллера — кристаллографические индексы, характеризующие расположение атомных плоскостей в кристалле. Индексы Миллера связаны
- 16. Плоскости с различными индексами Миллера в кубических кристаллах
- 17. Шкалирование Интенсивности дифракционных максимумов зависят от условий эксперимента (время экспозиции, напряжение на трубке и т.д.). Таким
- 18. Решение проблемы фаз В ходе эксперимента измеряются интенсивности дифрагированных лучей. Основной проблемой РСА является принципиальная невозможность
- 19. Фазовая проблема Подходы к решению проблемы: Изоморфное замещение Использование эффекта аномального рассеяния Метод молекулярного замещения «Прямые»
- 20. Изоморфное замещение Можно попытаться внедрить в молекулы кристалла некую метку – один или несколько тяжелых атомов
- 22. Модель, вписанная в карту электронной плотности
- 23. Построение модели белка После расчета карты электронной плотности становится возможным построение модели, в нашем случае –
- 24. Понятие разрешения имеет в РСА тот же смысл, что и при образовании изображения в оптическом микроскопе.
- 25. Уточнение модели белка После построения модели необходимо ее уточнение. Уточнение основано на сравнении интенсивностей дифракционных максимумов,
- 26. Кристаллизация В случае лабильных биомакромолекул этап получения качественных белковых кристаллов является одним из самых сложных. В
- 27. Кристаллизация Получение пересыщенного раствора: Испарение - постепенное удаление растворителя из раствора Понижение растворимости в процессе охлаждения
- 28. Выделение и очистка белка Для получения нужного белка используют различные биохимические методы Гомогенизация - измельчение биологического
- 29. Источники излучения Рентгеновские трубки Источники синхротронного излучения (синхротроны, лазеры на свободных электронах)
- 30. Источники рентгеновского излучения Rigaku R-Axis IV Advanced Photon Source in Argonne Lab
- 31. В качестве источника рентгеновских лучей в настоящее время стараются использовать синхротронный ускоритель. Это довольно дорогое сооружение.
- 32. Определение первых структур белков 1920-е – работа с фибриллярными белками (фиброин шелка, коллаген) 1930-е – 1940-е
- 33. Модели Полинга и Кори 1951 г Решающее обстоятельство, которое отличает их работу от всех предшествующих, состоит
- 34. Глобулярные белки Кристаллизация белков использовалась как метод очистки в биохимии задолго до появления такой области, как
- 35. Структура гемоглобина и миоглобина 1937г. – начало работы М. Перутца над установлением структуры гемоглобина 1953г. –
- 36. Структуры первых белков Структура миоглобина с разрешением 6 А Структура миоглобина высокого разрешения Структура гемоглобина
- 37. Кристалл гемоглобина
- 38. Структура миоглобина
- 39. Структура миоглобина
- 40. Структура гемоглобина
- 41. Достижения рентгеновской кристаллографии 8 кДа ингибитор трипсина, 150кДа ботулотоксин, 2МДа 50S субъединица прокариотической рибосомы и 66МДа
- 42. Кристаллизация мембранных белков Одно из самых значительных достижений РСА последних десятилетий состоит в начавшейся расшифровке трехмерных
- 43. Криоэлектронная микроскопия RyR1 IP3R1
- 44. Рецепторы, сопряженные с G-белками Three-dimensional structure of a G protein-coupled receptor or GPCR (magenta) embedded in
- 45. Достижения кристаллографии Холестерол Пенициллин Витамин B12 Дороти Ходжкин и макет витамина B12
- 46. Витамин B12
- 47. Пенициллин
- 48. «За определение с помощью рентгеновских лучей структур биологически активных веществ», пенициллина и витамина B12 Ходжкин в
- 49. ДНК 1938. Получена первая рентгенограмма ДНК. У. Астбери показано, что азотистые основания расположены в определенном порядке
- 50. ДНК Английский биофизик и учёный-рентгенограф, занималась изучением структуры ДНК. Розалинд Франклин известна в большей степени своей
- 51. Protein data bank Информация, полученная методами рентгеновской кристаллографии или ЯМР-спектроскопии занесена в банк данных 3-D структур
- 53. Скачать презентацию