Структурная организация белковой молекулы

Содержание

Слайд 2

Биохимия – наука о молекулярных основах жизни. Биохимия изучает различные молекулы,

Биохимия – наука о молекулярных основах жизни.

Биохимия изучает различные молекулы, химические

реакции и процессы, протекающие в живых клетках и организмах.
Главная задача биохимии – установление связи между молекулярной структурой и биологической функцией химических компонентов живых организмов.
Слайд 3

Биохимия Статическая биохимия изучает химический состав организма. Динамическая биохимия изучает совокупность

Биохимия

Статическая биохимия
изучает
химический
состав организма.


Динамическая биохимия
изучает
совокупность

превращений
веществ и энергии в организме.
Слайд 4

В зависимости от объекта исследования выделяют биохимию человека и животных, биохимию растений, биохимию микроорганизмов.

В зависимости от объекта исследования выделяют

биохимию человека и животных,
биохимию

растений,
биохимию микроорганизмов.
Слайд 5

Разделы биохимии эволюционная биохимия, энзимология, биохимия витаминов, квантовая биохимия, молекулярная биология, клиническая биохимия.

Разделы биохимии

эволюционная биохимия,
энзимология,
биохимия витаминов,
квантовая биохимия,
молекулярная биология,

клиническая биохимия.
Слайд 6

Клиническая биохимия раздел биохимии, изучающий изменения биохимических процессов в организме человека

Клиническая биохимия

раздел биохимии, изучающий изменения биохимических процессов в организме человека

при патологических состояниях, а также разрабатывающий методы обнаружения этих изменений в целях диагностики и прогноза заболеваний,
относится к субдисциплинам клинической лабораторной медицины,
изучает структуру и обмен индивидуальных биомолекул в норме и при болезнях человека.
Слайд 7

Значение клинической биохимии На современном этапе развития медицины возросло значение биохимических

Значение клинической биохимии

На современном этапе развития медицины возросло значение биохимических исследований.
Применение

новых лекарств, методов лечения, проведение хирургических вмешательств и реанимационных мероприятий требует постоянного биохимического контроля.
Лабораторные методы исследования составляют до 75% всех видов исследования пациента.
Слайд 8

Разделы клинической биохимии клиническая энзимология, клиническая нейрохимия, клиническая витаминология.

Разделы клинической биохимии

клиническая энзимология,
клиническая нейрохимия,
клиническая витаминология.

Слайд 9

Биохимические исследования позволяют выявить причину заболевания, предложить рациональный и эффективный путь

Биохимические исследования позволяют

выявить причину заболевания,
предложить рациональный и эффективный путь

лечения,
разработать методику ранней диагностики,
следить за ходом болезни,
контролировать эффективность лечения.
Слайд 10

Основные достижения биохимии определён химический состав клеток, тканей, организма, открыта двойная

Основные достижения биохимии

определён химический состав клеток, тканей, организма,
открыта двойная

спираль ДНК,
многие ферменты изучены и получены в чистом виде,
установлены энзиматические свойства РНК,
выяснены особенности строения и функционирования мембран,
установлено как клетки запасают и используют энергию,
открыты окислительное фосфорилирование, ПОЛ, АОС,
прослежены метаболические пути синтеза и распада главных биомолекул,
выяснены многие аспекты регуляции метаболизма,
накоплены данные о механизме действия главных гормонов,
открыты регуляторные пептиды (гормоны, пептидные факторы роста, опиоидные пептиды),
определён механизм действия лекарств,
расшифрованы молекулярные механизмы иммунитета,
открыты молекулярные механизмы канцерогенеза,
генная терапия,
установлены биохимические основы значительного числа заболеваний.
Слайд 11

Генная терапия Дефицит аденозиндезаминазы ведёт к развитию иммунодефицита. Ген АDА вносится

Генная терапия

Дефицит аденозиндезаминазы ведёт к развитию иммунодефицита. Ген АDА

вносится в клетки больного.
Вирусы как основной фактор эволюции генома человека.
Слайд 12

Молекулярные основы канцерогенеза Открыто более 60 онкогенных белков (фактор роста тромбоцитов).

Молекулярные основы канцерогенеза

Открыто более 60 онкогенных белков (фактор роста тромбоцитов).
Эти факторы

в определённых условиях могут вызывать трансформацию клеток.
Слайд 13

Молекулярные механизмы иммунитета Применяется молекулярные регуляторы иммунитета: ИЛ-2 применяется в лечении

Молекулярные механизмы иммунитета

Применяется молекулярные регуляторы иммунитета:
ИЛ-2 применяется в лечении злокачественных

опухолей. ИЛ-2 стимулирует созревание Т-киллерной популяции лимфоцитов.
ФНО является регулятором иммунитета, участвует в апоптозе.
Слайд 14

Главные направления развития в области биохимии биологические мембраны и биоэнергетика, биосинтез

Главные направления развития в области биохимии

биологические мембраны и биоэнергетика,
биосинтез

белка,
молекулярные основы памяти,
рациональное питание,
молекулярные основы соматических и наследственных заболеваний,
молекулярные основы злокачественного роста,
молекулярные основы иммунитета,
процессы узнавания на молекулярном уровне,
дифференцировка клеток высших организмов,
организация и механизм функционирования генома,
регуляция действия ферментов и теория ферментного катализа.
Слайд 15

Белки высокомолекулярные азотсодержащие органические вещества, молекулы которых построены из остатков АМК,

Белки

высокомолекулярные азотсодержащие органические вещества, молекулы которых построены из остатков

АМК,
составляют основу и структуры, и функции живых организмов.
Каждый организм характеризуется уникальным набором белков.
Слайд 16

Многогранность функций белков обеспечивает способность белков строго избирательно, специфически соединяться с широким кругом разнообразных веществ.

Многогранность функций белков обеспечивает способность белков строго избирательно, специфически соединяться

с широким кругом разнообразных веществ.
Слайд 17

На долю белков приходится - 70-80 % в: мышцах, печени, селезёнке,

На долю белков приходится

- 70-80 % в:
мышцах,
печени,

селезёнке,
почках.
- 45 % во всём теле человека от сухой массы.
Слайд 18

Состав белков Помимо углерода, кислорода, водорода, входящих в состав почти всех

Состав белков

Помимо углерода, кислорода, водорода, входящих в состав почти всех

органических полимерных молекул, обязательным компонентом белков является азот.
Содержание азота в белках довольно постоянно – 16% , поэтому иногда количество белка в биологических объектах определяют по содержанию белкового азота.
Слайд 19

Белки самый многочисленный класс макромолекул, полипептиды, содержащие 100 и более АМК,

Белки

самый многочисленный класс макромолекул,
полипептиды, содержащие 100 и более АМК,

соединённых пептидными связями. Пептидные связи – ковалентные, уникальны по размерам.
Слайд 20

Специфические особенности белков определяются длиной пептидной цепи, различиями АМК состава, порядком чередования АМК.

Специфические особенности белков определяются

длиной пептидной цепи,
различиями АМК состава,

порядком чередования АМК.
Слайд 21

Аминокислотный состав белков Помимо 20 АМК в некоторых белках обнаружены и

Аминокислотный состав белков

Помимо 20 АМК в некоторых белках обнаружены и другие

АМК, а также их производные:
оксипролин, оксилизин в коллагене,
дийодтирозин в тироксине,
γ-карбоксиглутаминовая кислота в протромбине,
селеноцистеин в ГПО.
Слайд 22

Первичная структура белка порядок, последовательность расположения АМК в полипептидной цепи.

Первичная структура белка

порядок, последовательность расположения АМК в полипептидной цепи.

Слайд 23

Свойства первичной структуры белка уникальна, детерминирована генетически, её стабильность обеспечивается в

Свойства первичной структуры белка

уникальна, детерминирована генетически,
её стабильность обеспечивается в

основном пептидными связями, возможно участие небольшого числа дисульфидных связей,
в первичной структуре детерминированы вторичная, третичная и четвертичная структуры белковой молекулы,
в полипептидной цепи могут быть обнаружены разнообразные комбинации АМК:
не во всех белках содержатся все 20 АМК,
ни в одном белке АМК не содержатся в эквивалентных отношениях,
некоторые АМК встречаются редко и в меньшем количестве (гли в 10 раз чаще, чем три).
принцип структурного подобия (в белках встречаются идентичные пептидные структуры),
в состав полипептидной цепи входит 100-1000 АМК.
Слайд 24

По частоте обнаружения АМК делят на постоянно встречающиеся, изредка встречающиеся.

По частоте обнаружения АМК делят на

постоянно встречающиеся,
изредка встречающиеся.

Слайд 25

Для определения АМК состава белки гидролизуют. Гидролизат: в АМК анализатов, с

Для определения АМК состава белки гидролизуют.

Гидролизат:
в АМК анализатов,
с помощью

автоматической ионообменной хроматографии,
секвенатор используется для изучения первичной структуры.
Слайд 26

Изучена первичная структура у 1500 белков инсулин, миоглобин, гемоглобин, цитохром С, АКТГ, рибонуклеаза, АСТ, химотрипсиноген.

Изучена первичная структура у 1500 белков

инсулин,
миоглобин,
гемоглобин,
цитохром С,

АКТГ,
рибонуклеаза,
АСТ,
химотрипсиноген.
Слайд 27

Даже небольшие изменения первичной структуры изменяют свойства белков. HbA1 - у

Даже небольшие изменения первичной структуры изменяют свойства белков.

HbA1 - у здоровых

людей,
HbS - у больных серповидно-клеточной анемией.
HbS в шестом положении β-цепи вместо глу имеет валин.
Отличается по физическим, химическим и биологическим свойствам.
Слайд 28

Вторичная структура пространственное расположение полипептидной цепи, поддерживаемое водородными связями С=О …

Вторичная структура

пространственное расположение полипептидной цепи, поддерживаемое водородными связями С=О …

Н-N между фрагментами цепи.
Связи нековалентные, непрочные.
Слайд 29

Типы вторичной структуры

Типы вторичной структуры

Слайд 30

α-спираль устойчивая винтовая лестница, закрученная по часовой стрелке, NН-группа остатка АМК

α-спираль

устойчивая винтовая лестница, закрученная по часовой стрелке,
NН-группа остатка АМК взаимодействует

с СО – группой четвёртого от него остатка,
на виток приходится 3,6 АМК остатка,
5,4 Å – шаг спирали (расстояние между витками).
Слайд 31

АМК формирующие α-спираль: ала, лей, глн, цис, фен, тир, три, мет,

АМК

формирующие α-спираль: ала, лей, глн, цис, фен, тир, три, мет,

вал,
дестабилизирующие α-спираль: сер, иле, тре, глу, лиз, арг, гли, асп,
нарушающие α-спираль: про, оксипролин.
Белки с α-спиралью: гемоглобин, миоглобин.
Слайд 32

β-складчатость пептидные цепи располагаются параллельно друг другу в один слой, подобно

β-складчатость

пептидные цепи располагаются параллельно друг другу в один слой,

подобно листу, сложенному гармошкой.
На каждой плоскости образуются пептидные связи и радикалы выходят из структуры.
Полипептидные цепи могут формировать параллельные или антипараллельные β-структуры.
Слайд 33

Складчатые структуры

Складчатые структуры

Слайд 34

В белках встречаются области с нерегулярной вторичной структурой, которые называются беспорядочными

В белках встречаются области с нерегулярной вторичной структурой, которые называются беспорядочными

клубками.
Во многих белках присутствует и α-спираль и β-складчатость.
Слайд 35

Белки с β-складчатостью β-кератины (фиброин шёлка), фибриллярные белки волос, шёлка.

Белки с β-складчатостью

β-кератины (фиброин шёлка),
фибриллярные белки волос, шёлка.

Слайд 36

Метод для расшифровки вторичной структуры рентгеноструктурный анализ. Этим методом доказано существование

Метод для расшифровки вторичной структуры

рентгеноструктурный анализ.
Этим методом доказано существование

ещё двух уровней структурной организации белковой молекулы, оказавшихся промежуточными между вторичной и третичной.
Слайд 37

Надвторичные структуры агрегаты полипептидных цепей, обладающих собственной вторичной структурой и образующихся

Надвторичные структуры

агрегаты полипептидных цепей, обладающих собственной вторичной структурой и образующихся

в белках в результате их термодинамической или кинетической стабильности (βαβαβ-сегменты).
Слайд 38

Домен компактная глобулярная структурная единица внутри полипептидных цепей. Домены создаются объединением

Домен

компактная глобулярная структурная единица внутри полипептидных цепей.
Домены создаются объединением и

чередованием α-цепей и β-слоёв, между которыми находятся рыхлые структуры.
Домены могут выполнять разные функции.
Центры связывания белка с лигандом часто располагаются между доменами.
Активный центр гексокиназы расположен в расщелине между двумя доменами.
Слайд 39

Третичная структура пространственное расположение пептидной цепи, поддерживаемое межрадикальными связями. Все биологические

Третичная структура

пространственное расположение пептидной цепи, поддерживаемое межрадикальными связями.
Все биологические свойства

белков связаны с сохранностью их третичной структуры.
Слайд 40

Связи дисульфидная – ковалентная, Все остальные связи нековалентны: гидрофобные – между

Связи

дисульфидная –
ковалентная,
Все остальные связи
нековалентны:
гидрофобные

– между
аминогруппами
с неполярными радикалами (вал, мет, ала, фен, иле),
водородные между полярными радикалами (OH, NH2, SH, COOH),
ионные - между заряженными полярными радикалами (лиз, арг, гис, асп, глу).
Слайд 41

Белки с известной третичной структурой гемоглобин, трипсин, лизоцим, инсулин, цитохром.

Белки с известной третичной структурой

гемоглобин,
трипсин,
лизоцим,
инсулин,
цитохром.

Слайд 42

Методы изучения третичной структуры рентгеноструктурный анализ, электронное микроскопирование.

Методы изучения третичной структуры

рентгеноструктурный анализ,
электронное микроскопирование.

Слайд 43


Слайд 44

Формы конформаций Т-форма, R-форма. Фолдинг – процесс укладки синтезированной полипептидной цепи.

Формы конформаций

Т-форма,
R-форма.
Фолдинг – процесс укладки синтезированной полипептидной цепи.


Описан ряд наследственных заболеваний человека, развитие которых связывают с нарушением вследствие мутаций фолдинга:
пигментозы, фиброзы.
Слайд 45

Белки теплового шока (шапероны) располагаются между N-концевым сигнальным пептидом и матричным

Белки теплового шока (шапероны)

располагаются между N-концевым сигнальным пептидом и матричным

белком,
стресслимитирующая система,
играют роль в адаптационной стабилизации клеточных структур, в реализации стресс-реакции.
Слайд 46

Функции шаперонов способность предотвращать образование из полипептидной цепи неспецифических (хаотичных) беспорядочных

Функции шаперонов

способность предотвращать образование из полипептидной цепи неспецифических (хаотичных) беспорядочных клубков


обеспечение транспорта их к субклеточным мишеням, создавая условия для завершения свёртывания белковой молекулы
Слайд 47

Шапероны

Шапероны

Слайд 48

Белок Р53 проапоптозный фактор, страж генома.

Белок Р53

проапоптозный фактор,
страж генома.

Слайд 49

Четвертичная структура белок может состоять из нескольких цепей, число и взаиморасположение в пространстве которых различно.

Четвертичная структура

белок может состоять из нескольких цепей, число и взаиморасположение

в пространстве которых различно.
Слайд 50

Олигомерные белки состоят из нескольких полипептидных цепей: гемоглобин -4, гексокиназа – 2, ГЛДГ -6, ферритин -24.

Олигомерные белки

состоят из нескольких полипептидных цепей:
гемоглобин -4,
гексокиназа – 2,

ГЛДГ -6,
ферритин -24.
Слайд 51

Связи, поддерживающие четвертичную структуру гидрофобные, ионные, водородные.

Связи, поддерживающие четвертичную структуру

гидрофобные,
ионные,
водородные.

Слайд 52

Белки с известной четвертичной структурой гемоглобин, ГЛДГ, миоглобин, ГК. миоглобин гемоглобин

Белки с известной четвертичной структурой

гемоглобин,
ГЛДГ,
миоглобин,
ГК.

миоглобин

гемоглобин

Слайд 53

Каждый белок характеризуется уникальной структурой, обеспечивающей уникальность его функций.

Каждый белок характеризуется уникальной структурой, обеспечивающей уникальность его функций.

Слайд 54

Пептиды органические молекулы, в состав которых входит несколько (до 30) остатков

Пептиды

органические молекулы, в состав которых входит несколько (до 30) остатков

АМК, связанных пептидной связью,
низкомолекулярные пептиды содержат от 2 до 10 АМК (трипептиды),
пептиды со средней молекулярной массой – от 500 до 5000 Д, так называемые, «средние» молекулы,
высокомолекулярные пептиды с молекулярной массой от 5000 до 16000 Д.
Слайд 55

Различают пептиды – гормоны: вазопрессин, окситоцин, глюкагон, пептиды, участвующие в регуляции

Различают

пептиды – гормоны: вазопрессин, окситоцин, глюкагон,
пептиды, участвующие в регуляции

пищеварения: гастрин, секретин,
пептиды крови: глутатион, каллидин,
нейропептиды: пептиды памяти, сна, эндорфины, энкефалины,
пептиды, участвующие в сокращении мышц,
пептиды –внутренние эндотоксины («средние» молекулы).
Слайд 56

Функции белков структурная, каталитическая, регуляторная, рецепторная, иммунологическая, защитная, транспортная, сократительная, опорная,

Функции белков

структурная,
каталитическая,
регуляторная,
рецепторная,
иммунологическая,
защитная,
транспортная,
сократительная,
опорная,

обезвреживающая,
энергетическая,
геннорегуляторная,
создание биопотенциалов мембран,
гомеостатическая,
индивидуальное строение органов,
обеспечивают хорошее зрение.