ОСНОВНЫЕ НАПРАВЛЕНИЯ РАЗВИТИЯ СИСТЕМНОЙ БИОЛОГИИ И ЕЕ ВЛИЯНИЕ НА РАЗРАБОТКУ НОВЫХ ЛЕКАРСТВЕННЫХ ПРЕПАРАТОВ А.М. Михальский, В.Н. Н

Содержание

Слайд 2

Системная биология Системная биология – новая тенденция на стыке биологических и

Системная биология

Системная биология – новая тенденция на стыке биологических и технических

наук.
Это область междисциплинарных исследований, основанных на биологических знаниях, которая направлена на изучение сложных биологических систем. В основе системной биологии лежат достижения генетики.
Системная биология развивается на основе математического моделирования генетических, метаболических, организменных и экологических сетей, а также методов теории управления и кибернетики.
Слайд 3

Системная биология – система дисциплин

Системная биология – система дисциплин

Слайд 4

Системная биология связывает процессы на молекулярном уровне с событиями на индивидуальном

Системная биология связывает процессы на молекулярном уровне с событиями на индивидуальном

и популяционном уровнях

Рисунок из S.W. Edwards and R.J. Preston TOXICOL. SCIENCES 106(2), 312–318 (2008)

Слайд 5

Системная биология связывает процессы на молекулярном уровне с событиями на индивидуальном

Системная биология связывает процессы на молекулярном уровне с событиями на индивидуальном

и популяционном уровнях

направление биологии

направление математического моделирования

Слайд 6

СИСТЕМНАЯ БИОЛОГИЯ -СОВОКУПНОСТЬ OMICS Системная биология включает в себя ряд наук

СИСТЕМНАЯ БИОЛОГИЯ -СОВОКУПНОСТЬ OMICS

Системная биология включает в себя ряд наук –

так называемых OMICS – геномику, эпигеномику и транскриптомику (анализ экспрессии генов и генетических цепей), протеомику (анализ процессов взаимодействия белков), и т.д.
Она охватывает также организмы (феномика, изучающая изменения организма на протяжении жизни) и сообщества организмов (биомика - изучение сообществ различных биомов – тундры, тайги и т.п.).
Слайд 7

Феномика изучает организм как целостный объект живой природы. Целостность организма –

Феномика изучает организм как целостный объект живой природы. Целостность организма –

его способность сохранять жизнедеятельность на протяжении жизни и в различных условиях среды. Целостность обеспечивается системами управления организма – в борьбе с неблагоприятными условиями существования, микро- и макрохищниками. Основными характеристиками целостности являются стационарность и гомеостаз.

ФЕНОМИКА

Слайд 8

Феномика изучает организм как целостный объект живой природы. Целостность организма –

Феномика изучает организм как целостный объект живой природы. Целостность организма –

его способность сохранять жизнедеятельность на протяжении жизни и в различных условиях среды. Целостность обеспечивается системами управления организма – в борьбе с неблагоприятными условиями существования, микро- и макрохищниками. Основными характеристиками целостности являются стационарность и гомеостаз.

ФЕНОМИКА

Слайд 9

Феномика изучает организм как целостный объект живой природы. Целостность организма –

Феномика изучает организм как целостный объект живой природы. Целостность организма –

его способность сохранять жизнедеятельность на протяжении жизни и в различных условиях среды. Целостность обеспечивается системами управления организма – в борьбе с неблагоприятными условиями существования, микро- и макрохищниками. Основными характеристиками целостности являются стационарность и гомеостаз.

ФЕНОМИКА

Слайд 10

Феномика изучает организм как целостный объект живой природы. Целостность организма –

Феномика изучает организм как целостный объект живой природы. Целостность организма –

его способность сохранять жизнедеятельность на протяжении жизни и в различных условиях среды. Целостность обеспечивается системами управления организма – в борьбе с неблагоприятными условиями существования, микро- и макрохищниками. Основными характеристиками целостности являются стационарность и гомеостаз.

ФЕНОМИКА

Слайд 11

Главной биологической целью существования организмов является передача генов в следующее поколение

Главной биологической целью существования организмов является передача генов в следующее

поколение – оставление потомства. Условием передачи генов в следующее поколение является стационарность на протяжении жизни. Для ее обеспечения в организме имеется специальный (пассивный) контур управления. Гомеостаз – постоянство внутренней среды – создается за счет механизмов активного управления, накладывающихся на этот контур. Гомеостаз возникает только тогда, когда он дает системе дополнительные преимущества.

УНИВЕРСАЛЬНЫМ СВОЙСТВОМ ЖИВОГО ЯВЛЯЮТСЯ СТАЦИОНАРНОСТЬ И ГОМЕОСТАЗ

Слайд 12

Главной биологической целью существования организмов является передача генов в следующее поколение

Главной биологической целью существования организмов является передача генов в следующее

поколение – оставление потомства. Условием передачи генов в следующее поколение является стационарность на протяжении жизни. Для ее обеспечения в организме имеется специальный (пассивный) контур управления. Гомеостаз – постоянство внутренней среды – создается за счет механизмов активного управления, накладывающихся на этот контур. Гомеостаз возникает только тогда, когда он дает системе дополнительные преимущества.

УНИВЕРСАЛЬНЫМ СВОЙСТВОМ ЖИВОГО ЯВЛЯЮТСЯ СТАЦИОНАРНОСТЬ И ГОМЕОСТАЗ

Слайд 13

СТАЦИОНАРНОСТЬ И ГОМЕОСТАЗ ПОДДЕРЖИВАЮТСЯ ЧЕРЕЗ ЕСТЕСТВЕННЫЕ ТЕХНОЛОГИИ ОРГАНИЗМА

СТАЦИОНАРНОСТЬ И ГОМЕОСТАЗ ПОДДЕРЖИВАЮТСЯ ЧЕРЕЗ ЕСТЕСТВЕННЫЕ ТЕХНОЛОГИИ ОРГАНИЗМА

Слайд 14

СТАЦИОНАРНОСТЬ ПРИНЦИПИАЛЬНАЯ СХЕМА ЕСТЕСТВЕННОЙ ТЕХНОЛОГИИ ОРГАНИЗМА

СТАЦИОНАРНОСТЬ

ПРИНЦИПИАЛЬНАЯ СХЕМА ЕСТЕСТВЕННОЙ ТЕХНОЛОГИИ ОРГАНИЗМА

Слайд 15

СТАЦИОНАРНОСТЬ ПРИНЦИПИАЛЬНАЯ СХЕМА ЕСТЕСТВЕННОЙ ТЕХНОЛОГИИ ОРГАНИЗМА

СТАЦИОНАРНОСТЬ

ПРИНЦИПИАЛЬНАЯ СХЕМА ЕСТЕСТВЕННОЙ ТЕХНОЛОГИИ ОРГАНИЗМА

Слайд 16

СТАЦИОНАРНОСТЬ ПРИНЦИПИАЛЬНАЯ СХЕМА ЕСТЕСТВЕННОЙ ТЕХНОЛОГИИ ОРГАНИЗМА

СТАЦИОНАРНОСТЬ

ПРИНЦИПИАЛЬНАЯ СХЕМА ЕСТЕСТВЕННОЙ ТЕХНОЛОГИИ ОРГАНИЗМА

Слайд 17

СТАЦИОНАРНОСТЬ ПРИНЦИПИАЛЬНАЯ СХЕМА ЕСТЕСТВЕННОЙ ТЕХНОЛОГИИ ОРГАНИЗМА

СТАЦИОНАРНОСТЬ

ПРИНЦИПИАЛЬНАЯ СХЕМА ЕСТЕСТВЕННОЙ ТЕХНОЛОГИИ ОРГАНИЗМА

Слайд 18

СТАЦИОНАРНОСТЬ ПРИНЦИПИАЛЬНАЯ СХЕМА ЕСТЕСТВЕННОЙ ТЕХНОЛОГИИ ОРГАНИЗМА Поддержание гомеостаза

СТАЦИОНАРНОСТЬ

ПРИНЦИПИАЛЬНАЯ СХЕМА ЕСТЕСТВЕННОЙ ТЕХНОЛОГИИ ОРГАНИЗМА

Поддержание
гомеостаза

Слайд 19

БЛОК-СХЕМА ЕСТЕСТВЕННЫХ ТЕХНОЛОГИЙ ОРГАНИЗМА

БЛОК-СХЕМА ЕСТЕСТВЕННЫХ ТЕХНОЛОГИЙ ОРГАНИЗМА

Слайд 20

ГОМЕОСТАЗ ШИРОКО РАСПРОСТРАНЁН В ПРИРОДЕ Осмотический гомеостаз у бокоплавов Gammarus

ГОМЕОСТАЗ ШИРОКО РАСПРОСТРАНЁН В ПРИРОДЕ

Осмотический гомеостаз у бокоплавов Gammarus

Слайд 21

ГОМЕОСТАТИЧЕСКАЯ КРИВАЯ АДАПТИРУЕТСЯ К ВНЕШНИМ УСЛОВИЯМ Температура тела x [°C] в

ГОМЕОСТАТИЧЕСКАЯ КРИВАЯ АДАПТИРУЕТСЯ К ВНЕШНИМ УСЛОВИЯМ

Температура тела x [°C] в зависимости

от среды v [°C]
(1 – ночь, 2 – день).
Американский опоссум ведет ночной образ жизни
Слайд 22

Зависимость температуры тела самки питона x от температуры среды v: 1

Зависимость температуры тела самки питона x от температуры среды v:

1 – в обычных условиях, 2 – при производстве потомства
Самка питона способна согревать яйца, поддерживая температуру внутри колец тела за счет мышечных сокращений.

ГОМЕОСТАЗ УПРАВЛЯЕМ

Слайд 23

ГОМЕОСТАЗ НЕ ОБЯЗАТЕЛЕН К животным, пользующимся преимуществами гомеостаза, относятся, в частности,

ГОМЕОСТАЗ НЕ ОБЯЗАТЕЛЕН


К животным, пользующимся преимуществами гомеостаза, относятся, в частности,

теплокровные млекопитающие.

Тем не менее, даже среди млекопитающих в Африке обнаружен вид голых землекопов (Heterocephalus glaber), не обладающий температурным гомеостазом.

Слайд 24

МЕТОДЫ СИСТЕМНОЙ БИОЛОГИИ ПЕРСПЕКТИВНЫ ПРИ РЕШЕНИИ РАЗЛИЧНЫХ ЗАДАЧ Гомеостаз и здоровье:

МЕТОДЫ СИСТЕМНОЙ БИОЛОГИИ ПЕРСПЕКТИВНЫ ПРИ РЕШЕНИИ РАЗЛИЧНЫХ ЗАДАЧ

Гомеостаз и здоровье: системная

медицина (P4 medicine predictive, personalize, preventive, participant)
Естественные технологии организма и старение.
Естественные технологии организма и отравляющие вещества.
Экология и гомеостаз.
Искусственный организм.
Разработка новых лекарственных препаратов.
Слайд 25

ПЕРСПЕКТИВЫ Разработка новых лекарственных препаратов

ПЕРСПЕКТИВЫ

Разработка новых лекарственных препаратов

Слайд 26

МЕТОД СИСТЕМНОЙ БИОЛОГИИ В ФАРМИНДУСТРИИ

МЕТОД СИСТЕМНОЙ БИОЛОГИИ В ФАРМИНДУСТРИИ

Слайд 27

ПОИСК ЛЕКАРСТВ МЕТОДОМ КЛАССИФИКАЦИИ

ПОИСК ЛЕКАРСТВ МЕТОДОМ КЛАССИФИКАЦИИ

Слайд 28

ПОИСК ЛЕКАРСТВ МЕТОДОМ КЛАССИФИКАЦИИ Математическое моделирование

ПОИСК ЛЕКАРСТВ МЕТОДОМ КЛАССИФИКАЦИИ

Математическое моделирование

Слайд 29

Решение задачи классификации при разработке новых лекарств Обучающая выборка Экзаменационная выборка Конструирование пространства описания Вещества-кандидаты

Решение задачи классификации при разработке новых лекарств

Обучающая выборка

Экзаменационная выборка

Конструирование пространства описания

Вещества-кандидаты

Слайд 30

Методы системной биологии позволяют оптимизировать компьютерную разработку новых лекарств Обучающая выборка

Методы системной биологии позволяют оптимизировать компьютерную разработку новых лекарств

Обучающая выборка

Экзаменационная выборка

Конструирование

пространства описания

Выбор ЯДРА для преобразования пространства

Вещества-кандидаты

Слайд 31

Скалярное произведение в спрямляющем пространстве задаётся ядром (kernel trick)

Скалярное произведение в спрямляющем пространстве задаётся ядром (kernel trick)

Слайд 32

Ядра бывают разные Полиномиальное Гауссово

Ядра бывают разные

Полиномиальное
Гауссово

Слайд 33

Ядра бывают разные Полиномиальное Гауссово «Гомеостатическое»

Ядра бывают разные

Полиномиальное
Гауссово
«Гомеостатическое»

Слайд 34

ЗАКЛЮЧЕНИЕ Системная биология является средством объединения процессов, протекающих на разных уровнях

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Системная биология является средством объединения процессов, протекающих на разных уровнях организации,

в разных масштабах времени и пространства
Методы системной биологии лежат в основе новой дисциплины – системной медицины
Системная биология позволяет повысить эффективность компьютерных методов разработки новых лекарственных препаратов, интегрируя дополнительные данные и информацию
Слайд 35

ЗАКЛЮЧЕНИЕ Системная биология является средством объединения процессов, протекающих на разных уровнях

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Системная биология является средством объединения процессов, протекающих на разных уровнях организации,

в разных масштабах времени и пространства
Методы системной биологии лежат в основе новой дисциплины – системной медицины
Системная биология позволяет повысить эффективность компьютерных методов разработки новых лекарственных препаратов, интегрируя дополнительные данные и информацию