Школа Науки о данных. Введение в молекулярную биологию

Июль 26, 2022

Главная
Биология
Школа Науки о данных. Введение в молекулярную биологию

Содержание

2. Введение в молекулярную биологию Молекулярная биология для компьютерщиков за полтора часа Мария Попцова зав. лаборатории биоинформатики
3. Объекты в биологии Биологический объект - это живой организм Все живые тела состоят из клеток Клетка
4. Клетка-город Объект биологии
5. Клетка как город Внешняя стена с воротами => мембрана с каналами Кремль => ядро Библиотека =>
6. Why do we need genome? The inner life of the cell https://www.youtube.com/watch?v=wJyUtbn0O5Y
7. ЧТО ТАКОЕ ГЕНОМ? Для биолога Для биоинформатика Ряд Нобелевских премий 1950-1970
8. Геномы разных органзимов
9. Вторичная структура – альфа-спираль и бета-лист Альфа-субъединица АТФ-синтетазы Лайнус Полинг Нобелевская премия по химии 1954 Обитатели
10. Proteins are made of 20 amino acids Over 100 amino acids exist in nature
11. Белок - текст, написанный на алфавите из 20 букв
12. Genome is made of DNA
13. DNA is made of 4 nucleotides
14. Chargaff’s rules 1st Chargaff’s rule А=Т and G=C in double-stranded DNA 2nd Chargaff’s rule А=Т и
15. Good Quality DNA X-Ray images Морис Уилкинс и Розалинд Франклин .
16. Nobel Prize in 1962 Геном - текст, написанный на алфавите из 4 букв
17. Расшифровать генетический код
18. Георгий Гамов - объясняет загадочное число 20. - число различных ромбовых комбинаций именно в такой модели
19. «Мы просто пили калифорнийское вино, и нам приходили идеи» Георгий Антонович Гамов Джордж Гамов, физик, ALA
20. Код без запятых Синтез белков происходит не на ДНК, а на посреднике в виде молекулы РНК
21. 1957, Francis Crick a talk at University College, London Francis Crick’s unpublished 1956 sketch of the
22. Открытие РНК Об РНК знали с 1868 года, когда Фридрих Мишер открыл нуклеиновые кислоты. 1961 -
23. V Международный биохимический конгресс 1961 Москва, 10-16 августа Ниренберг М.В., Маттеи Г. // Тр. V Международ.
24. Эксперимент Ниренберга
25. 1968 - Нобелевская премия по физиологии и медицине Ниренберг, Хорана, Холли
26. Центральная догма молекулярной биологии ДНК РНК Белок Репликация Транскрипция Трансляция
27. DNA replication https://www.youtube.com/watch?v=4jtmOZaIvS0
28. Transcription and translation https://www.youtube.com/watch?v=41_Ne5mS2ls
29. Рождение технологий
30. 1977 год Нобелевская премия по химии 1980 г. Метод секвенирования Сэнгера The Wellcome Trust Sanger Institute,
31. Первый отсеквенированный геном 1995 г. бактерия Haemophilus influenzae –гемофильная палочка или палочка Пфейфера 5 Mb
32. Human Genome Project Started in 1990 Finished 2001/2003 Sanger Sequencing 3 Gb
34. Next Generation Sequencing, or NextGenSeq, or NGS
37. NextGen Sequencing Revolution Human genome – Volumes, double-sided, 4pt, ~ 43,000 chars per page To print
39. Скачать презентацию

Слайд 2

Введение в молекулярную биологию
Молекулярная биология для компьютерщиков
за полтора часа
Мария

Попцова

зав. лаборатории биоинформатики
факультет компьютерных наук

Слайд 3

Объекты в биологии
Биологический объект - это живой организм
Все живые тела состоят

из клеток
Клетка – элементарная единица живого
Все клетки имеют одинаковые принципы организации

Слайд 4

Клетка-город
Объект биологии

Слайд 5

Клетка как город
Внешняя стена с воротами => мембрана с каналами
Кремль =>

ядро
Библиотека => геном
Библиотека находится в Кремле => геном находится в ядре
Роботы => белки
В книгах библиотеки (геноме) содержатся инструкции как делать роботов (белки)

Слайд 6

Why do we need genome? The inner life of the cell
https://www.youtube.com/watch?v=wJyUtbn0O5Y

Слайд 7

ЧТО ТАКОЕ ГЕНОМ?
Для биолога
Для биоинформатика
Ряд Нобелевских премий 1950-1970

Слайд 8

Геномы разных органзимов

Слайд 9

Вторичная структура – альфа-спираль и бета-лист
Альфа-субъединица АТФ-синтетазы
Лайнус Полинг
Нобелевская премия по

химии 1954

Обитатели клетки-города

Слайд 10

Proteins are made of 20 amino acids
Over 100 amino acids exist

in nature

Слайд 11

Белок - текст, написанный на алфавите
из 20 букв

Слайд 12

Genome is made of DNA

Слайд 13

DNA is made of 4 nucleotides

Слайд 14

Chargaff’s rules
1st Chargaff’s rule
А=Т and G=C in double-stranded DNA
2nd Chargaff’s rule
А=Т

и G=C in single-stranded DNA

http://www.youtube.com/watch?v=HvJlnujmYcg

Human Genome:
A=30.9% and T=29.4%; G=19.9% and C=19.8%

Слайд 15

Good Quality DNA X-Ray images
Морис Уилкинс и Розалинд Франклин
.

Слайд 16

Nobel Prize in 1962
Геном - текст, написанный на алфавите
из 4

букв

Слайд 17

Расшифровать генетический код

Слайд 18

Георгий Гамов
- объясняет загадочное число 20.
- число различных ромбовых комбинаций

именно в такой модели равно как раз двадцати.

Бубновый код

Треугольный (комбинаторный)

Перекрывающиеся

Слайд 19

«Мы просто пили калифорнийское вино, и нам приходили идеи» Георгий Антонович

Гамов

Джордж Гамов, физик, ALA — аланин Ричард Фейнман, физик, GLY- глицин Джеймс Уотсон, биолог, PRO — пролин Макс Дельбрюк, физик, TRP триптофан Фрэнсис Крик, биолог, TYR – тиразин
Эрвин Чаргаф, биохимик, LYS – лизин

Francis Crick, Alexander Rich, George Gamow, James Watson, Melvin Calvin

Клуб РНК-галстуков

Слайд 20

Код без запятых
Синтез белков происходит не на ДНК, а на посреднике

в виде молекулы РНК
Гипотеза Крика об адаптерных молекулах
Проблема рамки считывания и значащих и незначащих кодонов

Френсис Крик

Слайд 21

1957, Francis Crick a talk at University College, London
Francis Crick’s unpublished

1956 sketch of the central dogma. (Image: Wellcome Library, London.)

стала известна
как Crick’s Central Dogma
или
Центральная догма молекулярной эволюции

Слайд 22

Открытие РНК
Об РНК знали с 1868 года, когда Фридрих Мишер

открыл нуклеиновые кислоты.
1961 - Две публикации в Nature
announcing the isolation of messenger RNA (mRNA)
Theoretical Review François Jacob and Jacques Monod about role of mRNA in gene regulation

Слайд 23

V Международный биохимический конгресс
1961
Москва, 10-16 августа
Ниренберг М.В., Маттеи Г. // Тр.

V Международ. биохим. конгресса. Симп.1. 1962.
С.211—226

Слайд 24

Эксперимент Ниренберга

Слайд 25

1968 - Нобелевская премия по физиологии и медицине
Ниренберг, Хорана,
Холли

Слайд 26

Центральная догма молекулярной биологии
ДНК
РНК
Белок
Репликация
Транскрипция
Трансляция

Слайд 27

DNA replication
https://www.youtube.com/watch?v=4jtmOZaIvS0

Слайд 28

Transcription and translation
https://www.youtube.com/watch?v=41_Ne5mS2ls

Слайд 29

Рождение технологий

Слайд 30

1977 год
Нобелевская премия по химии 1980 г.
Метод секвенирования Сэнгера
The Wellcome Trust

Sanger Institute, 1992

1992 г

Начал с получения полной аминокислотной последовательности инсулина в 1951-52

Слайд 31

Первый отсеквенированный геном
1995 г.
бактерия Haemophilus influenzae –гемофильная палочка или палочка

Пфейфера

5 Mb

Слайд 32

Human Genome Project
Started in 1990
Finished 2001/2003
Sanger Sequencing
3 Gb

Слайд 33

Слайд 34

Next Generation Sequencing, or NextGenSeq, or NGS

Слайд 35

Слайд 36

Слайд 37

NextGen Sequencing Revolution
Human genome –
Volumes, double-sided,
4pt, ~ 43,000

chars per page

To print is more expensive than to sequence

Школа Науки о данных. Введение в молекулярную биологию

Содержание

Введение в молекулярную биологиюМолекулярная биология для компьютерщиков за полтора часа Мария

Объекты в биологииБиологический объект - это живой организмВсе живые тела состоят

Клетка-городОбъект биологии

Клетка как городВнешняя стена с воротами => мембрана с каналамиКремль =>

Why do we need genome? The inner life of the cellhttps://www.youtube.com/watch?v=wJyUtbn0O5Y

ЧТО ТАКОЕ ГЕНОМ? Для биологаДля биоинформатика Ряд Нобелевских премий 1950-1970

Геномы разных органзимов

Вторичная структура – альфа-спираль и бета-листАльфа-субъединица АТФ-синтетазыЛайнус Полинг Нобелевская премия по

Proteins are made of 20 amino acidsOver 100 amino acids exist

Белок - текст, написанный на алфавите из 20 букв

Genome is made of DNA

DNA is made of 4 nucleotides

Chargaff’s rules 1st Chargaff’s ruleА=Т and G=C in double-stranded DNA2nd Chargaff’s ruleА=Т

Good Quality DNA X-Ray imagesМорис Уилкинс и Розалинд Франклин.

Nobel Prize in 1962Геном - текст, написанный на алфавите из 4

Расшифровать генетический код

Георгий Гамов- объясняет загадочное число 20. - число различных ромбовых комбинаций

«Мы просто пили калифорнийское вино, и нам приходили идеи» Георгий Антонович

Код без запятыхСинтез белков происходит не на ДНК, а на посреднике

1957, Francis Crick a talk at University College, LondonFrancis Crick’s unpublished

Открытие РНК Об РНК знали с 1868 года, когда Фридрих Мишер

V Международный биохимический конгресс1961Москва, 10-16 августаНиренберг М.В., Маттеи Г. // Тр.