Содержание
- 2. Биополимеры Нуклеиновые кислоты Белки Полисахариды
- 3. Фридрих Мишер 1844—1895 Первые из известных изображений клеточных ядер. А.Левенгук (1632 – 1723 ), 1719 Феликс
- 4. Первичная структура – полная ковалентная структура молекулы Вторичная структура – совокупность спиральных участков молекулы (не зависящая
- 5. Первичная структура Последовательность мономеров… R1-R2-R3-R4-R5-… Ra-Rb Rb-Ra соединенных по принципу «голова к хвосту»
- 6. ДНК Первичная структура
- 7. 1 2 3 4 5 6 7 8 9 1 2 3 4 5 6 Пиримидин
- 8. Дезоксирибоза 1 2 3 4 5 1’ 2’ 3’ 4’ 5’ 1’ 2’ 3’ 4’ 5’
- 9. Нуклеотиды - фосфорные эфиры нуклеозидов Эфиры ортофосфорной кислоты нуклеозидмонофосфаты Дезоксиаденозин-5’-монофосфат Дезоксиаденозин-5’-дифосфат Эфиры пирофосфорной кислоты нуклеозиддифосфаты Эфиры
- 10. Первичная структура ДНК Нуклеотиды - фосфорные эфиры нуклеозидов Эфиры ортофосфорной кислоты нуклеозидмонофосфаты Дезоксиаденозин-3’-монофосфат Дезоксиаденозин-3’-дифосфат Эфиры пирофосфорной
- 11. Физические свойства нуклеотидов Основание Аденин Гуанин Цитозин Тимин Максисмум УФ-поглощения, нм 260 245 265 268 Первичная
- 12. Динуклеотиды NpN 5’ 3’ 5’-pApC-3’ 5’-pApC-3’ 5’-ApCp-3’ 5’-pApCp-3’ Первичная структура ДНК
- 13. P G Первичная структура ДНК Олигонуклеотиды и полинуклеотиды NpNpNpNpN… 5’ 3’ 5’-pApCpGpTpC-3’ ACGTC P P A
- 14. Первичная структура ДНК Сахарофосфатный остов Азотистые основания 5’ 3’ A - аденин T - тимидин G
- 16. ДНК Вторичная структура
- 17. Стэкинг-взаимодействия Вторичная структура ДНК
- 18. Стэкинг-взаимодействия Вторичная структура ДНК
- 19. Стэкинг-взаимодействия Вторичная структура ДНК Ориентационное взаимодействие взаимодействие между постоянными диполями (сила Кеезома [r3]) Индукционное взаимодействие взаимодействие
- 20. Стэкинг-взаимодействия Вторичная структура ДНК Пиррол Пиридин Имидазол http://www.slideshare.net/katsuyama/computational-organic-chemistry
- 21. Стэкинг-взаимодействия Вторичная структура ДНК http://slideplayer.com/slide/9396582/ Пиримидин http://slideplayer.com/slide/8380330/ Пурин
- 22. Стэкинг-взаимодействия Вторичная структура ДНК Аденин Гуанин Цитозин Урацил
- 23. Водородные связи Вторичная структура ДНК Shishkin O.V. et al. Int. J. Mol. Sci. 2003, 4(10), 537-547
- 24. Вторичная структура ДНК СФО СФО СФО СФО 2.83Å 2.86Å 2.84Å 2.85Å 2.90Å Аденин Тимин Цитозин Гуанин
- 25. Вторичная структура ДНК P G 5’ P P A C P C P T 3’ P
- 26. 5’ 5’ 3’ 3’ Вторичная структура ДНК Условные обозначения
- 27. Вторичная структура ДНК Принцип комплементарности СФО СФО СФО СФО Правила Чаргаффа А=Т, Г=Ц R=Y M=K 2.83Å
- 28. Вторичная структура ДНК Принцип комплементарности
- 29. Вторичная структура ДНК Конформации нуклеозидов Анти Син Син Анти
- 30. Вторичная структура ДНК Конформации фуранозного кольца 1 2 3 4 5 1’ 2’ 3’ 4’ 5’
- 31. Вторичная структура ДНК Конформации пары оснований Геометрия пары оснований
- 32. 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 x y z
- 33. Вторичная структура ДНК Двойная спираль ДНК http://www.digitaljournal.com
- 34. Двойная спираль ДНК Вторичная структура ДНК B-ДНК A-ДНК B-ДНК A-ДНК Z-ДНК
- 35. 3’ 5’ Сахаро- фосфатный остов Азотистые основания Двойная спираль ДНК Вторичная структура ДНК
- 36. + 5’ 3’ 3’ 5’ 5’ 3’ 3’ 5’ Двойная спираль ДНК Вторичная структура ДНК
- 37. B-ДНК ~10.5 п.н. Сахарофосфатный остов Азотистые основания Двойная спираль ДНК Вторичная структура ДНК
- 38. Вторичная структура ДНК Параметры двойных спиралей ДНК
- 39. Вторичная структура нуклеиновых кислот Шпильки, стебельки, узелки Шпилька Петля на стебле (стебель-петля) Псевдоузел
- 40. Вторичная структура ДНК Палиндромы (АРГЕНТИНАМАНИТНЕГРА)
- 41. Вторичная структура ДНК Палиндромы Неправильное спаривание +
- 43. Плавление (денатурация) ДНК Вторичная структура ДНК
- 44. Плавление ДНК Вторичная структура ДНК
- 45. Вторичная структура ДНК Плавление (денатурация) ДНК Tm – температура плавления (m = “melting”)
- 46. Вторичная структура ДНК Плавление (денатурация) ДНК Олигонуклеотид Синтетический олигонуклеотид с нестабильными концами Синтетический олигонуклеотид со стабильными
- 47. Плавление (денатурация) ДНК Вторичная структура ДНК T (°C) NaOH + Локальное плавление Разделение цепей
- 48. Плавление (денатурация) ДНК Вторичная структура ДНК ДНК из локуса рибосомных генов, частично денатурированная щелочью (очищенная электронная
- 49. Реассоциация (ренатурация) ДНК Вторичная структура ДНК Нуклеация Рост 2-цепочечного участка Схлопывание цепей
- 50. Реассоциация (ренатурация) ДНК Вторичная структура ДНК Нуклеация Рост 2-цепочечного участка
- 51. Реассоциация (ренатурация) ДНК Вторичная структура ДНК Результат быстрого охлаждения ДНК после денатурации
- 52. ATTGCGGTCATGTAGCG TAACGCCAGTACATCGC ATTGCGGTCATGTAGCG TAACGCCAGTACATCGC ATTGCGGTCATGTAGCG TAACGCCAGTACATCGC ATTGCGGTCATGTAGCG TAACGCCAGTACATCGC ATTGCGGTCATGTAGCG TAACGCCAGTACATCGC ATTGCGGTCATGTAGCG Реассоциация (ренатурация) ДНК Вторичная структура
- 53. AAAAAAAAAAAAAAAAA Реассоциация (ренатурация) ДНК TTTTTTTTTTTTTTTTT AAAAAAAAAAAAAAAAA TTTTTTTTTTTTTTTTT + Вторичная структура ДНК 2L + 1 вариантов …
- 54. Реассоциация (ренатурация) ДНК Вторичная структура ДНК Локальное плавление (образование петель) Схлопывание Слияние петель Схлопывание Структуры ДНК
- 55. Реассоциация (ренатурация) ДНК Вторичная структура ДНК Отжиг– нагрев и медленное охлаждение Ta – температура отжига (a
- 57. Гибкость ДНК Вторичная структура ДНК В растворе молекула ДНК представляет собой хаотичный клубок
- 58. Шаг пары оснований Вторичная структура ДНК
- 59. Вторичная структура ДНК Конформации шага пары оснований
- 60. Конформационные диапазоны шагов пар оснований Вторичная структура ДНК Конформационная подвижность шага пар оснований
- 61. 5’ Вторичная структура ДНК Подвижность шага пар оснований 3’ Г Ц 3’ 5’ 5’ 3’ Ц
- 62. Вторичная структура ДНК Электронная конфигурация пар оснований А Т G C
- 63. Вторичная структура ДНК Электронные конфигурации шагов пар оснований
- 64. Вторичная структура ДНК Гибкость разных последовательностей ДНК AAAAAAAAAAAAAAAAA TTTTTTTTTTTTTTTTT GGGGGGGGGGGGGGGGG CCCCCCCCCCCCCCCCC AGCTTGACTAGTCATCA TCGAACTGATCAGTAGT
- 66. РНК Первичная структура
- 67. 1 2 3 4 5 6 7 8 9 1 2 3 4 5 6 Пиримидин
- 68. Различия в биологических свойствах урацила и тимина Первичная структура РНК Ядро Цитоплазма Урацил Тимин ДНК РНК
- 69. H2O NH3 ATTGCTCGATGCTTUGTTAGT TAACGAGCTACGAAGCAATCA AUUGCUCGAUGCUUCGUUAGU UAACGAGCUACGAAGCAAUCA AUUGCUCGAUGCUUUGUUAGU UAACGAGCUACGAAGCAAUCA AUUGCUCGAUGCUUUGUUAGU UAACGAGCUACGAAACAAUCA AUUGCUCGAUGCUUCGUUAGU UAACGAGCUACGAAGCAAUCA ATTGCTCGATGCTTCGTTAGT TAACGAGCTACGAAGCAATCA ATTGCTCGATGCTTCGTTAGT TAACGAGCTACGAAGCAATCA
- 70. Рибоза 1 2 3 4 5 1’ 2’ 3’ 4’ 5’ 1’ 2’ 3’ 4’ 5’
- 71. Нуклеотиды - фосфорные эфиры нуклеозидов Эфиры ортофосфорной кислоты нуклеозидмонофосфаты Аденозин-5’-монофосфат (АМФ) Аденозин-5’-дифосфат (АДФ) Эфиры пирофосфорной кислоты
- 72. Первичная структура РНК Нуклеотиды - фосфорные эфиры нуклеозидов Эфиры ортофосфорной кислоты нуклеозидмонофосфаты Аденозин-3’-монофосфат Аденозин-3’-дифосфат Эфиры пирофосфорной
- 73. Первичная структура РНК цАМФ аденозин-3’,5’-цикломонофосфат 3’,5’-цикло-АМФ
- 74. P C Первичная структура РНК Олигонуклеотиды и полинуклеотиды NpNpNpNpN… 5’ 3’ 5’-pApGpCpU-3’ AGCU P P A
- 75. Первичная структура РНК Сахарофосфатный остов Азотистые основания 5’ 3’
- 76. РНК Вторичная структура
- 77. Вторичная структура РНК Конформации фуранозного кольца 1 2 3 4 5 1’ 2’ 3’ 4’ 5’
- 78. Вторичная структура РНК Внутрицепочечные шпильки 16S рРНК Псевдоузел тРНК
- 80. Нестандартные вторичные и третичная структура нуклеиновых кислот
- 81. Уотсон-криковские пары
- 82. Хугстиновские пары Уотсон-криковские пары Хугстиновские пары
- 83. Триплекс в большом желобке
- 84. Триплекс в большом желобке РНК Теломеразы
- 85. Квадруплекс Теломерная ДНК
- 86. Третичная структура РНК Целующиеся петли Транспортная РНК
- 87. Третичная структура РНК Триплекс в малом желобке (водородные связи между азотистым основанием и малой бороздкой) Самосплайсирующиеся
- 88. Третичная структура РНК Триплекс в малом желобке Мотив «ля-минор» (A-minor motif) (водородные связи между аденином и
- 89. Третичная структура РНК Рибозная «застежка-молния» (водородные связи между OH группами у С2’ атома рибозы) Рибосомальная РНК
- 90. Третичная структура РНК Третичная структура тРНК Целующиеся петли Мотив A-minor
- 92. Методы исследования нуклеиновых кислот
- 93. Методы исследования ДНК и РНК Электрофорез 1 2 3 4 + - + - Электролит
- 94. Методы исследования ДНК и РНК Гель-электрофорез + - + -
- 95. Методы исследования ДНК и РНК Гель-электрофорез lgμ = lgμ0 - Kr·τ μ – электрофоретическая подвижность в
- 96. Методы исследования ДНК и РНК Гель-электрофорез
- 97. Методы исследования ДНК и РНК Гель-электрофорез Зависимость электрофоретической подвижности от длины ДНК в гелях разной плотности
- 98. Методы исследования ДНК и РНК Гель-электрофорез Определение длины фрагмента ДНК
- 99. Методы исследования ДНК и РНК Гель-электрофорез Определение состояния ДНК Линейная ДНК Кольцевая ДНК Кольцевая суперскрученная ДНК
- 100. Методы исследования ДНК и РНК Гель-электрофорез Определение однонитевых разрывов в ДНК
- 101. Кантилевер Лазер Фотодиод Образец Подвижный столик Основание Зонд Зонд на прямоугольной консоли (электронная микроскопия) Атомно-силовая микроскомия
- 102. Контактный режим АСМ Методы исследования ДНК и РНК
- 103. «Полуконтактный» режим Tapping mode АСМ Методы исследования ДНК и РНК
- 104. Глобулы диаметром 80 нм Глобулярная структура хромосомы АСМ Методы исследования ДНК и РНК
- 105. Взаимодействие ДНК с белками (для эффективного связывания требуется суперскрученность) Линейная ДНК Суперскрученная ДНК АСМ Методы исследования
- 107. Ультрацентрифугирование Седиментация VS – скорость движения без ускорения а = ω2r Седиментация – движение с постоянной
- 108. Коэффициент и константа седиментации Если седиментация происходит в воде при 20°С (ρ20,W и η20,W известны), то
- 109. Ультрацентрифуга Молекулы с разными Vs Ультрацентрифугирование 1923 г. – 5000 g 1926 г. – 100000 g
- 110. Плавучая плотность Создание градиента плотности в колонке Линдерстрема-Ланга Annu.Rev.Biochem.-2005.-74.-1–28 Ультрацентрифугирование h
- 111. Плавучая плотность t=0 t1 t2 t3 t4 Мениск Дно Формированиее градиента плотности при ультрацентрифугировании растворов солей
- 112. ρ h Плавучая плотность Плавучая плотность ρч плотность среды, при которой движение частицы прекращается, т.е. разность
- 113. Плавучая плотность ρч – ρс = 0 ρч – ρс = 0 Ультрацентрифугирование
- 114. Седиментация f – фактор трения зависит от: формы частицы размера частицы вязкости жидкости Mч = s
- 115. Небольшое отступление Разделение частиц по плавучей плотности Methods in Biotechnology, Vol. 24: Animal Cell Biotechnology Зрелые
- 116. Линейная и кольцевая ДНК Суперскрученная ДНК Градиент плотности CsCl Journal of General Virology.-2000.-81.-3073-3082 Разделение частиц по
- 118. Скачать презентацию