Список общедоступных баз данных

Август 24, 2022

Главная
Медицина
Список общедоступных баз данных

Содержание

2. Список баз данных которые можно использовать
3. База данных национального института рака NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov) Необходимо описать базу данных, структуру , основные вкладки, какую
4. Описание вкладок базы данных NSBI Всего 43 вкладки, одному человеку достаточно описать одну вкладку с указанием
5. COSMIC Catalogue Of Somatic Mutations In Cancer баз данных соматических мутаций, свойственных различным типам опухолевых заболеваний
6. PFAM - Protein families database of alignments and HMMs коллекция белковых семейств http://pfam.xfam.org/ Описание базы данных,
7. 1000 Genomes http://www.1000genomes.org/ Описание базы данных, описание вкладок, примеры работы с базой данных. (2 человека)
8. DrugBank база данных лекарственных веществ с химической, фармакологической и фармацевтической информацией. http://www.drugbank.ca/ Описание базы данных, описание
9. Reactome База данных о биологических путях у человека http://www.reactome.org/ Описание базы данных, описание вкладок, примеры работы
10. Пример описания базы данных База данных STRING - Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins
17. Nighborhood: Подобный геномный контекст у разных видов предполагают аналогичную функцию белков. Fusion: белки, которые связаны внутри
23. Скачать презентацию

Слайд 2

Список баз данных которые можно использовать

Слайд 3

База данных национального института рака NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov)
Необходимо описать базу данных, структуру

, основные вкладки, какую информацию они несут.

Слайд 4

Описание вкладок базы данных NSBI
Всего 43 вкладки, одному человеку достаточно описать

одну вкладку с указанием информации этой вкладки и примером работы во вкладке (примеры в виде скриншотов).

Слайд 5

COSMIC Catalogue Of Somatic Mutations In Cancer баз данных соматических мутаций, свойственных

различным типам опухолевых заболеваний человека. http://cancer.sanger.ac.uk/cosmic

Описание базы данных, описание вкладок, примеры работы с базой данных. (2 человека)

Слайд 6

PFAM - Protein families database of alignments and HMMs коллекция белковых семейств http://pfam.xfam.org/
Описание базы данных,

описание вкладок, примеры работы с базой данных.

Слайд 7

1000 Genomes http://www.1000genomes.org/
Описание базы данных, описание вкладок, примеры работы с базой данных.

(2 человека)

Слайд 8

DrugBank база данных лекарственных веществ с химической, фармакологической и фармацевтической информацией. http://www.drugbank.ca/
Описание

базы данных, описание вкладок, примеры работы с базой данных.

Слайд 9

Reactome База данных о биологических путях у человека http://www.reactome.org/
Описание базы данных, описание вкладок,

примеры работы с базой данных. (2 человека)

Слайд 10

Пример описания базы данных
База данных STRING - Search Tool for the

Retrieval of Interacting Genes/Proteins (http://string-db.org/)

Это биологическая база данных и web-ресурс описывает и предсказывает белок-белковые взаимодействия. База данных аккумулирует в себя информацию из большого числа источников включающих экспериментальные данные. База содержит в себе информацию о 9,6 млн белков более 2000 организмов.

Слайд 11

Слайд 12

Слайд 13

Слайд 14

Слайд 15

Слайд 16

Слайд 17

Nighborhood: Подобный геномный контекст у разных видов предполагают аналогичную функцию белков.
Fusion:

белки, которые связаны внутри геномов, весьма вероятно, могут быть функционально связаны между.
Occurence: Белки, которые имеют аналогичную функцию или находятся в том же пути метаболизма, должны быть отображены вместе и имеют схожие филогенетическое профиль.
Coexpression: Прогнозируемая связь между генами на основе наблюдаемых закономерностей одновременной экспрессии генов.

Слайд 18

Слайд 19

Слайд 20

Слайд 21

Список общедоступных баз данных

Содержание

Список баз данных которые можно использовать

База данных национального института рака NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov) Необходимо описать базу данных, структуру

Описание вкладок базы данных NSBIВсего 43 вкладки, одному человеку достаточно описать

COSMIC Catalogue Of Somatic Mutations In Cancer баз данных соматических мутаций, свойственных

PFAM - Protein families database of alignments and HMMs коллекция белковых семейств http://pfam.xfam.org/Описание базы данных,

1000 Genomes http://www.1000genomes.org/Описание базы данных, описание вкладок, примеры работы с базой данных.

DrugBank база данных лекарственных веществ с химической, фармакологической и фармацевтической информацией. http://www.drugbank.ca/Описание

Reactome База данных о биологических путях у человека http://www.reactome.org/Описание базы данных, описание вкладок,

Пример описания базы данныхБаза данных STRING - Search Tool for the

Nighborhood: Подобный геномный контекст у разных видов предполагают аналогичную функцию белков. Fusion:

Похожие презентации