Многофункциональные биомолекулы

Содержание

Слайд 2

Мультифункціональні біомолекули Молекули, що змінюють хімічні властивості під зовнішнім фізичним впливом

Мультифункціональні біомолекули

Молекули, що змінюють хімічні властивості під зовнішнім фізичним впливом

Молекули, що

використовуються для надання нових властивостей іншим системам
Слайд 3

Фотохімічна активація ферментативних реакцій I. Willner, B. Basnar, B. Willner, FEBS

Фотохімічна активація ферментативних реакцій
I. Willner, B. Basnar, B. Willner, FEBS Journal

2007, 274, 302

Генерування фотострумів шляхом фотохімічно-індукованої активапції ензиматичних каскадів наночастинками CdS.
(A) Фотохімічна активація окиснення лактату, що перебігає за участю цитохрому с у присутності LDH.
(B) Фотохімічна активація відновлення нітрату, що перебігає за участю цитохрому с у присутності NR.
(C) Фотоструми, генеровані в біокаталітичних каскадах за різних концентрацій субстрату (лактат/нітрат).

LDH - лактат дегідрогеназа
NR - нітрат редуктаза

Слайд 4

P. K. Agarwal, C. Schultz, A. Kalivretenos, B. Ghosh, S. E.

P. K. Agarwal, C. Schultz, A. Kalivretenos, B. Ghosh, S. E.

Broedel, Jr.J. Phys. Chem. Lett. 2012, 3, 1142

Схема з’єднання азобензенового містку і ензиму

Ліпаза В Candida antarctica

Зміна активності фермента під дією світла

Слайд 5

Активність фермента у фотоактивованому стані (при освітленні) і незмінному стані (в

Активність фермента у фотоактивованому стані (при освітленні) і незмінному стані (в

темноті).
Активація ферменту досягається одночасним освітленням ферменту з азобензеновим містком УФ і блакитним світлом.

Активність модифікованого фермента вимірювали в суміші 1 μг ферменту,
50 нмоль п-нітрофенілбутирату (PNPB) (250 μM) в 50 мМ Tris-Cl, pH 8.0.

Зміна активності фермента під дією світла

Слайд 6

Фотопереключення іонотропного рецептору глутамату P. Gorostiza, M. Volgraf, R. Numano, S.

Фотопереключення іонотропного рецептору глутамату
P. Gorostiza, M. Volgraf, R. Numano, S. Szobota,

D. Trauner, E. Y. Isacoff, PNAS, 2007, 104, 10865
Слайд 7

Шляхи зєднання MAG-1 до iGluR6-L439C: (a) перехід в транс-конформацію при освітленні

Шляхи зєднання MAG-1 до iGluR6-L439C:
(a) перехід в транс-конформацію при освітленні світлом

з довжиною хвилі 500 нм
б) заповнення сайту звязування MAG-1 з використанням високої концентрації глутамату
LBD = сайт звязування ліганду (ligand binding site)

Фотопереключення іонотропного рецептору глутамату
P. Gorostiza, M. Volgraf, R. Numano, S. Szobota, D. Trauner, E. Y. Isacoff, PNAS, 2007, 104, 10865

Слайд 8

Фотоактивний протеїн J. Bredenbeck, J. Helbing, A. Sieg, T. Schrader, W.

Фотоактивний протеїн
J. Bredenbeck, J. Helbing, A. Sieg, T. Schrader, W. Zinth,

C. Renner, R. Behrendt,
L. Moroder, J. Wachtveitl, P. Hamm PNAS, 2003, 100, 6452.

Спектри поглинання пептиду.
Зміна поглинання цис-транс- конформерів в ІЧ-діапазоні у випадку певних часів затримки між освітленням і реєстрацією спектру
Різниця спектрів поглинання в стаціонарному стані
Інтенсивності спектрів поглинання і різниці спектрів нормовані для порівняння

Слайд 9

Фотоактивний протеїн J. Bredenbeck, J. Helbing, A. Sieg, T. Schrader, W.

Фотоактивний протеїн
J. Bredenbeck, J. Helbing, A. Sieg, T. Schrader, W. Zinth,

C. Renner, R. Behrendt,
L. Moroder, J. Wachtveitl, P. Hamm PNAS, 2003, 100, 6452.
Слайд 10

Y. Zhang, F.Lu, K.G. Yager, D. van der Lelie, O. Gang,

Y. Zhang, F.Lu, K.G. Yager, D. van der Lelie, O. Gang,


Nature Nanotechnology, 2013, DOI: 10.1038/NNANO.2013.209

Зборка систем різних наночастинок за допомогою ДНК

f – кількість ДНК на поверхні
STV – стрептавідін
(протеїн, що має високу спорідненість до біотину);
NHSS - N-гідроксисульфосукцинімід;
EDC, 1-етил-3-(3-диметиламінопропіл)карбодіїмід.

Спосіб функціоналізації наночастинок за допомогою ДНК

Слайд 11

Зборка систем різних наночастинок за допомогою ДНК Формування асоціатів через взаємодію

Зборка систем різних наночастинок за допомогою ДНК

Формування асоціатів через взаємодію імобілізованих

ДНК напряму або через місткову ДНК

Число у позначенні – кількість азотвмісних основ

Слайд 12

Зборка систем різних наночастинок за допомогою ДНК Наночастинки, модифіковані біотінільованою ДНК

Зборка систем різних наночастинок за допомогою ДНК

Наночастинки, модифіковані
біотінільованою ДНК
PC –

нанокуби Pd ;
PO – октаедри Pd;
PD – додекаедри Pd.

Наночастинки Pd,
f = 20 ± 5

Наночастинки
Fe2O3,
f = 4 ± 2

Наночастинки
CdSe/ZnS (Q5 та Q6),
CdTe/ZnS (Q7)
f = 30 ± 10

Наночастинки Au з плазмонним резонансом,
f = 50 ± 10

Спектри флуоресценції

Спектри поглинання

Вихідні наночастинки

Слайд 13

Малокутове розсіювання рентгенівських променів (SAXS). Наявність максимумів є ознакою утворення впорядкованої

Малокутове розсіювання рентгенівських променів (SAXS).
Наявність максимумів є ознакою утворення впорядкованої структури.

Шляхом симуляції спектру можна встановити тип кристалічної супер-гратки

Зборка систем різних наночастинок за допомогою ДНК

Метод дослідження

Наночастинки Pd/Au

Залежність відстані між частинками
від їх форми

Слайд 14

Зборка систем різних наночастинок за допомогою ДНК Агрегати наночастинок Fe2O3. Фіт

Зборка систем різних наночастинок за допомогою ДНК

Агрегати наночастинок Fe2O3.
Фіт – слабко-впорякована

гранецентрована гратка, позначена як “Фаза F”
Перетворення Фази-F на бінарну фазу Fe2O3-Au (Фаза-D) при додаванні наночастинок Au до агрегатів наночастинок Fe2O3.

Самозбірка супер-структур на основі різних наночастинок

Серія S(q) для систем, в яких довжина ДНК зменшується від 145 до 30 нм.
Коротші фрагменти ДНК сприяють утворенню більшої кількості фази D (Nј
45 (FeO_Au15_15) і 30 (FeO_Au0_15)), а довші ведуть до утворення суміші фаз (Nј145 (FeO_Au65_65) і 70(FeO_Au35_35)).

Слайд 15

Залежність швидкості процесу перетворення Фази-F на Фазу-D від довжини ДНК. Зборка

Залежність швидкості процесу перетворення Фази-F на Фазу-D від довжини ДНК.

Зборка

систем різних наночастинок за допомогою ДНК