Содержание
- 2. Алгоритм построения суффиксного дерева с учетом замечаний Построить дерево Г1. j* := 1; for i :=
- 3. Для поиска конца пути T[j : i] используются суффиксные связи. Они определяются для внутренних вершин суффиксного
- 4. Осталось показать, что переход по суффиксной связи всегда возможен. Теорема. Суффиксные связи определены для всех внутренних
- 5. Окончательный вариант "действий" во внутреннем цикле алгоритма (построение пути T[j : i+1]) выглядит следующим образом: От
- 6. Задачи, решаемые с помощью суффиксного дерева: Поиск образца: P = bacb; P = bbc; T =
- 7. Задачи, решаемые с помощью суффиксного дерева: Наибольшая общая подстрока двух строк. Обобщенное суффиксное дерево T1 =
- 8. Задачи, решаемые с помощью суффиксного дерева: Поиск палиндромов : T1 = Т; T2 = TR Общие
- 9. Суффиксный массив для строки T[1 : N] есть массив целых чисел от 1 до N, определяющий
- 10. Построение суффиксного массива путём лексического обхода суффиксного дерева. Пример: T = abacbcbacb (# Pos = (1,
- 11. Задачи, связанные с поиском повторов. Система антиплагиат Поиск признаков для классификации последовательностей. Κ = {Π1, Π2,
- 12. Вирус клещевого энцефалита (ВКЭ)
- 13. L-граммный анализ ВКЭ Группа 886 (m4 = 7): Lmax(Φ(Π4 / Κ)) = 491; Lmin(Φ(Π4 / Κ))
- 14. L-граммно-позиционный «срез» ΛL,pos(Πi) – множество различных L-грамм, расположенных в позиции pos в текстах класса Πi. ML,pos(Πi)
- 15. . «Устойчивые» позиции ВКЭ. Позиция 4618 (H - гистидин) : cac в 1, 2, 3, cat
- 16. . Примеры позиций, «характеризующих» класс:
- 17. Расстояния между строками и меры близости Расстояние Хэмминга: число несовпадений символов. Пример: А = abbaeac; dхэм
- 18. Хроника введения расстояний и мер сходства, основанных на идеях динамического программирования.
- 19. Схема динамического программирования для вычисления редакционного расстояния: d(0,0) = 0; d(i,0) = i, 1 ≤ i
- 20. Этап 1: заполнение матрицы динамического программирования. Этап 2: обратный ход. Построение выравнивания. ∀ d(i,j) на этапе
- 22. Скачать презентацию