Расширение кругозора

Август 4, 2022

Главная
Образование
Расширение кругозора

Содержание

2. Блок I «Как всё работает?» Блок II «Молекулярная биология. Работа в лаборатории» Блок III «Расширение кругозора»
3. Блок I «Как всё работает?» Как попасть в науку? Результат (цель ?) научной работы – статья
4. Результат научной работы - статья Научная статья – это написанный и опубликованный доклад, описывающий результаты оригинальных
5. Результат научной работы - статья Ревью/овервью (Review/overview) Представляет собой обзор информации на определенную тему Содержит данные
6. Структура научной статьи
7. Название статьи, авторы, организация
8. Название журнала Дата публикации DOI (идентификатор цифрового объекта)
9. Abstract; Содержание
10. Дополнительная информация Хронология публикации Ревьюеры Другое
11. Структура экспериментальной статьи Введение (Introduction) Теоретическое введение Описание модели заболевания Актуальность темы Материалы и методы (Materials
12. Структура экспериментальной статьи Результаты + обсуждение (Results + Discussion) Поэтапные эксперименты (распределение по параграфам) Название параграфа
13. Структура экспериментальной статьи Этический аспект (Ethics statement) Соблюдение норм по обращению с животными Вклад авторов (Author
14. Базы данных Первичные: хранилища первичных структур полимеров - ДНК и аминокислотных последовательностей (EMBL (Европа) , GenBank
15. NCBI (National Center for Biotechnological Information; USA) - центральный институт обработки и хранения данных молекулярной биологии.
16. Блок II «Молекулярная биология. Работа в лаборатории» Лабораторные (и не очень) животные Методы: ПЦР, гель-электрофорез Реал-тайм
17. Смысл: 1x ДНК 1000x ДНК Метод 1: Полимеразная Цепная реакция (ПЦР)
18. Метод 1: Полимеразная Цепная реакция (ПЦР) ДНК Нуклеотид А Т Г Ц
19. Метод 1: Полимеразная Цепная реакция (ПЦР) Реакционная смесь: Матрица – анализируемая ДНК Праймеры – олигонуклеотиды (15-30
20. Метод 1: Полимеразная Цепная реакция (ПЦР) Strip-tubes «Стрипы» Амплификатор («чёрный ящик»)
21. Метод 1: Полимеразная Цепная реакция (ПЦР) Strip-tubes «Стрипы» 1x ДНК 1000x ДНК
22. Режим работы амплификатора (этапы ПЦР)
23. https://www.yourgenome.org Режим работы амплификатора (этапы ПЦР)
24. ? Почему в ПЦР используют термостабильные ДНК-полимеразы? Сколько молекул ДНК мы получим, если прогоним 1 молекулу
25. Метод 2: Электрофорез в агарозном геле (визуализация результатов ПЦР) 1) ТАЕ-буфер + агароза => микроволновка 2)
26. Метод 2: Электрофорез в агарозном геле (визуализация результатов ПЦР) 3 4 https://www.wikihow.com/Make-an-Electrophoresis-Gel
27. Метод 2: Электрофорез в агарозном геле (визуализация результатов ПЦР) _ _ _ +++ https://www.wikihow.com/Make-an-Electrophoresis-Gel
28. ? Какая проба содержит в себе более длинный участок ДНК? Зачем проба с «лестницей»? Какие контроли
29. ? Какая проба содержит в себе более длинный участок ДНК? Зачем проба с «лестницей»? Какие контроли
30. Обнаружение инфекционных организмов (бактерий/вирусов) путем анализа клинических проб. Обнаружение мутаций (наследственные/опухолевые заболевания) https://biomolecula.ru/articles/metody-v-kartinkakh-polimeraznaia-tsepnaia-reaktsiia https://nplus1.ru/news/2017/05/31/DNA-mummies Установление личности
32. Скачать презентацию

Слайд 2

Блок I «Как всё работает?» Блок II «Молекулярная биология. Работа в лаборатории» Блок

III «Расширение кругозора»

Слайд 3

Блок I «Как всё работает?»
Как попасть в науку?
Результат (цель ?) научной

работы – статья
Искусство презентации + научные журналы
Самообразование: обучающие/информационные ресурсы

Слайд 4

Результат научной работы - статья
Научная статья – это написанный и опубликованный

доклад, описывающий результаты оригинальных исследований.

Слайд 5

Результат научной работы - статья
Ревью/овервью
(Review/overview)
Представляет собой обзор информации на определенную тему
Содержит

данные большого количества исследований

Экспериментальная статья (Primary research article)

Содержит оригинальные данные
Повествование идет от лица исследователей, участвовавших в экспериментах
Содержит детальную информацию об условиях проведения экспериментов

Сколько статей достаточно прочитать, для того, чтобы хорошо разбираться в теме?
Что ценнее: ревью или экспериментальная статья?

Слайд 6

Структура научной статьи

Слайд 7

Название статьи, авторы, организация

Слайд 8

Название журнала Дата публикации DOI (идентификатор цифрового объекта)

Слайд 9

Abstract; Содержание

Слайд 10

Дополнительная информация
Хронология публикации
Ревьюеры
Другое

Слайд 11

Структура экспериментальной статьи
Введение (Introduction)
Теоретическое введение
Описание модели заболевания
Актуальность темы
Материалы и методы (Materials

and Methods)
Каждый метод в отдельном параграфе
Информация о животных (какую информацию будем указывать?)
Условия проведения эксперимента
Используемые реагенты
Статистический анализ

Слайд 12

Структура экспериментальной статьи
Результаты + обсуждение (Results + Discussion)
Поэтапные эксперименты (распределение по

параграфам)
Название параграфа – мини-вывод по эксперименту
Изображения/Таблицы = Figures/Tables
Заключение (Conclusion)
Тезисное изложение результатов
Развитие исследования

Слайд 13

Структура экспериментальной статьи
Этический аспект (Ethics statement)
Соблюдение норм по обращению с животными
Вклад

авторов (Author contributions + Acknowledgments)
Другое
Ссылка на дополнительные материалы (Supplementary Materials)
Информация о грантах
Список литературы (References)
Строгие требования к оформлению, специфичные для каждого журнала

Слайд 14

Базы данных
Первичные: хранилища первичных структур полимеров - ДНК и аминокислотных последовательностей

(EMBL (Европа) , GenBank (США) , DDBJ (Япония))
Вторичные: обработанные первичные данные – паттерны и др.
Составные: сочетают инф-ию из 1ичн и 2ичн, дают больше возможностей при поиске.

P.S. Существует даже база данных по базам данных!)

Слайд 15

NCBI (National Center for Biotechnological Information; USA)
- центральный институт обработки

и хранения данных молекулярной биологии.

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/

NCBI

Базы данных статей научной литературы (PubMed)

Базы данных белковых доменов, ДНК (GenBank) и РНК

Таксономическая информация (TaxBrowser) – поиск инф-ии о конкретном биологическом виде

Программы биоинформатики (BLAST)

https://en.wikipedia.org/wiki/National_Center_for_Biotechnology_Information

Слайд 16

Блок II «Молекулярная биология. Работа в лаборатории»
Лабораторные (и не очень) животные
Методы:

ПЦР, гель-электрофорез
Реал-тайм ПЦР, секвенирование, цитометрия

Слайд 17

Смысл:
1x ДНК
1000x ДНК
Метод 1: Полимеразная Цепная реакция (ПЦР)

Слайд 18

Метод 1: Полимеразная Цепная реакция (ПЦР)
ДНК
Нуклеотид
А
Т
Г
Ц

Слайд 19

Метод 1: Полимеразная Цепная реакция (ПЦР)
Реакционная смесь:
Матрица – анализируемая ДНК
Праймеры –

олигонуклеотиды (15-30 штук), комплементарные цепям ДНК Forward (прямой) и Reverse (обратный)
Смесь нуклеотидов - dNTP (дезоксинуклеотидтрифосфаты): dATP+dTTP+dGTP+dCTP
Фермент – термостабильная ДНК-полимераза (Taq-полимераза; Pfu-полимераза)
Буфер – раствор, содержащий: - ионы Mg (зачем?) - соли, для поддержания pH - детергент Tween 20 + БСА (бычий сывороточный альбумин) – предотвращение «налипания» реагентов

Слайд 20

Метод 1: Полимеразная Цепная реакция (ПЦР)
Strip-tubes «Стрипы»
Амплификатор («чёрный ящик»)

Слайд 21

Метод 1: Полимеразная Цепная реакция (ПЦР)
Strip-tubes «Стрипы»
1x ДНК
1000x ДНК

Слайд 22

Режим работы амплификатора (этапы ПЦР)

Слайд 23

https://www.yourgenome.org
Режим работы амплификатора (этапы ПЦР)

Слайд 24

?
Почему в ПЦР используют термостабильные ДНК-полимеразы?
Сколько молекул ДНК мы получим, если

прогоним 1 молекулу через 3 цикла?
Каким требованиям должны соответствовать праймеры?
Можно ли проводить амплификацию вечно?

Слайд 25

Метод 2: Электрофорез в агарозном геле (визуализация результатов ПЦР)
1) ТАЕ-буфер + агароза

=> микроволновка
2) Добавление этидиум бромида (ОСТОРОЖНО!)

Слайд 26

Метод 2: Электрофорез в агарозном геле (визуализация результатов ПЦР)
3
4
https://www.wikihow.com/Make-an-Electrophoresis-Gel

Слайд 27

Метод 2: Электрофорез в агарозном геле (визуализация результатов ПЦР)
_ _ _
+++
https://www.wikihow.com/Make-an-Electrophoresis-Gel

Слайд 28

?
Какая проба содержит в себе более длинный участок ДНК? Зачем проба с

«лестницей»?
Какие контроли необходимо иметь?

Слайд 29

?
Какая проба содержит в себе более длинный участок ДНК? Зачем проба с

«лестницей»?
Какие контроли необходимо иметь?

Marker ladder

Слайд 30

Обнаружение инфекционных организмов (бактерий/вирусов) путем анализа клинических проб.
Обнаружение мутаций (наследственные/опухолевые заболевания)
https://biomolecula.ru/articles/metody-v-kartinkakh-polimeraznaia-tsepnaia-reaktsiia
https://nplus1.ru/news/2017/05/31/DNA-mummies
Установление

личности преступников/жертв по ДНК
Определение отцовства

Секвенирование ДНК
Целенаправленное внесение мутаций с помощью ПЦР

Изучение вымерших животных/предков человека
Изучение генетического материала известных личностей (фараоны)

Клиническая
медицина

Криминалистика

Генная инженерия

Палеонтология

Области применения ПЦР

Расширение кругозора

Содержание

Блок I «Как всё работает?» Блок II «Молекулярная биология. Работа в лаборатории» Блок

Блок I «Как всё работает?»Как попасть в науку?Результат (цель ?) научной

Результат научной работы - статьяНаучная статья – это написанный и опубликованный

Результат научной работы - статьяРевью/овервью(Review/overview)Представляет собой обзор информации на определенную темуСодержит

Структура научной статьи

Название статьи, авторы, организация

Название журнала Дата публикации DOI (идентификатор цифрового объекта)

Abstract; Содержание

Дополнительная информацияХронология публикацииРевьюерыДругое

Структура экспериментальной статьиВведение (Introduction)Теоретическое введениеОписание модели заболеванияАктуальность темы Материалы и методы (Materials

Структура экспериментальной статьиРезультаты + обсуждение (Results + Discussion)Поэтапные эксперименты (распределение по

Структура экспериментальной статьиЭтический аспект (Ethics statement)Соблюдение норм по обращению с животными Вклад

Базы данныхПервичные: хранилища первичных структур полимеров - ДНК и аминокислотных последовательностей

NCBI (National Center for Biotechnological Information; USA) - центральный институт обработки

Блок II «Молекулярная биология. Работа в лаборатории»Лабораторные (и не очень) животныеМетоды:

Смысл:1x ДНК1000x ДНКМетод 1: Полимеразная Цепная реакция (ПЦР)

Метод 1: Полимеразная Цепная реакция (ПЦР)ДНКНуклеотидАТГЦ

Метод 1: Полимеразная Цепная реакция (ПЦР)Реакционная смесь: Матрица – анализируемая ДНК Праймеры –

Метод 1: Полимеразная Цепная реакция (ПЦР)Strip-tubes «Стрипы»Амплификатор («чёрный ящик»)

Метод 1: Полимеразная Цепная реакция (ПЦР)Strip-tubes «Стрипы»1x ДНК1000x ДНК

Режим работы амплификатора (этапы ПЦР)

https://www.yourgenome.orgРежим работы амплификатора (этапы ПЦР)

?Почему в ПЦР используют термостабильные ДНК-полимеразы? Сколько молекул ДНК мы получим, если

Метод 2: Электрофорез в агарозном геле (визуализация результатов ПЦР)1) ТАЕ-буфер + агароза

Метод 2: Электрофорез в агарозном геле (визуализация результатов ПЦР)34https://www.wikihow.com/Make-an-Electrophoresis-Gel

Метод 2: Электрофорез в агарозном геле (визуализация результатов ПЦР)_ _ _+++https://www.wikihow.com/Make-an-Electrophoresis-Gel

?Какая проба содержит в себе более длинный участок ДНК? Зачем проба с

?Какая проба содержит в себе более длинный участок ДНК? Зачем проба с

Похожие презентации

Блок I «Как всё работает?»
Как попасть в науку?
Результат (цель ?) научной

Результат научной работы - статья
Научная статья – это написанный и опубликованный

Результат научной работы - статья
Ревью/овервью
(Review/overview)
Представляет собой обзор информации на определенную тему
Содержит

Дополнительная информация
Хронология публикации
Ревьюеры
Другое

Структура экспериментальной статьи
Введение (Introduction)
Теоретическое введение
Описание модели заболевания
Актуальность темы
Материалы и методы (Materials

Структура экспериментальной статьи
Результаты + обсуждение (Results + Discussion)
Поэтапные эксперименты (распределение по

Структура экспериментальной статьи
Этический аспект (Ethics statement)
Соблюдение норм по обращению с животными
Вклад

Базы данных
Первичные: хранилища первичных структур полимеров - ДНК и аминокислотных последовательностей

NCBI (National Center for Biotechnological Information; USA)
- центральный институт обработки

Блок II «Молекулярная биология. Работа в лаборатории»
Лабораторные (и не очень) животные
Методы:

Смысл:
1x ДНК
1000x ДНК
Метод 1: Полимеразная Цепная реакция (ПЦР)

Метод 1: Полимеразная Цепная реакция (ПЦР)
ДНК
Нуклеотид
А
Т
Г
Ц

Метод 1: Полимеразная Цепная реакция (ПЦР)
Реакционная смесь:
Матрица – анализируемая ДНК
Праймеры –

Метод 1: Полимеразная Цепная реакция (ПЦР)
Strip-tubes «Стрипы»
Амплификатор («чёрный ящик»)

Метод 1: Полимеразная Цепная реакция (ПЦР)
Strip-tubes «Стрипы»
1x ДНК
1000x ДНК

https://www.yourgenome.org
Режим работы амплификатора (этапы ПЦР)

?
Почему в ПЦР используют термостабильные ДНК-полимеразы?
Сколько молекул ДНК мы получим, если

Метод 2: Электрофорез в агарозном геле (визуализация результатов ПЦР)
1) ТАЕ-буфер + агароза

Метод 2: Электрофорез в агарозном геле (визуализация результатов ПЦР)
3
4
https://www.wikihow.com/Make-an-Electrophoresis-Gel

Метод 2: Электрофорез в агарозном геле (визуализация результатов ПЦР)
_ _ _
+++
https://www.wikihow.com/Make-an-Electrophoresis-Gel

?
Какая проба содержит в себе более длинный участок ДНК? Зачем проба с

?
Какая проба содержит в себе более длинный участок ДНК? Зачем проба с