Методы исследования комплексообразования. Леция 2

Сентябрь 9, 2022

Главная
Химия
Методы исследования комплексообразования. Леция 2

Содержание

2. Схематическое представление процесса образования заряженных каплей раствора ДНК в ацетате аммония (отрицательная и положительная моды)
3. Полные спектры ESI-MS дуплекса d(CGCGAATTCGCG)2 с дауномицином, доксорубицином и бромистым этидием в отрицательной (верх) и положительной
4. Масс-спектрометрический анализ
5. Образование 10-компонентного белкового комплекса с кофакторами и лигандами (а) Диссоциация мультипротеинового комплекса (b)
6. Плазмонный резонанс
7. Сенсограмма
12. Метод кругового дихроизма Вращательная сила электронного перехода
13. Структура и спектры поглощения и КД уридина
14. Спектр КД димера Общее выражение Три слагаемых а) собственный КД мономеров (одноэлектронный член) б) магнитно-электрический член
15. Экситонный спектр КД
16. Спектры КД ДНК при 0% и 60% спирта (В-форма) и 80% спирта (А-форма)
17. Индуцированный КД (по Mason, 1971) Влияние асимметричного поля ДНК: смешение электрического и магнитного моментов одного перехода
18. Сила вращения разрешенного перехода с большим дипольным моментом, взаимодействующего с хирально расположенным дипольным моментом
19. Интеркаляционное связывание
20. Бороздочное связывание
21. ИКД связанных с ДНК мономеров и димеров актиноцина ИКД изолированного мономера (интеркаляция) Экситонное взаимодействие (димеры)
22. Преобразование спектров ИКД Спектры ИКД связанных и взаимодействующих мономеров Результат вычитания из спектров взаимодействующих мономеров предельного
23. Инфракрасная спектроскопия
24. Флуоресцентная спектроскопия Физическая основа - испускание света при переходе из возбужденного в основное состояние - временной
31. Синглет-синглетный перенос энергии Способность хромофоров, удаленных от данного хромофора (до 80А), находящегося в возбужденном синглетном состоянии,
32. Примеры рентгенограмм (дифракционных картин) Белок ДНК-порфирин
33. Изоморфное замещение
34. Процесс определения структуры белка по дифракции на одиночном кристалле и использованию явления аномального рассеяния
35. Пример модели, вписанной в карту электронной плотности
36. Кристаллическая структура комплекса ДНК-актиномицинD
38. Скачать презентацию

Слайд 2

Схематическое представление процесса образования
заряженных каплей раствора ДНК в ацетате аммония

(отрицательная и положительная моды)

Слайд 3

Полные спектры ESI-MS дуплекса d(CGCGAATTCGCG)2
с дауномицином, доксорубицином и бромистым этидием
в

отрицательной (верх) и положительной (низ) моде

Слайд 4

Масс-спектрометрический анализ

Слайд 5

Образование 10-компонентного белкового
комплекса с кофакторами и лигандами (а)
Диссоциация мультипротеинового комплекса

(b)

Слайд 6

Плазмонный резонанс

Слайд 7

Сенсограмма

Слайд 8

Слайд 9

Слайд 10

Слайд 11

Слайд 12

Метод кругового дихроизма Вращательная сила электронного перехода

Слайд 13

Структура и спектры поглощения и КД уридина

Слайд 14

Спектр КД димера
Общее выражение
Три слагаемых
а) собственный КД мономеров (одноэлектронный член)

б) магнитно-электрический член
в) экситонный член
Необходимость учитывать дополнительные слагаемые в первом члене (возмущение, вносимое полем димера) и в остальных членах (взаимодействие с другими электронными переходами мономера)

Слайд 15

Экситонный спектр КД

Слайд 16

Спектры КД ДНК при 0% и 60% спирта (В-форма) и 80%

спирта (А-форма)

Слайд 17

Индуцированный КД (по Mason, 1971)
Влияние асимметричного поля ДНК: смешение электрического и

магнитного моментов одного перехода (одно-электронный член)
Конформационная подвижность лиганда
Вырожденное экситонное взаимодействие между соседними связанными молекулами лиганда
Невырожденное экситонное взаимодействие хромофора лиганда и мономера ДНК
Невырожденное экситонное взаимодействие между соседними связанными молекулами лиганда
Зависимость от r в каждом случае
Соотношение со спектром поглощения

Слайд 18

Сила вращения разрешенного перехода с большим дипольным моментом, взаимодействующего с хирально

расположенным дипольным моментом

Слайд 19

Интеркаляционное связывание

Слайд 20

Бороздочное связывание

Слайд 21

ИКД связанных с ДНК мономеров и димеров актиноцина
ИКД изолированного мономера (интеркаляция)
Экситонное

взаимодействие (димеры)

Слайд 22

Преобразование спектров ИКД
Спектры ИКД связанных и взаимодействующих мономеров
Результат вычитания из спектров

взаимодействующих мономеров предельного спектра (при r=0.02) - экситонная составляющая ИКД

Слайд 23

Инфракрасная спектроскопия

Слайд 24

Флуоресцентная спектроскопия
Физическая основа - испускание света при переходе из возбужденного в

основное состояние - временной масштаб 10-9 - 10-8 с.
Наблюдаемые параметры
1) Квантовый выход - отношение числа излученных фотонов к числу поглощенных - зависит от:
а) внутренняя конверсия (колебательные свободы)
б) столкновение и комплексообразование с тушителем
в) интеркомбинационная конверсия (переход в триплетное возбужденное состояние)
2) Форма и положение спектра возбуждения и излучения (флуоресценции)
а) нет зависимости от длины волны возбуждения
б) сдвиг в область более низких энергий относительно полосы поглощения
в) зеркальное отражение длинноволновой полосы поглощения
3) Время жизнм
4) Поляризация

Слайд 25

Слайд 26

Слайд 27

Слайд 28

Слайд 29

Слайд 30

Слайд 31

Синглет-синглетный перенос энергии
Способность хромофоров, удаленных от данного хромофора (до 80А), находящегося

в возбужденном синглетном состоянии, вызывать тушение его флуоресценции - слабые взаимодействия
а) донор и акцептор энергии (D и A)
б) возникновение резонанса - совпадение энергии излучения D с энергией поглощения А
в) теория Ферстера - зависимостьот расстояния между D и А

Слайд 32

Примеры рентгенограмм (дифракционных картин)
Белок
ДНК-порфирин

Слайд 33

Изоморфное замещение

Слайд 34

Процесс определения структуры белка по дифракции на одиночном кристалле и использованию

явления аномального рассеяния

Слайд 35

Пример модели, вписанной в карту электронной плотности

Слайд 36

Методы исследования комплексообразования. Леция 2

Содержание

Схематическое представление процесса образования заряженных каплей раствора ДНК в ацетате аммония

Полные спектры ESI-MS дуплекса d(CGCGAATTCGCG)2 с дауномицином, доксорубицином и бромистым этидиемв