Научная деятельность в сфере АПК (агропромышленный комплекс). Возможности, перспективы развития, идея создания проектных групп

Содержание

Слайд 2

Кому нужны проектные группы и в чем проблема? 1. Испытывать препараты

Кому нужны проектные группы и в чем проблема?

1. Испытывать препараты и

схемы ветеринарных мероприятий дорого и выборки получаются нерепрезентативными 3 птичника с суммарным поголовьем 75 тыс. гол это n=3. 100 голов опытной группы в птичнике это n=100 сравниваемое с контрольной группой размером в 10 тысяч голов. Это намного надежнее и реперезентатинвнее, условия содержания опытной и контрольной групп идентичны, инфекционный фон – идентичен.

2. Желательно выбирать лучший препарат, из 3х - 4х а не один из одного... Как это бывает обычно.

3. Желательно выбирать лучший препарат, из 3х - 4х а не один из одного... Как это бывает обычно.

4. Недостатки:
А) Птицеводы не будут проводить ограниченные опыты по несколько групп в одном птичнике
Б) Фармкомпании не хотят рисковать. Ведь Если птицефабрика выберет лучший препарат/схему из пяти, то четыре компании проиграют...

Слайд 3

Выход есть! Студенты, аспиранты, молодые специалисты и ученые! Энтузиазм! Молодость и

Выход есть!

Студенты, аспиранты, молодые специалисты и ученые!
Энтузиазм! Молодость и задор!
Бесплатный

труд на благо аграрной науки!
Слайд 4

Траектории развития проектных групп 5 препаратов, 5 студентов, одна проблема Обучение

Траектории развития проектных групп

5 препаратов, 5 студентов, одна проблема
Обучение лабораторным методам

контроля эффективности схем ветеринарных мероприятий на птицефабрике
Разработка новых препаратов – под создание бизнес-процесса для фарм.компании /МИП, малого бизнеса (продукт, технология, персонал)
Подготовка кадров для птицефабрики /фарм. компании (вбырать лучшего из пяти)
Слайд 5

Что мы получаем? 5 дипломных работ Подготовленные кадры для с.-х. производства

Что мы получаем?

5 дипломных работ
Подготовленные кадры для с.-х. производства или торговой

компании
Одно решение проблемы
3-4 успешных опыта с подробным анализом механизмов и эффектов действия препарата
Лаборатория, обслуживающая проект, тоже чего-нибудь заработает
Совершенствование лабораторной службы
с.-х. производства
Слайд 6

Материалы и методы: Антиген получали из предварительно убитой кипячением взвеси бактериальных

Материалы и методы:

Антиген получали из предварительно убитой кипячением взвеси бактериальных клеток.

Использовали инактивированные культуры сальмонелл серотипов Hamburg, Enteritidis, Reading, Typhimurium Virchow, Infantis а также культуру сальмонеллы которая была выделена из пищевой продукции. Для получения флуоресцентно-меченых антигенов, к взвеси инактивированных бактериальных клеток добавляли 0,1% раствор флуоресцентного красителя – акридиновый оранжевый.
Изучали уровень антител в реакции иммунофлуоресцентной агглютинации. Предварительно определили оптимальную концентрацию антигенов. Для этой цели антигены разводили с шагом 1:2 и вносили в лунки 96 луночного микропланшета с V – образным дном, через 16 часов инкубации оценивали светимость антигенов с помощью трансиллюминатора GelDok BioRad. Затем проводили реакцию агглютинации с сыворотками крови, которые раститровали с шагом 1:2.
Для оценки процента серопозитивной птицы. исследовали 24 пробы сыворотки крови от цыплят-бройлеров в возрасте 40 дн в ИРА с антигеном сальмонеллы выделенной ранее на этой же птицефабрике. Часть положительных образцов были протестированы в РА с флуоресцентномеченными антигенами Hamburg, Enteritidis, Reading, Typhimurium, Virchow, Infantis для выявления перекрестных реакций с полевым штаммом. Реакцию ставили по методу [1].
Слайд 7

1 2 3 4 5 6 Прежде чем оценить эффективность противосальмонеллезных

1 2 3 4 5 6

Прежде чем оценить эффективность противосальмонеллезных

мероприятий – нужно выявить эпизоотически значимый штамм

Средний титр в РА с антигенами сальмонелл разных серотипов, Log2

Процент серопозитивной птицы в РА к антигенам сальмонелл разных серотипов , %

Реакция агглютинации с флюоресцентно-меченным антигеном S. infantis

Использование серологических тестов на бройлерах для оценки эффективности мероприятий – можно по разнице процента серопозитивной птиц и/или среднего титра между опытными и контрольными птичниками оценить эффективность противосальмонеллезных мероприятий за 10-14 дн до отбора проб крови

1:512
1:256
1:128
1:64
1:32
1:16
1:8

Слайд 8

Флюресцентные методы в микробиологии Флюоресцентно меченные сальмонеллы имеющие Spv оперон Флюоресцентно

Флюресцентные методы в микробиологии

Флюоресцентно меченные сальмонеллы имеющие Spv оперон

Флюоресцентно меченные (снаружи)

сальмонеллы и фагоцит

Метод Live /dead

Слайд 9

Строение жгутика Примеры траекторий движения бактерий Подавление подвижности P. aeruginosa на

Строение жгутика

Примеры траекторий движения бактерий

Подавление подвижности P. aeruginosa на среде MIO

при различных концентрациях (штамм P. aeruginosa 668)

Постмаркетинговое исследование в биотехнологии: Флавофосфолипол – подавление факторов патогенности бактерий (подвижность)

Средние концентрации флавофосфолипола ингибирующие рост и подвижность бактерий

Слайд 10

Микропланшеты для ПЦР – удобны для изучения биопленок Fig. 1. PCR

Микропланшеты для ПЦР – удобны для изучения биопленок

Fig. 1. PCR -

microplate after growing biofilms and staining with crystal violet.

Figure 2 Change in optical density of Pseudomonas aeruginosa ATCC 9027 biofilm in a test with crystal violet, OD450

Biofilm growth dynamics, OD 450

Слайд 11

Слайд 12

Рисунок 1. Кинетика ПЦР в режиме реального времени при различных концентрациях

Рисунок 1. Кинетика ПЦР в режиме реального времени при различных концентрациях

геномной ДНК C.perfringens. Тесты поставлены в четырех повторностях и видно что реакция достаточно воспроизводима

Калибровочная кривая для ПЦР в режиме реального времени при различных концентрациях геномной ДНК C.perfringens. График характеризует возможность количественной оценки содержания клостридий в биоматериале и воспроизводимость таких исследований

ПЦР в режиме реального времени для детекции Clostridium perfringens

Слайд 13

Количественная ПЦР в ветеринарии, растениеводстве, животноводстве и селекции Оценка биологических эффектов

Количественная ПЦР в ветеринарии, растениеводстве, животноводстве и селекции

Оценка биологических эффектов по

изменению экспрессии целевых генов (кормление, фармакология, токсикология)
Изменение вирусной и бактериальной нагрузки
Выявление функционально-значимых мутаций (маркерная селекция)
Эпигенетика – изменение метилирования промоторов под действием кормления и т.д.
Верификация результатов GWAS
HRM!!!
Слайд 14

Измерение флуоресценции при помощи ПЦР амплификатора CFX (Bio-Rad) с использованием канала

Измерение флуоресценции при помощи ПЦР амплификатора CFX (Bio-Rad) с использованием канала

FAM . Примечание : 1 (2 часа опыта), 2- (3 часа), 3 – (4 часа) , 4 (5 часов).

Измерение флуоресценции при помощи ПЦР амплификатора CFX (Bio-Rad) с использованием канала HEX. Примечание : 1 (2 часа опыта), 2- (3 часа), 3 – (4 часа) , 4 (5 часов).

Использование реалтайм-амплификатора в режиме флуориметра

Слайд 15

Оценка динамики прироста водопотребления – интегральный показатель воспалительных процессов в кишечнике?

Оценка динамики прироста водопотребления – интегральный показатель воспалительных процессов в кишечнике?

динамика водопотребления, мл/голову

прирост водоптребления в динамике, сглаженная диаграмма (вспышка эймериоза)

Проблемы с эймериозами в РФ

1. Риск восстановления патогенности вакцинных штаммов при использовании разных вакцинных штаммов
2. Развитие устойчивости к кокцидиостатикам
3. Эволюция в направлении роста интенсивности экссудативных процессов
4. Дифференциальная диагностика от бактериальных токсико-инфекций и вирусных энтеритов

Слайд 16

строение Слизистая тощей кишки, вид сверху НОРМА ПАТОЛОГИЯ


строение

Слизистая тощей кишки, вид сверху

НОРМА

ПАТОЛОГИЯ

Слайд 17

Рис.3 Динамика изменения длины ворсинок у цыплят бройлеров Таблица 1 –

Рис.3 Динамика изменения длины ворсинок у цыплят бройлеров

Таблица 1 –

Размеры кишечных ворсин у цыплят-бройлеров, мкм.
Слайд 18

Разные варианты статистического анализа Odds ratio (отношение шансов) можно рассчитать на

Разные варианты статистического анализа

Odds ratio (отношение шансов) можно рассчитать на этом

сайте https://www.medcalc.org/calc/odds_ratio.php
Корреляцию по Спирмену можно рассчитать на этом сайте http://math.semestr.ru/corel/spirmen.php

Различия уровней антител (igM) к вирусу МПВИ в птичниках с разным уровнем смертности

Так как метапневмовирусная инфекция проявляется у бройлеров незадолго до убоя, то обнаружение антител класса igY(G) представляется проблематичным а их уровни в большей степени зависят не от вирусной нагрузки, а от времени контакта птицы с возбудителем

Слайд 19

Примеры ассоциативных исследований Рис. 1 Уровни альбумина в крови в двух

Примеры ассоциативных исследований

Рис. 1 Уровни альбумина в крови в двух группах

птичников с наибольшей и наименьшей сохранностью. На фоне астровирусного нефрита цыплят

Рис. 2. Инфицированность селезенки ВБМ у цыплят с дерматитами и без дерматитов

Большое количество птичников, в сочетании с отсутствием возможности пресекать циркуляцию инфекционных агентов методом пусто-занято, обеспечивают хорошую воспроизводимость инфекционных процессов, что позволяет экстраполировать данные с нескольких птичников на все остальное поголовье. Эта же проблема позволяет одновременно отбирать образцы из птичников с разными показателями (сохранность, продуктивность) и сравнивать их по результатам лабораторных исследований.

Таким образом, следует разделять серологические исследования (а также ПЦР и биохимии) на мониторинговые, скрининговые и ассоциативные.

Слайд 20

Испытание противовирусной эффективности препарата Тривирон на модели ИБК Изменение концентрации вируса

Испытание противовирусной эффективности препарата Тривирон на модели ИБК

Изменение концентрации вируса ИБК

в трахее (A), и бронхах (В) в зависимости от экспозиции Cq +SD
Примечание: чем больше Cq – тем меньше вируса

Выживаемость цыплят при лечении «Тривироном» и в контрольной группе

Слайд 21

Профилактика ИБК – профилактика ИЛТ и МПВИ

Профилактика ИБК – профилактика ИЛТ и МПВИ

Слайд 22

Распределение антигена вируса ИБК по данным иммунофлюоресцентной микроскопии в опыте с

Распределение антигена вируса ИБК по данным иммунофлюоресцентной микроскопии в опыте с

аэрозольным применением «Тривирона»

10 минут экспозиции

40 минут экспозиции

Слайд 23

Формирование микробиоты кишечника цыплят, "созревание слизистой кишечника" – почему это важно?

Формирование микробиоты кишечника цыплят, "созревание слизистой кишечника" – почему это важно?

Концентрации

микроорганизмов разных таксономических групп у цыплят (в возрасте 9 дн.) получавших "Проваген" и контрольной группы.

ПЦР в режиме реального времени на наличие вируса герпеса индеек FC126
Примечание: 1 контроль (исходный образец вакцины), 2- отрицательный контроль (разведенная вакцина без «Провагена»), 3-вакцина + «Проваген» в концентрации 8 Log10 кое/мл. Чем раньше появляется сигнал на графике, тем больше вируса было в образце.