Аффинная хроматография

Содержание

Слайд 2

Аффинная хроматография Аффинная хроматография (АХ) представляет собой метод разделения биологических молекул,

Аффинная хроматография

Аффинная хроматография (АХ) представляет собой метод разделения биологических молекул,

который основан на различии не физико-химических признаков молекулы (заряда, формы и размера), а специфичности функциональных свойств, отличающих данный фермент от множества других биополимеров.
Биологическое взаимодействие между лигандом и молекулой-мишенью может быть результатом образования:
Водородных связей
Электростатического взаимодействия
Ван-дер-Ваальсового взаимодействия
Гидрофобного взаимодействия
Один шаг аффинной очистки дает огромную экономию времени по сравнению с менее селективными многоступенчатыми процедурами.
Слайд 3

Механизм разделения в АХ а – иммобилизация лиганда (ковалентно); б –связывание

Механизм разделения в АХ

а – иммобилизация лиганда (ковалентно); б –связывание целевого

вещества (нековалентно) и удаление сопутствующих примесей; в – десорбция целевого вещества

Если лиганд присоединяется непосредственно к носителю, эффективность специфического взаимодействия заметно снижается вследствие пространственных затруднений - активные центры многих биологически активных веществ часто локализованы в середине глобулы и недоступны для небольших молекул лигандов, непосредственно связанных с матрицей.

Слайд 4

Проведение процесса хроматографии В аффинной хроматографии выделяют две фазы: подвижной фазой

Проведение процесса хроматографии

В аффинной хроматографии выделяют две фазы: подвижной фазой служит

жидкость, неподвижной фазой может быть твердый сорбент. Разделение в аффинной хроматографии обычно проводят на хроматографических колонках в две фазы (адсорбция и десорбция); иногда разделяемую смесь помещают в сосуд с сорбентом и выдерживают до полного связывания исследуемого компонента. Затем сорбент промывают буферным раствором для удаления не связавшихся веществ, после чего десорбируют исследуемый компонент.

В виде частиц различной формы изображены молекулы с различными химическими структурами, из которых только одна вступает в специфическое взаимодействие с частицами геля.

Слайд 5

Неподвижная фаза Неподвижная фаза в аффинной хроматографии представляет собой специально получаемый

Неподвижная фаза

Неподвижная фаза в аффинной хроматографии представляет собой специально получаемый

сорбент, построенный обычно по схеме: носитель – «ножка» – специфический лиганд. Носителем служит чаще всего сефароза - производное агарозы, имеющее поперечные сшивки. Присоединение к ней лиганда или соединяющего звена («ножки»), содержащих, как правило, аминогруппу, осуществляется после активации сефарозы бромцианом.
Слайд 6

Подвижная фаза Подвижная фаза аффинной хроматографии должна: обладать низкой вязкостью; обеспечивать

Подвижная фаза

Подвижная фаза аффинной хроматографии должна:
обладать низкой вязкостью;
обеспечивать необходимый уровень

селективности;
быть дешевой;
быть нетоксичной;
быть инертной;
быть совместимой с методами детектирования (например, с УФ-детектором нельзя использовать в качестве элюента бензол).
Обычно используют углеводороды (гексан, гептан, изооктан, циклогексан) с добавлением небольших количеств СНСl3 или диизопропилового эфира.
Слайд 7

Лиганды, используемые в АХ Выбор лиганда для аффинной хроматографии зависит от

Лиганды, используемые в АХ

Выбор лиганда для аффинной хроматографии зависит от двух

факторов:
лиганд должен обладать обратимым сродством к целевому белку;
лиганд должен содержать химические группы, через которые он может быть иммобилизован на матрице без нарушения связывающей активности.
Лигандами могут служить такие субстраты как крахмал или гликоген, однако их превращение в ходе аффинной хроматографии, катализируемое разделяемым ферментом, постоянно изменяет свойства сорбента. Поэтому, как правило, применяют аналоги субстратов, устойчивые к дальнейшему превращению, т.е. ингибиторы ферментов. Так, для выделения протеиназ используют нерасщепляемые ими пептиды D-аминокислот.
Слайд 8

Сорбенты, используемые в АХ Матрица является инертным носителем, с которым лиганд

Сорбенты, используемые в АХ

Матрица является инертным носителем, с которым лиганд может

быть ковалентно или не ковалентно связан. Основные свойства хроматографических матриц:
Чрезвычайно низкая неспецифическая адсорбция
Открытая пористая структура, обеспечивающая высокую связывающую способность даже для больших биомолекул;
Стабильность в диапазоне условий эксперимента, таких как высокий и низкий рН, детергенты и т.д.
Сефароза – агароза в форме шариков, демонстрирует многие из этих свойств. Сефарозы изменяют и модифицируют в соответствии с конкретными требованиями разделения. В качестве сорбентов для аффинной хроматографии применяются гели на основе агарозы: сефароза 4В, сефароза СL, аффи-гель.
Слайд 9

Разрушение аффинной связи Аффинную связь вещества с сорбентом можно нарушить либо:

Разрушение аффинной связи

Аффинную связь вещества с сорбентом можно нарушить либо:


путем создания неблагоприятных для биоспецифического взаимодействия условий;
путем конкурентной аффинной элюции.
Слайд 10

Аппаратурное оформление процесса Современный жидкостной хроматограф включает емкости для элюентов, насосы

Аппаратурное оформление процесса

Современный жидкостной хроматограф включает емкости для элюентов, насосы высокого

давления, дозатор, хроматографическую колонку, детектор, регистрирующий прибор, систему управления и математической обработки результатов.
Колонки для ВЭЖХ изготовляют чаще всего из нержавеющей стальной полированной трубки длиной 10- 25 см и внутренним диаметром 3-5 мм.
Для увеличения чувствительности детектора иногда применяют послеколоночную дериватизацию компонентов смеси. Для этого с потоком элюента вводят такие реагенты, которые, взаимодействуя с разделенными веществами, образуют производные с более выраженными свойствами, например, сильнее поглощают в УФ или видимой области спектра или обладают большей флуоресцирующей способностью и т. д. Иногда дериватизацию проводят до хроматографического анализа и разделяют производные, а не исходные вещества.
Слайд 11

Некоторые белки, разделяемые АХ Иммуноглобулины Разнообразие антиген – антитело взаимодействий создало

Некоторые белки, разделяемые АХ

Иммуноглобулины
Разнообразие антиген – антитело взаимодействий создало множество

приложений для антител и их фрагментов. Они используются в терапии, диагностике и научных исследованиях. Использование технологии рекомбинантных ДНК дало возможность манипулировать их свойствами для решения многих задач. Значительным преимуществом для очистки антител и их фрагментов является то, что известно много информации о свойствах молекул – мишеней антител.
IgG, фрагменты IgG и подклассы
Разделение IgG и его фрагментов основано на высоком сродстве к белку А. Аналогичный белок G связывается с Fc-фрагментом IgG. Белки А и G – это бактериальные протеины (из Staphylococcus aureus и Streptococcus, соответственно) которые на сефарозной матрице образуют чрезвычайно полезный и простой сорбент для многих рутинных процедур.