Регуляция активности ферментов. (Лекция 3)

Содержание

Слайд 2

Регуляция каталитической активности фермента осуществляется: 1) присоединением эффекторных молекул (активаторы и

Регуляция каталитической активности фермента осуществляется:
1) присоединением эффекторных молекул (активаторы и ингибиторы);
2)

регуляция с помощью белок-белковых взаимодействий;
3) путем ковалентной модификации (фосфорелирование, ацетилирование, метилирование);
4) регуляция частичным или ограничен-ным протеолизом.
Слайд 3

Активаторы ферментов – это вещества: 1) формирующие активный центр фермента (Со2+,

Активаторы ферментов – это вещества:
1) формирующие активный центр фермента (Со2+,

Mg2+ Zn2+ Fe2+, Са2+);
2) облегчающие образование фермент-субстратного комплекса (Mg2+);
3) восстанавливающие SH-группы (глутатион, цистеин, меркаптоэтанол);
4) стабилизирующие нативную структуру белкафермента.
Слайд 4

Активируют ферментативные реакции обычно катионы (в таблице Менделеева с 19 по

Активируют ферментативные реакции обычно катионы (в таблице Менделеева с 19 по

30). Анионы менее активны, хотя ионы хлора и анионы некоторых других галогенов могут активировать пепсин, амилазу, аденилатциклазу. Активаторами могут быть белки: апопротеин A-I (лецитин-холестерол-ацилтрансфераза — ЛХАТ), апопротеин С-Н (липопротеинлипаза —ЛПЛ), вторичные внутриклеточные посредники.
Слайд 5

Ингибиторы ферментов — это соединения, которые взаимодействуя с ферментом, препятствуют образованию

Ингибиторы ферментов — это соединения, которые взаимодействуя с ферментом, препятствуют образованию

нормального фермент-субстратного комплекса, уменьшая тем самым скорость реакции или прекращая ее.
Слайд 6

Ингибиторы делят на две группы — неспецифические и специфические. Неспецифические ингибиторы

Ингибиторы делят на две группы — неспецифические и специфические.
Неспецифические ингибиторы

вызывают денатурацию белка-фермента (соли тяжелых металлов, кислоты, щелочи и др.) и их действие не связано с механизмами ферментативного катализа.
Действие специфических ингибиторов связано с механизмами ферментативного катализа. Специфические ингибиторы делятся на 2 группы: необратимые и обратимые.
Слайд 7

При необратимом ингибировании происходит непрерывная модификация молекул фермента, в результате чего

При необратимом ингибировании происходит непрерывная модификация молекул фермента, в результате чего

фермент частично или полностью теряет свою активность. Такое действие оказывают вещества, которые прочно и необратимо связывают функциональные группы активного центра или препятствуют-изменению валентности металла активного центра.
Слайд 8

1. Ингибиторы металлосодержащих ферментов (HCN, RCN, HF, СО и др.). Эти

1. Ингибиторы металлосодержащих ферментов (HCN, RCN, HF, СО и др.). Эти

соединения связываются с металлами с переменной валентностью (Сu или Fe), в результате чего нарушается процесс переноса электронов по дыхательной цени ферментов, поэтому эти ингибиторы называются дыхательными ядами.
2. Ингибиторы ферментов, содержащих SH-группу в активном центре (монойодацетат, дийодацетат, йодацетамид, соединения мышьяка и ртути).
3. Ингибиторы ферментов, содержащих ОН-группу в активном центре (фосфороорганические соединения, инсектициды). Эти ингибиторы тормозят, прежде всего, активность холинэстсразы – фермента, играющего первостепенную роль в деятельности нервной системы.
Слайд 9

Конкурентные ингибиторы — это молекулы, настолько похожие на молекулы субстратов реакций,

Конкурентные ингибиторы — это молекулы, настолько похожие на молекулы субстратов реакций,

что ферменты «не могут их различить». В результате связывания конкурентного ингибитора с активным центром фермента уменьшается количество истинных ферментсубстратных комплексов и падает скорость катализируемой реакции. Классическим примером конкурентного ингибирования является торможение сукцинатдегидрогеназы малоновой кислотой. Сукцинатлегидрогеназа катализирует окисление янтарной кислоты (сукцината) путем дегидрирования в фумаровую кислоту.
Слайд 10

Слайд 11

Неконкурентные ингибиторы — вещества, не имеющие структурного сходства с субстратами. Неконкурентные

Неконкурентные ингибиторы — вещества, не имеющие структурного сходства с субстратами. Неконкурентные

ингибиторы связываются не с активным центром, а в другом месте молекулы фермента, в том числе и в области аллостерического центра. Обратимые неконкурентные ингибиторы понижают Vmax а счет уменьшения количества действующих молекул фермента. Ингибиторы этого типа не мешают связыванию субстрата с активным центром сохранившихся молекул фермента, в результате величина Km не меняется. Механизм ингибирования состоит в снижении скорости реакции за счет уменьшения количества нормальных фермент-субстратных комплексов. Таким образом, при неконкурентном ингибировании: Vmax уменьшается, a Km не изменяется.
Слайд 12

Слайд 13

Аллостерическая регуляция Происходит путем присоединения к аллостерическому центру фермента эффекторов —

Аллостерическая регуляция
Происходит путем присоединения к аллостерическому центру фермента эффекторов —

активаторов и ингибиторов. Если в роли активатора выступают молекулы субстрата — гомотропная активация, если какой-то другой метаболит — гетеротропная. Для аллостерических ферментов кривая насыщения субстратом представляет собой сигмоидную кривую, а не гиперболу как для нерегуляторных ферментов.
Слайд 14

1. Аллостерические ферменты состоят из 2-х или более, часто симметричных, субъединиц,

1. Аллостерические ферменты состоят из 2-х или более, часто симметричных, субъединиц,

т. е. имеют четвертичную структуру.
2. Субъединицы фермента могут находиться в 2-х конформациях: R и Т. Конформации R (relax расслабление) обладает высоким сродством к субстрату, конформация Т (tense — напряжение) — низким сродством. Формы R и Т могут переходить друг в друга.
3. Эффекторы связываются с Т и R-конформациями фермента. Аллостерический ингибитор связывается преимущественно с Т-конформацией и еестабилизирует. В присутствии ингибитора большая часть молекул находятся в Т-конформации, что снижает сродство фермента к субстрату. Аллостерический активатор связывается преимущественно с R-конформацией.
4. Субъединицы атлостерических ферментов связаны между собой нековалентными связями. Изменение конформации одной субъединицы приводит к изменению конформации соседних субъединиц (кооперативный эффект).
Слайд 15

Предложено 2 модели кооперативного эффекта. Симметричная модель: субъединицы должны находиться в

Предложено 2 модели кооперативного эффекта.
Симметричная модель: субъединицы должны находиться в одном

и том же конформационном состоянии, т. е. возможны состояния RR и ТТ и невозможно состояние RT. В отсутствие субстрата почти все молекулы фермента находятся в Т-конформации. Добавление субстрата приводит к переходу Т-конформации в R-конформации одновременно всех субъединиц.
Слайд 16

Последовательная модель. Согласно этой модели каждая субъединица может существовать в одном

Последовательная модель. Согласно этой модели каждая субъединица может существовать в одном

из возможных конформационных состояний (R или Т). Связывание субстрата с одной субъединицей может вызвать последовательное изменение конформации соседней субъединицы или соседних субъединиц и в результате увеличивать (положительная кооперативность) или уменьшать (отрицательная кооперативность) их сродство к субстрату.
Слайд 17

Регуляция активности по принципу обратной связи (ретроингибирование) Во многих биосинтетических процессах

Регуляция активности по принципу обратной связи (ретроингибирование)
Во многих биосинтетических процессах основным

типом регуляции скорости многоступенчатого процесса является ингибирование по принципу обратной связи, когда конечный продукт связывается с активным центром фермента и ингибирует его. Такие ферменты называются ключевыми, находятся на первых этапах метаболического пути и определяют скорость всего процесса.

Например, фермент аспартат-транскарбамоилаза осуществляет первый этап синтеза пиримидиновых нуклеотидов и ингибируется продуктом этого биосинтеза цитидинтрифосфатом (ЦТФ) по принципу обратной связи.

Слайд 18

Активация предшественником (форактивация) — первый метаболит в многоступенчатом процессе активирует фермент, катализирующий первую или последнюю стадию.

Активация предшественником (форактивация) — первый метаболит в многоступенчатом процессе активирует фермент,

катализирующий первую или последнюю стадию.
Слайд 19

Химическая (ковалентная) модификация. Заключается в присоединении к ферменту или отщеплении от

Химическая (ковалентная) модификация.
Заключается в присоединении к ферменту или отщеплении от него

низкомолекулярной молекулы, при котором происходит активация или ингибирование фермента.
Например, фермент, участвующий в синтезе гликогена — гликогенсинтаза — при присоединении фосфорной кислоты становится неактивным, а фермент распада гликогена — фосфорилаза —активным.
Слайд 20

Фосфорилирование-дефосфорилирование является наиболее эффективным способом контроля активности белков по следующим причинам:

Фосфорилирование-дефосфорилирование является наиболее эффективным способом контроля активности белков по следующим причинам:
1.

Фосфорильныс группы приносят два отрицательных заряда в молекулу белка, что изменяет характер электростатических взаимодействий (например, изменяется связывание субстрата и каталитическая активность).
2. Фосфатная группа может участвовать в образовании трех или более водородных связей. Тетраэдрическая геометрия фосфорильной группы делает водородные связи строго направленными, что важно для межмолекулярных отношений.
3. Величина свободной энергии фосфорилирования белков достаточно высока:в макроэргической связи АТФ имеется -12 ккал/моль (-50 кДж/моль). Примерно половина тратится на фосфорилирование, а вторая половина депонируется в фосфорилированном белке. Такое фосфорилированис может изменить конформационное равновесие между двумя состояниями белка в 104 раз.
Слайд 21

4. Фосфорилирование-дефосфорилирование занимает примерно секунду, что по скорости увязывается с физиологическими

4. Фосфорилирование-дефосфорилирование занимает примерно секунду, что по скорости увязывается с физиологическими

процессами.
5. Фосфорилирование носит, как правило, каскадный характер с увеличением концентрации продукта на каждом этапе в 10 или более раз (амилификационный эффект фосфорилирования).
6. АТФ является энергетической валютой клетки. Фосфор освобождается в прямой реакции АТФ<- ->АДФ + Рн; фосфор потребляется в обратной реакции. Следовательно, процесс фосфорилирования-дефосфорилирования белков связан с концентрацией Рн и регуляцией метаболизма.
Слайд 22

Слайд 23

Активация проферментов. Происходит путем отщепления части полипептидной цепи от молекулы предшественника

Активация проферментов.
Происходит путем отщепления части полипептидной цепи от молекулы предшественника

с образованием активного центра фермента. Этот путь характерен для агрессивных протеолитических ферментов, которые синтезируются в неактивной форме (проферменты) в желудке и поджелудочной железе и участвуют в переваривании белков. Синтез в виде проферментов исключает самопереваривание органов.
Слайд 24

Специфический частичный протеолиз является распростра-ненным способом активации ферментов и других белков

Специфический частичный протеолиз является распростра-ненным способом активации ферментов и других белков

в биологических системах.
1. Свертывание крови является каскадом протеолитических реакций, обеспечивающим быстрый и усиленный ответ на повреждение тканей и кровеносных сосудов (см. «Свертывание крови»).
2. Многие гормоны пептидной природы синтезируются в виде предшественников (проинсулин, проопиомеланокортин), после частичного протеолиза которых образуются гормоны.
3. Нерастворимые в воде фибриллы коллагена возникают после частичного протеолиза водорастворимого проколлагена.
4. Запрограммированная гибель клеток — апоптоз опосредуется протеолитическими ферментами каспазами, которые синтезируются в виде прокаспаз.