Общая характеристика ферментов как биологических катализаторов

Содержание

Слайд 2

ФЕРМЕНТЫ (ЭНЗИМЫ) – СОЕДИНЕНИЯ БЕЛКОВОЙ ПРИРОДЫ, СПОСОБНЫЕ КАТАЛИТИЧЕСКИ УСКОРЯТЬ ПРОТЕКАНИЕ ХИМИЧЕСКИХ

ФЕРМЕНТЫ (ЭНЗИМЫ) – СОЕДИНЕНИЯ БЕЛКОВОЙ ПРИРОДЫ, СПОСОБНЫЕ КАТАЛИТИЧЕСКИ УСКОРЯТЬ ПРОТЕКАНИЕ ХИМИЧЕСКИХ

РЕАКЦИЙ

Значение для изучения:
Ферменты - биологические регуляторы химических процессов в клетке (основа жизнедеятельности);
Нарушения в их структуре и функции – возникновение энзимопатий.
Энзимодиагностика.
Энзимотерапия.
Использование к качестве реактивов для определения метаболитов.

Слайд 3

Сходство ферментов с небиологическими катализаторами заключается в том, что: Небиологические катализаторы

Сходство ферментов с небиологическими катализаторами заключается в том, что:

Небиологические катализаторы и

энзимы ускоряют энергетически возможные реакции;
Ведут реакции в обход энергетического барьера;
Слайд 4

Сходство ферментов с небиологическими катализаторами заключается в том, что: Свободная энергия

Сходство ферментов с небиологическими катализаторами заключается в том, что:

Свободная энергия

Время

Конечные продукты

Начальные

субстраты

Е’а

Еа

Е’а – энергия активации катализируемой ферментами реакции

Еа – энергия активации некатализируемой реакции

Слайд 5

Сходство ферментов с небиологическими катализаторами заключается в том, что: В ходе

Сходство ферментов с небиологическими катализаторами заключается в том, что:

В ходе катализа

направление реакции не изменяется;
Не расходуются во время реакции;
Требуется небольшое их количество.
Слайд 6

Отличия ферментов от небиологических катализаторов (основные свойства) Скорость ферментативных реакций значительно

Отличия ферментов от небиологических катализаторов (основные свойства)

Скорость ферментативных реакций значительно

выше;
Ферменты обладают высокой специфичностью (субстратной и каталитической);
3. Ферменты обладают конформационной лабильностью.
4. Энзимы действуют при определенных оптимальных условиях (температура, рН, микроэлементы, кооперативность);
5. Скорость ферментативной реакции может регулироваться.
Слайд 7

Структура ферментов Фермент (энзим) Простой белок (РНК-аза, пищевые ферменты) Сложный белок

Структура ферментов

Фермент (энзим)

Простой белок
(РНК-аза,
пищевые ферменты)

Сложный белок
(холофермент)

Белковая часть (апофермент)

Небелковая часть

Простетическая группа

Кофермент

Слайд 8

Небелковая часть Производные витаминов Гемы, входящие в состав цитохромов, каталазы, пероксидазы,

Небелковая часть

Производные витаминов
Гемы, входящие в состав цитохромов, каталазы, пероксидазы, гуанилатциклазы,

NO-синтазы и являющиеся простетической группой ферментов
Нуклеотиды – доноры и акцепторы остатка фосфорной кислоты
Убихинон, или кофермент Q, участвующий в переносе электронов и протонов
Фосфоаденозилметионин, участвующий в переносе сульфата
S-аденозилметионин – донор метильной группы
Глутатион, участвующий в окислительно-восстановительных реакциях
Слайд 9

Функции небелковой части фермента Перенос атомов водорода, электронов (окислительно-восстановительные реакции –

Функции небелковой части фермента

Перенос атомов водорода, электронов (окислительно-восстановительные реакции – НАД,

ФАД и др.).
Перенос химических групп (фосфопиридоксаль, биотин и др.)
Реакции синтеза, изомеризации, расщепление связей (ТДФ и др.)
Слайд 10

Активные центры ферментов Субстратный Каталитический Аллостерический Закономерности в построении активных центров

Активные центры ферментов

Субстратный

Каталитический

Аллостерический

Закономерности в построении активных центров
1. В построении

активных центров принимают участие небольшое количество радикалов аминокислот, обычно находящихся на значительном расстоянии друг от друга в полипептидной цепи.
2. Чаще всего в состав центра входят радикалы гис, сер, лиз, асп, цис.
3. В построении центров сложных ферментов участвуют химические группировки небелковой части.
Слайд 11

Активные центры ферментов Субстратный Каталитический Аллостерический Закономерности в построении активных центров

Активные центры ферментов

Субстратный

Каталитический

Аллостерический

Закономерности в построении активных центров
4. Если фермент

является олиго- или мультимером, то обычно на каждом протомере есть субстратный и каталитический участки.
5. Энергия взаимодействия субстрата с активным центром слабая с образование нековалентных связей
6. Активные центры формируются при образовании третичной и четвертичной структуры белковой части в процессе взаимодействия с субстратом (индуцированное соответствие).
Слайд 12

Схема строения активного центра фермента

Схема строения активного центра фермента

Слайд 13

Формирование активных центров химотрипсина А-цепь(13) В-цепь(140) С-цепь(96) 16-илей 57-гис 102-асп 195-сер

Формирование активных центров химотрипсина

А-цепь(13)

В-цепь(140)

С-цепь(96)

16-илей

57-гис

102-асп

195-сер

Слайд 14

Активный центр фермента Участок связывания Обеспечивает субстратную специфичность (выбор субстрата) -Абсолютная

Активный центр фермента

Участок связывания

Обеспечивает
субстратную специфичность
(выбор субстрата)

-Абсолютная субстратная специфичность
-Групповая субстратная специфичность
-Стереоспецифичность


Слайд 15

+ Абсолютная субстратная специфичность Аргиназа Орнитин + Мочевина + Уреаза +2 Н2О Н2О

+

Абсолютная субстратная специфичность

Аргиназа

Орнитин

+

Мочевина

+

Уреаза

+2

Н2О

Н2О

Слайд 16

Активный центр фермента Участок связывания Обеспечивает субстратную специфичность (выбор субстрата) -Абсолютная

Активный центр фермента

Участок связывания

Обеспечивает
субстратную специфичность
(выбор субстрата)

-Абсолютная субстратная специфичность
-Групповая субстратная специфичность
-Стереоспецифичность


Слайд 17

Групповая субстратная специфичность +2 Триацилглицерол 2-Моноацилглицерол Панкреатическая липаза Н2О

Групповая субстратная специфичность

+2

Триацилглицерол

2-Моноацилглицерол

Панкреатическая
липаза

Н2О

Слайд 18

ГРУППОВАЯ СУБСТРАТНАЯ СПЕЦИФИЧНОСТЬ Пепсин - NH2 (фен, тир, три, глу, асп)

ГРУППОВАЯ СУБСТРАТНАЯ СПЕЦИФИЧНОСТЬ

Пепсин

- NH2

(фен, тир, три, глу, асп)

Трипсин

- СООH

(лиз, арг)

Химотрипсин

- СООH

(тир,

фен, три)
Слайд 19

ГРУППОВАЯ СУБСТРАТНАЯ СПЕЦИФИЧНОСТЬ Тир Пепсин Химотрипсин

ГРУППОВАЯ СУБСТРАТНАЯ СПЕЦИФИЧНОСТЬ

Тир

Пепсин

Химотрипсин

Слайд 20

Активный центр фермента Участок связывания Обеспечивает субстратную специфичность (выбор субстрата) -Абсолютная

Активный центр фермента

Участок связывания

Обеспечивает
субстратную специфичность
(выбор субстрата)

-Абсолютная субстратная специфичность
-Групповая субстратная специфичность
-Стереоспецифичность


Слайд 21

Стереоспецифичность Стереоспецифичность к D-сахарам + АТФ + АДФ Гексокиназа D-глюкоза D-глюкозо-6-фосфат Стереоспецифичность к L-аминокислотам

Стереоспецифичность

Стереоспецифичность к D-сахарам

+ АТФ

+ АДФ

Гексокиназа

D-глюкоза

D-глюкозо-6-фосфат

Стереоспецифичность к L-аминокислотам

Слайд 22

Активный центр фермента Участок связывания Каталитический участок Обеспечивает субстратную специфичность (выбор

Активный центр фермента

Участок связывания

Каталитический участок

Обеспечивает
субстратную специфичность
(выбор субстрата)

-Абсолютная субстратная специфичность
-Групповая субстратная

специфичность
-Стереоспецифичность

Обеспечивает каталитическую специфичность выбора пути превращения данного субстрата

Специфичность пути превращения субстрата

Слайд 23

КАТАЛИТИЧЕСКАЯ СПЕЦИФИЧНОСТЬ Каталитические пути превращения глюкозо-6-фосфата

КАТАЛИТИЧЕСКАЯ СПЕЦИФИЧНОСТЬ

Каталитические пути превращения глюкозо-6-фосфата

Слайд 24

Механизм действия ферментов Е + S ЕS ЕP Е + P Этапы ферментативного катализа

Механизм действия ферментов

Е + S

ЕS

ЕP

Е + P

Этапы ферментативного катализа

Слайд 25

Механизм действия ферментов Изменение свободной энергии в ходе химической реакции, некатализируемой и катализируемой ферментами

Механизм действия ферментов

Изменение свободной энергии в ходе химической реакции, некатализируемой и

катализируемой ферментами
Слайд 26

2 H2O2 2 H2O O2 + Еа 18000 кал/моль платина (11

2 H2O2

2 H2O

O2

+

Еа

18000 кал/моль

платина (11 700 кал/моль)

каталаза (

менее 2000 кал/моль)
Слайд 27

Множественные формы ферментов Ферменты – катализирующие одну химическую реакцию с принципиально

Множественные формы ферментов

Ферменты – катализирующие одну химическую реакцию с принципиально одинаковым

механизмом, но отличающиеся друг от друга физико-химическими свойствами, кинетическими параметрами, условиями активации, особенностями связи белковой и небелковой части.

Генетически обусловленные (изоферменты – отличаются по первичной структуре белка)

Генетически необусловленные (возникают вследствие химической модификации)

Слайд 28

Реакция, катализируемая лактатдегидрогеназой (ЛДГ)

Реакция, катализируемая
лактатдегидрогеназой (ЛДГ)