Еволюція міжклітинного сигналінгу

Содержание

Слайд 2

Склад сигнальної системи

Склад сигнальної системи

Слайд 3

Загальні принципи еволюції сигналінгу

Загальні принципи еволюції сигналінгу

Слайд 4

Еволюція механізмів сигналінгу Вторинні месенджери

Еволюція механізмів сигналінгу

Вторинні месенджери

Слайд 5

1 етап

1 етап

Слайд 6

Рання еволюція сигнальної системи Одними із перших стимулів, що одночасно являються

Рання еволюція сигнальної системи

Одними із перших стимулів, що одночасно являються і

месенджерами могли бути йони Ca2+, тому що:
Значна концентрація Са2+ токсична, тому має існувати значний градієнт концентрації цього йону між зовнішньо- та внутрішньоклітинним середовищем.
Кальцій – розповсюджений елемент у земній корі (5%).
Можуть існувати небілкові кальцієві транспортери.
Слайд 7

Іонофори Ще один варіант простих переносників йонів (лише за градієнтом). Наприклад,

Іонофори

Ще один варіант простих переносників йонів (лише за градієнтом).
Наприклад, A23187 –

частково специфічний до Са2+.
Слайд 8

Небілкові кальцієві канали у сучасних бактерій Полі-β-гідроксибутиратні канали відомі у Azotobacter

Небілкові кальцієві канали у сучасних бактерій

Полі-β-гідроксибутиратні канали відомі у Azotobacter vinelandii,

Bacillus subtilis, Haemophilus influenzae, і Escherichia colі. Вони траспортують Са у зв’язаній з поліфосфатом формі.
Імовірно, можуть транспортувати в обидва напрямки. Транспортують йони набагато швидше ніж іонофори.

Reusch & Sadoff, 1988

Слайд 9

Первинні системи сигналінгу без ампліфікації 1. Сигналінг із зовнішнім середовищем 2. Примітивний міжклітинний сигналиінг

Первинні системи сигналінгу без ампліфікації

1. Сигналінг із зовнішнім середовищем

2. Примітивний міжклітинний

сигналиінг
Слайд 10

Первинна кальцій-залежна система Кальцієва система зв’язана з іншою. Повноцінний (незалежний від

Первинна кальцій-залежна система

Кальцієва система зв’язана з іншою.
Повноцінний (незалежний від середовища) кальцієвий

сигналінг може виникнути лише з появою компартменталізації.
Слайд 11

Можливі функції Груповий гідроліз субстрату. Примітивний хемотаксис за принципом роботи аналогічний

Можливі функції

Груповий гідроліз субстрату.
Примітивний хемотаксис за принципом роботи аналогічний прокаріотичному (є

індуктор – є рух).
Проблеми такої системи:
Слабо підтримується груповим добором через дуже обмежене поширення сигналу.
Залежність інтенсивності відповіді від інтенсивності стимулу – необхідна ампліфікація сигналу.
Слайд 12

2 етап

2 етап

Слайд 13

Поява ампліфікації Модифікації білків – > двокомпонентні системи. Транскрипційна регуляція. Вторинні

Поява ампліфікації

Модифікації білків – > двокомпонентні системи.
Транскрипційна регуляція.
Вторинні месcенджери.
Додатковий шлях у

бактерій – ампліфікація позитивним зв’язком (відчуття кворуму).
Слайд 14

Еволюція сайтів фосфорилування Першим кроком до вирішення проблеми необхідності ампліфікації сигналу

Еволюція сайтів фосфорилування

Першим кроком до вирішення проблеми необхідності ампліфікації сигналу була

поява посттрансляційних модифікацій ефекторів (ефектор І порядка швидше активує більшу кількість ефекторів ІІ порядку).
Поява сайтів фосфорилування відбулася на місці негативно заряджених амінокислот у білку (Glu, Asp).

Pearlman et al., 2011

Слайд 15

Двокомпонентні системи Kristin K. Koretke, Andrei N. Lupas, Patrick V. Warren,

Двокомпонентні системи

Kristin K. Koretke, Andrei N. Lupas, Patrick V. Warren, Martin

Rosenberg, and James R. Brown Evolution of Two-Component Signal Transduction Mol. Biol. Evol. 17(12):1956–1970. 2000
Слайд 16

Вторинні месенджери

Вторинні месенджери

Слайд 17

Поява модифікації рецепторів – хемотаксис бактерій Регуляція за – зв’язком

Поява модифікації рецепторів – хемотаксис бактерій

Регуляція за – зв’язком

Слайд 18

Вторинні месенджери Циклічні нуклеотиди – найбільш розповсюджені як серед про- так і еукаріот. cAMP

Вторинні месенджери

Циклічні нуклеотиди – найбільш розповсюджені як серед про- так і

еукаріот.

cAMP

Слайд 19

3 етап

3 етап

Слайд 20

Прокаріоти - + зв’язок

Прокаріоти - + зв’язок

Слайд 21

Регуляція позитивним зворотнім зв’язком Повноцінна ампліфікація у сигнальній системі, що активно

Регуляція позитивним зворотнім зв’язком

Повноцінна ампліфікація у сигнальній системі, що активно

підтримується груповим добором.
Виникає у прокаріот після розходження з еукаріотами.
Слайд 22

Кворум сенсинг (відчуття кворуму) Найчастіше ефектор і синтаза автоіндуктора знаходяться в

Кворум сенсинг (відчуття кворуму)

Найчастіше ефектор і синтаза автоіндуктора знаходяться в одному

опероні.

Кворум сенсинг у симбіонта кальмара Euprymna scolopes Vibrio fischeri, який забеспечує світіння за допомогою фермента люциферази.

Waters & Bassler, 2005

Слайд 23

Бувають і складніші системи з декількома автоіндукторами Кворум сенсинг у Pseudomonas aeruginosa

Бувають і складніші системи з декількома автоіндукторами

Кворум сенсинг у Pseudomonas aeruginosa

Слайд 24

Еукаріоти – ускладнення рецепторів

Еукаріоти – ускладнення рецепторів

Слайд 25

Рецептори з ферментативною активністю Тирозин кіназний рецептор - Metazoa Серин-треонін кіназний рецептор – майже всі еукаріоти

Рецептори з ферментативною активністю

Тирозин кіназний рецептор - Metazoa

Серин-треонін кіназний рецептор –

майже всі еукаріоти
Слайд 26

G-білок залежні рецептори

G-білок залежні рецептори

Слайд 27

Арешт рецепторів – негативна регуляція сигналу Регуляція за – зв’язком

Арешт рецепторів – негативна регуляція сигналу

Регуляція за – зв’язком

Слайд 28

Регуляторні мономерні ГТФази – «перемикачі»

Регуляторні мономерні ГТФази – «перемикачі»

Слайд 29

Ускладнення регуляції Bhattacharyya et al., 2006

Ускладнення регуляції

Bhattacharyya et al., 2006

Слайд 30

Диверсифікація сигнальних каскадів Збільшення різноманітності сигнальних каскадів – важлива передумова появи

Диверсифікація сигнальних каскадів

Збільшення різноманітності сигнальних каскадів – важлива передумова появи багатоклітинності.
Наприклад,

у Metazoa з’являються повністю модульні трьохкомпонентні системи, основані на фосфорилуванні тирозину.
Першими з’являються Eraser (PTP, phosphotyrosine phosphatase) домени для виправлення випадкового фосфорилювання Tyr Ser/Thr кіназами. Далі – Reader (SH2); функціональною система змогла стати лише після появи Writer (TyrK, tyrosine kinase).

Функціонуюча сигнальна система

Pincus et al., 2008
Lim & Pawson, 2010

Слайд 31

Висновки Таким чином, еволюція сигнальних систем йшла в напрямку збільшення “еволюційної

Висновки

Таким чином, еволюція сигнальних систем йшла в напрямку збільшення “еволюційної здатності”

(evolvability) системи, кількості шляхів її регуляції і удосконалення систем ампліфікації сигналу (шлях оптимізації підтримки груповим-добором).