Дрозофила - модельный организм для генетических исследований

Содержание

Слайд 2

Википедия Дрозофила фруктовая, дрозофила малая, или дрозофила обыкновенная (Drosophila melanogaster) —двукрылое)

Википедия

Дрозофила фруктовая, дрозофила малая, или дрозофила обыкновенная (Drosophila melanogaster) —двукрылое) —двукрылое насекомое, вид плодовой мухи) —двукрылое насекомое, вид плодовой мухи из рода дрозофил) —двукрылое насекомое,

вид плодовой мухи из рода дрозофил, наиболее часто использующийся в генетических) —двукрылое насекомое, вид плодовой мухи из рода дрозофил, наиболее часто использующийся в генетических экспериментах (во второй половине XX века дрозофила стала одним из основных модельных организмов) —двукрылое насекомое, вид плодовой мухи из рода дрозофил, наиболее часто использующийся в генетических экспериментах (во второй половине XX века дрозофила стала одним из основных модельных организмов также для биологии развития).

В современной биологической литературе часто упоминается как просто «дрозофила» или «плодовая мушка».

лат. Drosophila 
от др.-греч. δρόσος — роса, влага + φιλέω — любить

Слайд 3

Почему дрозофила – удобный модельный объект? Очень короткий срок развития от

Почему дрозофила – удобный модельный объект?

Очень короткий срок развития от яйца

до взрослой мухи.
Дрозофила может давать до 40 поколений, тогда как человеку для этого потребуется 1000 лет.
Слайд 4

Почему дрозофила – удобный модельный объект? Легко отличать самца от самки

Почему дрозофила – удобный модельный объект?

Легко отличать самца от самки
Исключительная

плодовитость. Одна оплодотворенная самка за всю жизнь даёт ~400 потомков.
Слайд 5

Почему дрозофила – удобный модельный объект? Основные маркерные мутации хорошо различимы

Почему дрозофила – удобный модельный объект?

Основные маркерные мутации хорошо различимы
Богатство мутаций,

способность мушек к обширному мутагенезу позволяет достаточно быстро накапливать данные при изучении многих биохимических и эволюционных процессов
Слайд 6

Малое число хромосом Самец Самка Уникальные политенные хромосомы Почему дрозофила –

Малое число хромосом
Самец Самка
Уникальные политенные хромосомы

Почему дрозофила – удобный модельный объект?

2

2

3

3

4

4

В

соматических клетках самца и самки дрозофилы содержится по 4 пары хромосом (2n = 8): три пары аутосом и одна пара половых хромосом
Слайд 7

Почему дрозофила – удобный модельный объект? Питательные среды достаточно простые, что

Почему дрозофила – удобный модельный объект?

Питательные среды достаточно простые, что позволяет

дрозофилу разводить дешево и менее трудоемко по сравнению с другими лабораторными животными.
Слайд 8

Исследования дрозофил в космосе Исследования «космических мух» помогут найти механизмы защиты

Исследования дрозофил в космосе

Исследования «космических мух» помогут найти механизмы защиты

от космической радиации для космонавтов.
На дрозофилах исследуют влияние невесомости и условий космоса на иммунитет.

«Дом» дрозофил
в лаборатории

«Космический дом» дрозофил

На спутнике «Фотон-М» 2014 г.

Слайд 9

Кто и когда первый стал использовать дрозофилу в экспериментах?

Кто и когда первый стал использовать дрозофилу в экспериментах?

Слайд 10

Кто первый стал использовать дрозофилу в экспериментах? Кастл и Карпентер, 1906

Кто первый стал использовать дрозофилу в экспериментах?

Кастл и Карпентер, 1906 г.
«The

organism used in this experiment in close-breeding was Drosophila ampelophila Low, a small dipterous insect known under various popular names such as "the little fruit fly, pomace fly, vinegar fly, wine fly, and pickled fruit fly " ….»
«Организм, использованный в этом эксперименте называется Drosophila ampelophila Low, небольшое двукрылое насекомое, известное под различными бытовыми названиями, такими как "маленькая фруктовая мушка, жмыховая мушка, уксусная мушка, винная мушка и маринадная мушка " ...»
Слайд 11

Томас Морган и ученики авторы хромосомной теории наследственности Thomas Hunt Morgan

Томас Морган и ученики авторы хромосомной теории наследственности

Thomas Hunt Morgan
(1866–1945)

Alfred

Henry Sturtevant
(1891–1970)

Herman Joseph Muller
(1890–1967)

Calvin Blackman 
Bridges
(1889–1938)

В 1915 г. вышла их книга «Механизм менделевской наследственности» («The Mechanism Heredity»), в которой сообщалось, что наследственность подчиняется вполне определенным законам и описывается точными количественными методами.
«За открытия, связанные с выяснением роли хромосом в наследственности» в 1933 г. Т. Морган был удостоен звания лауреата Нобелевской премии. В 1946 г эту премию получил Г. Мёллер «За разработку метода получения мутаций с помощью рентгеновских лучей».

Слайд 12

«Колоссально много для развития учения о наследственности сделал американец Томас Морган,

«Колоссально много для развития учения о наследственности сделал американец Томас Морган,

который вначале был столь же ярым противником Менделя и решил его опровергнуть на другом объекте - кроликах. Однако попечители Колумбийского университета, где работал Морган, сочли кроликов чересчур дорогими; Морган не пал духом и использовал для опытов крошечную плодовую мушку - дрозофилу. Дрозофила стала классическим объектом генетики - редчайший случай, когда скупость снабженцев оказала науке неоценимую услугу! Дело в том, что за год можно получить 25 поколений дрозофил и разместить на одном лабораторном столе их многотысячные «стада»».
Медников Б.М., Дарвинизм в XX веке, М., «Советская Россия», 1975 г., с. 25.

Почему Т. Морган стал использовать дрозофилу?

Слайд 13

Отечественные учёные, работавшие с дрозофилой Николай Владимирович Тимофеев-Ресовский (1900-1981) - один

Отечественные учёные, работавшие с дрозофилой

Николай Владимирович
Тимофеев-Ресовский
(1900-1981)
- один из

основоположников популяционной и радиационной генетики

«Действие рентгенлучей на наследственную мутабильность дрозофилы» 28 июня 1929 г.
– одна из первых работ.

Фрагмент рукописи

Слайд 14

Н.И. Вавилов, Т. Морган и Н.В. Тимофеев-Ресовский Итака. 1932 г. «…Мушка

Н.И. Вавилов, Т. Морган
и Н.В. Тимофеев-Ресовский
Итака. 1932 г.

«…Мушка называлась дрозофила.

Трехмиллиметровая мушка с тигровым брюшком. Если бы я писал научно-популярную книгу, я бы прежде всего воспел дрозофилу, сочинил бы нечто вроде оды этому насекомому, верному помощнику тысяч генетиков начиная с 1909 года. Оду за ее откровенность. Или за ее болтливость. Болтливый объект, который хорош тем, что так плохо хранит тайны природы. Трудно оценить, какую большую службу сослужила дрозофила науке…»
Даниил Гранин «Зубр»

Тимофеев-Ресовский с начала 1920-х годов участвовал в работе неформального семинара, организованного группой С. С. Четверикова в институте Н. К. Кольцова («Дрозсоор», или «совместное орание по поводу дрозофилы»), из которого вышли многие советские генетики.

Слайд 15

- Незаменимый объект! Быстро размножается. Потомство большое. Наследственные признаки четкие. Мутацию

- Незаменимый объект! Быстро размножается. Потомство большое. Наследственные признаки четкие.

Мутацию не спутать с нормальной. Глаза красные, глаза белые. Во всех серьезных лабораториях мира работают на дрозофиле. Невежды любят говорить о том, что дрозофила не имеет хозяйственного значения. Но никто и не пытается вывести породу жирномолочных дрозофил. Они нужны, чтобы изучать законы наследственности. Законы эти одинаковы для мухи и для слона. На слонах получите тот же результат. Только поколение мух растет за две недели. Вместо того, чтобы из мухи делать слона, мы из слона делаем муху!

Один из учеников Зубра Николай Викторович Лучник записал
речь учителя во славу дрозофилы:

Слайд 16

Отечественные учёные, работавшие с дрозофилой М.Е. Лобашев изучал мутагенное действие химических

Отечественные учёные, работавшие с дрозофилой

М.Е. Лобашев изучал
мутагенное действие химических веществ

в 1934 г.

Впервые в истории науки генетики возникает идея о мутировании не как о мгновенном акте, а как о процессе, текущем во времени, имеющем обратимый характер. Т.о. была высказана мысль о возможности восстановления клетки, находящейся в предмутационном состоянии. Следовательно, открылась возможность вмешательства в процесс становления мутаций, т.е. возможность как ускорения, так и замедления его течения.
Впервые был поставлен и вопрос о роли системного, организменного контроля мутационного процесса.

Слайд 17

Отечественные учёные, работавшие с дрозофилой Николай Петрович Дубинин (1907-1998) В 30-х

Отечественные учёные, работавшие с дрозофилой

Николай Петрович
Дубинин
(1907-1998)

В 30-х годах показал
адаптивное

значение
ряда хромосомных мутаций. Исследуя ступенчатый аллелизм впервые сделал вывод о делимости гена и его сложной линейной структуре.

Иосиф Абрамович
Рапопорт
(1912-1990)

Николай Николаевич
Соколов
(1902 – 1975)

Борис Николаевич
Сидоров
(1908 – 1980)

Учёные-эволюционисты. Изучали виды-двойники дрозофил, поскольку только на этом материале можно провести точный генетический анализ первичных изолирующих барьеров между видами. Вместе с Дубининым создали трех- и пятихромосомные расы дрозофил.

Развитии химического мутагенеза и создание химических супермутагенов, в сотни раз повышающих уровень спонтанного мутирования.

Слайд 18

В середине 30-х годов учеными Н.П. Дубининым, Б.Н. Сидоровым, В.В. Хвостовой

В середине 30-х годов учеными Н.П. Дубининым, Б.Н. Сидоровым, В.В. Хвостовой

и А.А. Прокофьевой-Бельговской был открыт и изучен «эффект положения» генов, когда нормальный ген, будучи искусственно перенесен в другое место хромосомы, менял характер своего проявления. Этот феномен является и ныне одной из горячих точек современной науки.

Александра Алексеевна
Прокофьева-Бельговская
(1903—1984)

Отечественные учёные, работавшие с дрозофилой

Prokofyeva-Belgovskaya A.A. «The Structure of the Y Chromosome in the Salivary Glands of Drosophila melanogaster. Genetics.1937».

эффект положения
гена white

Слайд 19

Елизавета Ивановна Балкашина (1899—1981) Открыла в 1928 году у дрозофил группу

Елизавета Ивановна
Балкашина
(1899—1981)

Открыла в 1928 году у дрозофил группу генов,

ответственных за ключевые стадии онтогенеза. Провела анализ гомеозисной мутации spineless-aristаpedia. Отметила, что мутация «выбивает» измененных мух за пределы класса насекомых.

Мутация в гене spineless превращает аристы в лапки

Отечественные учёные, работавшие с дрозофилой

Дикий тип

Мутант

Слайд 20

Отечественные учёные, работавшие с дрозофилой Борис Львович Астауров (1904-1974) В 1927

Отечественные учёные, работавшие с дрозофилой

Борис Львович
Астауров
(1904-1974)

В 1927 году открыл гомеозисную

мутацию tetraptera и заметил, что эта мутация переносит мух за пределы отряда двукрылых.
Эти мутации можно рассматривать как изменения одного гена, ведущие к неотении – возврат к предковым формам.

Bithorax

Слайд 21

Эдвард Льюис изучал гомеозисные гены, которые управляли развитием сегментов личинки в

Эдвард Льюис изучал гомеозисные гены, которые управляли развитием сегментов личинки в

органы имаго.
Льюис обнаружил коллинеарность во времени и пространстве между порядком генов в комплексе bithorax и структурой органов в сегментах.
Исследователь получил Нобелевскую премию по медицине в 1995 г.

Эдвард Льюис
Edward B. Lewis
(1918 – 2004)

Томас Кауфман
Thomas C. Kaufman

Molecular and Genetic Organization of The Antennapedia Gene Complex of Drosophila melanogaster

Американские учёные, изучавшие
гомеозисные (Hox) гены дрозофилы в 50-60х гг.

Слайд 22

bithorax Проявление гомеозисных мутаций у Drosophila Трансформация антенны в ногу комплекс

bithorax

Проявление гомеозисных мутаций у Drosophila

Трансформация антенны в ногу
комплекс генов

Antennepedia

Трансформация гальтеров в крылья
комплекс генов bithorax

Слайд 23

Пример гомеозисных мутаций: выключение гена proboscipedia у дрозофилы и клопа

Пример гомеозисных мутаций: выключение гена proboscipedia у дрозофилы и клопа

Слайд 24

Пример гомеозисных мутаций у растений Превращение тычинки в лепесток

Пример гомеозисных мутаций у растений

Превращение тычинки в лепесток

Слайд 25

Hoxb Эволюционный консерватизм организации и специфичности комплексов гомеозисных генов Antennepedia Complex Bithorax Complex

Hoxb

Эволюционный консерватизм организации и специфичности комплексов гомеозисных генов

Antennepedia Complex

Bithorax Complex


Слайд 26

План строения взрослого организма закладывается в эмбриогенезе

План строения взрослого организма закладывается в эмбриогенезе

Слайд 27

Общая модель формирования передне-задних градиентов Bcd Hb

Общая модель формирования передне-задних градиентов

Bcd Hb

Слайд 28

Первая «передняя» система морфогенов, определяет области головы и груди. Вторая «задняя»

Первая «передняя» система морфогенов, определяет области головы и груди.
Вторая «задняя»

система морфогенов определяет сегментацию абдоминальной области.
Третья «терминальная» система морфогенов отвечает за формирование несегментированных переднего (акрона) и заднего (тельсона) концов эмбриона.
Четвёртая система морфогенов контролирует становление паттерна вдоль D/V-оси.

Открытие К.Нюсляйн-Вольхард и Э. Вишауса:
Четыре системы морфогенов участвуют в поляризации эмбриона дрозофилы

Кристина
Нюсляйн-Вольхард

Эрик
Вишаус

Dorsal

A

A

A

P

P

P

D

V

Получили Нобелевскую премию вместе с Льюисом в 1995 г.

Слайд 29

W. Driever, V. Siegel, C. Nüsslein-Volhard. 1990. Development. 109:811–820. Bicoid mutant

W. Driever, V. Siegel, C. Nüsslein-Volhard.  1990. Development. 109:811–820.

 Bicoid mutant

 Дикий тип

Эмбрионы дрозофилы

СРАВНЕНИЕ

СЕГМЕНТАЦИИ ЭМБРИОНА И ИМАГО ДРОЗОФИЛЫ

КАК ИЗУЧАЛИ?
Получали мутантов с нарушением порядка сегментов

Слайд 30

Поляризация ооцита Передний морфоген Задний морфоген Ооцит дрозофилы поляризован. Оси полярности

Поляризация ооцита

Передний
морфоген

Задний
морфоген

Ооцит дрозофилы поляризован.
Оси полярности будущего эмбриона предопределены

генотипом матери.

А

Р

Слайд 31

Вальтер Геринг, 1938 г. рождения (Walter Jakob Gehring) Профессор биологии развития

Вальтер Геринг, 1938 г. рождения
(Walter Jakob Gehring)
Профессор биологии развития и генетики

Базельского университета.
"There's a genetic eye program, a leg program, a wing program, and the homeotic genes are the master switches which turn on these various programs"
Известен своими выдающимися достижениями в области генетики развития Дрозофилы, изучения генов теплового шока, транспозонов и гомеозисных генов.
Его группе принадлежит открытие гомеобокса.

Можно управлять работой генов: эксперименты Вальтера Геринга

Pax-6

eyeless

Эктопическая экспрессия гена eyeless

Ген человека
Pax-6

Ген дрозофилы
eyeless

Слайд 32

Система GAL4-UAS Brand A.H., Perrimon N. Targeted gene expression as a

Система GAL4-UAS

Brand A.H., Perrimon N. Targeted gene expression as a means

of altering cell fates and generating dominant phenotypes // Development. 1993. V. 118. P. 401-415

UAS - Upstream Activated Sequences - дрожжевой промотор, который активируется дрожжевым регуляторным белком GAL4

Слайд 33

Линия-драйвер GAL4 Линия-реcпондер Принцип работы системы GAL4-UAS Создание линий трансгенных дрозофил,

Линия-драйвер GAL4

Линия-реcпондер

Принцип работы системы GAL4-UAS

Создание линий трансгенных дрозофил, нарабатывающих дрожжевой белок

GAL4 под контролем специфических промоторов – коллекционные линии.
Создание линии трансгенных дрозофил, содержащих изучаемый ген под контролем дрожжевых сайтов UAS (молчат в геноме мухи).
Совмещение в одном генотипе двух компонентов системы простым скрещиванием.

Тканеспецифический промотор

Изучаемый ген

Слайд 34

Техника GAL4-UAS позволяет специфично контролировать экспрессию гена Мисэкспрессия Подавление Убиквитарная экспрессия

Техника GAL4-UAS позволяет специфично контролировать экспрессию гена

Мисэкспрессия Подавление

Убиквитарная
экспрессия GAL4 под промотором

гена тубулина;
Под UAS подставлен, например, ген человека PAX-6

UAS-трансген экспрессирует РНК-шпильку, комплеиентарную гену eyeless.

UAS

Слайд 35

Политенные хромосомы слюнных желёз личинок Обычные хромосомы дрозофилы 0,1 мм Личинка Tub-GAL4>UAS-GFP

Политенные хромосомы слюнных желёз личинок

Обычные хромосомы дрозофилы

0,1 мм

Личинка

Tub-GAL4>UAS-GFP

Слайд 36

Визуализация и картирование хромосомных перестроек Делеция Инверсия

Визуализация и картирование хромосомных перестроек

Делеция

Инверсия

Слайд 37

Мы можем «видеть» линейно организованное расположение генов в хромосоме cut ocelliless

Мы можем «видеть» линейно организованное расположение генов в хромосоме

cut

ocelliless

Слайд 38

Мы можем видеть работу генов в хромосоме Формирование ПУФОВ генами теплового

Мы можем видеть работу генов в хромосоме

Формирование ПУФОВ генами теплового шока

после тепловой обработки (а)
Тот же участок хромосомы до тепловой обработки (b).
Слайд 39

Мобильные генетические элементы («прыгающие» гены) дрозофилы Первыми, кому удалось открыть мобильные

Мобильные генетические элементы («прыгающие» гены) дрозофилы

Первыми, кому удалось открыть мобильные элементы

у дрозофилы, были российские ученые Г.П. Георгиев и В.А. Гвоздев и трое их молодых сотрудников Ю. Ильин, Н. Чуриков и Е. Ананьев.
Открытие было сделано ими в 1976 году.

Владимир Алексеевич
Гвоздев

Георгий Павлович
Георгиев

Исторический снимок впервые обнаруженных мобильных элементов (черные точки – сайты гибридизации) дрозофилы , сделанный Е. Ананьевым в 1976 году (Georgiev G.P. et al. Isolation of eukaryotic DNA fragments containing structural genes and the adjacent sequences. Science. 1977)

Гибридизация in situ на хромосомах

Слайд 40

Картирование генов с помощью гибридизации in situ радиоактивного ДНК-зонда на хромосомах

Картирование генов с помощью гибридизации in situ радиоактивного ДНК-зонда на хромосомах

Х-хромосома

Х-хромосома

Мутант

Гибридизация

с мобильным Р-элементом

Дикий тип

Гибридизация с фрагментом гена

Слайд 41

Выявление мест связывания с ДНК изучаемого белка Окраска антителами к Polycomb

Выявление мест связывания с ДНК изучаемого белка

Окраска антителами к Polycomb

Слайд 42

Можно выявлять гены, нарушающие упаковку хроматина и структуру хромосом Дикий тип

Можно выявлять гены, нарушающие упаковку хроматина и структуру хромосом

Дикий тип

Мутант

Хромоцентр

есть (красные стрелки)

Хромоцентра нет

К чему могут привести мутации таких генов у человека?
Нерасхождение хромосом, и, как следствие, синдром Дауна, например.
Дерепрессия онкогенов или репрессия генов-онкосупрессоров – опухоли, рак

Слайд 43

Как использовать дрозофилу для понимания биохимических процессов, генетики и наследственных болезней

Как использовать дрозофилу для понимания биохимических процессов, генетики и наследственных болезней

человека?
- На биохимическом уровне (на уровне клетки) дрозофила и человек устроены одинаково.
- Гены человека (мыши, крысы и т.д.), в отличие от дрозофилы, часто представлены в геноме многими копиями, что затрудняет исследование функций этих генов.
Слайд 44

Как использовать дрозофилу для изучения генов человека?

Как использовать дрозофилу для изучения генов человека?

Слайд 45

Гены, контролирующие спинное закрытие у эмбрионов дрозофилы, есть у человека, они

Гены, контролирующие спинное закрытие у эмбрионов дрозофилы, есть у человека, они

«включаются» при ранозаживлении

Были открыты 2 сигнальных пути, контролирующие ранозаживление: JNK и DPP

Мутанты с «дырой» на спине

JNK

DPP

Слайд 46

Гены дрозофилы, гомологи которых у человека связаны с заболеваниями Диабет Рак

Гены дрозофилы, гомологи которых у человека связаны с заболеваниями

Диабет

Рак лёгких

Мышечная дистрофия

Кардиомиопатия

Около

61 % известных человеческих заболеваний имеют узнаваемое соответствие в генетическом коде плодовой мушки, 50 % белковых последовательностей имеют аналоги у млекопитающих.
Слайд 47

Рак прямой кишки Колики Глухота Диабет Болезнь Паркинсона Гены дрозофилы, гомологи

Рак прямой кишки

Колики

Глухота

Диабет

Болезнь Паркинсона

Гены дрозофилы, гомологи которых у человека связаны с

заболеваниями (продолжение)
Слайд 48

Фиброматоз Глаукома Эпилепсия Лейкемия Умственная отсталость Гены дрозофилы, гомологи которых у человека связаны с заболеваниями (продолжение)

Фиброматоз

Глаукома

Эпилепсия

Лейкемия

Умственная отсталость

Гены дрозофилы, гомологи которых у человека связаны с заболеваниями (продолжение)

Слайд 49

Гены дрозофилы, гомологи которых у человека связаны с заболеваниями (окончание) Миопатия Ацидоз почечных канальцев Глаукома

Гены дрозофилы, гомологи которых у человека связаны с заболеваниями (окончание)

Миопатия

Ацидоз почечных

канальцев

Глаукома

Слайд 50

Nobel prizes for work on Drosophila 1933 Thomas Hunt Morgan -

Nobel prizes for work on Drosophila



1933 Thomas Hunt

Morgan - the role played by chromosomes in heredity

1946 Hermann Joseph Muller - the production of mutations by means of X-ray irradiation

1995 Edward B. Lewis, Christiane Nüsslein-Volhard, Eric F. Wieschaus - the genetic control of early embryonic development



2011 Bruce A. Beutler, Jules A. Hoffmann, - the activation of innate immunity and Ralph M. Steinman for his discovery of the dendritic cell and its role in adaptive immunity

2017 Jeffrey C. Hall, Michael Rosbash and Michael W. Young - molecular mechanisms controlling the circadian rhythm