Аминокислоты, полипептиды, белки

Содержание

Слайд 2

АМИНОКИСЛОТЫ Это производные углеводородов, содержащие амино- и карбоксильную группы H2N-CH2-COOH аминоуксусная

АМИНОКИСЛОТЫ

Это производные углеводородов, содержащие
амино- и карбоксильную группы

H2N-CH2-COOH

аминоуксусная
кислота
глицин (гликокол)

*

2-аминопропановая
α-аланин

3-аминопропановая

β-аланин

4-аминобутановая
γ-аминомасляная

Слайд 3

пара-амино- бензойная кислота (ПАБК) анестезин (этиловый эфир ПАБК) новокаин (β-диэтиламино- этиловый эфир ПАБК)

пара-амино-
бензойная
кислота
(ПАБК)

анестезин
(этиловый
эфир ПАБК)

новокаин
(β-диэтиламино-
этиловый эфир
ПАБК)

Слайд 4

В белки входят 20 α-аминокислот * алифатические ароматические гетероцикли- ческие изолейцин

В белки входят 20 α-аминокислот

*

алифатические

ароматические

гетероцикли-
ческие

изолейцин

*

*

*

фенилаланин

пролин

*

(вторичная
аминогруппа)

Слайд 5

С Т Е Р Е О И З О М Е

С Т Е Р Е О И З О М Е

Р И Я

Относительная конфигурация α-аминокислот, как
и у гидроксикислот определяется по конфигура-
ционному эталону – глицериновому альдегиду

Кроме глицина все α-аминокислоты содержат
асимметрический атом углерода

Например, орнитин

*

*

L-орнитин

D-орнитин

*

Все природные амино-
кислоты - L-ряда

Слайд 6

D-аланин L-аланин

D-аланин

L-аланин

Слайд 7

Некоторые аминокислоты, например изолейцин, треонин, цистин и гидроксипролин содержат 2 асимметрических

Некоторые аминокислоты, например изолейцин, треонин,
цистин и гидроксипролин содержат 2 асимметрических
атома углерода,

поэтому они существуют в виде 4 опти-
ческих изомеров [кроме цистина, у которого есть ось сим-
метрии, т.е. изомеров – меньше (3)]

Реакция нуклеофильного замещения SN2

sp3

L-ряд

(аминокислоты)

+ ОН-

СООН

H2N-

OH-

sp2

карбкатион
(плоский)

H2N- +

sp3

D-ряд

(гидроксикислоты)

Слайд 8

Слайд 9

Получение аминокислот 1. Кислотный гидролиз белков 2. Гидроксинитрильный способ (циангидринный, реакция

Получение аминокислот

1. Кислотный гидролиз белков

2. Гидроксинитрильный способ (циангидринный,
реакция Зелинского-Стадникова)

R-CH=O

HCN

гидроксинитрил

NН3

-

Н2О

2Н2О

- NН3

Слайд 10

Слайд 11

3. Взаимодействие аммиака с галогенопроизвод- ными карбоновых кислот (реакция Гофмана) Сl2

3. Взаимодействие аммиака с галогенопроизвод-
ными карбоновых кислот (реакция Гофмана)

Сl2

- HCl

2NН3

-

NH4Cl

4. Восстановление нитрогруппы в ароматических
карбоновых кислотах (см. реакцию Зинина)

5. Синтез Габриэля – получение аминокислот с
с первичной аминогруппой (см. тему «Амины»)

6. В организме – переаминирование (трансамини-
рование – основной путь биосинтеза АК (см. лекцию «Альдегиды»)

Слайд 12

Кислотно-основные свойства аминокислот Образование внутренних солей (биполярных или амфотерных ионов) :

Кислотно-основные свойства аминокислот

Образование внутренних солей (биполярных
или амфотерных ионов)

:


2. Амфотерность

HCl

NaOH

-

Н2О

R+

R-

Слайд 13

3. Аминокислоты - комплексоны Хелатный эффект [Ni(NH3)6]2+ Кнест. ≈ 10-8 Кнест.

3. Аминокислоты - комплексоны

Хелатный эффект

[Ni(NH3)6]2+

Кнест. ≈ 10-8

Кнест. ≈ 10-18

Хелатный эффект

заклю-
чается в большей устойччи-
вости хелатных соединений
по сравнению с обычными
комплексами

Комплексоны – органические полидентатные лиганды,
в результате взаимодействия которых с комплексообра-
зователями образуются внутрикомплексные (хелатные)
соединения

Слайд 14

Причины устойчивости хелатных соединений: увеличение энтропии системы; 2) образование пяти- и

Причины устойчивости хелатных соединений:
увеличение энтропии системы;
2) образование пяти- и щестичленных циклов

Хелатный

эффект иначе иногда называют
энтропийным эффектом

Полиаминополикарбоновые кислоты

остаток
аминокислоты - глицина

трилон Б

Слайд 15

пентацин Хелатотерапия антидотная терапия при отравлении солями тяжелых металлов (Pb2+, Hg2+,

пентацин

Хелатотерапия

антидотная терапия при отравлении солями
тяжелых металлов (Pb2+, Hg2+, Cd2+, Cu2+

и др.)
2) радиозащитное действие (выведение Sr90 и др.)
3) лечение при недостатке Fe, Ca и т.д.
Слайд 16

Изоэлектрическая точка белка Это то значение рН = рI, при котором

Изоэлектрическая точка белка

Это то значение рН = рI, при котором число

разно-
именных зарядов в белке одинаково и Σq = 0

-NH3+

-NH3+

-COO-

-COO-


(Σq = 0)

глобула

Н+

ОН-

-NH3+

-NH3+

-COOН

-COOН

R+

(рН < рI)

нить

-NH2

-NH2

-COO-

-COO-

R-

(рН > рI)

нить

-H2O

Слайд 17

ИЭТ аминокислоты - это то значение рН, при котором концентрация катионов

ИЭТ аминокислоты - это то значение рН, при
котором концентрация катионов

(R+) равна кон-
центрации анионов (R-), а в основном аминокис-
лота находится в виде биполярного иона (R±)

рН ИЭТ аминокислот
(на примере глицина)

Ка1

R+

+ Н+


Ка2

R-


+ Н+

Слайд 18

[Н+] = Ка1 . Ка2 ; рН = рI = pКа1

[Н+] =

Ка1 . Ка2 ;

рН = рI =

pКа1 + pКа2

2

Для глицина:

рI =

2,6 + 9,8

2

= 6,2

Слайд 19

Аминокислоты кислые нейтральные основные моноамино- дикарбоновые моноамино- монокарбоновые диамино- монокарбоновые 1

Аминокислоты

кислые

нейтральные

основные

моноамино-
дикарбоновые

моноамино-
монокарбоновые

диамино-
монокарбоновые

1 NH2-группа,
2 COOН-группы

1 NH2-группа,
1 COOН-группа

2 NH2-группы,
1 COOН-группа

рI

(2-3)

рI (5-6)

рI (8-9)

рI = 3,22

рI = 6,20

рI = 9,74

Слайд 20

Методы определения ИЭТ белков I. Прямой метод - метод электрофореза (это

Методы определения ИЭТ белков

I. Прямой метод - метод электрофореза (это наблю-
дение

за поведением чaстиц в электрическом поле при
электрофорезе)

+

+

+

-

-

-

Буфер I

Буфер II

Буфер III

рН < рI

Z+

рН > рI

Z-

рН = рI

Z = 0

(нет движения)

Слайд 21

u электрофоретическая подвижность рН ИЭТ

u

электрофоретическая
подвижность

рН

ИЭТ

Слайд 22

Электрофоретическое разделение белков буфер (рН=8,6) буфер (рН=8,6) + - Хроматографическая бумага

Электрофоретическое разделение белков

буфер
(рН=8,6)

буфер
(рН=8,6)

+

-

Хроматографическая
бумага

Смесь
белков (*)

рI

α-глобулин 4,8

γ-глобулин 6,4

β-глобулин 5,2

*

При рН=8,6
(pH

> pI) Z-, т.е.
движение к (+)
полюсу
Слайд 23

+ - * смесь белков α Чем больше (pH - pI),

+

-

*

смесь белков

α

Чем больше
(pH - pI), тем
больше ско-
рость дви-
жения

Применение
электрофореза
в медицине:

диагностика
2) контроль

за ходом лечения

β

γ

Слайд 24

Электрофорез белков плазмы α β γ альбумин

Электрофорез белков плазмы

α

β

γ

альбумин

Слайд 25

II. Косвенные методы Ряд свойств белков экстремален (max или min) в

II. Косвенные методы

Ряд свойств белков экстремален (max или min)
в изоэлектрической

точке

1. Гидратация - min

2. Растворимость - min

3. Коагуляция (под действием спирта) – mах
(метод максимальной мутности)

4. Вязкость - min

5. Осмотическое давление - min

6. Набухание - min

7. Застудневание - процесс превращения вещест-
ва из текучего состояния в структурированное
- min

Слайд 26

Термические превращения аминокислот 1) α-аминокислоты α α + t0 - 2H2O 2,5-диалкил-3,6-дикето- пиперазин

Термические превращения аминокислот

1) α-аминокислоты

α

α

+

t0

- 2H2O

2,5-диалкил-3,6-дикето-
пиперазин

Слайд 27

2) β-аминокислоты α β t0 - NH3 непредельная кислота 3) γ-аминокислоты

2) β-аминокислоты

α

β

t0

- NH3

непредельная кислота

3) γ-аминокислоты

γ

t0

- H2O

γ-лактам

Аналогично: из δ- и ε-аминокислот -

δ- и ε- лактамы
Слайд 28

Другие общие химические свойства аминокислот по NH2-группе по СООН-группе - СО2

Другие общие химические свойства
аминокислот

по NH2-группе

по СООН-группе

- СО2

R-CH2-NH2

HO-N=O

- N2

C2H5OH

- H2O

CH3I

3 моль

бетаин

Слайд 29

по NH2-группе по СООН-группе PCl5 CH3COCl - HCl - HCl NH3

по NH2-группе

по СООН-группе

PCl5

CH3COCl

- HCl

- HCl

NH3

- H2O

R-C=O

R

- H2O

(*)

(*) Кроме метаналя, который дает

N-метилольное произ-
водное:

Н2С=О +

Слайд 30

Превращения аминокислот в организме Аминокислота метио- нин (Мет) – поставщик СН3-группы

Превращения аминокислот в организме

Аминокислота метио-
нин (Мет) – поставщик
СН3-группы в

реакциях
алкилирования (например, коламин → холин)

2) В основе ряда ох-red превращений лежит
реакция (цистеин D цистин):

2

цистеин (Цис)

[O]

цистин (Цис-S-S-Цис)

[H]

Слайд 31

3) Дезаминирование (генетическая связь α-аланина, молочной кислоты и ПВК) Н2O [O]

3) Дезаминирование (генетическая связь
α-аланина, молочной кислоты и ПВК)

Н2O

[O]

[H]

NН3

4) Декарбоксилирование

H2N-(CH2)5-NH2

-

СО2

фермент

лизин (Лиз)

кадаверин

(при гниении)

гистидин (Гис)

- СО2

фермент

гистамин

5) Реакции восстановительного аминирования и
реакции трансаминирования – см. лекцию
«Карбонильные соединения»

Слайд 32

Полипептиды Это продукты поликонденсации аминокислот (с отщеплением воды) и образованием амидной

Полипептиды

Это продукты поликонденсации аминокислот
(с отщеплением воды) и образованием амидной
(пептидной) связи

В

общем виде - полипептид:

пептидные связи

Слайд 33

Пример. γ-Глутатион (трипептид) – активатор ферментов, содержится во всех клетках организма,

Пример.

γ-Глутатион (трипептид) – активатор ферментов,
содержится во всех клетках организма, участвует

в ox-red
процессах, т.к. в его составе находится цистеин

γ-Глу- Цис-Гли

N-конец

С-конец

γ-глутамил-цистеинил-глицин

Название: перечисляют аминокислоты, начиная с N-конца,
с добавлением суффикса –ил, кроме С-концевой амино-
кислоты, для которой сохраняется ее полное название

Слайд 34

Специфичность белков определяется: аминокислотным составом – природой и количеством аминокислот 2)

Специфичность белков определяется:

аминокислотным составом – природой и
количеством аминокислот

2) аминокислотной последовательностью


первичной структурой белка

В настоящее время установлена структура > 600 белков,
Например, гормоны - инсулин (51 аминокислота), оксито-
цин и вазопрессин (нонапептиды), фермент – рибонуклеа-
за (124 аминокислоты) и др.

Сложности искусственного синтеза пептидов:
а) много вариантов сочетания, б) маленький выход конеч-
ного продукта (т.к. много стадий)

Слайд 35

Пространственное строение полипептидов Вторичная структура белка 1. Пептидная связь а) частичная

Пространственное строение полипептидов

Вторичная структура белка

1. Пептидная связь

а) частичная двоесвязанность (из-за р-π

сопряжения
электронной пары азота с π-электронами С=О связи)

Наличие плоской cо-
пряженной структуры -
– причина затруднения
вращения вокруг
связи С-N

≈ 14 кДж/моль

≈ 100 кДж/моль

≈ 40-80 кДж/моль

Слайд 36

б) трансоидная конформация Сравните! lС=O 0,121 нм lN-С 0,147 нм длиннее! короче!

б) трансоидная конформация

Сравните!

lС=O 0,121 нм

lN-С 0,147 нм

длиннее!

короче!

Слайд 37

2. α-Спираль и β-складчатая структура Упорядоченное свертывание «остова» полипептидной цепи в

2. α-Спираль и β-складчатая структура

Упорядоченное свертывание «остова» полипептидной
цепи в результате

образования водородных связей
между С=О-группами и NH-группами

α-спираль
(преобладает
в глобулярных
белках)

N-H

N-H

C=O

C=O

Л.Полинг,
Р.Кори

Параметры:
шаг = 5,4 ангстрема;
диаметр = 5,4 ангс-
трема;
1 виток состоит
из 3,7 аминокислот

Слайд 38

Слайд 39

α-Спираль

α-Спираль

Слайд 40

β-складчатая структура N-конец С-конец (преобладает в фибрилляр- ных белках)

β-складчатая структура

N-конец

С-конец

(преобладает
в фибрилляр-
ных белках)

Слайд 41

β-складка

β-складка

Слайд 42

β-Складка

β-Складка

Слайд 43

Полипептид

Полипептид

Слайд 44

Тройная спираль коллагена

Тройная спираль коллагена

Слайд 45

Третичная структура белка Трехмерное свертывание полипептидной цепи, приводя- щее к наложению

Третичная структура белка

Трехмерное свертывание
полипептидной цепи, приводя-
щее к наложению одних

участ-
ков α-спирали или β-складчатой
структуры на другие участки цепи

Это происходит за счет различных
взаимодействий:

водородные связи;
2) дисульфидные мостики;
3) электростатические взаимодействия;
4) гидрофобные взаимодействия

Слайд 46

Слайд 47

Ион-ионные взаимодействия Ковалентное связывание N-конец С-конец

Ион-ионные
взаимодействия

Ковалентное
связывание

N-конец

С-конец

Слайд 48

Следует иметь в виду, что изгибы полипептидной цепи обусловлены наличием аминокислот

Следует иметь в виду, что изгибы полипептидной
цепи обусловлены наличием аминокислот со
вторичной

аминогруппой – пролина и гидрокси-
пролина; в этих случаях пептидная связь не со-
держит водорода, поэтому невозможна стабили-
зация пространственной структуры за счет водо-
родной связи

Х=Н Про
Х=ОН Про-ОН

Про

нарушение
регулярности

Слайд 49

Некоторые белки, например гемоглобин, обладают чет- вертичной структурой; при этом одинаковые

Некоторые белки, например
гемоглобин, обладают чет-
вертичной структурой; при
этом одинаковые или сход-
ные субъединицы

соединя-
ются в единое целое с сим-
метричным пространствен-
ным расположением

Четвертичная структура белка

Четвертичная структура стабилизируется, как
правило, водородными связями и гидрофобны-
ми взаимодействиями

Слайд 50

Полипептид

Полипептид