Физико-химические свойства белков

Содержание

Слайд 2

Физико-химические свойства белков Молекулярная масса; Амфотерность; Наличие заряда, электрофорез; Растворимость, свойства белковых растворов Денатурация

Физико-химические свойства белков

Молекулярная масса;
Амфотерность;
Наличие заряда, электрофорез;
Растворимость, свойства белковых растворов
Денатурация

Слайд 3

Белки – амфотерные электролиты. Заряд белковой молекулы. Знак и величина заряда

Белки – амфотерные электролиты. Заряд белковой молекулы.

Знак и величина заряда Б

молекулы зависят от особенностей первичной структуры.
Протамины, гистоны (+), R - аргинин лизин

Заряд белковой молекулы можно менять, изменяя pH среды.

Слайд 4

ИЭТ – тот pH среды, при котором белок находится в изоэлектрическом

ИЭТ – тот pH среды, при котором белок находится в изоэлектрическом

состоянии. Заряд равен 0.

ИЭТ (pJ) – паспортная характеристика, индивидуальная для каждого белка, зависит от первичной структуры.

А – 4,8; Г – 6,8; пепсин – 1,0; химотрипсин – 8,1; клупеин – 12,0

pH > pJ (-)
pH < pJ (+)
pH = pJ (0)

Знание ИЭТ важно для понимания особенностей первичной структуры, для понимания стабильности белка в растворе (pJ – Б.↓.)

Слайд 5

Методы разделения белков по заряду 1. Электрофорез – движение заряженных частиц

Методы разделения белков по заряду

1. Электрофорез – движение заряженных частиц в

электрическом поле.
Скорость движения зависит от:
Разности потенциалов;
Молекулярной массы;
Формы белковой молекулы;
Взаимодействия со средой движения;
pH и состава буфера.
Зональный ЭФ на носителях:( бумаге, агар-агаре, крахмале, ПААГ)

Белки плазмы крови:
Бумага – 5 (6)
Крахмал – 10
ПААГ – 15 – 20

Слайд 6

2. Ионообменная хроматография Ионообменники Катионообменники (-) Карбоксиметил – целлюлоза (КМЦ) Анионообменники

2. Ионообменная хроматография

Ионообменники

Катионообменники (-)
Карбоксиметил – целлюлоза (КМЦ)

Анионообменники
ДЭАЭ – целлюлоза
ДЭАЭ – сефадекс

А)

связывание по заряду
Б) элюция (снятие) раствором с другим pH
Слайд 7

3. Изоэлектрическое фокусирование (электрофокусирование, изотахофорез) pH = pJ остановка движения О.Вестерберг амфолины (полиаминополикарбоновые кислоты)

3. Изоэлектрическое фокусирование (электрофокусирование, изотахофорез)

pH = pJ остановка движения

О.Вестерберг амфолины (полиаминополикарбоновые кислоты)

Слайд 8

Молекулярная масса белков Зависит от: Особенностей первичной структуры; Наличия четверичной структуры;

Молекулярная масса белков

Зависит от:
Особенностей первичной структуры;
Наличия четверичной структуры;
Массы небелковой части (простой

белок или сложный)
Молекулярные массы некоторых белков:
Инсулин 5 733
Миоглобин кашалота 17 600
Пепсин 35 000
Альбумин яичный 46 000
Гемоглобин лошади 68 000
γ – глобулин человека 160 000
Каталаза 250 000
Фибриноген человека 450 000
Глутаматдетидрогеназа 1 000 000
Гемоцианин улитки 6 000 000
Вирус табачной мозайки 40 000 000
Слайд 9

Методы определения молекулярной массы белков Расчетные Вискозиметрические Осмометрические Оптические Гравиметрические (ультрацентрифугирование) Гельфильтрация Электрофорез (ЭФ) Ультрафильтрация

Методы определения молекулярной массы белков

Расчетные
Вискозиметрические
Осмометрические
Оптические
Гравиметрические (ультрацентрифугирование)
Гельфильтрация
Электрофорез (ЭФ)
Ультрафильтрация

Слайд 10

Методы определения (разделения) белков по массе Ультрацентрифугирование – гравиметрический метод 1913г.

Методы определения (разделения) белков по массе

Ультрацентрифугирование – гравиметрический метод
1913г. - Думанский,

1923г. – Сведберг
Фактор разделения – относительное центробежное ускорение
Константа седиментации – 10-13 с = сведберг

R – газовая постоянная
Т – температура по Кельвину
D – коэффициент диффузии
P – плотность растворителя
σ – плотность белковых частиц

Слайд 11

Слайд 12

2. Гельхроматография (гельфильтрация) Принцип антисита (медленно – мелкие, быстро – крупные молекулы)

2. Гельхроматография (гельфильтрация)

Принцип антисита (медленно – мелкие, быстро – крупные молекулы)

Слайд 13

3. Диск-электрофорез в ПААГ в присутствии ДСН (додецилсульфат Na) Чем >

3. Диск-электрофорез в ПААГ в присутствии ДСН (додецилсульфат Na)

Чем > мол.

масса, тем. > пептидных связей > отрицательный заряд

Движение будет осуществляться в зависимости от массы (размера) молекулы

Слайд 14

4. Ультрафильтрация (молекулярные фильтры) Диализ – неспособность молекул белка проходить через

4. Ультрафильтрация (молекулярные фильтры)

Диализ – неспособность молекул белка проходить через полупроницаемые

мембраны – способ очистки белка от низкомолекулярных соединений.
Слайд 15

Растворимость Зависит от: АК состава (чем больше полярных групп, тем больше

Растворимость

Зависит от:
АК состава (чем больше полярных групп, тем больше растворимость)
Особенностей организации

молекулы (Г>Ф)
Свойств растворителя
Стабильность придают:
Заряд белковой молекулы
Наличие гидратной оболочки
Слайд 16

Влияет на растворимость: Ионная сила раствора: С – концентрация b -

Влияет на растворимость:

Ионная сила раствора:

С – концентрация
b - валентность

1. Концентрация нейтральных

солей

Высаливание – осаждение белка из раствора солями щелочных и щелочноземельных металлов (NH4)2SO4, Na2SO4
Процесс обратимый.

Каждый белок высаливается при определенной ионной силе (концентрации соли) A – 100%, Г – 50% (NH4)2SO4

Слайд 17

Слайд 18

2. Температура

2. Температура

Слайд 19

Методы фракционирования по растворимости: Изоэлектрическое осаждение Высаливание Осаждение водоотнимающими средствами (спирт,

Методы фракционирования по растворимости:
Изоэлектрическое осаждение
Высаливание
Осаждение водоотнимающими средствами (спирт, ацетон на холоду

по Кону)

3. pH
pH = pJ (0) изоэлектрическое осаждение

Слайд 20

Свойства белков в растворе Медленно дифундируют Не проходят через полупроницаемые мембраны

Свойства белков в растворе

Медленно дифундируют
Не проходят через полупроницаемые мембраны
Опалесцируют
Рассеивают свет
Способны к

набуханию
Характеризуются высокой вязкостью
Обладают низким Росм и высоким Ронк
Поглощают УФ λ=280нм
Слайд 21

Нативный белок – белок с неизменной структурой и свойствами. Факторы денатурации:

Нативный белок – белок с неизменной структурой и свойствами.
Факторы денатурации:
Физические (t,

давление, УЗ)
Химические (кислоты, щелочи, тяжелые металлы)
Биологические (протеолитические ферменты)
Признаки денатурации:
Потеря биологической активности;
Изменение конформации белковой молекулы;
Увеличение числа функциональных групп (появляются гидрофобные);
Уменьшение растворимости и осаждение;
Изменение вязкости, оптической активности, прозрачности растворов белка;
Изменение окрашиваемости (гистология);
Большая доступность действию протеолитических ферментов.

Денатурация – любое негидролитическое изменение структуры белка, приводящие к изменению его биологических и физико-химических свойств

Слайд 22

Химическая (ковалентная) модификация 1) Фосфатная модификация 2) Ацетатная модификация 3) Метилирование

Химическая (ковалентная) модификация
1) Фосфатная модификация
2) Ацетатная модификация
3) Метилирование
4) Аминирование
5) АДФ-рибозилирование
Химическая модификация

– способ регуляции функциональной активности белка in vivo
Слайд 23

Гомогенизация – разрушение ткани, клеток Экстракция – извлечение белка различными растворителями

Гомогенизация – разрушение ткани, клеток
Экстракция – извлечение белка различными растворителями (вода,

слабые солевые растворы)
Разделение экстракта на индивидуальные белки (высаливание, pJ-осаждение, дифференциальное центрифугирование)
Различные виды хроматографии (ионообменная, аффинная, ЭФ, гельфильтрация)
Очистка (диализ, гельфильтрация, кристаллизация-высаливание, установка гомогенности)

Выделение и очистка белка

Слайд 24

Классификация белков По форме (Г и Ф) По степени сложности (простые

Классификация белков

По форме (Г и Ф)
По степени сложности (простые и сложные)
По

растворимости (и другим физико-химическим свойствам)
По функциям
По вторичной и третичной структуре (α, β, α+β, α/β)
По месту локализации
Слайд 25

Белки Простые (протеины) Альбумины 60т pJ-4,7 Глобулины 160т pJ-6.8 Растительные: Глютелины

Белки

Простые
(протеины)
Альбумины 60т pJ-4,7
Глобулины 160т pJ-6.8
Растительные:
Глютелины
Проламины
Ядерные:
Протамины 5-10т pJ-11,0
Гистоны 10-20т pJ-9,5
Кислые белки pJ-4,5

Другие:
Протеиноиды

Сложные
(протеиды)

Слайд 26

А – Н2О и крепкие солевые растворы >50%, 100% уменш. Г

А – Н2О и крепкие солевые растворы >50%, 100% уменш.
Г –

н/р Н2О растворимы в солевых растворах до 50%, 50% уменш.
Проламины – 60о – 80о спирт
Глютелины – разбавленные щелочи
Протамины (80% арг лиз) и гистоны (30% арг лиз) – белки основного характера
В основе классификации гистонов арг/лиз, 5 классов: Н, Н2а, Н2в, Н3, Н4
Гистоны – небелковая часть нуклеопротеидов (структурная и регуляторная функции)
Слайд 27

Сложные белки Хромопротеиды - окрашенные белки (chroma – краска) Гемопротеиды –

Сложные белки

Хромопротеиды - окрашенные белки (chroma – краска)
Гемопротеиды – Нв, миоглобин,

каталаза, пероксидаза, цитохромы
Простетическая часть – ГЕМ – металлопорфириновый комплекс
Нв = 96% глобин + 4% гем (глобин + 4 гема)
Глобин – белок с четверичной структурой, состоит из 4-х полипептидных цепочек
Нв А (взрослый) б2pб б – 141АК·2
574АК
в – 146АК·2
Слайд 28

Первичная структура ГЕМ – α – ГЕМ – β – 2

Первичная структура

ГЕМ – α –
ГЕМ – β –

2

Вторичная структура

– спирализованные сегменты разной длины, соединенные неспирализованными (α – 7%, β – 8%)

полипептидные цепочки

полипептидные цепочки

Слайд 29

Третичная структура – формирование субъединиц, внутри каждой образуется «гидрофобный» карман, в

Третичная структура – формирование субъединиц, внутри каждой образуется «гидрофобный» карман, в

котором располагается Гем, который удерживается силами Ван дер Ваальса между неполярными участками Гема и гидрофобными радикалами АК. Кроме этого железо Гема 5-координационной связью с имидазольным радикалом гистидина в глобине.

Третичная структура

Слайд 30

Четверичная структура – похожа на тетраэдр, субъединицы расположены попарно Между б

Четверичная структура – похожа на тетраэдр, субъединицы расположены попарно
Между б и

в – силы Ван дер Ваальса
Между субъединицами одного типа:
Ионные
Солевые

Четвертичная структура

Модель гемоглобина (по Перутцу)

Слайд 31

Производные гемоглобина Схема образования производных гемоглобина

Производные гемоглобина
Схема образования
производных
гемоглобина

Слайд 32

Типы гемоглобинов Физиологические НвР (примитивный) эмбриональный Ε4? Е2α2 Говер–I Говер –

Типы гемоглобинов

Физиологические
НвР (примитивный) эмбриональный
Ε4? Е2α2
Говер–I Говер – II
НвF (фетальный) у плода

– 70%
Α2γ2
НвА1 взрослый
α2β2
НвА2 – α2σ2

Аномальные
Нв Н – в4
НвБарта – г4
Нв S – в в цепи глу(в) ? вал
Нв М – остатки гис ? тир = Fe+3 ? мет Нв

Слайд 33

Кровь взрослого человека НвА1 - 95 – 96% НвА2 – 2-3%

Кровь взрослого человека

НвА1 - 95 – 96% НвА2 – 2-3% НвF – 0,1

– 2%

Мутации генов, кодирующих α и β цепи могут существенным образом сказываться на биологических функциях Нв. Известно более 100 мутантных Нв.
Гемоглобинопатия – патологическое состояние характеризующиеся изменением биологической функции Нв вследствие мутации – наследственного изменения структуры какой-либо цепи нормального Нв (молекулярная болезнь)
Талассемия – аномалия Нв, связанная с понижением скорости синтеза α цепи Нв (α-талассемия) или β цепи (β-талассемия).

Слайд 34

Фосфопротеиды Небелковая часть – фосфорная кислота Постоянный фосфопротеид – казеин молока

Фосфопротеиды

Небелковая часть – фосфорная кислота
Постоянный фосфопротеид – казеин молока
Временные фосфопротеиды –

фосфатные модификации белка
Фосфорилированный белок ⬄ дефосфорилированный белок (сложный) (простой)
Металлопротеиды
Содержат ионы одного или нескольких металлов
Fe+2 ферритин, трансферрин, гемосидерин
Zn+2 карбоангидраза, карбоксипептидаза
Cu+2 цитохромоксидаза
Mg+2 фосфотрансферазы (киназы)
Mn+2 аргиназа