Этиологическая диагностика внебольничных инфекций дыхательных путей

клинического материала на питательные среды - идентификация и определение чувствительности к АБ
Некультуральные методы выявления возбудителей: - Экспресс-тесты - Методы амплификации нуклеиновых кислот (ПЦР и др.)
Иммуносерологические исследования

Ежлова Е.Б., и соавт. МУК 4.2.3115 -13. Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека. Москва, 2013.

catarrhalis, энтеробактерий, S. aureus, P. aeruginosa
Могут использоваться респираторные образцы (мокрота, орофарингеальный мазок, аспират из синуса и др.), кровь, плевральная жидкость
Возможна идентификация микроорганизмов и определение их чувствительности к АБ

КУЛЬТУРАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ ПРИ ИНФЕКЦИЯХ ДЫХАТЕЛЬНЫХ ПУТЕЙ

Зубков М.Н. . В кн.: Респираторная медицина. Под ред. А.Г. Чучалина М.: ГЭОТАР-Медиа, 2007. Т. 1, С. 238-252. 2. Clinical Microbiology Procedures Handbook. 3d ed. update. L.S. Garcia, editor in chief. ASM Press. Washington, DC. 2010.

качества образца (х100) (Э < 10 в п/з, Л > 25 в п/з)
Морфология и количество микроорганизмов (х1000, <10 полей) → предварительный диагноз, более точная интерпретация культурального исследования
Грам(+) диплококки

Зубков М.Н. . В кн.: Респираторная медицина. Под ред. А.Г. Чучалина М.: ГЭОТАР-Медиа, 2007. Т. 1, С. 238-252. 2. Clinical Microbiology Procedures Handbook. 3d ed. update. L.S. Garcia, editor in chief. ASM Press. Washington, DC. 2010.

значение!

Streptococcus viridans
Staphylococcus epidermidis и saprophyticus
Enterococcus spp.
Neisseria spp.
Candida spp.

1. Зубков М.Н. . В кн.: Респираторная медицина. Под ред. А.Г. Чучалина М.: ГЭОТАР-Медиа, 2007. Т. 1, С. 238-252.

aureus, K. pneumoniae
Целесообразно при тяжелом течении (выше вероятность бактериемии!)
Целесообразно использовать коммерческие флаконы и автоматизированный метод (↓ сроки, ↑ информативность)
При правильном получении образцов – 100% этиологический диагноз!

1. Зубков М.Н. . В кн.: Респираторная медицина. Под ред. А.Г. Чучалина М.: ГЭОТАР-Медиа, 2007. Т. 1, С. 238-252. 2. Clinical Microbiology Procedures Handbook. 3d ed. update. L.S. Garcia, editor in chief. ASM Press. Washington, DC. 2010.

терапии (даже 1 доза ↓ информативность)
Соблюдать технику получения образцов - мокрота – после обработки полости рта, при глубоком откашливании - кровь – не касаться руками места венепункции, не менее 2-х образцов, не менее 10 мл/образец
Быстрая доставка в лабораторию и/или соблюдение условий хранения образцов

1. Зубков М.Н. . В кн.: Респираторная медицина. Под ред. А.Г. Чучалина М.: ГЭОТАР-Медиа, 2007. Т. 1, С. 238-252. 2. Clinical Microbiology Procedures Handbook. 3d ed. update. L.S. Garcia, editor in chief. ASM Press. Washington, DC. 2010.

~ 72- 120 ч

белков в кислой среде

Узнаем бактерию по «отпечаткам пальцев»… всего за 5-15 мин.

MALDI масс-спектрометр + компьютерная БД (>2800 видов бактерий и грибов)

специфичность >90%

ЭКСПРЕСС-ДИАГНОСТИКА ПНЕВМОКОККОВОЙ ПНЕВМОНИИ У ВЗРОСЛЫХ

Тяжелая ВП
Пациенты с непродуктивным кашлем
Предшествующая АБ терапия

1. Ежлова Е.Б., и соавт. МУК 4.2.3115 -13. Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека. Москва, 2013. 2. Lim W.S., et al. Thorax 2009; 64: iii2-iii55.

или тест на основе ИФА

Тяжелая ВП
Известные факторы риска легионеллезной инфекции
Пациенты с непродуктивным кашлем

Чувствительность – 70-95%, специфичность - 95%

Культуральное исследование (инвазивные образцы) и ПЦР – редко, дорогостоящий и трудоемкий метод – используется только при НП!

Ежлова Е.Б., и соавт. МУК 4.2.3115 -13. Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав Cпотребителей и благополучия человека. Москва, 2013.

выявления БГСА >90%
Быстрое получение результата (решение о тактике в режиме реального времени)
Входят в алгоритмы диагностики и лечения ОТФ и контроля за стрептококковой инфекцией
Себестоимость сопоставима с культуральным исследованием

1.Брико Н.И., и соавт. Профилактика стрептококковой (группы А) инфекции". Клинические рекомендации. – М: Министерство здравоохранения Российской Федерации, 2013 – 41с. 2. Промыслова Е.А., и соавт. Педиатрическая фармакология 2013; 10 (6): 10–14.

т.д.) – вариабельная чувствительность и специфичность

ДИАГНОСТИКА РЕСПИРАТОРНЫХ ИНФЕКЦИЙ, ВЫЗВАННЫХ “АТИПИЧНЫМИ” ВОЗБУДИТЕЛЯМИ

Mycoplasma pneumoniae

ПЦР респираторных образцов и/или ПИФ (выявление антигенов в респираторных образцах)
Серологические исследования не рекомендуются в связи с отсутствием надежных коммерческих тестов

Chlamydophila pneumoniae

1. Ежлова Е.Б., и соавт. МУК 4.2.3115 -13. Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека. Москва, 2013. 2. Lim W.S., et al. Thorax 2009; 64: iii2-iii55.

Для ПЦР предпочтителен образец из нижних дыхательных путей, при отсутствии – комбинированный мазок (назо-и орофарингеальный)

антигенов в клинических образцах
Иммуносерологические исследования

Наиболее значимо выявление вирусов гриппа!

1. Ежлова Е.Б., и соавт. МУК 4.2.3115 -13. Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав Cпотребителей и благополучия человека. Москва, 2013.

респираторных вирусов (ОРВИ-скрин)
Тест-системы для выявления и дифференциации вирусов гриппа А и В, в том числе H1N1 (пандемический), H3N5 и др.
Мультиплексная тест-система для выявления M. pneumoniae, C. pneumoniae

Ежлова Е.Б., и соавт. МУК 4.2.3115 -13. Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав Cпотребителей и благополучия человека. Москва, 2013.

случаях: - подозрение на коклюш - эпидемия гриппа, группа высокого риска развития осложнений
Клинический материал для исследования: - назофарингеальный или орофарингеальный мазок/смыв, трахеальный аспират, мокрота
Прямое обнаружение антигенов (вирусы гриппа, РС вирус), ПЦР-РВ (др. респираторные вирусы), ПЦР и культуральное исследование (B. pertussis)

Walsh E. Acute bronchitis. In: In: Mandell GL, Bennett JE, Dolin R. (eds). Principles & Practice of Infectious Diseases. 7th ed. Churchill Livingstone, 2010: 873-6

только при неэффективности стартовой АБ терапии или по эпидемиологическим показаниям

бактериоскопия и культуральное исследование мокроты/трахеального аспирата (тяжелая ВП)
культуральное исследование крови (тяжелая ВП)
культуральное исследование плевральной жидкости (если есть показания для плевральной пункции)
экспресс-диагностика легионеллезной и пневмококковой антигенурии (тяжелая ВП, эпид. факторы риска)
ПЦР/экспресс-тесты на вирусы гриппа А (по показаниям)

Госпитализированные пациенты

Проект клинических рекомендаций по ВП у взрослых, 2018 г.

GL, Bennett JE, Dolin R. (eds). Principles & Practice of Infectious Diseases. 7th ed. Churchill Livingstone, 2010: 873-6

При неосложненном течении ХОБЛ не проводится → эмпирическая АБ терапия
Показания для микробиологического исследования:
- частые обострения (> 4 обострений в год)
- хроническая продукция гнойной мокроты
- тяжелое обострение ХОБЛ
Клиническим материалом для исследования, как правило, является мокрота (у пациентов с тяжелым обострением – инвазивные респираторные образцы )

при целостной барабанной перепонке – материл, полученный путем тимпанопункции - при перфорированной – мазок отделяемого из полости среднего уха

spp.

не имеют
этиологического
значения

этиологически значимы при наружном отите

хода, мазок из носоглотки – недостоверны
Материал, полученный при эндоскопии синуса – велика вероятность контаминации
Аспират из синуса – количественное исследование – «золотой стандарт» бактериологической диагностики
Промывные воды синуса