Митохондриальный геном и болезни человека

Содержание

Слайд 2

1- хп ячмень (ПК) 2- митох ячмень (КМ) 3- хп ячмень

1- хп ячмень (ПК)
2- митох ячмень (КМ)
3- хп ячмень (СвЦ)
4 -

хп ячмень (СвЦ)
5 –мт ячмень (ЗГ)
6- хп подсолнечник
(ПГ)

Долог путь от гена к признаку…

Слайд 3

Митохондрии в клетке, строение митохондрий

Митохондрии в клетке, строение митохондрий

Слайд 4

Функции митохондрий Синтез АТФ – «энергетический центр» клетки (95% синтезируется в

Функции митохондрий

Синтез АТФ – «энергетический центр» клетки (95% синтезируется в мт)
Участие

в метаболизме аминокислот, липидов, холестерола, стероидов, нуклеотидов
Инициация процессов апоптоза (программируемой клеточной смерти)
Регуляция экспрессии ядерного генома
Участие в собственном воспроизведении
Слайд 5

Митохондриальный геном человека – 37 генов, 16. 569 пар нуклеотидов 2

Митохондриальный геном человека – 37 генов, 16. 569 пар нуклеотидов

2 гена

рибосомальной РНК
22 гена транспортной РНК
13 белок-кодирующих генов

Молекула ДНК замкнута в кольцо
Гены расположены очень плотно, на обеих цепочках ДНК, иногда перекрываются

Слайд 6

Митохондриальный геном человека

Митохондриальный геном человека

Слайд 7

Репликация митохондриальной ДНК млекопитающих L-цепь Н-цепь новая Н-цепь (7S ДНК) D-петля

Репликация митохондриальной ДНК млекопитающих

L-цепь

Н-цепь

новая Н-цепь (7S ДНК)

D-петля

мтДНК

ОL

ОH

ОH

HSP LSP

LSP

HSP

D-петля

ДНК-репликация в митохондриях связана с транскрипцией;
L- и H- цепи реплицируются с разных точек : ОL и ОH
Молекула мтДНК в области D-петли трехнитчатая.

Короткий РНК транскрипт с LSP –праймер для репликации H-цепи

участок Н цепи, оттесняемый 7S ДНК

Слайд 8

ДНК- полимераза гамма(γ) состоит из двух субъединиц: α - каталитической и

ДНК- полимераза гамма(γ)

состоит из двух субъединиц:
α - каталитической и

β -дополнительной (accessory)
125 -140 kDa 35 – 54 kDa

Полимеразная активность

Экзонуклеазная активность proofreading: мутация в этой области уменьшает точность репликации

Участвует в узнавании РНК-праймеров

Слайд 9


Слайд 10

Особености митохондриальной наследственности Материнское наследование Мультикопийность геномов (сотни органелл, тысячи ДНК

Особености митохондриальной наследственности

Материнское наследование
Мультикопийность геномов (сотни органелл, тысячи ДНК молекул)
Гетероплазмия
Митотическая сегрегация
Пороговый

эффект
Слайд 11

Ткани с низким порогом мутантной ДНК: мозг сердце скелетная мускулатура сетчатка

Ткани с низким порогом мутантной ДНК:

мозг
сердце
скелетная мускулатура
сетчатка глаза
почечные канальцы
эндокринные железы

Клетки этих

тканей наиболее метаболически активны, энергетически зависимы
Слайд 12

Слайд 13

Мутации в митохондриальной ДНК человека происходят в пять раз чаще, чем

Мутации в митохондриальной ДНК
человека происходят в пять раз чаще,
чем

в ядерной,

поскольку

геном митохондрий не защищен гистоновыми
белками;
репарационные процессы в митохондриях
менее совершенны, чем в ядре

Митохондрии поглощают более 90% клеточного кислорода;
Образуется большое количество ДНК-повреждающих свободных радикалов.

При этом

Слайд 14

В настоящее время описано более 190 патогенных точечных мутаций митохондриальной ДНК

В настоящее время описано
более 190 патогенных точечных мутаций митохондриальной

ДНК
около 200 делеций, инсерций и других структурных реорганизаций мтДНК
Слайд 15

Источники митохондриальных патологий: Изменения в генах ядерного кодирования (более 1000 генов

Источники митохондриальных патологий:

Изменения в генах ядерного кодирования
(более 1000 генов

кодируют мт белки)
Изменения в генах митохондриального кодирования (37 генов)
Выпадения участков мтДНК (делеции, множественные делеции)
Истощение пула митохондриальной ДНК
Слайд 16

Особенности мутаций митохондриальных генов Одна из важнейших особенностей – клиническое разнообразие

Особенности мутаций митохондриальных генов

Одна из важнейших особенностей – клиническое разнообразие

сиблингов.
Это – отражение «эффекта бутылочного горлышка». Какое количество мутантных молекул попадет в ооцит на раннем этапе оогенеза – дело случая :
Слайд 17

Слайд 18

Уменьшение синтеза АТФ Нарушение кальциевого баланса клетки Повышение количества ROS (reactive

Уменьшение синтеза АТФ
Нарушение кальциевого баланса клетки
Повышение количества ROS (reactive oxygen species)

Особенности

мутаций митохондриальных генов

Мутации могут затрагивать:

специфические белки – при точечных мутациях и малых делециях структурных генов,

а также митохондриальный геном в целом:

большие делеции;
мутации в генах тРНК;
мутации в генах рРНК.

В результате мутациий наблюдается:

Слайд 19

ген ДНК-полимеразы гамма (осуществляет синтез мтДНК); ген тимидинфосфорилазы (нарушает метаболизм тимидина);


ген ДНК-полимеразы гамма
(осуществляет синтез мтДНК);
ген

тимидинфосфорилазы
(нарушает метаболизм тимидина);
ген Twinkle (участвует в поддержании целостности
митохондриального генома).

Некоторые мутации ядерной ДНК могут приводить к мутациям митохондриальной ДНК:

Информация о мутациях в этих генах накапливается стремительно

Слайд 20

Особенности мутации митохондриальных генов Строгая связь между сайтом мутации и клиническим

Особенности мутации митохондриальных генов

Строгая связь между сайтом мутации и клиническим фенотипом

часто отсутствует:

Одна и та же мутация может вызывать разные симптомы.
Один и тот же клинический фенотип могут формировать разные мутации

Исключения:
MERRF синдром - мутации всегда в тРНКLys гене; LHON – мутации в генах ND

Слайд 21

2/3 известных точечных мутаций мтДНК сосредоточены в тРНК генах (9% генома)

2/3 известных точечных мутаций мтДНК сосредоточены в тРНК генах (9% генома)

Больше всего

мутантных точек выявлено в лейциновой тРНК
Слайд 22

Мутации лейциновой тРНК

Мутации лейциновой тРНК

Слайд 23

Синдром Лебера: LHON (1871 г.) наследуемая по материнской линии потеря зрения

Синдром Лебера: LHON (1871 г.)

наследуемая по материнской линии потеря зрения

происходит у людей 20-30 лет вследствие
атрофии зрительного нерва и
дегенерации ганглиозного слоя клеток ретины

Заболевание связано с передаваемой от матери мутацией митохондриальной ДНК в одном из ND генов (комплекс I).
В 70% случаев это G11778A (ND4), а в Японии в 90%
в 13% случаев G3460A (ND1);
в 14% случаев T14484C (ND6)

Мутация находится в гомоплазматическом состоянии

Примеры некоторых синдромов

Слайд 24

ДНК-диагностика синдрома Лебера в семье N проведена нами впервые в 2006

ДНК-диагностика синдрома Лебера в семье N проведена нами впервые в 2006

году

здоровый сестра мать человек пробанда

G11778A замена

G11778

пробанд с синдромом Лебера

Слайд 25

Лишь у 50% мужчин и 10% женщин носителей патогенных мутаций комплекса

Лишь у 50% мужчин и 10% женщин носителей патогенных мутаций комплекса

I в действительности происходит потеря зрения

Загадки синдрома Лебера:

В 80-85% случаев поражаются мужчины (Х хромосома несет какой-то локус чувствительности ?)

??

В формировании заболевания участвуют какие-то дополнительные факторы ( ???)

??

??

Чаще всего мутации, ведущие к синдрому Лебера, встречаются в мтДНК гаплогруппы J; эту группу несут около 15% европейцев

Слайд 26

Мутации генов транспортной РНК Самая часто встречающаяся точечная мутация: А3243G в

Мутации генов транспортной РНК

Самая часто встречающаяся точечная мутация: А3243G в лейциновой

тРНК
Обнаружена у большинства больных с синдромом
MELAS

Миопатия

энцефалопатия

лактат-ацидоз
инсультоподобные (stroke-like) эпизоды

Мутация встречается исключительно в гетероплазматическом состоянии

В одних семьях А3243G вызывает преимущественно кардиомиопатию, в других – диабет и глухоту, в третьих PEO, в четвертых - энцефалопатию

???

Слайд 27

Впервые ДНК-диагностика синдрома MELAS была проведена нами в 2007 году Мама:

Впервые ДНК-диагностика синдрома MELAS была проведена нами в 2007 году

Мама: фенотипически

здоровая женщина очень маленького роста

1ый ребенок
1988-2000
Кардиопатия, ЗПР, ЗФР.
Умерла скоропостижно после травмы

I брак

II брак

2ой ребенок
1991-2007
Менингоэнцефалит
Умер от ишемического инфаркта обоих полушарий мозжечка

3ий ребенок родился в 1998 Прогрессирующая миопатия, миокардио-дистрофия

Митохондриопатия??

Обнаружена мутация MELAS у сына (80% мутантных молекул в крови) у мамы (40% )

Слайд 28

Мутация резко снижает эффективность трансляции в мт и тем самым провоцирует дефицит дыхательной цепи

Мутация резко снижает эффективность трансляции в мт и тем самым провоцирует

дефицит дыхательной цепи
Слайд 29

Мутации генов рибосомальной РНК Чаще всего встречается мутация гена 12S рРНК

Мутации генов рибосомальной РНК


Чаще всего встречается мутация гена 12S

рРНК A1555G

Вызывает несиндромную потерю слуха из-за чувствительности носителей мутации к ототоксическим аминогликозидам

Другие мутации генов 12S и 16S вызывают кардиомиопатию, атаксию, MELAS, диабет mellitus, сенсорно-невральная потерю слуха

Слайд 30

T8993G: лейцин замещается на аргинин в ATPase6, что приводит к нарушению

  T8993G: лейцин замещается на аргинин в ATPase6,
что приводит к

нарушению синтеза АТФ
Если доля мтДНК больше 90%,
клиническое проявление наблюдается раньше и
симптомы более тяжелые: подострая некротизирующая энцефалопатия с чертами синдрома Лея (LS)

Примеры некоторых синдромов

NARP (neuropathy ataxia and retinitis pigmentosa)
Мутация в гене ATPase6 – трансверсия Т – G
в нуклеотиде 8993 (70-90% мутантной ДНК)

Слайд 31

Синдром Лея – тяжелейшее нейродегенеративное заболевание: - симметричные некротические повреждения в

Синдром Лея – тяжелейшее нейродегенеративное заболевание:

- симметричные некротические повреждения в субкортикальных

областях ЦНС – базальных ганглиях, таламусе, стволе мозга, спинном мозге;

- демиелинизация, сосудистая пролиферация и «глиозис»;

Заболевание начинается в раннем детстве, редко во взрослом состоянии;

- моторная и умственная регрессия, атаксия, дистония, аномальное дыхание

Смерть наступает обычно через два года после начала заболевания

Слайд 32

LS 2/10 случаев – мутации митохондр. ДНК (MILS) 1/10 cлучаев –

LS

2/10 случаев – мутации митохондр. ДНК (MILS)

1/10 cлучаев – мутации Х-хромосомы

ATPase

6

PDHC

7/10 cлучаев – рецессивные мутации ядерных аутосомных генов, кодирующих субъединицы дыхательной цепи или белки, участвующие в ее сборке

Слайд 33


Слайд 34

Та же делеция 5 т.п.н. вызывает еще 2 синдрома: Синдром PEO

Та же делеция 5 т.п.н. вызывает еще 2 синдрома:

Синдром PEO –


Прогрессирующая наружная офтальмоплегия

Синдром Пирсона – PS
Гипопластическая анемия, нарушение экзокринной функции поджелудочной железы

Все три синдрома являются спорадическими, формиуются в зависимости от сегрегации мутантных мтДНК с накоплением в разных тканях

Слайд 35

В случае этой же делеции в 5 тыс п.н. вместо фатального

В случае этой же делеции в 5 тыс п.н. вместо фатального

KSS может наблюдаться PEO

Прогрессирующая наружная офтальмоплегия, птоз

Патология связана с параличом наружных глазодвигательных мышц

Биохимически в мышцах обнаруживаются дефекты ферментов дыхательной цепи, особенно цитохромоксидазы

Процент мутантных молекул в этом случае меньше, чем при KSS синдроме, синдром не связан с угрозой для жизни больного

Слайд 36

Синдром митохондриальной деплеции - МDS В клетках остается 1 - 30%

Синдром митохондриальной деплеции - МDS

В клетках остается 1 - 30% от

нормального количества мтДНК

Синдром проявляется в первые недели после рождения:
фатальная гепатопатия;
миопатия с генерализованной гипотонией;
кардиомиопатия с судорогами (синдр. де-Тони-Дебре-Фанкони);
атрофия проксимальных групп мышц;
утрата сухожильных рефлексов.

Смерть наступает в тяжелых случаях в первый год жизни

Слайд 37

Патологии, вызванные изменением генов дыхательной цепи LHON LHON+дистония Спорадическая миопатия Спорадическая

Патологии, вызванные изменением генов дыхательной цепи

LHON
LHON+дистония
Спорадическая миопатия

Спорадическая миопатия

Спорадическая

миопатия
Энцефаломиопатия

NARP
MILS
FBSN

Синдром Лея
Лейкодистрофия

Синдром Лея
Параганглиома

Синдром Лея
Кардиоэнцефалопатия
Лейкодистрофия/тубулопатия

М

Я

Слайд 38

Слайд 39

Слайд 40

Слайд 41

Слайд 42

Слайд 43

Слайд 44

Слайд 45

Слайд 46

Другой подход - уменьшить соотношение мутантная:нормальная мтДНК I. Увеличить количество немутантных

Другой подход - уменьшить соотношение мутантная:нормальная мтДНК

I. Увеличить количество

немутантных молекул путем

«сдвига генов»

Индуцируется пролиферация сателлитных клеток в скелетных мышцах

У некоторых больных с миопатией % мутантной мтДНК в сателлитных клетках ниже, чем в в скелетной мышце

Обычно сателлитные клетки пролиферируют и сливаются со скелетными миофибриллами в ответ на стресс или упражнение

Пропорция нормальных мтДНК молекул в мышце увеличивалась, дефект корректировался

Лечение митохондриальных болезней (2)

Слайд 47

II.Уменьшить количество мутантных молекул мтДНК Разработка синтетических молекул, избирательно связывающихся с

II.Уменьшить количество мутантных молекул мтДНК

Разработка синтетических молекул, избирательно связывающихся с мутаными

ДНК и блокирующих их репликацию

Введение в митохондрии фермента рестриктазы, избирательно разрушающего мутантную ДНК

Лечение митохондриальных болезней (3)

Успех достигнут пока только in vitro

Слайд 48

Лечение митохондриальных болезней (4) Импорт из цитоплазмы нормальных тРНК вместо дефектных

Лечение митохондриальных болезней (4)

Импорт из цитоплазмы нормальных тРНК вместо дефектных митохондриальных

Замена

дефектного комплекса дых. цепи на нормальный, полученный из другого организма (дрожжей)

Все эти подходы - в стадии экпериментальной разработки

«Молекулярно-внутриклеточная реконструкция»

Пересадка ядра яйцеклетки из мутантной цитоплазмы в нормальную

Слайд 49

Лечение митохондриальных болезней –насколько это реально? Фармакологическое Вылечить от митохондриального заболевания

Лечение митохондриальных болезней –насколько это реально?

Фармакологическое

Вылечить от митохондриального заболевания сегодня невозможно
Применяется

симптоматическое лечение:

Физическое

Хирургическое

Физиотерапия, аэробная гимнастика, умеренные и легкие нагрузки


Анти-эпилептические препараты, гормоны, витамины, метаболиты, кофакторы

Блефаропластика, имплантация cohlear, трансплантация сердца, почек, печени, подкожная эндоскопическая гастротомия, cricopharyngeal миотомия

Слайд 50

Ряд препаратов провоцирует митохондриальные заболевания или отягощает их течение Вальпроат: увеличивает


Ряд препаратов провоцирует митохондриальные заболевания или отягощает их течение

Вальпроат:

увеличивает частоту судорог при MELAS, гепатотоксичен
Аспирин, фенобарбитал
Кортикостероиды
Тетрациклин, хлорамфеникол
Аминогликозиды стрептомицин, гентамицин, амикацин, неомицин, канамицин - ототоксичны
Этамбутол ( провоцирует проявление LHON)
Статин ( провоцирует проявление MELAS)
Антиретровирусные препараты: AZT – zidovudine, doxorubicin вызывают деплецию мтДНК

Список далеко не полный!